MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanococcus aeolicus Nankai-3 chromosome

Total Repeats: 1977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009635	TTATT	2	10	260	269	20 %	80 %	0 %	0 %	150400440
2	NC_009635	TATTT	2	10	806	815	20 %	80 %	0 %	0 %	150400440
3	NC_009635	ATCAA	2	10	993	1002	60 %	20 %	0 %	20 %	150400440
4	NC_009635	ATATT	2	10	2235	2244	40 %	60 %	0 %	0 %	150400441
5	NC_009635	ATAAA	2	10	2988	2997	80 %	20 %	0 %	0 %	150400442
6	NC_009635	TTATA	2	10	4025	4034	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009635	TAATA	2	10	4092	4101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009635	AATAT	2	10	4638	4647	60 %	40 %	0 %	0 %	150400444
9	NC_009635	TAATT	2	10	7095	7104	40 %	60 %	0 %	0 %	150400445
10	NC_009635	TCCAT	3	15	7982	7996	20 %	40 %	0 %	40 %	150400446
11	NC_009635	ATTTT	2	10	8040	8049	20 %	80 %	0 %	0 %	150400446
12	NC_009635	TAATA	2	10	8914	8923	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009635	TATAA	2	10	8988	8997	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009635	AGGGC	2	10	9261	9270	20 %	0 %	60 %	20 %	150400447
15	NC_009635	AAAAT	2	10	10540	10549	80 %	20 %	0 %	0 %	150400448
16	NC_009635	TAATT	2	10	12290	12299	40 %	60 %	0 %	0 %	150400449
17	NC_009635	AAGAT	2	10	14181	14190	60 %	20 %	20 %	0 %	150400450
18	NC_009635	ATATA	2	10	14395	14404	60 %	40 %	0 %	0 %	150400450
19	NC_009635	AAAAT	2	10	14804	14813	80 %	20 %	0 %	0 %	150400451
20	NC_009635	TAAAA	2	10	15210	15219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009635	ATTAA	2	10	15503	15512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009635	AAAAT	2	10	15872	15881	80 %	20 %	0 %	0 %	150400452
23	NC_009635	ATTTT	2	10	16135	16144	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009635	TATAT	2	10	16179	16188	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009635	ATTAT	2	10	16191	16200	40 %	60 %	0 %	0 %	150400453
26	NC_009635	TTTTC	2	10	16502	16511	0 %	80 %	0 %	20 %	150400453
27	NC_009635	ATTTT	2	10	17520	17529	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009635	ATTTT	2	10	17536	17545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009635	TCTTT	2	10	18139	18148	0 %	80 %	0 %	20 %	150400454
30	NC_009635	TTTTA	2	10	18255	18264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009635	GATAT	2	10	18678	18687	40 %	40 %	20 %	0 %	150400455
32	NC_009635	TAATA	2	10	19113	19122	60 %	40 %	0 %	0 %	150400455
33	NC_009635	TTTTA	2	10	19173	19182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009635	GTATT	2	10	19223	19232	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009635	ATTAT	2	10	19296	19305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009635	AATAT	2	10	19527	19536	60 %	40 %	0 %	0 %	150400456
37	NC_009635	ATAAA	2	10	21009	21018	80 %	20 %	0 %	0 %	150400458
38	NC_009635	ATATA	2	10	21706	21715	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009635	AATAA	2	10	21734	21743	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009635	TATGG	2	10	22195	22204	20 %	40 %	40 %	0 %	150400459
41	NC_009635	AAACA	2	10	22320	22329	80 %	0 %	0 %	20 %	150400459
42	NC_009635	AAATA	2	10	23769	23778	80 %	20 %	0 %	0 %	150400460
43	NC_009635	AAAAT	2	10	24478	24487	80 %	20 %	0 %	0 %	150400461
44	NC_009635	AAATA	2	10	24499	24508	80 %	20 %	0 %	0 %	150400461
45	NC_009635	TATAT	2	10	25506	25515	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009635	AGGAA	2	10	27310	27319	60 %	0 %	40 %	0 %	150400465
47	NC_009635	TAGAT	2	10	27562	27571	40 %	40 %	20 %	0 %	150400465
48	NC_009635	ATTTG	2	10	27895	27904	20 %	60 %	20 %	0 %	150400465
49	NC_009635	GAAAA	2	10	29456	29465	80 %	0 %	20 %	0 %	150400465
50	NC_009635	GATAT	2	10	29690	29699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009635	CACAA	2	10	31470	31479	60 %	0 %	0 %	40 %	150400467
52	NC_009635	AGAAT	2	10	31659	31668	60 %	20 %	20 %	0 %	150400467
53	NC_009635	AATGG	2	10	31709	31718	40 %	20 %	40 %	0 %	150400467
54	NC_009635	ATATT	2	10	32575	32584	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009635	TTTAT	2	10	32698	32707	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009635	TGAAA	2	10	32790	32799	60 %	20 %	20 %	0 %	150400469
57	NC_009635	AATAA	2	10	33187	33196	80 %	20 %	0 %	0 %	150400469
58	NC_009635	AATTG	2	10	33336	33345	40 %	40 %	20 %	0 %	150400469
59	NC_009635	ATATT	2	10	33374	33383	40 %	60 %	0 %	0 %	150400469
