MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED02

Total Repeats: 713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009621	TGAG	2	8	987	994	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009621	GGTC	2	8	2943	2950	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009621	GGCG	2	8	5240	5247	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009621	AAAC	2	8	22388	22395	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009621	ATCG	2	8	23702	23709	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009621	GGCG	2	8	28916	28923	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009621	TGCC	2	8	28936	28943	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009621	TCCC	2	8	29867	29874	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_009621	AGCC	2	8	32650	32657	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009621	CGCC	2	8	33776	33783	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_009621	CTGC	2	8	33820	33827	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009621	ATGG	2	8	40281	40288	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009621	AGGA	2	8	46312	46319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009621	CGCC	2	8	50580	50587	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_009621	GCCT	2	8	54100	54107	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009621	CGCC	2	8	59853	59860	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_009621	GCCG	2	8	62578	62585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009621	AGCG	2	8	66166	66173	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009621	GCGG	2	8	73925	73932	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009621	GCTG	2	8	83140	83147	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009621	TCCT	2	8	92990	92997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009621	CCGG	2	8	97955	97962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009621	ACCG	2	8	102559	102566	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009621	CGGC	2	8	102625	102632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009621	CGAC	2	8	104787	104794	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009621	GCAG	2	8	109922	109929	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009621	CGAG	2	8	110072	110079	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009621	GCGG	2	8	110087	110094	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009621	TCCG	2	8	110103	110110	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009621	TCGT	2	8	110542	110549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009621	TCGC	2	8	114406	114413	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009621	CAAA	2	8	115395	115402	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009621	GCCG	2	8	122565	122572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009621	TTGA	2	8	122664	122671	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009621	AGGA	2	8	125651	125658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009621	GCCG	2	8	128314	128321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009621	GCGG	2	8	132874	132881	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009621	ACTC	2	8	133150	133157	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009621	GGCG	2	8	138248	138255	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009621	ACAG	2	8	138439	138446	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009621	CGTC	2	8	143269	143276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009621	CAGC	2	8	143646	143653	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009621	GATA	2	8	145484	145491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009621	CGGC	2	8	146435	146442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009621	ATCA	2	8	156762	156769	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009621	GCAT	2	8	158342	158349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009621	TGCC	2	8	159037	159044	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009621	GTTG	2	8	161788	161795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009621	TAGT	2	8	161939	161946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009621	GCAC	2	8	175549	175556	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009621	CTCG	2	8	177925	177932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009621	GATC	2	8	182519	182526	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009621	CTGC	2	8	182621	182628	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009621	GTAA	2	8	182884	182891	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009621	CCGG	2	8	183537	183544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009621	AGGT	2	8	188072	188079	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009621	GCAA	2	8	190353	190360	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009621	AAGA	2	8	193515	193522	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009621	CGGC	2	8	201978	201985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009621	TGCC	2	8	207651	207658	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009621	GCCC	2	8	209552	209559	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_009621	TGCT	2	8	209632	209639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009621	CGGC	2	8	209654	209661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009621	GGCG	2	8	209725	209732	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009621	GCAG	2	8	212550	212557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009621	TCGG	2	8	215921	215928	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009621	AAGA	2	8	216594	216601	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009621	CGGT	2	8	228798	228805	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009621	TTTG	2	8	229176	229183	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009621	CAGG	2	8	238415	238422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009621	TATT	2	8	247302	247309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009621	CGTC	2	8	251572	251579	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009621	GGTC	2	8	253952	253959	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009621	GACG	2	8	254537	254544	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009621	CCCG	2	8	255115	255122	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_009621	AACA	2	8	260477	260484	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009621	AATA	2	8	261586	261593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009621	CGGA	2	8	262423	262430	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009621	CCAA	2	8	264287	264294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009621	CAAA	2	8	265690	265697	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009621	ACCC	2	8	265740	265747	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_009621	GCGG	2	8	267905	267912	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009621	GCCG	2	8	269506	269513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009621	ACGG	2	8	271294	271301	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009621	AGGC	2	8	271649	271656	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009621	CAGC	2	8	271810	271817	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009621	CGGC	2	8	271941	271948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009621	CTTG	2	8	272431	272438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009621	CGGA	2	8	272574	272581	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009621	TCGA	2	8	273058	273065	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009621	GCTC	2	8	273271	273278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009621	CCCG	2	8	273435	273442	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NC_009621	GCAG	2	8	277892	277899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009621	TTTA	2	8	278959	278966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009621	GCAG	2	8	285435	285442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009621	AACG	2	8	285478	285485	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009621	GGTT	2	8	301203	301210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009621	CTTT	2	8	307927	307934	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009621	AAGC	2	8	312376	312383	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009621	TTTC	2	8	312447	312454	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009621	TATT	2	8	314855	314862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009621	CATT	2	8	315232	315239	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_009621	CAAG	2	8	315441	315448	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009621	CAGG	2	8	315570	315577	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009621	TTTG	2	8	317720	317727	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009621	CGGG	2	8	320052	320059	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009621	GCGG	2	8	320485	320492	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009621	CCAT	2	8	320856	320863	