MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 9116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009632	ATTT	2	8	468	475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009632	AAGA	2	8	621	628	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009632	GGTT	2	8	1111	1118	0 %	50 %	50 %	0 %	150392481
4	NC_009632	ATGC	2	8	1136	1143	25 %	25 %	25 %	25 %	150392481
5	NC_009632	TCAT	2	8	1905	1912	25 %	50 %	0 %	25 %	150392481
6	NC_009632	TAAT	2	8	2274	2281	50 %	50 %	0 %	0 %	150392482
7	NC_009632	ATTA	2	8	2594	2601	50 %	50 %	0 %	0 %	150392482
8	NC_009632	GACT	2	8	2816	2823	25 %	25 %	25 %	25 %	150392482
9	NC_009632	TAAA	2	8	2911	2918	75 %	25 %	0 %	0 %	150392482
10	NC_009632	TTTA	2	8	2972	2979	25 %	75 %	0 %	0 %	150392482
11	NC_009632	TTCA	2	8	3260	3267	25 %	50 %	0 %	25 %	150392482
12	NC_009632	GATG	2	8	3281	3288	25 %	25 %	50 %	0 %	150392482
13	NC_009632	AATT	2	8	3385	3392	50 %	50 %	0 %	0 %	150392482
14	NC_009632	ATTA	2	8	3441	3448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009632	AAAT	2	8	3498	3505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009632	AATT	2	8	3697	3704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009632	ATTA	2	8	3916	3923	50 %	50 %	0 %	0 %	150392483
18	NC_009632	TTCT	2	8	4006	4013	0 %	75 %	0 %	25 %	150392483
19	NC_009632	TCAT	2	8	4017	4024	25 %	50 %	0 %	25 %	150392483
20	NC_009632	GTAT	2	8	5255	5262	25 %	50 %	25 %	0 %	150392485
21	NC_009632	TATC	2	8	6158	6165	25 %	50 %	0 %	25 %	150392485
22	NC_009632	TAGA	2	8	6563	6570	50 %	25 %	25 %	0 %	150392485
23	NC_009632	TGGA	2	8	6689	6696	25 %	25 %	50 %	0 %	150392485
24	NC_009632	AATG	2	8	6912	6919	50 %	25 %	25 %	0 %	150392485
25	NC_009632	TCAA	2	8	7143	7150	50 %	25 %	0 %	25 %	150392486
26	NC_009632	ATGG	2	8	7465	7472	25 %	25 %	50 %	0 %	150392486
27	NC_009632	GGTA	2	8	7656	7663	25 %	25 %	50 %	0 %	150392486
28	NC_009632	TAAG	2	8	7721	7728	50 %	25 %	25 %	0 %	150392486
29	NC_009632	TCGT	2	8	7967	7974	0 %	50 %	25 %	25 %	150392486
30	NC_009632	ACAA	2	8	8093	8100	75 %	0 %	0 %	25 %	150392486
31	NC_009632	TTAG	2	8	8530	8537	25 %	50 %	25 %	0 %	150392486
32	NC_009632	GTCA	2	8	8764	8771	25 %	25 %	25 %	25 %	150392486
33	NC_009632	AATA	2	8	9030	9037	75 %	25 %	0 %	0 %	150392486
34	NC_009632	TGTA	2	8	9390	9397	25 %	50 %	25 %	0 %	150392486
35	NC_009632	TGAT	2	8	9689	9696	25 %	50 %	25 %	0 %	150392486
36	NC_009632	CATA	2	8	9948	9955	50 %	25 %	0 %	25 %	150392487
37	NC_009632	GTCA	2	8	10429	10436	25 %	25 %	25 %	25 %	150392487
38	NC_009632	AATG	2	8	11935	11942	50 %	25 %	25 %	0 %	150392488
39	NC_009632	CCAT	2	8	12443	12450	25 %	25 %	0 %	50 %	150392488
40	NC_009632	CAAT	2	8	12506	12513	50 %	25 %	0 %	25 %	150392488
41	NC_009632	CTAC	2	8	12701	12708	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009632	ACGT	2	8	12865	12872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009632	ATTA	2	8	13036	13043	50 %	50 %	0 %	0 %	150392489
44	NC_009632	ATTT	2	8	13566	13573	25 %	75 %	0 %	0 %	150392489
45	NC_009632	GCAA	2	8	13907	13914	50 %	0 %	25 %	25 %	150392489
46	NC_009632	TAAA	2	8	14197	14204	75 %	25 %	0 %	0 %	150392489
47	NC_009632	TAAA	2	8	14670	14677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009632	ATTT	2	8	15269	15276	25 %	75 %	0 %	0 %	150392490
49	NC_009632	GCAA	2	8	16642	16649	50 %	0 %	25 %	25 %	150392492
