MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009632	TGAAC	2	10	7099	7108	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009632	GTAGG	2	10	14532	14541	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009632	TCGAT	2	10	23944	23953	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009632	ATATT	2	10	24481	24490	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009632	TTTCA	2	10	34437	34446	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009632	TAAAA	2	10	35890	35899	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009632	AGATA	2	10	36048	36057	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009632	ATGAG	2	10	37345	37354	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009632	TTTAA	2	10	43431	43440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009632	AAAAT	2	10	43523	43532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009632	GAATT	2	10	44726	44735	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009632	TGGTG	2	10	45378	45387	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009632	ATATA	2	10	48278	48287	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009632	ATAAA	2	10	57084	57093	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009632	CTAGT	2	10	63826	63835	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009632	TAATA	2	10	66621	66630	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009632	TATAA	2	10	66750	66759	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009632	ATTTT	2	10	70794	70803	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009632	GTGAG	2	10	75160	75169	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009632	TTTTA	2	10	83171	83180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009632	GTGTT	2	10	88981	88990	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009632	ATTCA	2	10	91573	91582	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009632	CTAAA	2	10	93474	93483	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009632	CAAAA	2	10	93505	93514	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009632	GTAAT	2	10	113665	113674	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009632	ATTTT	2	10	135963	135972	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009632	CAAAA	2	10	180667	180676	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009632	TAAAG	2	10	181016	181025	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009632	TATCA	2	10	190985	190994	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009632	ATCAT	2	10	199117	199126	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009632	CAACT	2	10	211249	211258	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009632	TGTGA	2	10	215645	215654	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009632	GCTTT	2	10	215761	215770	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009632	TGATT	2	10	216107	216116	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009632	GAAAA	2	10	226754	226763	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009632	CTAAG	2	10	226919	226928	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009632	TAACA	2	10	227125	227134	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009632	AATAT	2	10	246320	246329	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009632	TATTT	2	10	252311	252320	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009632	AACAT	2	10	260654	260663	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009632	GATAA	2	10	264591	264600	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009632	ATAAC	2	10	269238	269247	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_009632	TGAAT	2	10	269349	269358	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009632	ATTAA	2	10	269490	269499	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009632	TTCAT	2	10	272551	272560	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_009632	AAAGT	2	10	273234	273243	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009632	TAAAA	2	10	274947	274956	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009632	AAATT	2	10	276263	276272	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009632	TAAAA	2	10	290409	290418	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009632	GAAAA	2	10	298199	298208	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009632	ATAAA	2	10	298317	298326	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009632	TCATA	2	10	306669	306678	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009632	ATTTA	2	10	320592	320601	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009632	TAAAT	2	10	351894	351903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009632	ATTTT	2	10	357451	357460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009632	GAAAG	2	10	366614	366623	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009632	TTTAA	2	10	397649	397658	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009632	ATAGA	2	10	406801	406810	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009632	TGACA	2	10	406993	407002	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009632	GATAA	2	10	419298	419307	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009632	ATTAA	2	10	424720	424729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009632	TATCA	2	10	434040	434049	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009632	AGAAT	2	10	455408	455417	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009632	TAAGG	2	10	455472	455481	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009632	ATTGT	2	10	456691	456700	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009632	TAAAT	2	10	462930	462939	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009632	AGATA	2	10	463033	463042	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009632	ACAGT	2	10	465504	465513	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009632	CATAA	2	10	475988	475997	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009632	TAAAA	2	10	476212	476221	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009632	AATAT	2	10	478357	478366	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009632	AAAGT	2	10	489153	489162	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009632	AAATT	2	10	492332	492341	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009632	TAAAG	2	10	503333	503342	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009632	CTCAC	2	10	505238	505247	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
76	NC_009632	CAAAG	2	10	505263	505272	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009632	CTTAA	2	10	522889	522898	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009632	TGGTG	2	10	540708	540717	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009632	CAACT	2	10	541279	541288	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_009632	GGTAA	2	10	541753	541762	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009632	TCGTG	2	10	542572	542581	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009632	GATTG	2	10	544906	544915	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009632	GATTT	2	10	549837	549846	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009632	ATATA	2	10	552255	552264	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009632	CAAAG	2	10	558803	558812	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_009632	TTGAT	2	10	561964	561973	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009632	AGACA	2	10	575946	575955	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009632	AAGTA	2	10	578381	578390	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009632	TTAAA	2	10	580504	580513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009632	GATAA	2	10	580543	580552	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009632	GGTAA	2	10	586072	586081	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009632	TCGTG	2	10	586891	586900	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_009632	GATTG	2	10	589197	589206	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009632	GGTAA	2	10	591284	591293	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009632	TCGTG	2	10	592103	592112	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_009632	GATTG	2	10	594375	594384	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009632	ATATA	2	10	600989	600998	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009632	AAAAT	2	10	605764	605773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009632	TTTAT	2	10	605873	605882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009632	TTATG	2	10	608879	608888	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009632	ATTTA	2	10	609024	609033	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009632	ACAAT	2	10	610829	610838	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_009632	TGAAT	2	10	615296	615305	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009632	GTATA	2	10	615353	615362	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009632	TATAA	2	10	619069	619078	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009632	GTTTA	2	10	635239	635248	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009632	TAAAG	2	10	639433	639442	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009632	GAAGC	2	10	640789	640798	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_009632	ATATT	2	10	645569	645578	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009632	TTAAC	2	10	648517	648526	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_009632	AATTT	2	10	648602	648611	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009632	ATAAA	2	10	656818	656827	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009632	TTATA	2	10	671196	671205	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009632	CACAT	2	10	671592	671601	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_009632	ATGAT	2	10	680615	680624	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009632	TAATT	2	10	684102	684111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009632	TAAAT	2	10	693503	693512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009632	AAATT	2	10	695507	695516	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009632	TAAAA	2	10	702402	702411	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009632	ATTAA	2	10	704590	704599	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009632	TTATT	2	10	704639	704648	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009632	CAATA	2	10	704705	704714	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009632	TTAAT	2	10	707332	707341	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009632	AAATA	2	10	709597	709606	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009632	ATTTT	2	10	709619	709628	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009632	ATAAA	2	10	716311	716320	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009632	TTTTA	2	10	720170	720179	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009632	AAAGG	2	10	720491	720500	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009632	ATATA	2	10	723728	723737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009632	AAACT	2	10	727253	727262	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009632	TTCAC	2	10	732466	732475	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_009632	GGTTG	2	10	743447	743456	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009632	AGTAG	2	10	753156	753165	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009632	AAGTT	2	10	755125	755134	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009632	AATTG	2	10	755157	755166	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009632	AAACT	2	10	757032	757041	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009632	ATTTA	2	10	757423	757432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009632	AAAGT	2	10	759671	759680	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009632	AATTT	2	10	762280	762289	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009632	CATGA	2	10	764440	764449	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_009632	TGTTT	2	10	767753	767762	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009632	ATCAT	2	10	768823	768832	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_009632	AATTT	2	10	773715	773724	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009632	AATTA	2	10	780517	780526	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009632	ATTTA	2	10	784698	784707	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009632	AAAGT	2	10	784791	784800	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009632	TAAAG	2	10	786630	786639	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009632	ATTTT	2	10	797182	797191	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_009632	TTAAA	2	10	2186612	2186621	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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490	NC_009632	TATTT	2	10	2300229	2300238	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_009632	TTACC	2	10	2335215	2335224	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
500	NC_009632	TTTAT	2	10	2338782	2338791	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

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