MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED03

Total Repeats: 2769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009622	TCG	2	6	315	320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378264
2	NC_009622	CAA	2	6	376	381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378264
3	NC_009622	AGC	2	6	464	469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378264
4	NC_009622	TTC	2	6	470	475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150378264
5	NC_009622	GGA	2	6	698	703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150378264
6	NC_009622	GGT	2	6	785	790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378264
7	NC_009622	CGC	2	6	836	841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378264
8	NC_009622	GGC	2	6	878	883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378264
9	NC_009622	GCA	2	6	908	913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378264
10	NC_009622	GCA	2	6	1497	1502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378265
11	NC_009622	AAG	2	6	1713	1718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378266
12	NC_009622	GCT	2	6	1733	1738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378266
13	NC_009622	CGG	2	6	1776	1781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378266
14	NC_009622	AAC	2	6	1869	1874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378266
15	NC_009622	GGA	2	6	1973	1978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150378266
16	NC_009622	CAA	2	6	1987	1992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378266
17	NC_009622	CGT	2	6	2068	2073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378266
18	NC_009622	GCT	2	6	2162	2167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378266
19	NC_009622	CGA	2	6	2278	2283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378266
20	NC_009622	AAC	2	6	2507	2512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378266
21	NC_009622	ATA	2	6	2529	2534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150378266
22	NC_009622	CGT	2	6	2598	2603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378266
23	NC_009622	GAC	2	6	2832	2837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378267
24	NC_009622	CAC	2	6	2923	2928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378267
25	NC_009622	ATG	2	6	2945	2950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378267
26	NC_009622	CGA	2	6	3137	3142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378267
27	NC_009622	CCT	2	6	3153	3158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150378267
28	NC_009622	GAA	2	6	3289	3294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378267
29	NC_009622	AAC	2	6	3320	3325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378267
30	NC_009622	TGG	2	6	3579	3584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378267
31	NC_009622	CAA	2	6	3585	3590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378267
32	NC_009622	AAG	2	6	3971	3976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378268
33	NC_009622	AAG	2	6	4146	4151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378268
34	NC_009622	TCG	2	6	4405	4410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378269
35	NC_009622	TCA	2	6	4421	4426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378269
36	NC_009622	TGC	2	6	4526	4531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378269
37	NC_009622	TGG	2	6	4614	4619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378269
38	NC_009622	CGA	2	6	4641	4646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378269
39	NC_009622	AGC	2	6	4775	4780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378269
40	NC_009622	GAA	2	6	4837	4842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378269
41	NC_009622	CGA	2	6	4998	5003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378269
42	NC_009622	GGC	2	6	5020	5025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378269
43	NC_009622	CGC	2	6	5131	5136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378269
44	NC_009622	CGT	2	6	5238	5243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378269
45	NC_009622	CGG	2	6	5244	5249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378269
46	NC_009622	ATG	2	6	6172	6177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378270
47	NC_009622	GAA	2	6	6178	6183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378270
48	NC_009622	GAC	2	6	6221	6226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378270
49	NC_009622	AAG	2	6	6346	6351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378270
50	NC_009622	AGG	2	6	6356	6361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150378270
51	NC_009622	GCC	2	6	6372	6377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378270
52	NC_009622	TTC	2	6	6395	6400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150378270
53	NC_009622	AGC	2	6	6421	6426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378270
54	NC_009622	CAG	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378270
55	NC_009622	CGA	2	6	6484	6489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378270
56	NC_009622	CGT	2	6	6767	6772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378271
57	NC_009622	TTC	2	6	6791	6796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150378271
58	NC_009622	CCG	2	6	6856	6861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378271
59	NC_009622	GGT	2	6	6871	6876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378271
60	NC_009622	GAC	2	6	6883	6888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378271
61	NC_009622	GGC	2	6	7074	7079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378272
62	NC_009622	TGC	2	6	7083	7088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378272
63	NC_009622	CGC	2	6	7095	7100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378272
64	NC_009622	GTC	2	6	7135	7140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378272
65	NC_009622	GGA	2	6	7146	7151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150378272
66	NC_009622	GCC	2	6	7299	7304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378272
67	NC_009622	ACG	2	6	7315	7320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378272
68	NC_009622	TGC	2	6	7411	7416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378272
69	NC_009622	GCA	2	6	7586	7591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378272
70	NC_009622	GTG	2	6	7700	7705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378272
71	NC_009622	CGA	2	6	7803	7808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378272
72	NC_009622	GAC	2	6	7809	7814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378272
73	NC_009622	CCA	2	6	7847	7852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378272
74	NC_009622	GCG	2	6	7880	7885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378272
75	NC_009622	TGA	2	6	7979	7984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378272
