MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanococcus vannielii SB chromosome

Total Repeats: 386

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009634	TTAAC	2	10	251	260	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009634	TGGCT	2	10	1798	1807	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009634	AGGCG	2	10	1848	1857	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009634	TTTAA	2	10	4777	4786	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009634	ATCCC	2	10	4826	4835	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_009634	TATAA	2	10	8166	8175	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009634	ACTAT	2	10	11480	11489	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009634	TAAAC	3	15	14431	14445	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009634	TAAAA	2	10	16720	16729	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009634	AATTT	2	10	17196	17205	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009634	TGATT	2	10	21127	21136	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009634	AAACT	2	10	22486	22495	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009634	TAATT	2	10	26446	26455	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009634	TTCCT	2	10	26541	26550	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009634	TTATT	2	10	29769	29778	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009634	TTTTA	2	10	31008	31017	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009634	TAATA	2	10	33721	33730	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009634	TAAAA	2	10	40301	40310	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009634	TATAA	2	10	43981	43990	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009634	ATTAT	2	10	47533	47542	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009634	ATTTT	2	10	47677	47686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009634	TAAAA	2	10	56756	56765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009634	TATTT	2	10	62841	62850	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009634	ATAAA	2	10	64602	64611	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009634	ATATA	2	10	72964	72973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009634	AGAAA	2	10	76991	77000	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009634	TTAAA	2	10	84905	84914	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009634	CTTTT	2	10	95172	95181	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009634	AGAAA	2	10	96698	96707	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009634	TTAAT	2	10	105372	105381	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009634	TATTT	2	10	106994	107003	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009634	CTTTT	2	10	108351	108360	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009634	ATTTA	2	10	108686	108695	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009634	TTTTG	2	10	111054	111063	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009634	ATTAA	2	10	114930	114939	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009634	TTCAA	2	10	115569	115578	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009634	TGCAT	2	10	115598	115607	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009634	TAATT	2	10	127123	127132	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009634	AAAAT	2	10	127403	127412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009634	ATTTA	2	10	134359	134368	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009634	AATTT	2	10	160696	160705	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009634	AAATA	2	10	161397	161406	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009634	TTTTA	4	20	161502	161521	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009634	TAAGT	2	10	169898	169907	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009634	AAAAT	2	10	181467	181476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009634	AAATC	2	10	186650	186659	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009634	ATAAA	2	10	187595	187604	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009634	TATTT	2	10	188201	188210	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009634	ATATA	2	10	190117	190126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009634	AATTT	2	10	190729	190738	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009634	ATTAT	2	10	197925	197934	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009634	TAAAA	6	30	198723	198752	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009634	TTATA	2	10	202078	202087	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009634	ATATA	2	10	202306	202315	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009634	TAAAT	2	10	235321	235330	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009634	TTTTA	2	10	240705	240714	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009634	ATTTT	2	10	240844	240853	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009634	TATTT	2	10	243287	243296	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009634	ATTTA	2	10	243528	243537	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009634	TATTT	2	10	248380	248389	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009634	AGATT	2	10	260169	260178	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009634	ACAAA	2	10	260522	260531	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009634	CAAAA	2	10	261804	261813	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009634	TATGC	2	10	263378	263387	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009634	GTGTT	2	10	265088	265097	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009634	TACTT	2	10	266972	266981	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009634	GGTAT	2	10	267508	267517	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009634	ATATT	2	10	269541	269550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009634	TAAAT	2	10	270294	270303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009634	TAAAA	2	10	278616	278625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009634	ATAAC	2	10	293925	293934	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_009634	TAATT	2	10	298176	298185	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009634	AAACT	2	10	302571	302580	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009634	ATTAA	2	10	302669	302678	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009634	CATGT	2	10	315272	315281	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009634	AACAA	2	10	316125	316134	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009634	GTATA	2	10	317904	317913	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009634	AACTT	2	10	319090	319099	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009634	TGACA	2	10	320463	320472	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_009634	TAAAA	2	10	321275	321284	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009634	AACAA	2	10	322991	323000	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009634	TTCTT	2	10	323993	324002	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009634	ATACA	2	10	331359	331368	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009634	TAAAT	4	20	334535	334554	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009634	ATTTA	2	10	340291	340300	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009634	ATATT	2	10	341237	341246	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009634	TAAAA	7	35	347597	347631	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009634	TAAAA	2	10	350489	350498	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009634	AATTA	2	10	353528	353537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009634	ATAAA	2	10	368487	368496	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009634	TTAAG	2	10	374925	374934	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009634	ATTTA	2	10	382784	382793	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009634	GTTTA	2	10	388070	388079	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009634	TTTAA	2	10	388997	389006	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009634	TAAAT	2	10	389038	389047	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009634	TCAAA	2	10	396199	396208	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_009634	TTAAA	2	10	397531	397540	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009634	TAAAA	2	10	403478	403487	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009634	AATAA	2	10	411504	411513	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009634	TTAAA	2	10	411554	411563	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009634	CATTA	2	10	415747	415756	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_009634	GGTTT	2	10	427886	427895	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009634	TAAAA	2	10	428978	428987	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009634	ATATA	2	10	432442	432451	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009634	ACCTT	2	10	434162	434171	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_009634	ATATA	2	10	443984	443993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009634	AAATA	2	10	446251	446260	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009634	AAAAT	2	10	456478	456487	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009634	GATTT	2	10	457240	457249	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009634	ATATA	2	10	471111	471120	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009634	TAAAT	2	10	472655	472664	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009634	GAAAT	2	10	475219	475228	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009634	ATTTT	2	10	475293	475302	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009634	TATTT	4	20	475303	475322	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009634	AATTA	2	10	476339	476348	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009634	TTTAA	2	10	480508	480517	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009634	AAATT	2	10	481759	481768	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009634	TTTTA	2	10	486976	486985	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009634	AAAAT	2	10	492750	492759	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009634	TAATT	2	10	492976	492985	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009634	TTTTA	2	10	493001	493010	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009634	ATAGA	2	10	495360	495369	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009634	ATTTA	2	10	495406	495415	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009634	TAAAA	2	10	497301	497310	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009634	TAATT	2	10	512179	512188	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009634	TTTAA	3	15	519907	519921	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009634	AAAAT	2	10	533940	533949	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009634	TTTAT	3	15	539505	539519	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009634	TTTAT	3	15	539525	539539	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009634	TTATT	4	20	540747	540766	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009634	ATGAT	2	10	540842	540851	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009634	AATTT	2	10	544727	544736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009634	AATAT	2	10	553705	553714	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009634	AAATC	2	10	553783	553792	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_009634	AAATT	2	10	561039	561048	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009634	AAGTA	2	10	565722	565731	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009634	AAATT	2	10	568226	568235	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009634	AAATA	2	10	568251	568260	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009634	TATTT	2	10	568358	568367	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009634	TAAAT	2	10	570484	570493	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009634	TAAAA	2	10	574569	574578	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009634	AATTT	2	10	581377	581386	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009634	TTAAA	2	10	581387	581396	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009634	TAAAA	2	10	583794	583803	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009634	TTAAA	2	10	583806	583815	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009634	TTAAA	2	10	587292	587301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009634	TAAAA	2	10	587627	587636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009634	TTAAA	2	10	589672	589681	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009634	TAAAT	2	10	591436	591445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_009634	ATTTT	2	10	1699822	1699831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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384	NC_009634	TTTAA	2	10	1707224	1707233	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.