MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanococcus vannielii SB chromosome

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009634	GGCCTT	2	12	1523	1534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009634	AATAAA	2	12	8297	8308	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009634	ATATTT	2	12	12895	12906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009634	TATTTA	2	12	16404	16415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009634	AAATTT	2	12	26303	26314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009634	AAAATT	2	12	32374	32385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009634	TTATTT	2	12	49580	49591	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009634	TAATTA	2	12	54966	54977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009634	TTTAAA	2	12	63601	63612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009634	AACATT	2	12	97351	97362	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009634	AATTAT	2	12	97532	97543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009634	TCTAAG	2	12	105327	105338	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009634	TAAAAA	2	12	109247	109258	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009634	AAATTT	2	12	116083	116094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009634	GTATAA	2	12	131446	131457	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009634	TATTTT	2	12	167252	167263	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009634	TTTAAA	2	12	181863	181874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009634	ATTTTT	2	12	191607	191618	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009634	AAAAAC	2	12	202143	202154	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_009634	TATAAA	2	12	208276	208287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009634	TTTAAA	2	12	208329	208340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009634	AATTAA	2	12	212452	212463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009634	AAAATT	2	12	216117	216128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009634	AAAAAG	2	12	241633	241644	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009634	TTTTAT	2	12	243853	243864	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009634	TATTTT	2	12	245965	245976	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009634	TTAAAA	2	12	246862	246873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009634	CTTAAT	3	18	248181	248198	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009634	TACTGC	2	12	263896	263907	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009634	TACTGC	2	12	269402	269413	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009634	TAAAAA	2	12	284869	284880	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009634	TAATAT	2	12	288017	288028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009634	TTTATT	2	12	299299	299310	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009634	ACATGA	2	12	311907	311918	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_009634	TTCGCT	2	12	319583	319594	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009634	AATTTA	2	12	331091	331102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009634	TATTTT	2	12	339258	339269	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009634	ATTTTT	2	12	372644	372655	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009634	TAAAAA	2	12	388106	388117	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009634	ATTTTA	2	12	390041	390052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009634	AGTATT	2	12	405362	405373	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009634	AATTAA	2	12	430920	430931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009634	ATTTTA	2	12	456562	456573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009634	TAAAAA	2	12	469020	469031	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009634	TAAATT	2	12	469970	469981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009634	ATTTTT	2	12	495314	495325	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009634	TTTTAA	2	12	497350	497361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009634	CCAAAG	2	12	507597	507608	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009634	CTTTTT	2	12	512243	512254	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_009634	AAATAC	2	12	519985	519996	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_009634	ATTTTT	4	24	543436	543459	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009634	ATTTTT	2	12	544771	544782	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009634	TTTCTT	2	12	563882	563893	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009634	AATTAA	2	12	563901	563912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009634	GTTTTA	2	12	563994	564005	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009634	TTTTAG	2	12	581408	581419	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009634	TAGATA	2	12	587600	587611	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009634	ATTTTT	2	12	616798	616809	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009634	AAAATA	2	12	623669	623680	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009634	AAAATT	2	12	639876	639887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009634	AATTTA	2	12	654652	654663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009634	ATTAAA	2	12	654668	654679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009634	TAAAAA	2	12	656560	656571	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009634	AAGAAT	2	12	685976	685987	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009634	AATTTA	2	12	699369	699380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009634	AGTAAA	2	12	709523	709534	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009634	TATTTA	2	12	742910	742921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009634	TTTTAA	2	12	754030	754041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009634	ATAAAT	2	12	787891	787902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009634	ATTTTA	2	12	811317	811328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009634	TTAAAA	2	12	813375	813386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009634	AATTTA	2	12	891257	891268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009634	TAAAAA	2	12	909133	909144	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009634	TTTAAG	2	12	913876	913887	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009634	TTAAAA	2	12	928984	928995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009634	TATAAA	2	12	933230	933241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009634	ATTTTT	2	12	938295	938306	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009634	CAATTC	2	12	957281	957292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009634	GCAGGG	2	12	975201	975212	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_009634	TAAAAA	2	12	1016747	1016758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009634	AAGGCC	2	12	1041758	1041769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009634	TATTTT	2	12	1045735	1045746	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009634	TACTTT	2	12	1049531	1049542	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_009634	ATTATA	2	12	1049772	1049783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009634	TATAAA	2	12	1060430	1060441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009634	ATTTTT	2	12	1060750	1060761	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009634	TATAAA	2	12	1065835	1065846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009634	ATTTTT	2	12	1066155	1066166	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009634	TATAAA	2	12	1071240	1071251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009634	ATTTTT	2	12	1071560	1071571	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009634	TATAAA	2	12	1076645	1076656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009634	ATTTTT	2	12	1076965	1076976	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009634	TAAATT	2	12	1102756	1102767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009634	AAAAAT	2	12	1117427	1117438	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009634	TTTAAA	2	12	1125136	1125147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009634	ATTTTT	2	12	1154217	1154228	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009634	TGCAGA	2	12	1155680	1155691	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_009634	TAAAAT	2	12	1163837	1163848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009634	TCAAAG	2	12	1168254	1168265	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_009634	GGAATT	2	12	1169043	1169054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009634	TTCAAA	2	12	1171580	1171591	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_009634	TTTTCT	2	12	1189153	1189164	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_009634	TAAATT	2	12	1196080	1196091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009634	TTAATT	2	12	1206322	1206333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009634	GGCCTT	2	12	1214967	1214978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009634	GGGAAA	2	12	1216753	1216764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009634	TTTAAA	2	12	1222293	1222304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009634	TATAAG	2	12	1226296	1226307	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009634	GGCCTT	2	12	1246753	1246764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009634	TTTAAA	2	12	1256767	1256778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009634	TTTATA	2	12	1264889	1264900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009634	GCATTT	2	12	1266880	1266891	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_009634	TTTTAA	2	12	1268290	1268301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009634	TTTCAT	2	12	1276243	1276254	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_009634	AATTTA	2	12	1321682	1321693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009634	ATTTTT	2	12	1321776	1321787	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009634	TTTTAG	2	12	1321866	1321877	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009634	TTTATT	2	12	1332787	1332798	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009634	TTATTT	2	12	1332805	1332816	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009634	AAAAAG	2	12	1333978	1333989	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009634	TTTTGT	2	12	1349096	1349107	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009634	AATTTA	2	12	1358148	1358159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009634	AATTAA	2	12	1366845	1366856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009634	TTTTAA	2	12	1375918	1375929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009634	CTTTTT	2	12	1402189	1402200	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_009634	TAAATT	2	12	1402217	1402228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009634	AAAATT	2	12	1404761	1404772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009634	TAATCA	2	12	1409292	1409303	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_009634	ATAAAA	2	12	1414328	1414339	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009634	TTTTTA	2	12	1432163	1432174	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009634	ATTTTA	2	12	1435045	1435056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009634	TTTATT	2	12	1437146	1437157	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009634	ATTTTA	2	12	1438860	1438871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009634	AATTTT	2	12	1438874	1438885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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137	NC_009634	TAGTAA	2	12	1461601	1461612	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.