MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED02

Total Repeats: 879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009621	GGATG	2	10	3223	3232	20 %	20 %	60 %	0 %	150377172
2	NC_009621	CGAGG	2	10	4622	4631	20 %	0 %	60 %	20 %	150377175
3	NC_009621	GTCCA	2	10	5641	5650	20 %	20 %	20 %	40 %	150377176
4	NC_009621	ACGAT	2	10	7058	7067	40 %	20 %	20 %	20 %	150377177
5	NC_009621	TGGGG	2	10	7447	7456	0 %	20 %	80 %	0 %	150377177
6	NC_009621	CGGCG	2	10	7584	7593	0 %	0 %	60 %	40 %	150377177
7	NC_009621	CGGCG	2	10	9346	9355	0 %	0 %	60 %	40 %	150377179
8	NC_009621	ACCGG	2	10	10698	10707	20 %	0 %	40 %	40 %	150377181
9	NC_009621	CGTCA	2	10	10850	10859	20 %	20 %	20 %	40 %	150377181
10	NC_009621	GGCGC	2	10	11437	11446	0 %	0 %	60 %	40 %	150377182
11	NC_009621	AAGGC	2	10	12266	12275	40 %	0 %	40 %	20 %	150377182
12	NC_009621	TCAGT	2	10	12384	12393	20 %	40 %	20 %	20 %	150377182
13	NC_009621	GCCAA	2	10	12864	12873	40 %	0 %	20 %	40 %	150377183
14	NC_009621	CCATT	2	10	13435	13444	20 %	40 %	0 %	40 %	150377184
15	NC_009621	TCCCC	2	10	14249	14258	0 %	20 %	0 %	80 %	150377184
16	NC_009621	GGATC	2	10	14409	14418	20 %	20 %	40 %	20 %	150377184
17	NC_009621	GGTCA	2	10	14443	14452	20 %	20 %	40 %	20 %	150377184
18	NC_009621	TCGGG	2	10	17509	17518	0 %	20 %	60 %	20 %	150377187
19	NC_009621	GCCGC	2	10	18723	18732	0 %	0 %	40 %	60 %	150377188
20	NC_009621	CGGGC	2	10	20616	20625	0 %	0 %	60 %	40 %	150377190
21	NC_009621	AGACG	2	10	21737	21746	40 %	0 %	40 %	20 %	150377191
22	NC_009621	GCCCT	2	10	24374	24383	0 %	20 %	20 %	60 %	150377194
23	NC_009621	GCTTC	2	10	24640	24649	0 %	40 %	20 %	40 %	150377194
24	NC_009621	CGCCC	2	10	25060	25069	0 %	0 %	20 %	80 %	150377194
25	NC_009621	GTTCA	2	10	25177	25186	20 %	40 %	20 %	20 %	150377194
26	NC_009621	GCCAG	2	10	26529	26538	20 %	0 %	40 %	40 %	150377196
27	NC_009621	GAGCG	2	10	28071	28080	20 %	0 %	60 %	20 %	150377197
28	NC_009621	CCGGG	2	10	29033	29042	0 %	0 %	60 %	40 %	150377198
29	NC_009621	GCATC	2	10	32064	32073	20 %	20 %	20 %	40 %	150377200
30	NC_009621	TGCCC	2	10	34501	34510	0 %	20 %	20 %	60 %	150377201
31	NC_009621	GACGT	2	10	35183	35192	20 %	20 %	40 %	20 %	150377202
32	NC_009621	CGCGC	2	10	35460	35469	0 %	0 %	40 %	60 %	150377202
33	NC_009621	GGCGC	2	10	35529	35538	0 %	0 %	60 %	40 %	150377202
34	NC_009621	GAACC	2	10	39782	39791	40 %	0 %	20 %	40 %	150377206
35	NC_009621	AGGCG	2	10	40210	40219	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009621	GCGAG	2	10	40829	40838	20 %	0 %	60 %	20 %	150377207
37	NC_009621	TCGCC	2	10	44256	44265	0 %	20 %	20 %	60 %	150377211
38	NC_009621	TGCCA	2	10	46563	46572	20 %	20 %	20 %	40 %	150377213
39	NC_009621	CGCGG	2	10	47072	47081	0 %	0 %	60 %	40 %	150377213
40	NC_009621	CGATG	2	10	47707	47716	20 %	20 %	40 %	20 %	150377214
41	NC_009621	CGAGC	2	10	48356	48365	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_009621	TCGCC	2	10	48787	48796	0 %	20 %	20 %	60 %	150377216
43	NC_009621	CCGAT	2	10	50532	50541	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_009621	GATCG	2	10	53208	53217	20 %	20 %	40 %	20 %	150377220
45	NC_009621	CGTGA	2	10	53457	53466	20 %	20 %	40 %	20 %	150377221
46	NC_009621	CGGAT	2	10	53549	53558	20 %	20 %	40 %	20 %	150377221
47	NC_009621	CATCG	2	10	57999	58008	20 %	20 %	20 %	40 %	150377225
48	NC_009621	GAGCG	2	10	60187	60196	20 %	0 %	60 %	20 %	150377227
49	NC_009621	CGGCG	2	10	60571	60580	0 %	0 %	60 %	40 %	150377227
50	NC_009621	GCCGG	2	10	62050	62059	0 %	0 %	60 %	40 %	150377227
51	NC_009621	CTCGC	2	10	62074	62083	0 %	20 %	20 %	60 %	150377227
52	NC_009621	TCGAA	2	10	62085	62094	40 %	20 %	20 %	20 %	150377227
53	NC_009621	GGCAC	2	10	64729	64738	20 %	0 %	40 %	40 %	150377228
54	NC_009621	CGTTG	2	10	68299	68308	0 %	40 %	40 %	20 %	150377230
55	NC_009621	TCCCG	2	10	68407	68416	0 %	20 %	20 %	60 %	150377231
