MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 13768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009633	TTTA	2	8	494	501	25 %	75 %	0 %	0 %	150387854
2	NC_009633	AATG	2	8	532	539	50 %	25 %	25 %	0 %	150387854
3	NC_009633	AATT	2	8	615	622	50 %	50 %	0 %	0 %	150387854
4	NC_009633	AAAG	2	8	716	723	75 %	0 %	25 %	0 %	150387854
5	NC_009633	ATGC	2	8	1301	1308	25 %	25 %	25 %	25 %	150387854
6	NC_009633	TTTA	2	8	1587	1594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009633	GAGG	2	8	1611	1618	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009633	AGGA	2	8	1816	1823	50 %	0 %	50 %	0 %	150387855
9	NC_009633	AATT	2	8	2317	2324	50 %	50 %	0 %	0 %	150387855
10	NC_009633	ATTA	2	8	2349	2356	50 %	50 %	0 %	0 %	150387855
11	NC_009633	AAGG	2	8	2448	2455	50 %	0 %	50 %	0 %	150387855
12	NC_009633	GTTT	2	8	2631	2638	0 %	75 %	25 %	0 %	150387855
13	NC_009633	TAAA	2	8	3071	3078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009633	AAAC	2	8	3597	3604	75 %	0 %	0 %	25 %	150387857
15	NC_009633	TTAT	2	8	4533	4540	25 %	75 %	0 %	0 %	150387858
16	NC_009633	AATT	2	8	4614	4621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009633	ATTT	2	8	5381	5388	25 %	75 %	0 %	0 %	150387859
18	NC_009633	TAAT	2	8	5535	5542	50 %	50 %	0 %	0 %	150387859
19	NC_009633	GAAA	2	8	5569	5576	75 %	0 %	25 %	0 %	150387859
20	NC_009633	TAGA	2	8	6033	6040	50 %	25 %	25 %	0 %	150387859
21	NC_009633	CTTT	2	8	6192	6199	0 %	75 %	0 %	25 %	150387859
22	NC_009633	ATAG	2	8	7146	7153	50 %	25 %	25 %	0 %	150387860
23	NC_009633	TGAA	2	8	7354	7361	50 %	25 %	25 %	0 %	150387860
24	NC_009633	AGCA	2	8	7828	7835	50 %	0 %	25 %	25 %	150387860
25	NC_009633	TAAC	2	8	9199	9206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009633	TAAT	2	8	9228	9235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009633	TAAT	2	8	9278	9285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009633	GAAG	2	8	9428	9435	50 %	0 %	50 %	0 %	150387861
29	NC_009633	ATTG	2	8	9477	9484	25 %	50 %	25 %	0 %	150387861
30	NC_009633	ATGA	2	8	9691	9698	50 %	25 %	25 %	0 %	150387862
31	NC_009633	CAAA	2	8	9731	9738	75 %	0 %	0 %	25 %	150387862
32	NC_009633	TTAA	2	8	9985	9992	50 %	50 %	0 %	0 %	150387862
33	NC_009633	AGGG	2	8	10001	10008	25 %	0 %	75 %	0 %	150387862
34	NC_009633	GATG	2	8	10035	10042	25 %	25 %	50 %	0 %	150387862
35	NC_009633	TAAA	2	8	10288	10295	75 %	25 %	0 %	0 %	150387863
36	NC_009633	AATT	2	8	10672	10679	50 %	50 %	0 %	0 %	150387863
37	NC_009633	AATG	2	8	10811	10818	50 %	25 %	25 %	0 %	150387863
38	NC_009633	ACAG	2	8	10992	10999	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009633	CAAG	2	8	11159	11166	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009633	ACCT	2	8	11462	11469	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009633	GCTA	2	8	13040	13047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009633	GACT	2	8	13051	13058	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009633	TAAA	2	8	13086	13093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009633	AGAA	2	8	13427	13434	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009633	GTTG	2	8	14696	14703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009633	GGTG	2	8	14864	14871	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009633	ATTG	2	8	16497	16504	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009633	CAAT	2	8	16529	16536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009633	TTTA	2	8	16909	16916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009633	AAAC	2	8	16927	16934	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009633	GTTT	2	8	16947	16954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009633	TATT	2	8	17206	17213	25 %	75 %	0 %	0 %	150387865
