MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanococcus aeolicus Nankai-3 chromosome

Total Repeats: 24671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009635	ATA	2	6	85	90	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009635	TAA	2	6	105	110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009635	ATA	2	6	175	180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009635	TTA	3	9	303	311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400440
5	NC_009635	ATA	2	6	413	418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400440
6	NC_009635	TTA	3	9	448	456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400440
7	NC_009635	TAT	3	9	459	467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400440
8	NC_009635	TGT	2	6	483	488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150400440
9	NC_009635	ACA	2	6	597	602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150400440
10	NC_009635	ATA	2	6	647	652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400440
11	NC_009635	ATT	2	6	694	699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400440
12	NC_009635	GTT	2	6	714	719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150400440
13	NC_009635	TAA	2	6	798	803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400440
14	NC_009635	ATT	2	6	840	845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400440
15	NC_009635	TGT	2	6	932	937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150400440
16	NC_009635	ATT	2	6	957	962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400440
17	NC_009635	TAA	2	6	1073	1078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400440
18	NC_009635	ATA	2	6	1169	1174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400440
19	NC_009635	CAA	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150400440
20	NC_009635	ATT	2	6	1200	1205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400440
21	NC_009635	ATT	3	9	1227	1235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400440
22	NC_009635	ATT	2	6	1311	1316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400440
23	NC_009635	ATT	2	6	1354	1359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400440
24	NC_009635	CCA	2	6	1447	1452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_009635	ATA	2	6	1489	1494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400441
26	NC_009635	ATA	2	6	1504	1509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400441
27	NC_009635	TTG	3	9	1552	1560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150400441
28	NC_009635	GAA	2	6	1579	1584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150400441
29	NC_009635	ATG	2	6	1705	1710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400441
30	NC_009635	AGA	2	6	1775	1780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150400441
31	NC_009635	AGA	2	6	1865	1870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150400441
32	NC_009635	ATT	2	6	1885	1890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400441
33	NC_009635	ATA	3	9	1897	1905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400441
34	NC_009635	AAT	2	6	2078	2083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400441
35	NC_009635	ATT	2	6	2217	2222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400441
36	NC_009635	ATA	2	6	2223	2228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400441
37	NC_009635	TAT	2	6	2365	2370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400441
38	NC_009635	TAA	2	6	2386	2391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400441
39	NC_009635	ATT	2	6	2444	2449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400441
40	NC_009635	TAA	3	9	2491	2499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400441
41	NC_009635	ATA	2	6	2526	2531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400441
42	NC_009635	CAG	2	6	2542	2547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150400441
43	NC_009635	TAT	2	6	2548	2553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400441
44	NC_009635	ATA	2	6	2582	2587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009635	ATT	2	6	2592	2597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009635	TAT	2	6	2658	2663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009635	ATG	2	6	2691	2696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400442
48	NC_009635	GAA	2	6	2699	2704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150400442
49	NC_009635	GAG	2	6	2723	2728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150400442
50	NC_009635	TGA	2	6	2779	2784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400442
51	NC_009635	GAA	2	6	2870	2875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150400442
52	NC_009635	GAC	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150400442
53	NC_009635	TAT	2	6	2885	2890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400442
54	NC_009635	GAA	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150400442
55	NC_009635	ACA	3	9	2930	2938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150400442
56	NC_009635	ATA	2	6	2961	2966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400442
57	NC_009635	GAT	2	6	3131	3136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400442
58	NC_009635	GAA	2	6	3152	3157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150400442
59	NC_009635	TTA	2	6	3161	3166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400442
60	NC_009635	ACT	2	6	3188	3193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400442
61	NC_009635	GAT	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400442
62	NC_009635	TAT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400442
63	NC_009635	CTA	2	6	3387	3392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400442
64	NC_009635	ATT	2	6	3463	3468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400442
65	NC_009635	AAT	2	6	3530	3535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400442
66	NC_009635	AAT	2	6	3568	3573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400442
67	NC_009635	TAT	2	6	3577	3582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400442
68	NC_009635	ATA	2	6	3622	3627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400442
69	NC_009635	AGT	2	6	3638	3643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009635	ATA	2	6	3644	3649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009635	TGG	2	6	3692	3697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009635	ATA	2	6	3714	3719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400443
73	NC_009635	AAT	2	6	3792	3797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400443
74	NC_009635	TGG	2	6	3882	3887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150400443
75	NC_009635	ATG	2	6	3919	3924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400443
76	NC_009635	AAT	2	6	4067	4072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009635	CTT	2	6	4310	4315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150400444
78	NC_009635	TAA	2	6	4317	4322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400444
79	NC_009635	CAA	2	6	4334	4339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150400444
80	NC_009635	CTA	2	6	4391	4396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400444
81	NC_009635	TCT	2	6	4438	4443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150400444
82	NC_009635	AAT	2	6	4471	4476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400444
83	NC_009635	GTT	2	6	4595	4600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150400444
84	NC_009635	TAT	2	6	4737	4742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400444
85	NC_009635	TTC	2	6	4755	4760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150400444
86	NC_009635	TAA	2	6	4917	4922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400444
87	NC_009635	TCC	2	6	4930	4935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150400444
88	NC_009635	ATA	2	6	4950	4955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400444
89	NC_009635	TCT	2	6	5059	5064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150400444
90	NC_009635	CTT	2	6	5162	5167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150400444
91	NC_009635	TCA	2	6	5398	5403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400444
92	NC_009635	TCA	2	6	5437	5442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400444
