MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanococcus aeolicus Nankai-3 chromosome

Total Repeats: 822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009635	AAAAAT	2	12	909	920	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400440
2	NC_009635	AAATAA	2	12	1416	1427	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400440
3	NC_009635	GATACA	2	12	1665	1676	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150400441
4	NC_009635	TTATAG	2	12	1741	1752	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150400441
5	NC_009635	TAAAGT	2	12	3905	3916	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400443
6	NC_009635	ATTTTT	2	12	4891	4902	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	150400444
7	NC_009635	ATTATC	2	12	5271	5282	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150400444
8	NC_009635	ATGGTC	2	12	8369	8380	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150400446
9	NC_009635	AAATTA	2	12	11124	11135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400449
10	NC_009635	TAACAA	2	12	12859	12870	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150400450
11	NC_009635	CATAAA	2	12	18203	18214	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150400454
12	NC_009635	CAATTT	2	12	23485	23496	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150400460
13	NC_009635	TGTGCC	2	12	27712	27723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150400465
14	NC_009635	AATGTG	2	12	28854	28865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400465
15	NC_009635	AATTAT	2	12	30872	30883	50 %	50 %	0 %	0 %	150400467
16	NC_009635	TTGAAG	2	12	33719	33730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400469
17	NC_009635	ATCTCC	2	12	35558	35569	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	150400471
18	NC_009635	ATTCAT	2	12	35890	35901	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150400471
19	NC_009635	AGGAAA	2	12	36541	36552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150400472
20	NC_009635	GTTGAT	2	12	36725	36736	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150400472
21	NC_009635	AAATGC	2	12	39361	39372	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150400473
22	NC_009635	TATATT	2	12	40234	40245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400474
23	NC_009635	AAATAA	2	12	40854	40865	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400475
24	NC_009635	CTATTG	2	12	41637	41648	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150400475
25	NC_009635	ATATAA	2	12	46107	46118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400479
26	NC_009635	TATGAA	2	12	49343	49354	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400482
27	NC_009635	TGAAAA	2	12	50711	50722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150400483
28	NC_009635	AAAAAG	3	18	54012	54029	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150400486
29	NC_009635	CAATAT	2	12	56234	56245	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150400487
30	NC_009635	TTAATT	2	12	61484	61495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400492
31	NC_009635	AGCTGA	2	12	65860	65871	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150400497
32	NC_009635	ATGTAG	2	12	66712	66723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400498
33	NC_009635	TTGAAA	2	12	66916	66927	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400498
34	NC_009635	TCAGGT	2	12	73500	73511	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150400504
35	NC_009635	TTGGAT	2	12	75061	75072	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150400505
36	NC_009635	CTGTAC	2	12	75095	75106	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150400505
37	NC_009635	TTGAAA	2	12	75107	75118	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400505
38	NC_009635	AAAATA	2	12	80142	80153	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400513
39	NC_009635	TGGGGT	2	12	85436	85447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150400521
40	NC_009635	TAGAAT	2	12	85968	85979	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400521
41	NC_009635	TTGGAG	2	12	86322	86333	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	150400521
42	NC_009635	CCAAAA	2	12	87447	87458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150400522
43	NC_009635	GGCTAA	2	12	88176	88187	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150400523
44	NC_009635	ATTCAA	2	12	88277	88288	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150400523
45	NC_009635	TTCATT	2	12	89761	89772	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150400524
46	NC_009635	TTTAAA	2	12	90671	90682	50 %	50 %	0 %	0 %	150400524
47	NC_009635	AATATT	2	12	92977	92988	50 %	50 %	0 %	0 %	150400526
48	NC_009635	TGGTAT	2	12	94399	94410	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150400528
49	NC_009635	ATAAAA	2	12	95067	95078	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400529
50	NC_009635	AGAAAA	2	12	96806	96817	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150400529
51	NC_009635	TCAAGT	2	12	101701	101712	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150400533
52	NC_009635	CCATAT	2	12	101737	101748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400533
53	NC_009635	TTAATT	2	12	104109	104120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400535
54	NC_009635	TTTTAA	2	12	106585	106596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400537
55	NC_009635	ATTTAT	2	12	107608	107619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400538
56	NC_009635	CTGCTT	2	12	109711	109722	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	150400540
57	NC_009635	GTAAAT	2	12	111055	111066	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400542
58	NC_009635	TATAGA	2	12	111087	111098	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400542
59	NC_009635	AAAAGA	2	12	111969	111980	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150400542
60	NC_009635	TTAAAT	2	12	112453	112464	50 %	50 %	0 %	0 %	150400543
61	NC_009635	GTAATG	2	12	113274	113285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400544
62	NC_009635	ATAGAA	2	12	113912	113923	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150400544
63	NC_009635	CAATTT	2	12	116067	116078	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150400546
64	NC_009635	AATAAA	2	12	117941	117952	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400547
65	NC_009635	GATATT	2	12	120065	120076	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150400547
66	NC_009635	TAATTA	2	12	120923	120934	50 %	50 %	0 %	0 %	150400548
67	NC_009635	ATGCCG	2	12	123958	123969	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150400550
68	NC_009635	CTTGAA	2	12	124653	124664	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150400551
69	NC_009635	TTGTAT	2	12	128346	128357	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150400553