53	NC_009633	AAAC	2	8	17551	17558	75 %	0 %	0 %	25 %	150387866
54	NC_009633	GAAA	2	8	18119	18126	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009633	CAAT	2	8	18556	18563	50 %	25 %	0 %	25 %	150387867
56	NC_009633	TTTA	2	8	19260	19267	25 %	75 %	0 %	0 %	150387868
57	NC_009633	ATGA	2	8	19366	19373	50 %	25 %	25 %	0 %	150387868
58	NC_009633	AAAT	2	8	19875	19882	75 %	25 %	0 %	0 %	150387868
59	NC_009633	TTTA	2	8	20201	20208	25 %	75 %	0 %	0 %	150387868
60	NC_009633	CTTT	2	8	20324	20331	0 %	75 %	0 %	25 %	150387868
61	NC_009633	TCCA	2	8	20411	20418	25 %	25 %	0 %	50 %	150387868
62	NC_009633	CAGC	2	8	20910	20917	25 %	0 %	25 %	50 %	150387869
63	NC_009633	TGAT	2	8	21412	21419	25 %	50 %	25 %	0 %	150387869
64	NC_009633	GTTT	2	8	21650	21657	0 %	75 %	25 %	0 %	150387869
65	NC_009633	TGAT	2	8	21718	21725	25 %	50 %	25 %	0 %	150387869
66	NC_009633	CACC	2	8	21735	21742	25 %	0 %	0 %	75 %	150387869
67	NC_009633	CAAG	2	8	22214	22221	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009633	ACCT	2	8	22517	22524	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009633	GCTA	2	8	24095	24102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009633	GACT	2	8	24106	24113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009633	TAAA	2	8	24141	24148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009633	AGAA	2	8	24486	24493	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009633	GTTG	2	8	25755	25762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009633	GGTG	2	8	25923	25930	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009633	AATC	2	8	27310	27317	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009633	CTAA	2	8	27323	27330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009633	TGAT	2	8	28115	28122	25 %	50 %	25 %	0 %	150387870
78	NC_009633	GAAA	2	8	28329	28336	75 %	0 %	25 %	0 %	150387870
79	NC_009633	TTTA	2	8	28595	28602	25 %	75 %	0 %	0 %	150387870
80	NC_009633	TAAA	2	8	28749	28756	75 %	25 %	0 %	0 %	150387870
81	NC_009633	AGTA	2	8	29198	29205	50 %	25 %	25 %	0 %	150387871
82	NC_009633	ATTC	2	8	29447	29454	25 %	50 %	0 %	25 %	150387871
83	NC_009633	TTTA	2	8	29659	29666	25 %	75 %	0 %	0 %	150387871
84	NC_009633	ATTC	2	8	29690	29697	25 %	50 %	0 %	25 %	150387871
85	NC_009633	TTAA	2	8	30009	30016	50 %	50 %	0 %	0 %	150387871
86	NC_009633	AAAC	2	8	30093	30100	75 %	0 %	0 %	25 %	150387871
87	NC_009633	GTAT	2	8	30110	30117	25 %	50 %	25 %	0 %	150387871
88	NC_009633	AATC	2	8	30224	30231	50 %	25 %	0 %	25 %	150387871
89	NC_009633	ATAA	2	8	30315	30322	75 %	25 %	0 %	0 %	150387871
90	NC_009633	AGTT	2	8	30530	30537	25 %	50 %	25 %	0 %	150387872
91	NC_009633	AGCT	2	8	31278	31285	25 %	25 %	25 %	25 %	150387873
92	NC_009633	GATC	2	8	31471	31478	25 %	25 %	25 %	25 %	150387873
93	NC_009633	TTAA	2	8	31709	31716	50 %	50 %	0 %	0 %	150387873
94	NC_009633	TGGT	2	8	32391	32398	0 %	50 %	50 %	0 %	150387874
95	NC_009633	TTTC	2	8	32975	32982	0 %	75 %	0 %	25 %	150387875
96	NC_009633	GTTT	2	8	33217	33224	0 %	75 %	25 %	0 %	150387875
97	NC_009633	ATCA	2	8	34172	34179	50 %	25 %	0 %	25 %	150387875