50	NC_009632	AAGG	2	8	16775	16782	50 %	0 %	50 %	0 %	150392492
51	NC_009632	GTAA	2	8	17199	17206	50 %	25 %	25 %	0 %	150392492
52	NC_009632	AAAG	2	8	17784	17791	75 %	0 %	25 %	0 %	150392493
53	NC_009632	AAAG	2	8	17799	17806	75 %	0 %	25 %	0 %	150392493
54	NC_009632	TTAA	2	8	18048	18055	50 %	50 %	0 %	0 %	150392493
55	NC_009632	TAGA	2	8	18831	18838	50 %	25 %	25 %	0 %	150392494
56	NC_009632	ACAA	2	8	18937	18944	75 %	0 %	0 %	25 %	150392494
57	NC_009632	ATGA	2	8	19019	19026	50 %	25 %	25 %	0 %	150392494
58	NC_009632	TAAA	2	8	19743	19750	75 %	25 %	0 %	0 %	150392494
59	NC_009632	CAAC	2	8	19877	19884	50 %	0 %	0 %	50 %	150392494
60	NC_009632	AATT	2	8	20076	20083	50 %	50 %	0 %	0 %	150392494
61	NC_009632	AGTA	2	8	20691	20698	50 %	25 %	25 %	0 %	150392495
62	NC_009632	ATTC	2	8	20776	20783	25 %	50 %	0 %	25 %	150392495
63	NC_009632	GTCT	2	8	20947	20954	0 %	50 %	25 %	25 %	150392496
64	NC_009632	TGAA	2	8	21132	21139	50 %	25 %	25 %	0 %	150392496
65	NC_009632	GCAT	2	8	21226	21233	25 %	25 %	25 %	25 %	150392496
66	NC_009632	GATT	2	8	21243	21250	25 %	50 %	25 %	0 %	150392496
67	NC_009632	GGTA	2	8	21733	21740	25 %	25 %	50 %	0 %	150392496
68	NC_009632	GGTT	2	8	23490	23497	0 %	50 %	50 %	0 %	150392497
69	NC_009632	AACA	2	8	23824	23831	75 %	0 %	0 %	25 %	150392497
70	NC_009632	TTTG	2	8	23928	23935	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009632	ATCT	2	8	24263	24270	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009632	GCCT	2	8	24391	24398	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009632	ATTT	2	8	24723	24730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009632	GTAC	2	8	25640	25647	25 %	25 %	25 %	25 %	150392498
75	NC_009632	AATC	2	8	26107	26114	50 %	25 %	0 %	25 %	150392499
76	NC_009632	ATCT	2	8	27541	27548	25 %	50 %	0 %	25 %	150392499
77	NC_009632	ACAA	2	8	28200	28207	75 %	0 %	0 %	25 %	150392500
78	NC_009632	AATG	2	8	28304	28311	50 %	25 %	25 %	0 %	150392500
79	NC_009632	TCGT	2	8	28336	28343	0 %	50 %	25 %	25 %	150392500
80	NC_009632	AACA	2	8	28781	28788	75 %	0 %	0 %	25 %	150392500
81	NC_009632	AATT	2	8	29318	29325	50 %	50 %	0 %	0 %	150392501
82	NC_009632	CAAT	2	8	29433	29440	50 %	25 %	0 %	25 %	150392501
83	NC_009632	GATG	2	8	29441	29448	25 %	25 %	50 %	0 %	150392501
84	NC_009632	TACT	2	8	29663	29670	25 %	50 %	0 %	25 %	150392501
85	NC_009632	GGCA	2	8	30362	30369	25 %	0 %	50 %	25 %	150392502
86	NC_009632	AAAG	2	8	30375	30382	75 %	0 %	25 %	0 %	150392502
87	NC_009632	GAAC	2	8	30819	30826	50 %	0 %	25 %	25 %	150392502
88	NC_009632	ATCA	2	8	31064	31071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009632	CAAC	2	8	31329	31336	50 %	0 %	0 %	50 %	150392503
90	NC_009632	TACA	2	8	31584	31591	50 %	25 %	0 %	25 %	150392503
91	NC_009632	AATG	2	8	31759	31766	50 %	25 %	25 %	0 %	150392503
92	NC_009632	GACT	2	8	32557	32564	25 %	25 %	25 %	25 %	150392503
93	NC_009632	TAAA	2	8	32853	32860	75 %	25 %	0 %	0 %	150392503
94	NC_009632	ATGA	2	8	32912	32919	50 %	25 %	25 %	0 %	150392503
95	NC_009632	CAAG	2	8	33279	33286	50 %	0 %	25 %	25 %	150392503
96	NC_009632	AAGC	2	8	33864	33871	50 %	0 %	25 %	25 %	150392504
97	NC_009632	TTCT	2	8	34516	34523	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009632	ATAA	2	8	34554	34561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009632	ATTA	2	8	34646	34653	50 %	50 %	0 %	0 %	150392505
