MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 1567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009632	GTTGAA	2	12	3315	3326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392482
2	NC_009632	ATAAAT	2	12	3416	3427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009632	TTTAAA	2	12	3593	3604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009632	GTTATC	2	12	7421	7432	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150392486
5	NC_009632	CAGATA	2	12	8330	8341	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150392486
6	NC_009632	CAAGCT	2	12	8389	8400	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150392486
7	NC_009632	GTAATG	2	12	9377	9388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392486
8	NC_009632	AGATGA	2	12	9780	9791	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150392486
9	NC_009632	ACAATT	2	12	11383	11394	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150392488
10	NC_009632	TAGCAT	2	12	11478	11489	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150392488
11	NC_009632	TAAATC	2	12	17296	17307	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009632	GCTTTA	2	12	17574	17585	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150392493
13	NC_009632	TTTGAA	2	12	18395	18406	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150392493
14	NC_009632	TTGGTG	2	12	19239	19250	0 %	50 %	50 %	0 %	150392494
15	NC_009632	TAAAGG	2	12	20442	20453	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150392495
16	NC_009632	TTGAAG	2	12	20639	20650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392495
17	NC_009632	TGATTG	2	12	21843	21854	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150392496
18	NC_009632	TGAAAT	2	12	22174	22185	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150392496
19	NC_009632	AAGGAA	2	12	22612	22623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392497
20	NC_009632	TGAATT	2	12	25540	25551	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150392498
21	NC_009632	ATTTCA	2	12	28024	28035	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150392500
22	NC_009632	ATCAGC	2	12	31339	31350	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150392503
23	NC_009632	AAAAGA	2	12	33980	33991	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150392504
24	NC_009632	ACATCT	2	12	35634	35645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392505
25	NC_009632	GTTTAA	2	12	36777	36788	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150392506
26	NC_009632	AAAAAT	2	12	37471	37482	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009632	AATGAA	2	12	38707	38718	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150392508
28	NC_009632	ACAACT	2	12	40772	40783	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150392509
29	NC_009632	TTTTCT	2	12	51593	51604	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	150392519
30	NC_009632	AATTAA	2	12	51783	51794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392519
31	NC_009632	GGCATG	2	12	52414	52425	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	150392520
32	NC_009632	TAAAAA	2	12	53576	53587	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150392520
33	NC_009632	CATTAA	2	12	54212	54223	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150392521
34	NC_009632	ATTTTT	2	12	63862	63873	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009632	ATAAGA	2	12	66318	66329	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009632	AAATAA	2	12	67983	67994	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150392537
37	NC_009632	TTTAAT	2	12	79050	79061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392545
38	NC_009632	ACAAAT	2	12	81465	81476	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150392548
39	NC_009632	AATTAA	2	12	81556	81567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392548
40	NC_009632	ATTTAT	2	12	83977	83988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009632	TTAATG	2	12	84501	84512	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150392549
42	NC_009632	AAGTCA	2	12	85706	85717	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150392551
43	NC_009632	AAAAAG	2	12	85820	85831	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150392551
44	NC_009632	GAAAAA	2	12	86133	86144	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150392551
45	NC_009632	AATTAT	2	12	88372	88383	50 %	50 %	0 %	0 %	150392553
46	NC_009632	ACCCTT	2	12	90211	90222	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	150392555
47	NC_009632	TTTAGC	2	12	92120	92131	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150392558
48	NC_009632	AAATAA	2	12	92171	92182	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150392558
49	NC_009632	GTTAGA	2	12	94289	94300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009632	AAAAGA	2	12	94343	94354	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009632	GCTAAA	2	12	97131	97142	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150392560
52	NC_009632	AACAAA	2	12	97552	97563	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009632	TAAAGA	2	12	101279	101290	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150392565
54	NC_009632	AACCAC	2	12	105151	105162	50 %	0 %	0 %	50 %	150392567
55	NC_009632	AATATA	2	12	106853	106864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009632	AACCGA	2	12	108462	108473	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	150392570
57	NC_009632	ATAGAT	2	12	113362	113373	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150392573
58	NC_009632	TATCAT	2	12	114129	114140	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150392574
59	NC_009632	TTTATT	2	12	114537	114548	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	150392575
60	NC_009632	TATTTG	2	12	114623	114634	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150392575
61	NC_009632	TAAATA	2	12	116056	116067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392575
62	NC_009632	TTTTTC	2	12	117900	117911	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	150392576
63	NC_009632	TTAAAT	2	12	117995	118006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009632	TAACAA	2	12	119352	119363	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_009632	TAAGCC	2	12	119761	119772	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150392578