60	NC_009635	TAAAT	2	10	38083	38092	60 %	40 %	0 %	0 %	150400473
61	NC_009635	ACCAA	2	10	38357	38366	60 %	0 %	0 %	40 %	150400473
62	NC_009635	ATTAT	2	10	39627	39636	40 %	60 %	0 %	0 %	150400473
63	NC_009635	GTTAT	2	10	42351	42360	20 %	60 %	20 %	0 %	150400476
64	NC_009635	TATAT	2	10	42544	42553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009635	TATAT	2	10	42559	42568	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009635	AGCGA	2	10	43944	43953	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009635	AGCGA	2	10	44002	44011	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009635	AAAAT	2	10	44852	44861	80 %	20 %	0 %	0 %	150400478
69	NC_009635	GAAAT	2	10	45030	45039	60 %	20 %	20 %	0 %	150400478
70	NC_009635	ATTTA	2	10	45160	45169	40 %	60 %	0 %	0 %	150400478
71	NC_009635	TTTTA	2	10	45630	45639	20 %	80 %	0 %	0 %	150400479
72	NC_009635	AAATA	2	10	45931	45940	80 %	20 %	0 %	0 %	150400479
73	NC_009635	ATAAA	2	10	46160	46169	80 %	20 %	0 %	0 %	150400479
74	NC_009635	AGGGA	2	10	46695	46704	40 %	0 %	60 %	0 %	150400480
75	NC_009635	ATTAT	2	10	46830	46839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009635	TAAAA	2	10	47050	47059	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009635	CAAAT	2	10	48369	48378	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009635	AATAA	2	10	48572	48581	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009635	ACCAT	2	10	51378	51387	40 %	20 %	0 %	40 %	150400483
80	NC_009635	GAAAT	2	10	51561	51570	60 %	20 %	20 %	0 %	150400483
81	NC_009635	GAAAA	2	10	52135	52144	80 %	0 %	20 %	0 %	150400484
82	NC_009635	AATTA	2	10	52397	52406	60 %	40 %	0 %	0 %	150400484
83	NC_009635	CCAGA	2	10	52513	52522	40 %	0 %	20 %	40 %	150400484
84	NC_009635	TAAAA	2	10	53018	53027	80 %	20 %	0 %	0 %	150400484
85	NC_009635	AAACC	2	10	54078	54087	60 %	0 %	0 %	40 %	150400486
86	NC_009635	TATTT	2	10	54934	54943	20 %	80 %	0 %	0 %	150400486
87	NC_009635	CTTTT	2	10	55859	55868	0 %	80 %	0 %	20 %	150400487
88	NC_009635	GTTCT	2	10	55896	55905	0 %	60 %	20 %	20 %	150400487
89	NC_009635	TATAT	2	10	56043	56052	40 %	60 %	0 %	0 %	150400487
90	NC_009635	GGTCT	2	10	56885	56894	0 %	40 %	40 %	20 %	150400487
91	NC_009635	TATAA	2	10	57439	57448	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009635	ATTTT	2	10	57476	57485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009635	TAATA	2	10	58712	58721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009635	ATTTA	2	10	58777	58786	40 %	60 %	0 %	0 %	150400489
95	NC_009635	TATTT	2	10	59130	59139	20 %	80 %	0 %	0 %	150400490
96	NC_009635	ATTTA	2	10	59142	59151	40 %	60 %	0 %	0 %	150400490
97	NC_009635	TTTAT	2	10	60293	60302	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009635	TTCTT	2	10	61434	61443	0 %	80 %	0 %	20 %	150400492
99	NC_009635	ATTTT	2	10	61735	61744	20 %	80 %	0 %	0 %	150400492
100	NC_009635	TATAT	2	10	62088	62097	40 %	60 %	0 %	0 %	150400492
101	NC_009635	TAAAA	2	10	63933	63942	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009635	AAAAT	2	10	65883	65892	80 %	20 %	0 %	0 %	150400497
103	NC_009635	AAATA	2	10	65950	65959	80 %	20 %	0 %	0 %	150400497
104	NC_009635	TAAAT	2	10	66437	66446	60 %	40 %	0 %	0 %	150400498
105	NC_009635	AATTA	2	10	66490	66499	60 %	40 %	0 %	0 %	150400498
106	NC_009635	CTATA	2	10	68138	68147	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009635	TTTGG	2	10	71813	71822	0 %	60 %	40 %	0 %	150400503
108	NC_009635	ATATT	2	10	72966	72975	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009635	ACAGG	2	10	73170	73179	40 %	0 %	40 %	20 %	150400504
110	NC_009635	TAATT	2	10	75914	75923	40 %	60 %	0 %	0 %	150400506
111	NC_009635	GATAG	2	10	76051	76060	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009635	TATTT	2	10	76751	76760	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009635	AATAT	2	10	78933	78942	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009635	ATTAA	2	10	78968	78977	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009635	ATGGT	2	10	80658	80667	20 %	40 %	40 %	0 %	150400513
116	NC_009635	AATTA	2	10	80735	80744	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009635	ATGTA	2	10	82354	82363	40 %	40 %	20 %	0 %	150400516
118	NC_009635	ATTTA	2	10	82851	82860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009635	ATTTT	2	10	82987	82996	20 %	80 %	0 %	0 %	150400517