56	NC_009621	GACTG	2	10	68431	68440	20 %	20 %	40 %	20 %	150377231
57	NC_009621	GCGCC	2	10	68533	68542	0 %	0 %	40 %	60 %	150377231
58	NC_009621	GACCA	2	10	70187	70196	40 %	0 %	20 %	40 %	150377232
59	NC_009621	GCTCG	2	10	70621	70630	0 %	20 %	40 %	40 %	150377232
60	NC_009621	CACGG	2	10	73128	73137	20 %	0 %	40 %	40 %	150377234
61	NC_009621	CGGAA	2	10	73969	73978	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009621	CCGCC	2	10	74029	74038	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
63	NC_009621	TCGCT	2	10	75873	75882	0 %	40 %	20 %	40 %	150377236
64	NC_009621	GCTTT	2	10	77564	77573	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009621	GGGCC	2	10	77817	77826	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
66	NC_009621	GCACC	2	10	78749	78758	20 %	0 %	20 %	60 %	150377240
67	NC_009621	TGCTT	2	10	79591	79600	0 %	60 %	20 %	20 %	150377240
68	NC_009621	ATTAG	2	10	85235	85244	40 %	40 %	20 %	0 %	150377247
69	NC_009621	GCCGG	2	10	88059	88068	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_009621	CGACG	2	10	90778	90787	20 %	0 %	40 %	40 %	150377252
71	NC_009621	TTCCG	2	10	96698	96707	0 %	40 %	20 %	40 %	150377259
72	NC_009621	GATGC	2	10	101710	101719	20 %	20 %	40 %	20 %	150377263
73	NC_009621	GCTCT	2	10	105654	105663	0 %	40 %	20 %	40 %	150377268
74	NC_009621	TGGAC	2	10	105722	105731	20 %	20 %	40 %	20 %	150377268
75	NC_009621	GCCGA	2	10	106101	106110	20 %	0 %	40 %	40 %	150377268
76	NC_009621	TGCCG	2	10	109791	109800	0 %	20 %	40 %	40 %	150377269
77	NC_009621	GCCGG	2	10	112870	112879	0 %	0 %	60 %	40 %	150377273
78	NC_009621	TCAAT	2	10	113309	113318	40 %	40 %	0 %	20 %	150377274
79	NC_009621	TTGAA	2	10	115245	115254	40 %	40 %	20 %	0 %	150377277
80	NC_009621	GAAGC	2	10	115646	115655	40 %	0 %	40 %	20 %	150377278
81	NC_009621	AGATC	2	10	118280	118289	40 %	20 %	20 %	20 %	150377281
82	NC_009621	GAAGC	2	10	119169	119178	40 %	0 %	40 %	20 %	150377281
83	NC_009621	CCGTT	2	10	119184	119193	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_009621	CAGCG	2	10	119559	119568	20 %	0 %	40 %	40 %	150377282
85	NC_009621	GCGCG	2	10	122121	122130	0 %	0 %	60 %	40 %	150377283
86	NC_009621	CGGCG	2	10	124382	124391	0 %	0 %	60 %	40 %	150377285
87	NC_009621	CAATT	2	10	125674	125683	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009621	GTCGA	2	10	130187	130196	20 %	20 %	40 %	20 %	150377289
89	NC_009621	CTTCG	2	10	130679	130688	0 %	40 %	20 %	40 %	150377289
90	NC_009621	GGGCA	2	10	132149	132158	20 %	0 %	60 %	20 %	150377290
91	NC_009621	AGGGC	2	10	132348	132357	20 %	0 %	60 %	20 %	150377291
92	NC_009621	CGGCA	2	10	135651	135660	20 %	0 %	40 %	40 %	150377295
93	NC_009621	GCCTT	2	10	137443	137452	0 %	40 %	20 %	40 %	150377297
94	NC_009621	GCCGG	2	10	140888	140897	0 %	0 %	60 %	40 %	150377301
95	NC_009621	ACGAA	2	10	141850	141859	60 %	0 %	20 %	20 %	150377301
96	NC_009621	GAGCG	2	10	142846	142855	20 %	0 %	60 %	20 %	150377302
97	NC_009621	CGCAG	2	10	143336	143345	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_009621	GCGCG	2	10	143470	143479	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
99	NC_009621	TCGTG	2	10	145786	145795	0 %	40 %	40 %	20 %	150377305
100	NC_009621	ATCAC	2	10	146796	146805	40 %	20 %	0 %	40 %	150377306
101	NC_009621	CACCG	2	10	147376	147385	20 %	0 %	20 %	60 %	150377307
102	NC_009621	ATCGT	2	10	148570	148579	20 %	40 %	20 %	20 %	150377308
103	NC_009621	TCCGC	2	10	148886	148895	0 %	20 %	20 %	60 %	150377308
104	NC_009621	ACGCA	2	10	149016	149025	40 %	0 %	20 %	40 %	150377308
105	NC_009621	ATTCC	2	10	150211	150220	20 %	40 %	0 %	40 %	150377309
106	NC_009621	CCATG	2	10	151620	151629	20 %	20 %	20 %	40 %	150377310
107	NC_009621	GGTCC	2	10	152570	152579	0 %	20 %	40 %	40 %	150377310
