MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED03

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009622	CAATTT	2	12	222	233	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009622	GATTGC	2	12	2727	2738	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150378267
3	NC_009622	CACCTC	2	12	5660	5671	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009622	ATCGAT	2	12	6917	6928	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150378271
5	NC_009622	CCGCGA	2	12	15160	15171	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	150378279
6	NC_009622	GACCAT	2	12	17936	17947	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150378282
7	NC_009622	CGATCT	2	12	18218	18229	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150378282
8	NC_009622	CGCTCA	2	12	20597	20608	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	150378285
9	NC_009622	CTATCT	2	12	23603	23614	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	150378287
10	NC_009622	CTCGTC	2	12	24191	24202	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	150378288
11	NC_009622	CTCGCC	2	12	25237	25248	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	150378289
12	NC_009622	GAACAC	2	12	30424	30435	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	150378294
13	NC_009622	GAGCAC	2	12	31921	31932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009622	ATCGAC	2	12	39611	39622	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150378300
15	NC_009622	AAGCCA	2	12	39998	40009	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009622	CTATGC	2	12	45011	45022	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150378306
17	NC_009622	CGCGAC	2	12	46896	46907	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	150378306
18	NC_009622	GCTGGC	2	12	49206	49217	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	150378309
19	NC_009622	CGCAGC	2	12	50057	50068	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009622	TCGCCG	2	12	50172	50183	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009622	AGATCG	2	12	57725	57736	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150378314
22	NC_009622	GATCGA	2	12	59435	59446	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150378315
23	NC_009622	GGCGCC	2	12	60045	60056	0 %	0 %	50 %	50 %	150378316
24	NC_009622	TAGCGA	2	12	61892	61903	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150378318
25	NC_009622	CGCTGA	2	12	63352	63363	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150378319
26	NC_009622	AGGACC	2	12	87437	87448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378345
27	NC_009622	GGATCT	2	12	88536	88547	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009622	TCCGGA	2	12	93962	93973	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150378348
29	NC_009622	CACGGC	2	12	100817	100828	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	150378357
30	NC_009622	CCGATC	2	12	100846	100857	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	150378357
31	NC_009622	ATGGTT	2	12	105254	105265	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150378360
32	NC_009622	TTGCCG	2	12	111644	111655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009622	ACCGTG	2	12	112339	112350	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009622	GTCGCG	2	12	113972	113983	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	150378365
35	NC_009622	ATCCAG	2	12	121362	121373	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150378369
36	NC_009622	ATCCAG	2	12	124620	124631	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150378369
37	NC_009622	ATCGGC	2	12	143583	143594	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150378369
38	NC_009622	ATCCAG	2	12	147293	147304	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150378370
39	NC_009622	ATCCAG	2	12	150563	150574	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150378370
40	NC_009622	ATCCAG	2	12	153818	153829	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150378370
41	NC_009622	ATCCAG	2	12	157073	157084	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150378370
42	NC_009622	ATCCAG	2	12	160358	160369	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150378370
43	NC_009622	ATCCAG	2	12	163634	163645	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150378370
44	NC_009622	ATCCAG	2	12	166910	166921	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150378370
45	NC_009622	GCCACG	2	12	178248	178259	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009622	TCGATC	2	12	182719	182730	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150378384
47	NC_009622	AGTTCA	2	12	183184	183195	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150378384
48	NC_009622	CGCTCG	2	12	184693	184704	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	150378386
49	NC_009622	GTCGAC	2	12	187209	187220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009622	CTGGCA	2	12	189600	189611	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009622	CGTGCG	2	12	189696	189707	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009622	CCGGCG	2	12	189940	189951	0 %	0 %	50 %	50 %	150378391
53	NC_009622	GGTGCT	2	12	195414	195425	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	150378394
54	NC_009622	GAAGTC	2	12	208080	208091	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150378405
55	NC_009622	TTCACC	2	12	210777	210788	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	150378407
56	NC_009622	TCGTCA	2	12	211463	211474	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150378408
57	NC_009622	TCTGCC	2	12	215676	215687	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	150378410
58	NC_009622	TCTTCG	2	12	216813	216824	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	150378411

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.