MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 1934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009632	ATTT	2	8	468	475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009632	AAGA	2	8	621	628	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009632	ATTA	2	8	3441	3448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009632	AAAT	2	8	3498	3505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009632	AATT	2	8	3697	3704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009632	CTAC	2	8	12701	12708	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009632	ACGT	2	8	12865	12872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009632	TAAA	2	8	14670	14677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009632	TTTG	2	8	23928	23935	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009632	ATCT	2	8	24263	24270	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009632	GCCT	2	8	24391	24398	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009632	ATTT	2	8	24723	24730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009632	ATCA	2	8	31064	31071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009632	TTCT	2	8	34516	34523	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009632	ATAA	2	8	34554	34561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009632	TAAA	2	8	35931	35938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009632	ATTT	2	8	36373	36380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009632	AAAT	2	8	36476	36483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009632	TTAA	2	8	37463	37470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009632	AAGA	2	8	38321	38328	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009632	CAAA	2	8	43242	43249	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009632	TTTG	2	8	45069	45076	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009632	AATT	2	8	45110	45117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009632	AATT	2	8	45158	45165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009632	ACCA	2	8	45190	45197	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009632	TGGT	2	8	45326	45333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009632	ATTT	2	8	45353	45360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009632	GCTG	2	8	45390	45397	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009632	CTAC	2	8	45651	45658	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009632	AGTA	2	8	45725	45732	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009632	TGTT	2	8	45827	45834	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009632	ATTT	2	8	45898	45905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009632	TTAT	2	8	48515	48522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009632	TTAC	2	8	49287	49294	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009632	TCAT	2	8	49604	49611	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009632	AATT	2	8	49682	49689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009632	TTAC	2	8	51435	51442	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009632	TTTA	2	8	54949	54956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009632	TTAT	3	12	56859	56870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009632	TCAT	2	8	60231	60238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009632	TTGA	2	8	60239	60246	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009632	TAAA	2	8	62645	62652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009632	AATT	2	8	65471	65478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009632	TCAA	2	8	65541	65548	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009632	TTAA	2	8	65549	65556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009632	ATAA	2	8	65917	65924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009632	AATA	2	8	66367	66374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009632	ATCA	2	8	67004	67011	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009632	GAAT	2	8	67152	67159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009632	AAAT	2	8	67194	67201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009632	GTTA	2	8	67243	67250	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009632	TTAA	2	8	75236	75243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009632	AGCT	2	8	75449	75456	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009632	AAAG	2	8	75545	75552	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009632	TATT	2	8	75599	75606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009632	ACGT	2	8	79281	79288	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009632	TTCA	2	8	80949	80956	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009632	ATAA	2	8	81155	81162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009632	ATAA	2	8	81165	81172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009632	ATCA	2	8	81290	81297	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009632	AACA	2	8	83217	83224	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009632	ATTG	2	8	83336	83343	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009632	CTTG	2	8	83496	83503	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009632	ATTT	2	8	83655	83662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009632	CATA	2	8	84043	84050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009632	AATA	2	8	92379	92386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009632	AGCA	2	8	92613	92620	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009632	AATT	2	8	92746	92753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009632	AAAG	2	8	93064	93071	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009632	CCAA	2	8	93183	93190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009632	TACT	2	8	93542	93549	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009632	AATT	2	8	94124	94131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009632	TTAA	2	8	94164	94171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009632	AAAG	2	8	94179	94186	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009632	ATTA	2	8	94358	94365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009632	TATT	2	8	94607	94614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009632	AATT	2	8	94645	94652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009632	TATG	2	8	94742	94749	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009632	TATT	2	8	94780	94787	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009632	CAAT	2	8	94991	94998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009632	AAGG	2	8	95268	95275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009632	AAGA	2	8	95550	95557	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009632	AAAG	2	8	95619	95626	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009632	AGCT	2	8	96202	96209	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009632	TAAT	2	8	96276	96283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009632	TAAT	2	8	96348	96355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009632	AGAA	2	8	96367	96374	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009632	TTGT	2	8	97486	97493	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009632	AATC	2	8	100876	100883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009632	ATAA	2	8	104125	104132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009632	ATAA	2	8	107205	107212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009632	CAAT	2	8	109077	109084	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009632	AGGG	2	8	112131	112138	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009632	AAAG	2	8	113713	113720	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009632	ATAA	2	8	114254	114261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009632	TATT	2	8	114292	114299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009632	AGTA	2	8	116234	116241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009632	TTGT	2	8	116377	116384	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009632	AAAT	2	8	118026	118033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009632	ATTG	2	8	119272	119279	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009632	GTTA	2	8	119394	119401	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009632	TAAA	2	8	134039	134046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009632	TAAA	2	8	134077	134084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009632	GAAA	2	8	134910	134917	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009632	ATAA	2	8	135728	135735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009632	TAAA	2	8	135975	135982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009632	AAAT	2	8	141887	141894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009632	ATTA	2	8	141921	141928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009632	ATTA	2	8	142760	142767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009632	TAAA	2	8	142784	142791	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009632	GAGC	2	8	143697	143704	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009632	TGAA	2	8	143760	143767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009632	ATAG	2	8	144671	144678	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009632	TAAA	2	8	146948	146955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009632	CTTT	2	8	151379	151386	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009632	CTTT	2	8	152636	152643	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009632	ATTT	2	8	152723	152730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009632	AAGA	2	8	154309	154316	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009632	GAGT	2	8	154332	154339	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009632	ACTT	2	8	155894	155901	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009632	ATTT	2	8	158232	158239	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009632	TATT	2	8	161076	161083	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009632	TAAT	2	8	161236	161243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009632	TAAA	2	8	175361	175368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009632	AATA	2	8	180585	180592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009632	GTTT	2	8	180865	180872	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009632	TAAC	2	8	180965	180972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009632	ATTT	2	8	181208	181215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009632	AAAT	2	8	182373	182380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009632	GTTT	2	8	182414	182421	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009632	TTTA	2	8	182653	182660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009632	GAGT	2	8	184404	184411	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009632	TCAT	2	8	189152	189159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009632	TTTG	2	8	189235	189242	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009632	ATTT	2	8	190601	190608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009632	ATTT	2	8	190613	190620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009632	ATGT	2	8	190844	190851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009632	TTAA	2	8	190965	190972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009632	AGTA	2	8	191007	191014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009632	ATCA	2	8	199151	199158	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_009632	TAAA	2	8	199876	199883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009632	ATGT	2	8	204413	204420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009632	TTAA	2	8	205893	205900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009632	AATA	2	8	205973	205980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009632	TGTA	2	8	210731	210738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009632	CTTA	2	8	210820	210827	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009632	TAAT	2	8	210846	210853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009632	TTTG	2	8	210936	210943	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009632	AAAG	2	8	211117	211124	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009632	AGTT	2	8	215616	215623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009632	CTTT	2	8	223361	223368	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_009632	ATTT	2	8	226859	226866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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