MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Methanococcus vannielii SB chromosome

Total Repeats: 922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009634	GGCCTT	2	12	1523	1534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009634	GATTTG	2	12	5870	5881	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150398762
3	NC_009634	AAGCAA	2	12	5900	5911	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	150398762
4	NC_009634	AATAAA	2	12	8297	8308	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009634	ATTTAC	2	12	8652	8663	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150398766
6	NC_009634	TTAAAA	2	12	8897	8908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150398766
7	NC_009634	ATATTT	2	12	12895	12906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009634	GAAATT	2	12	14356	14367	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150398775
9	NC_009634	AAAATG	2	12	14400	14411	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150398775
10	NC_009634	ATTTTA	2	12	15649	15660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150398777
11	NC_009634	TTGAAA	2	12	15923	15934	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150398777
12	NC_009634	TATTTA	2	12	16404	16415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009634	CAACTG	2	12	20569	20580	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150398783
14	NC_009634	ATTCAA	2	12	23703	23714	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150398787
15	NC_009634	ATGTCT	2	12	24888	24899	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150398788
16	NC_009634	TCGCTT	2	12	25882	25893	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	150398788
17	NC_009634	CAAGGT	2	12	26066	26077	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150398788
18	NC_009634	AAATTT	2	12	26303	26314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009634	AAAATT	2	12	32374	32385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009634	AATTAA	2	12	34258	34269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150398796
21	NC_009634	CATTAT	2	12	35691	35702	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150398798
22	NC_009634	ATTCAG	2	12	40201	40212	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150398802
23	NC_009634	AATTGG	2	12	41849	41860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150398804
24	NC_009634	ATATTA	2	12	44429	44440	50 %	50 %	0 %	0 %	150398806
25	NC_009634	TTATTT	2	12	49580	49591	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009634	ATGGGG	2	12	53220	53231	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	150398813
27	NC_009634	TAATTA	2	12	54966	54977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009634	TTTATT	2	12	56613	56624	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	150398816
29	NC_009634	TTTGAT	2	12	58048	58059	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150398818
30	NC_009634	ATTTTT	2	12	60962	60973	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	150398820
31	NC_009634	TCATTT	2	12	63580	63591	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150398823
32	NC_009634	TTTAAA	2	12	63601	63612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009634	TTTCAG	2	12	67328	67339	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150398827
34	NC_009634	TCTTTC	2	12	68260	68271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150398827
35	NC_009634	TCGTAT	2	12	70541	70552	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150398829
36	NC_009634	TCTTTT	2	12	70664	70675	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	150398829
37	NC_009634	ATTGCA	2	12	70865	70876	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150398829
38	NC_009634	TGTAAA	2	12	73901	73912	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150398832
39	NC_009634	TGGTGA	2	12	73979	73990	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	150398832
40	NC_009634	TTTCTT	2	12	76707	76718	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	150398836
41	NC_009634	TTACAA	2	12	76853	76864	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150398836
42	NC_009634	AAGAAC	2	12	77614	77625	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	150398838
43	NC_009634	GGCTCA	2	12	78297	78308	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150398838
44	NC_009634	AAATAA	2	12	78890	78901	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150398838
45	NC_009634	AATTGA	2	12	79121	79132	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150398838
46	NC_009634	AAACAA	2	12	79875	79886	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	150398839
47	NC_009634	ATTTTT	2	12	80065	80076	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	150398839
48	NC_009634	AGAATT	2	12	80269	80280	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150398839
49	NC_009634	AGAAAA	2	12	84351	84362	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150398841
50	NC_009634	TAAAGA	2	12	84465	84476	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150398841
51	NC_009634	AATTAC	2	12	85197	85208	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150398842
52	NC_009634	TGAAAT	2	12	85245	85256	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150398842
53	NC_009634	TAAAAA	2	12	88624	88635	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150398844
54	NC_009634	ATTTAC	2	12	88681	88692	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150398844
55	NC_009634	TTAAAA	2	12	90893	90904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150398846
56	NC_009634	ATTTTG	2	12	93003	93014	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150398846
57	NC_009634	AACATT	2	12	97351	97362	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_009634	AATTAT	2	12	97532	97543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009634	TAGAAA	2	12	98563	98574	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150398850
60	NC_009634	TCTAAA	2	12	99846	99857	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150398850
61	NC_009634	AAAAAT	2	12	102035	102046	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150398851
62	NC_009634	AAAAAG	2	12	102728	102739	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150398852
63	NC_009634	TCAATC	2	12	104375	104386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150398853
64	NC_009634	GCTCTT	2	12	104613	104624	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	150398853
65	NC_009634	TCTAAG	2	12	105327	105338	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009634	TTTGAA	2	12	106058	106069	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150398854