93	NC_009635	CTG	2	6	5459	5464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150400444
94	NC_009635	TCC	2	6	5560	5565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150400444
95	NC_009635	AAT	2	6	5672	5677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400444
96	NC_009635	CAC	2	6	5729	5734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_009635	TCA	2	6	5856	5861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400445
98	NC_009635	TCC	2	6	5871	5876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150400445
99	NC_009635	AAT	2	6	5877	5882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400445
100	NC_009635	ATT	2	6	5892	5897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400445
101	NC_009635	CCT	2	6	5901	5906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150400445
102	NC_009635	CTG	2	6	5911	5916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150400445
103	NC_009635	TAT	2	6	6043	6048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400445
104	NC_009635	TAA	2	6	6172	6177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400445
105	NC_009635	CAG	2	6	6511	6516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150400445
106	NC_009635	TCC	2	6	6533	6538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150400445
107	NC_009635	TTC	2	6	6659	6664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150400445
108	NC_009635	CAG	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150400445
109	NC_009635	TAA	2	6	6742	6747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400445
110	NC_009635	ACT	2	6	6888	6893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400445
111	NC_009635	ATA	2	6	6929	6934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400445
112	NC_009635	CAT	2	6	6946	6951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400445
113	NC_009635	AAT	2	6	6953	6958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400445
114	NC_009635	TCA	2	6	6975	6980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400445
115	NC_009635	ATT	2	6	7113	7118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400445
116	NC_009635	ATT	2	6	7300	7305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400446
117	NC_009635	TCA	2	6	7347	7352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400446
118	NC_009635	TAT	2	6	7353	7358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400446
119	NC_009635	CTT	2	6	7428	7433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150400446
120	NC_009635	ATA	2	6	7441	7446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400446
121	NC_009635	CTA	2	6	7682	7687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400446
122	NC_009635	AAT	2	6	7832	7837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400446
123	NC_009635	TGA	2	6	7874	7879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400446
124	NC_009635	CAA	2	6	7890	7895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150400446
125	NC_009635	AAT	2	6	7901	7906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400446
126	NC_009635	ATA	2	6	8057	8062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400446
127	NC_009635	TCT	2	6	8069	8074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150400446
128	NC_009635	TTG	2	6	8120	8125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150400446
129	NC_009635	TTC	2	6	8248	8253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150400446
130	NC_009635	TTG	2	6	8543	8548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150400446
131	NC_009635	ACC	2	6	8555	8560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150400446
132	NC_009635	TAA	3	9	8694	8702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400446
133	NC_009635	CAT	2	6	8703	8708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400446
134	NC_009635	ATA	2	6	8810	8815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400446
135	NC_009635	TCC	2	6	8816	8821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_009635	GTG	2	6	9110	9115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009635	AAT	2	6	9206	9211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400447
138	NC_009635	GGA	2	6	9216	9221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150400447
139	NC_009635	ATA	2	6	9282	9287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400447
140	NC_009635	ATT	2	6	9383	9388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400447
141	NC_009635	TAA	2	6	9625	9630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400447
142	NC_009635	GAA	2	6	9720	9725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150400447
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152	NC_009635	GGT	2	6	10372	10377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009635	ATA	2	6	10387	10392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400448
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156	NC_009635	AAT	2	6	10604	10609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_009635	TAA	2	6	10659	10664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_009635	TAT	3	9	10736	10744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_009635	GAT	2	6	10848	10853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400449
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165	NC_009635	TAA	2	6	11212	11217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400449
166	NC_009635	GTG	2	6	11278	11283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150400449
167	NC_009635	AGT	2	6	11298	11303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400449
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185	NC_009635	ATT	2	6	12563	12568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400449
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188	NC_009635	ATA	2	6	12749	12754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_009635	TAA	2	6	12922	12927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400450
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223	NC_009635	TAT	2	6	15481	15486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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232	NC_009635	TAT	2	6	16129	16134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_009635	ATA	2	6	16165	16170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_009635	CAT	2	6	17378	17383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400453
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252	NC_009635	TTA	2	6	17495	17500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_009635	CTG	2	6	17510	17515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_009635	TTA	2	6	17530	17535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_009635	TTA	2	6	17546	17551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_009635	AAT	2	6	17600	17605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400454
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258	NC_009635	TTC	2	6	17687	17692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150400454
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260	NC_009635	CCA	2	6	17820	17825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150400454
261	NC_009635	TTC	2	6	17876	17881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150400454
262	NC_009635	TTG	2	6	17928	17933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150400454
263	NC_009635	CTA	2	6	17965	17970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400454
264	NC_009635	TTC	2	6	18047	18052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150400454
265	NC_009635	CTG	2	6	18055	18060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150400454
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267	NC_009635	ATT	2	6	18081	18086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400454
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269	NC_009635	CTT	2	6	18321	18326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_009635	ATT	2	6	18401	18406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400455
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286	NC_009635	TAT	2	6	19338	19343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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374	NC_009635	TAA	2	6	25007	25012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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