108	NC_009621	TGGAA	2	10	153207	153216	40 %	20 %	40 %	0 %	150377310
109	NC_009621	CCGCA	2	10	154095	154104	20 %	0 %	20 %	60 %	150377311
110	NC_009621	TGGCG	2	10	155165	155174	0 %	20 %	60 %	20 %	150377311
111	NC_009621	ATGAA	2	10	155857	155866	60 %	20 %	20 %	0 %	150377312
112	NC_009621	CAATG	2	10	156091	156100	40 %	20 %	20 %	20 %	150377312
113	NC_009621	AGCCA	2	10	159015	159024	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_009621	GGGCC	2	10	161536	161545	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_009621	CGGCG	2	10	162797	162806	0 %	0 %	60 %	40 %	150377317
116	NC_009621	GGCAA	2	10	166070	166079	40 %	0 %	40 %	20 %	150377320
117	NC_009621	TCTGC	2	10	166308	166317	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_009621	AGCCG	2	10	170745	170754	20 %	0 %	40 %	40 %	150377324
119	NC_009621	ACGCG	2	10	172117	172126	20 %	0 %	40 %	40 %	150377324
120	NC_009621	GACGC	2	10	174264	174273	20 %	0 %	40 %	40 %	150377326
121	NC_009621	CAGGG	2	10	174794	174803	20 %	0 %	60 %	20 %	150377326
122	NC_009621	GGCGA	2	10	178235	178244	20 %	0 %	60 %	20 %	150377330
123	NC_009621	CGAAA	2	10	179046	179055	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_009621	AGGAA	2	10	181200	181209	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009621	ACAGC	2	10	181822	181831	40 %	0 %	20 %	40 %	150377335
126	NC_009621	TCGGT	2	10	182534	182543	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_009621	CGAAA	2	10	185934	185943	60 %	0 %	20 %	20 %	150377340
128	NC_009621	CTTTC	2	10	186876	186885	0 %	60 %	0 %	40 %	150377341
129	NC_009621	GAAGC	2	10	186999	187008	40 %	0 %	40 %	20 %	150377341
130	NC_009621	GGGGA	2	10	187156	187165	20 %	0 %	80 %	0 %	150377342
131	NC_009621	AACCG	2	10	188570	188579	40 %	0 %	20 %	40 %	150377343
132	NC_009621	AGGGA	2	10	189244	189253	40 %	0 %	60 %	0 %	150377344
133	NC_009621	ATTTC	2	10	190294	190303	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009621	TCCCG	2	10	191165	191174	0 %	20 %	20 %	60 %	150377345
135	NC_009621	GAACA	2	10	191642	191651	60 %	0 %	20 %	20 %	150377346
136	NC_009621	GGCGA	2	10	195090	195099	20 %	0 %	60 %	20 %	150377349
137	NC_009621	AGCGA	2	10	196556	196565	40 %	0 %	40 %	20 %	150377349
138	NC_009621	CCGCT	2	10	196759	196768	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
139	NC_009621	CGGGT	2	10	197794	197803	0 %	20 %	60 %	20 %	150377350
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150	NC_009621	GGCCC	2	10	211343	211352	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
151	NC_009621	CAGCA	2	10	212152	212161	40 %	0 %	20 %	40 %	150377362
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169	NC_009621	GGGGC	2	10	238236	238245	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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175	NC_009621	CGCAG	2	10	241886	241895	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
176	NC_009621	CGACC	2	10	243101	243110	20 %	0 %	20 %	60 %	150377395
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187	NC_009621	TCCAC	2	10	260486	260495	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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196	NC_009621	AGTTT	2	10	269570	269579	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
197	NC_009621	GCGTC	2	10	269621	269630	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
198	NC_009621	GCCGA	2	10	270053	270062	20 %	0 %	40 %	40 %	150377425
199	NC_009621	CCGGC	2	10	271204	271213	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
200	NC_009621	GCCGA	2	10	271262	271271	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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500	NC_009621	GCATT	2	10	689229	689238	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

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