76	NC_009622	TCG	2	6	8060	8065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378272
77	NC_009622	GGC	2	6	8089	8094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378272
78	NC_009622	TTC	2	6	8119	8124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150378272
79	NC_009622	AAC	2	6	8126	8131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378272
80	NC_009622	AAG	2	6	8161	8166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378272
81	NC_009622	CGA	2	6	8256	8261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378272
82	NC_009622	ACA	3	9	8372	8380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378272
83	NC_009622	GCG	2	6	8501	8506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378272
84	NC_009622	CGA	2	6	8574	8579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378272
85	NC_009622	GAC	2	6	8638	8643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378273
86	NC_009622	GGC	2	6	8776	8781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378273
87	NC_009622	ACC	2	6	8850	8855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378273
88	NC_009622	CTC	2	6	8909	8914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150378273
89	NC_009622	ACC	3	9	8949	8957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378273
90	NC_009622	CGA	2	6	9043	9048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378273
91	NC_009622	GAA	2	6	9155	9160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378273
92	NC_009622	AGG	2	6	9163	9168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150378273
93	NC_009622	TCG	2	6	9214	9219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378273
94	NC_009622	TCC	2	6	9336	9341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150378273
95	NC_009622	CTC	2	6	9356	9361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150378273
96	NC_009622	ATC	2	6	9447	9452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378273
97	NC_009622	CCG	2	6	9642	9647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378273
98	NC_009622	ACC	2	6	9678	9683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378273
99	NC_009622	TCG	2	6	9740	9745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378273
100	NC_009622	GCG	2	6	9781	9786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378273
101	NC_009622	CGC	2	6	9986	9991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378273
102	NC_009622	TTC	2	6	10020	10025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150378273
103	NC_009622	GCC	2	6	10091	10096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378273
104	NC_009622	GAC	2	6	10259	10264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378273
105	NC_009622	GAA	2	6	10286	10291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378273
106	NC_009622	CCG	2	6	10292	10297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378273
107	NC_009622	CAG	2	6	10322	10327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378273
108	NC_009622	AAG	2	6	10577	10582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378274
109	NC_009622	CAG	2	6	10597	10602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378274
110	NC_009622	GCA	2	6	10758	10763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378274
111	NC_009622	ATC	2	6	10810	10815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378274
112	NC_009622	TGC	2	6	10816	10821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378274
113	NC_009622	TCC	2	6	10835	10840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150378274
114	NC_009622	CCG	2	6	11042	11047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378274
115	NC_009622	CCT	2	6	11163	11168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150378274
116	NC_009622	CGA	2	6	11238	11243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378274
117	NC_009622	CAC	2	6	11269	11274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378274
118	NC_009622	GAA	2	6	11356	11361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378274
119	NC_009622	CGA	2	6	11403	11408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378274
120	NC_009622	ACA	2	6	11463	11468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378274
121	NC_009622	CAT	2	6	11472	11477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378274
122	NC_009622	GCC	2	6	11488	11493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378274
123	NC_009622	TTA	2	6	11572	11577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150378275
124	NC_009622	AGG	2	6	11647	11652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150378275
125	NC_009622	CTG	2	6	11725	11730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378275
126	NC_009622	GCC	2	6	12188	12193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378276
127	NC_009622	CAA	2	6	12195	12200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150378276
128	NC_009622	ACG	2	6	12227	12232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378276
129	NC_009622	TGG	2	6	12243	12248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150378276
130	NC_009622	CAC	2	6	12327	12332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150378276
131	NC_009622	TTG	2	6	12431	12436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150378276
132	NC_009622	GCA	2	6	12462	12467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150378276
133	NC_009622	GTC	2	6	12508	12513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378276
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138	NC_009622	ATC	2	6	13616	13621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378277
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158	NC_009622	TGA	2	6	15945	15950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378280
159	NC_009622	TGC	2	6	16062	16067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378280
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253	NC_009622	CGC	2	6	21632	21637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150378286
254	NC_009622	ATC	2	6	21693	21698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378286
255	NC_009622	CTT	3	9	21722	21730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150378286
256	NC_009622	CGG	2	6	21740	21745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378286
257	NC_009622	GAT	2	6	21845	21850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378286
258	NC_009622	CTA	2	6	21953	21958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150378286
259	NC_009622	CGG	2	6	21971	21976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150378286
260	NC_009622	TGA	2	6	21979	21984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150378286
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291	NC_009622	CGT	2	6	23483	23488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150378287
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500	NC_009622	GAA	2	6	46082	46087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150378306

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