100	NC_009632	GGAT	2	8	34862	34869	25 %	25 %	50 %	0 %	150392505
101	NC_009632	AATA	2	8	35010	35017	75 %	25 %	0 %	0 %	150392505
102	NC_009632	TGAA	2	8	35146	35153	50 %	25 %	25 %	0 %	150392505
103	NC_009632	AAGA	2	8	35508	35515	75 %	0 %	25 %	0 %	150392505
104	NC_009632	TAAA	2	8	35931	35938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009632	ATTT	2	8	36373	36380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009632	AAAT	2	8	36476	36483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009632	TCTT	2	8	36702	36709	0 %	75 %	0 %	25 %	150392506
108	NC_009632	ATGT	2	8	36936	36943	25 %	50 %	25 %	0 %	150392506
109	NC_009632	TTAA	2	8	37463	37470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009632	TCAT	2	8	37640	37647	25 %	50 %	0 %	25 %	150392507
111	NC_009632	AAAC	2	8	38148	38155	75 %	0 %	0 %	25 %	150392507
112	NC_009632	AAGA	2	8	38321	38328	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009632	GCAT	2	8	38501	38508	25 %	25 %	25 %	25 %	150392508
114	NC_009632	TAGC	2	8	38888	38895	25 %	25 %	25 %	25 %	150392509
115	NC_009632	TTTA	2	8	39076	39083	25 %	75 %	0 %	0 %	150392509
116	NC_009632	TTTG	2	8	39301	39308	0 %	75 %	25 %	0 %	150392509
117	NC_009632	CATA	2	8	39699	39706	50 %	25 %	0 %	25 %	150392509
118	NC_009632	TAGT	2	8	39837	39844	25 %	50 %	25 %	0 %	150392509
119	NC_009632	ATGT	2	8	39882	39889	25 %	50 %	25 %	0 %	150392509
120	NC_009632	GTTT	2	8	40507	40514	0 %	75 %	25 %	0 %	150392509
121	NC_009632	ATGA	2	8	41494	41501	50 %	25 %	25 %	0 %	150392510
122	NC_009632	ATAA	2	8	41752	41759	75 %	25 %	0 %	0 %	150392510
123	NC_009632	TGTA	2	8	41877	41884	25 %	50 %	25 %	0 %	150392510
124	NC_009632	ATTT	2	8	42100	42107	25 %	75 %	0 %	0 %	150392510
125	NC_009632	AAAC	2	8	42258	42265	75 %	0 %	0 %	25 %	150392510
126	NC_009632	GAAT	2	8	42348	42355	50 %	25 %	25 %	0 %	150392510
127	NC_009632	ATGG	2	8	42536	42543	25 %	25 %	50 %	0 %	150392510
128	NC_009632	CAAA	2	8	43242	43249	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009632	AATT	2	8	44347	44354	50 %	50 %	0 %	0 %	150392512
130	NC_009632	TAAA	2	8	44407	44414	75 %	25 %	0 %	0 %	150392512
131	NC_009632	TTTG	2	8	45069	45076	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009632	AATT	2	8	45110	45117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009632	AATT	2	8	45158	45165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009632	ACCA	2	8	45190	45197	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009632	TGGT	2	8	45326	45333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009632	ATTT	2	8	45353	45360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009632	GCTG	2	8	45390	45397	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009632	CTAC	2	8	45651	45658	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009632	AGTA	2	8	45725	45732	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009632	TGTT	2	8	45827	45834	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009632	ATTT	2	8	45898	45905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009632	ATAA	2	8	46148	46155	75 %	25 %	0 %	0 %	150392513
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144	NC_009632	CTTT	2	8	46446	46453	0 %	75 %	0 %	25 %	150392513
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