98	NC_009633	GAAT	2	8	34551	34558	50 %	25 %	25 %	0 %	150387875
99	NC_009633	CATT	2	8	34569	34576	25 %	50 %	0 %	25 %	150387875
100	NC_009633	CATA	2	8	34593	34600	50 %	25 %	0 %	25 %	150387875
101	NC_009633	ATTT	2	8	34809	34816	25 %	75 %	0 %	0 %	150387875
102	NC_009633	TCAG	2	8	34885	34892	25 %	25 %	25 %	25 %	150387875
103	NC_009633	TTAA	2	8	36030	36037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009633	AAAG	2	8	36077	36084	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009633	GGTG	2	8	36287	36294	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009633	TGAA	2	8	36343	36350	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009633	TAGC	2	8	36402	36409	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009633	AAAG	2	8	36712	36719	75 %	0 %	25 %	0 %	150387877
109	NC_009633	GTTC	2	8	37657	37664	0 %	50 %	25 %	25 %	150387877
110	NC_009633	AAAG	2	8	37883	37890	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009633	GCAT	2	8	38010	38017	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009633	TTTA	2	8	38782	38789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009633	AACT	2	8	38819	38826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009633	AATC	2	8	39281	39288	50 %	25 %	0 %	25 %	150387879
115	NC_009633	GGAA	2	8	39749	39756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009633	AAGA	2	8	39905	39912	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009633	ATTA	2	8	39973	39980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009633	TTTG	2	8	40053	40060	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009633	AAGC	2	8	40255	40262	50 %	0 %	25 %	25 %	150387880
120	NC_009633	AAGA	2	8	40388	40395	75 %	0 %	25 %	0 %	150387880
121	NC_009633	AGTT	2	8	40998	41005	25 %	50 %	25 %	0 %	150387881
122	NC_009633	AGTA	2	8	41149	41156	50 %	25 %	25 %	0 %	150387882
123	NC_009633	TTAA	2	8	41252	41259	50 %	50 %	0 %	0 %	150387882
124	NC_009633	TTAT	2	8	43048	43055	25 %	75 %	0 %	0 %	150387884
125	NC_009633	TTGG	2	8	43096	43103	0 %	50 %	50 %	0 %	150387884
126	NC_009633	CAAG	2	8	43145	43152	50 %	0 %	25 %	25 %	150387884
127	NC_009633	TACA	2	8	43162	43169	50 %	25 %	0 %	25 %	150387884
128	NC_009633	TAAA	2	8	43192	43199	75 %	25 %	0 %	0 %	150387884
129	NC_009633	CTTT	2	8	43429	43436	0 %	75 %	0 %	25 %	150387884
130	NC_009633	ATGA	2	8	43944	43951	50 %	25 %	25 %	0 %	150387885
131	NC_009633	AAGC	2	8	44373	44380	50 %	0 %	25 %	25 %	150387886
132	NC_009633	AAAG	2	8	44744	44751	75 %	0 %	25 %	0 %	150387887
133	NC_009633	ATCA	2	8	44950	44957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009633	CTTT	2	8	45062	45069	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009633	CTAG	2	8	45089	45096	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009633	AGGA	2	8	45263	45270	50 %	0 %	50 %	0 %	150387888
137	NC_009633	AGTT	2	8	45272	45279	25 %	50 %	25 %	0 %	150387888
138	NC_009633	AATG	2	8	45303	45310	50 %	25 %	25 %	0 %	150387888
139	NC_009633	ATTA	2	8	45666	45673	50 %	50 %	0 %	0 %	150387888
140	NC_009633	GATG	2	8	45885	45892	25 %	25 %	50 %	0 %	150387888
141	NC_009633	AAAG	2	8	46523	46530	75 %	0 %	25 %	0 %	150387889
142	NC_009633	AATT	2	8	46573	46580	50 %	50 %	0 %	0 %	150387889
143	NC_009633	GATT	2	8	46642	46649	25 %	50 %	25 %	0 %	150387889
144	NC_009633	CTAT	2	8	47361	47368	25 %	50 %	0 %	25 %	150387890
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