MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED03

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009622	TCGGT	2	10	6040	6049	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009622	CAACC	2	10	13056	13065	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_009622	ATGGA	2	10	13959	13968	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009622	TCTAG	2	10	25472	25481	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009622	CGCTC	2	10	25907	25916	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_009622	GCAGC	3	15	26774	26788	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_009622	ATCGC	2	10	31390	31399	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009622	TCCGA	2	10	31527	31536	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009622	CGGGG	2	10	32014	32023	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009622	TATCT	2	10	32253	32262	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009622	CGTCG	2	10	37229	37238	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_009622	CGTTT	2	10	38756	38765	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009622	ATCCG	2	10	40529	40538	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_009622	GAGCG	2	10	43738	43747	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009622	TCCGA	2	10	55423	55432	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_009622	TGGCT	2	10	56524	56533	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009622	CGAAA	2	10	69683	69692	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009622	TTCGT	2	10	76867	76876	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009622	GACCG	2	10	78770	78779	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009622	AAGGG	2	10	78795	78804	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009622	CATCG	2	10	81822	81831	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_009622	ATGAC	2	10	82879	82888	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009622	CTGGA	2	10	82973	82982	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009622	CATCG	2	10	90079	90088	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_009622	ATGGC	2	10	90735	90744	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009622	ATGAC	2	10	94738	94747	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009622	CTCGC	2	10	99109	99118	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_009622	AGCCG	2	10	103563	103572	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_009622	GATCC	2	10	109328	109337	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_009622	CACCC	2	10	112982	112991	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
31	NC_009622	CGATG	2	10	177273	177282	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009622	AGCTA	2	10	182080	182089	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009622	GAGGC	2	10	186060	186069	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009622	AGGGG	2	10	188461	188470	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009622	AGGGG	2	10	188967	188976	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009622	TCCGT	2	10	191535	191544	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_009622	CGCAG	2	10	198120	198129	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_009622	TTGCA	2	10	217688	217697	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009622	CTTGT	2	10	217986	217995	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.