66	NC_009632	ATCGCA	2	12	120976	120987	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150392579
67	NC_009632	TTTGAA	2	12	122007	122018	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150392580
68	NC_009632	CAATGG	2	12	130965	130976	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150392586
69	NC_009632	TGAAGA	2	12	131799	131810	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150392587
70	NC_009632	TTTCAT	2	12	132480	132491	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150392588
71	NC_009632	TGTATA	2	12	136700	136711	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150392593
72	NC_009632	TCGAAA	2	12	138201	138212	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150392595
73	NC_009632	CTATTG	2	12	140787	140798	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150392597
74	NC_009632	CATATG	2	12	141990	142001	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150392598
75	NC_009632	AATGTA	2	12	142891	142902	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009632	CTGTAA	2	12	144712	144723	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_009632	GGTATG	2	12	145033	145044	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	150392601
78	NC_009632	CAGATT	2	12	147631	147642	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150392603
79	NC_009632	AGATAT	2	12	155009	155020	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150392610
80	NC_009632	GTTTTT	2	12	155918	155929	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009632	ATGCCT	2	12	156148	156159	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150392611
82	NC_009632	TGAAAG	2	12	156788	156799	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150392611
83	NC_009632	GATATG	2	12	164288	164299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392617
84	NC_009632	ATTTGA	2	12	168194	168205	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150392620
85	NC_009632	GATTTT	2	12	172705	172716	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150392625
86	NC_009632	ACAAAG	2	12	177225	177236	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	150392629
87	NC_009632	TGTAAT	2	12	178249	178260	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150392630
88	NC_009632	AAAGAT	2	12	179238	179249	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150392632
89	NC_009632	ATTAAT	2	12	181144	181155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009632	CAATAT	2	12	181710	181721	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150392633
91	NC_009632	TCCCAC	2	12	182402	182413	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009632	TTGGTA	2	12	185736	185747	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150392638
93	NC_009632	GCGATT	2	12	185756	185767	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150392638
94	NC_009632	AAATTT	2	12	185854	185865	50 %	50 %	0 %	0 %	150392638
95	NC_009632	ACCTGC	2	12	188757	188768	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	150392641
96	NC_009632	AAGATA	2	12	188903	188914	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150392641
97	NC_009632	CGTTAA	2	12	191837	191848	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150392643
98	NC_009632	CTATTA	2	12	193688	193699	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150392643
99	NC_009632	TATGAT	2	12	195222	195233	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150392643
100	NC_009632	TTGAAA	2	12	195674	195685	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150392643
101	NC_009632	AACATT	2	12	198114	198125	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150392643
102	NC_009632	AGCAAC	2	12	201603	201614	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	150392647
103	NC_009632	TGTTTG	2	12	201651	201662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392647
104	NC_009632	CACCTT	2	12	203655	203666	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	150392649
105	NC_009632	ACCTTT	2	12	204160	204171	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	150392649
106	NC_009632	TTTATA	2	12	204256	204267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009632	ATTAAT	2	12	204279	204290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009632	GTAAAT	2	12	207899	207910	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150392652
109	NC_009632	ATTTTA	2	12	209494	209505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392653
110	NC_009632	TATCTT	2	12	214108	214119	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150392656
111	NC_009632	ATTTGG	2	12	215121	215132	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150392657
112	NC_009632	GAGTTT	2	12	218464	218475	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150392659
113	NC_009632	TATACA	2	12	222464	222475	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150392663
114	NC_009632	TTATTT	2	12	224496	224507	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	150392665
115	NC_009632	ATTTAT	2	12	225075	225086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392665
116	NC_009632	TTTTTA	2	12	225106	225117	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009632	CCCTGA	2	12	227833	227844	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	150392670
118	NC_009632	TCCTGA	2	12	228652	228663	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150392670
119	NC_009632	TCAATT	2	12	230803	230814	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150392672
120	NC_009632	AATATG	2	12	232103	232114	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150392673
121	NC_009632	GATTTT	2	12	235259	235270	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009632	AAAAAT	2	12	235610	235621	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150392675
123	NC_009632	AGGACA	2	12	237470	237481	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	150392677
124	NC_009632	ACATTT	2	12	237806	237817	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150392677
125	NC_009632	TTCTTG	2	12	242735	242746	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	150392681
126	NC_009632	GGACGT	2	12	253237	253248	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	150392690
127	NC_009632	ATATGA	2	12	255974	255985	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009632	GGAATA	2	12	270835	270846	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009632	TGGTAT	2	12	282415	282426	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150392711