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009621	TCGA	2	8	320889	320896	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009621	CGCT	2	8	322076	322083	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009621	GTAG	2	8	329904	329911	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009621	CGAT	2	8	332121	332128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009621	GCCT	2	8	334948	334955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009621	CGAT	2	8	335415	335422	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009621	GGAC	2	8	335649	335656	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009621	AACG	2	8	335778	335785	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009621	GCCT	2	8	336007	336014	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009621	GGCC	2	8	336290	336297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009621	GTGC	2	8	336755	336762	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009621	GCCC	2	8	338710	338717	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_009621	GGCG	2	8	338723	338730	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009621	TTCG	2	8	340102	340109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009621	GCAC	2	8	340163	340170	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_009621	CGGT	2	8	341601	341608	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009621	TTGA	2	8	354027	354034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009621	CCGG	2	8	364376	364383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009621	CTTT	2	8	364877	364884	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009621	GCCC	2	8	365046	365053	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
129	NC_009621	GTTC	2	8	366165	366172	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009621	GGAT	2	8	370234	370241	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009621	GTTG	2	8	372913	372920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009621	GGAC	2	8	373545	373552	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009621	GAGT	2	8	373555	373562	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009621	TCGA	2	8	373567	373574	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009621	AACG	2	8	373646	373653	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009621	GCAC	2	8	383192	383199	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009621	GACC	2	8	383446	383453	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_009621	GGCA	2	8	383534	383541	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009621	GACG	2	8	383587	383594	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009621	AGCG	2	8	384238	384245	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_009621	CCTT	2	8	386601	386608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009621	GGCC	2	8	386644	386651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_009621	GCCG	2	8	386796	386803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009621	TTGC	2	8	386934	386941	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009621	TCGA	2	8	388516	388523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_009621	GCCG	2	8	388740	388747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_009621	CGGC	2	8	388943	388950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_009621	GGAA	2	8	391243	391250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009621	TGTT	2	8	391257	391264	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009621	TTGA	2	8	392298	392305	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009621	CTTT	2	8	398733	398740	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_009621	CGAA	2	8	398755	398762	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_009621	CTGC	2	8	398861	398868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_009621	GCGT	2	8	400726	400733	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
155	NC_009621	GCCC	2	8	407683	407690	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
156	NC_009621	GGGA	2	8	407932	407939	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
157	NC_009621	TAAA	2	8	409993	410000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_009621	AGGG	2	8	410454	410461	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
159	NC_009621	TCGC	2	8	416346	416353	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
160	NC_009621	ACCG	2	8	419905	419912	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
161	NC_009621	TGAC	2	8	423987	423994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_009621	TCCG	2	8	434119	434126	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
163	NC_009621	GCCC	2	8	435322	435329	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
164	NC_009621	TCGA	2	8	435470	435477	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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168	NC_009621	GGCG	2	8	447597	447604	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
169	NC_009621	GATG	2	8	448025	448032	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
170	NC_009621	AAGC	2	8	448144	448151	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
171	NC_009621	TCGA	2	8	449687	449694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
172	NC_009621	GCCT	2	8	449820	449827	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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174	NC_009621	ACGG	2	8	455060	455067	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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176	NC_009621	GCAT	2	8	460339	460346	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
177	NC_009621	CGAA	2	8	461068	461075	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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179	NC_009621	GGCT	2	8	477599	477606	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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186	NC_009621	TGAG	2	8	499110	499117	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
187	NC_009621	GAGC	2	8	499297	499304	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
188	NC_009621	TTTG	2	8	502210	502217	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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190	NC_009621	TCGA	2	8	505829	505836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
191	NC_009621	AGCG	2	8	507082	507089	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
192	NC_009621	AGCG	2	8	507906	507913	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
193	NC_009621	GGGT	2	8	508035	508042	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
194	NC_009621	GATC	2	8	509724	509731	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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197	NC_009621	CCGA	2	8	513335	513342	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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211	NC_009621	CCGT	2	8	553321	553328	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
212	NC_009621	CAGG	3	12	553872	553883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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221	NC_009621	GGCC	2	8	576156	576163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
222	NC_009621	AAGA	2	8	576736	576743	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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224	NC_009621	AAGA	2	8	582093	582100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
225	NC_009621	AGTC	2	8	583007	583014	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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234	NC_009621	GCCG	2	8	602284	602291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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245	NC_009621	TGAA	2	8	610071	610078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_009621	TGGG	2	8	626336	626343	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_009621	GGAT	2	8	627991	627998	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
262	NC_009621	TCTA	2	8	628147	628154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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269	NC_009621	ATGC	2	8	633901	633908	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
270	NC_009621	GTTC	2	8	633951	633958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
271	NC_009621	GTCA	2	8	634192	634199	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
272	NC_009621	CGCA	2	8	637902	637909	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
273	NC_009621	GGGA	2	8	638006	638013	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
274	NC_009621	CGGC	2	8	640521	640528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
275	NC_009621	TGCT	2	8	640704	640711	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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282	NC_009621	CGAT	2	8	645144	645151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
283	NC_009621	TCGA	2	8	646348	646355	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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