67	NC_009634	AGTTTA	2	12	107904	107915	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150398855
68	NC_009634	TAAAAA	2	12	109247	109258	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009634	AAATTT	2	12	116083	116094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009634	GAATTT	2	12	117211	117222	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150398863
71	NC_009634	TGAAAA	2	12	121437	121448	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150398868
72	NC_009634	TTGAAT	2	12	121961	121972	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150398868
73	NC_009634	TTTTAA	2	12	124957	124968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150398871
74	NC_009634	TTTTTA	2	12	125074	125085	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	150398871
75	NC_009634	TACGGA	2	12	126339	126350	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150398872
76	NC_009634	GTATAA	2	12	131446	131457	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009634	TATGAA	2	12	131626	131637	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150398877
78	NC_009634	CAAAAC	2	12	132878	132889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150398879
79	NC_009634	TTTTTA	2	12	134827	134838	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	150398881
80	NC_009634	AATTAT	2	12	138257	138268	50 %	50 %	0 %	0 %	150398883
81	NC_009634	AATTGG	2	12	142042	142053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150398884
82	NC_009634	TTCCAG	2	12	146956	146967	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150398888
83	NC_009634	TTTCAT	2	12	147940	147951	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150398888
84	NC_009634	TACATT	2	12	150628	150639	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150398891
85	NC_009634	CTGAAG	2	12	151263	151274	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150398891
86	NC_009634	ATGGAT	2	12	155463	155474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150398893
87	NC_009634	ACTGCA	2	12	156414	156425	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150398893
88	NC_009634	AATTGA	2	12	156907	156918	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150398894
89	NC_009634	TGGAAT	2	12	157276	157287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150398895
90	NC_009634	GTTTAA	2	12	157471	157482	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150398895
91	NC_009634	CAAATA	2	12	161013	161024	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150398897
92	NC_009634	TTTTCA	2	12	161987	161998	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150398898
93	NC_009634	AATGTA	2	12	162182	162193	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150398898
94	NC_009634	TTAATT	2	12	166022	166033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150398901
95	NC_009634	TATTTT	2	12	167252	167263	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009634	TGCAAA	2	12	167901	167912	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150398903
97	NC_009634	CAACAT	2	12	169705	169716	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150398905
98	NC_009634	TATGCA	2	12	172612	172623	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150398908
99	NC_009634	TAGTAA	2	12	173529	173540	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150398908
100	NC_009634	TAAAAT	2	12	174438	174449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150398908
101	NC_009634	TGAAAA	2	12	174987	174998	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150398908
102	NC_009634	ATAAAT	2	12	175890	175901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150398909
103	NC_009634	TTGAAA	2	12	176272	176283	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150398909
104	NC_009634	ATTCAA	2	12	176788	176799	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150398910
105	NC_009634	GAAGCA	2	12	176886	176897	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	150398910
106	NC_009634	TGAAAT	2	12	177350	177361	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150398910
107	NC_009634	ATTTAA	2	12	178198	178209	50 %	50 %	0 %	0 %	150398910
108	NC_009634	ACTGGA	2	12	178684	178695	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150398911
109	NC_009634	GATAAT	2	12	179034	179045	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150398911
110	NC_009634	AATTGA	2	12	179313	179324	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150398911
111	NC_009634	TTTAAA	2	12	181863	181874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009634	TAACTG	2	12	185575	185586	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150398914
113	NC_009634	AAAAGA	2	12	185765	185776	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150398914
114	NC_009634	AAATGT	2	12	185838	185849	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150398914
115	NC_009634	TATAAC	2	12	187094	187105	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150398916
116	NC_009634	TAAATT	2	12	189030	189041	50 %	50 %	0 %	0 %	150398918
117	NC_009634	ATTTTT	2	12	191607	191618	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009634	GTTTTC	2	12	193079	193090	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	150398921
119	NC_009634	TCCAAT	2	12	200352	200363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150398925
120	NC_009634	CATTTA	2	12	201119	201130	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150398926
121	NC_009634	AAAAAC	2	12	202143	202154	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_009634	TTAAGT	2	12	206230	206241	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150398929
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229	NC_009634	ACAGAA	2	12	391637	391648	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	150399095
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240	NC_009634	AAGCAA	2	12	416486	416497	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	150399113
241	NC_009634	CACCTT	2	12	418174	418185	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	150399116
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343	NC_009634	TTGAAA	2	12	641209	641220	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150399339
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351	NC_009634	AATTTA	2	12	654652	654663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
352	NC_009634	ATTAAA	2	12	654668	654679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
353	NC_009634	CGTTTC	2	12	656520	656531	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	150399353
354	NC_009634	TAAAAA	2	12	656560	656571	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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