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131	NC_009632	ATATAG	2	12	292062	292073	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009632	ACGATG	2	12	292398	292409	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150392720
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134	NC_009632	ATAATT	2	12	298328	298339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009632	AGAATC	2	12	299956	299967	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150392725
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145	NC_009632	TCTTCA	2	12	318836	318847	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	150392745
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149	NC_009632	TAATTA	2	12	324686	324697	50 %	50 %	0 %	0 %	150392750
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153	NC_009632	TGAAGA	2	12	329015	329026	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150392752
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161	NC_009632	TAAAAA	2	12	361192	361203	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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190	NC_009632	GATGCT	2	12	428625	428636	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150392877
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219	NC_009632	ATATGA	2	12	483237	483248	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150392934
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223	NC_009632	TACAGT	2	12	487681	487692	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150392937
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228	NC_009632	AAAGGT	2	12	491217	491228	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150392940
229	NC_009632	TGTATA	2	12	492345	492356	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
230	NC_009632	GGACTT	2	12	493486	493497	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150392943
231	NC_009632	ATTTAT	2	12	495615	495626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_009632	CAAATA	2	12	500120	500131	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150392950
233	NC_009632	GATGAA	2	12	500815	500826	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150392950
234	NC_009632	TTTTGA	2	12	504148	504159	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150392955
235	NC_009632	TTTTTA	2	12	506201	506212	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
236	NC_009632	CGATTT	2	12	507822	507833	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150392958
237	NC_009632	ATGTTG	2	12	508110	508121	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150392958
238	NC_009632	GAGCAA	2	12	509483	509494	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	150392958
239	NC_009632	TAAAGA	2	12	510073	510084	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150392958
240	NC_009632	AAAATG	2	12	511634	511645	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
241	NC_009632	TGATAT	2	12	519307	519318	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150392968
242	NC_009632	TCATTA	2	12	520569	520580	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150392969
243	NC_009632	TTAACA	2	12	522035	522046	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150392971
244	NC_009632	AAGTGA	2	12	522338	522349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150392972
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248	NC_009632	ACGTTG	2	12	531998	532009	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
249	NC_009632	AAAATA	2	12	532720	532731	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_009632	GTTGGT	2	12	534074	534085	0 %	50 %	50 %	0 %	150392978
251	NC_009632	GCTATT	2	12	534146	534157	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150392978
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254	NC_009632	AAAATG	2	12	549404	549415	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150392987
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258	NC_009632	TTATAA	2	12	552065	552076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_009632	TTTATA	2	12	552982	552993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392991
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263	NC_009632	AAATTT	2	12	558824	558835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_009632	GCAAGA	2	12	563600	563611	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	150393004
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269	NC_009632	GAAACT	2	12	567666	567677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150393008
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290	NC_009632	TTATAA	2	12	619151	619162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_009632	GTTATA	2	12	619822	619833	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
292	NC_009632	ACGATG	2	12	623005	623016	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150393049
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312	NC_009632	GACTCA	2	12	647846	647857	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150393068
313	NC_009632	GACTCA	2	12	647876	647887	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150393068
314	NC_009632	GACTCA	2	12	647948	647959	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150393068
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345	NC_009632	TCAGAC	2	12	656120	656131	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150393070
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350	NC_009632	GACTCA	2	12	656333	656344	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150393070
351	NC_009632	GACTCA	2	12	656351	656362	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150393070
352	NC_009632	GACTCA	2	12	656369	656380	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150393070
353	NC_009632	GATTCA	2	12	656387	656398	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150393070
354	NC_009632	GACTCA	2	12	656459	656470	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150393070
355	NC_009632	GACTCA	2	12	656495	656506	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150393070
356	NC_009632	GACTCA	2	12	656513	656524	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150393070
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