120	NC_009635	TCCAT	2	10	83175	83184	20 %	40 %	0 %	40 %	150400517
121	NC_009635	TAAAA	2	10	84104	84113	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009635	TTCAA	2	10	85764	85773	40 %	40 %	0 %	20 %	150400521
123	NC_009635	TTGTT	2	10	86119	86128	0 %	80 %	20 %	0 %	150400521
124	NC_009635	TAATA	2	10	86882	86891	60 %	40 %	0 %	0 %	150400522
125	NC_009635	TGGAA	2	10	87038	87047	40 %	20 %	40 %	0 %	150400522
126	NC_009635	TGTAA	2	10	88822	88831	40 %	40 %	20 %	0 %	150400523
127	NC_009635	AAATA	2	10	89300	89309	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009635	TATTT	2	10	89469	89478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009635	ATTAA	2	10	89683	89692	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009635	AATTT	2	10	90180	90189	40 %	60 %	0 %	0 %	150400524
131	NC_009635	ATATA	2	10	90917	90926	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009635	GAAAA	2	10	92299	92308	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009635	CTATA	2	10	92609	92618	40 %	40 %	0 %	20 %	150400526
134	NC_009635	TAATA	2	10	93027	93036	60 %	40 %	0 %	0 %	150400526
135	NC_009635	AATAT	2	10	93037	93046	60 %	40 %	0 %	0 %	150400526
136	NC_009635	TAATT	2	10	94695	94704	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009635	TTCGC	2	10	95680	95689	0 %	40 %	20 %	40 %	150400529
138	NC_009635	AAATA	2	10	96145	96154	80 %	20 %	0 %	0 %	150400529
139	NC_009635	AATAT	2	10	96198	96207	60 %	40 %	0 %	0 %	150400529
140	NC_009635	AAATG	2	10	97918	97927	60 %	20 %	20 %	0 %	150400529
141	NC_009635	TGATT	2	10	99387	99396	20 %	60 %	20 %	0 %	150400530
142	NC_009635	ATTTT	2	10	99857	99866	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009635	CATAT	2	10	101304	101313	40 %	40 %	0 %	20 %	150400533
144	NC_009635	ATATA	2	10	101485	101494	60 %	40 %	0 %	0 %	150400533
145	NC_009635	TATTT	2	10	105568	105577	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009635	TAATT	2	10	105605	105614	40 %	60 %	0 %	0 %	150400536
147	NC_009635	CATAC	2	10	108849	108858	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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150	NC_009635	ATTTT	2	10	110132	110141	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009635	TATAT	2	10	110142	110151	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009635	ATATT	2	10	111296	111305	40 %	60 %	0 %	0 %	150400542
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158	NC_009635	TTTTC	2	10	114774	114783	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_009635	CTGTT	2	10	115151	115160	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
160	NC_009635	TATTT	2	10	116298	116307	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_009635	ATATT	2	10	116849	116858	40 %	60 %	0 %	0 %	150400547
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191	NC_009635	TATAT	2	10	142044	142053	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_009635	TACTA	2	10	189086	189095	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_009635	GAATA	2	10	195308	195317	60 %	20 %	20 %	0 %	150400614
262	NC_009635	ATTTT	2	10	195486	195495	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_009635	TTAAT	2	10	196061	196070	40 %	60 %	0 %	0 %	150400616
264	NC_009635	TAGAT	2	10	196485	196494	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
265	NC_009635	TTTCT	2	10	197309	197318	0 %	80 %	0 %	20 %	150400618
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268	NC_009635	TAAAT	2	10	199455	199464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_009635	ATTTA	2	10	200970	200979	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_009635	TAAAT	2	10	200982	200991	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_009635	TAAAT	2	10	211577	211586	60 %	40 %	0 %	0 %	150400633
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399	NC_009635	ATATA	2	10	314506	314515	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
400	NC_009635	TAATA	2	10	314519	314528	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_009635	TATTT	2	10	315263	315272	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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408	NC_009635	AAAAT	2	10	320259	320268	80 %	20 %	0 %	0 %	150400730
409	NC_009635	CTTTT	2	10	321080	321089	0 %	80 %	0 %	20 %	150400730
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