70	NC_009635	TATCTT	2	12	128885	128896	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150400554
71	NC_009635	ACTTTA	2	12	129559	129570	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150400555
72	NC_009635	ATATAA	2	12	130074	130085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400556
73	NC_009635	ATACAG	2	12	131388	131399	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150400556
74	NC_009635	AAACAA	2	12	132190	132201	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	150400557
75	NC_009635	CAACTA	2	12	133552	133563	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150400557
76	NC_009635	TCATAA	2	12	136160	136171	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150400558
77	NC_009635	AAAATA	2	12	139531	139542	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400560
78	NC_009635	ACGGGA	2	12	140269	140280	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	150400561
79	NC_009635	ATAAAA	2	12	143528	143539	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400566
80	NC_009635	TGATAT	2	12	144700	144711	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150400567
81	NC_009635	CAAAAT	2	12	145525	145536	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150400568
82	NC_009635	ATTCTT	2	12	146546	146557	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150400569
83	NC_009635	AGAAAA	2	12	147747	147758	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150400569
84	NC_009635	AAAATA	2	12	147857	147868	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400569
85	NC_009635	CTATGG	2	12	149912	149923	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150400572
86	NC_009635	AACAAA	2	12	150176	150187	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	150400572
87	NC_009635	TTAAAA	2	12	153873	153884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400574
88	NC_009635	TAATTT	2	12	153956	153967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400574
89	NC_009635	TAATTC	2	12	154502	154513	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150400575
90	NC_009635	AAATAA	2	12	156092	156103	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400576
91	NC_009635	TTAAAA	2	12	158538	158549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400578
92	NC_009635	AGATTT	2	12	159068	159079	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150400578
93	NC_009635	ATTGCC	2	12	160269	160280	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150400580
94	NC_009635	GATATT	2	12	162393	162404	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150400582
95	NC_009635	ATCTAT	2	12	167614	167625	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150400587
96	NC_009635	TCCTCT	2	12	167663	167674	0 %	50 %	0 %	50 %	150400587
97	NC_009635	ATTGAA	2	12	175571	175582	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400594
98	NC_009635	TTATTC	2	12	175945	175956	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150400595
99	NC_009635	ATAAAA	2	12	177763	177774	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400596
100	NC_009635	TTTAAT	2	12	187550	187561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400608
101	NC_009635	AAATAA	2	12	188440	188451	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400608
102	NC_009635	CAATAA	2	12	188494	188505	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150400608
103	NC_009635	ATTTTC	2	12	191383	191394	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150400610
104	NC_009635	GACCTG	2	12	192179	192190	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150400611
105	NC_009635	TTAAAT	2	12	196508	196519	50 %	50 %	0 %	0 %	150400617
106	NC_009635	TCTAAC	3	18	196718	196735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400617
107	NC_009635	TATGAT	2	12	202397	202408	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150400622
108	NC_009635	AAAATA	2	12	203030	203041	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400623
109	NC_009635	AGGAGC	2	12	205331	205342	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	150400626
110	NC_009635	TTTGCA	2	12	205918	205929	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150400627
111	NC_009635	TCATTT	2	12	206023	206034	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150400627
112	NC_009635	TGGATA	2	12	208438	208449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400630
113	NC_009635	TAAATT	2	12	208675	208686	50 %	50 %	0 %	0 %	150400630
114	NC_009635	AATATT	2	12	211178	211189	50 %	50 %	0 %	0 %	150400633
115	NC_009635	CCATAG	2	12	212140	212151	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150400634
116	NC_009635	TCCCAC	2	12	212977	212988	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	150400635
117	NC_009635	TTTTTC	2	12	214701	214712	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	150400638
118	NC_009635	AAATTT	2	12	214954	214965	50 %	50 %	0 %	0 %	150400638
119	NC_009635	TTAAAT	2	12	216385	216396	50 %	50 %	0 %	0 %	150400640
120	NC_009635	GAAATT	2	12	218301	218312	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400642
121	NC_009635	ATGCAA	2	12	219587	219598	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150400643
122	NC_009635	ATTTTC	2	12	219843	219854	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150400643
123	NC_009635	ATTATA	2	12	220068	220079	50 %	50 %	0 %	0 %	150400643
124	NC_009635	GAATTA	2	12	221590	221601	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400645
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235	NC_009635	TATAGA	2	12	431904	431915	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400846
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238	NC_009635	TATAAT	2	12	433159	433170	50 %	50 %	0 %	0 %	150400846
239	NC_009635	GTTTTA	2	12	436484	436495	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150400848
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339	NC_009635	TTATAA	2	12	641597	641608	50 %	50 %	0 %	0 %	150401052
340	NC_009635	TCCAAA	2	12	645359	645370	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150401056
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349	NC_009635	AACGGC	2	12	657792	657803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150401070
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352	NC_009635	ATATAA	2	12	663253	663264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401076
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354	NC_009635	CTGCAA	2	12	665394	665405	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150401078
355	NC_009635	CTCATA	2	12	667496	667507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150401079
356	NC_009635	TTATAA	2	12	668220	668231	50 %	50 %	0 %	0 %	150401080
357	NC_009635	AAATTA	2	12	671760	671771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150401083
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385	NC_009635	ATAATC	2	12	730821	730832	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150401140
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