MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED02

Total Repeats: 402

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009621	A	7	7	360	366	100 %	0 %	0 %	0 %	150377169
2	NC_009621	C	6	6	4095	4100	0 %	0 %	0 %	100 %	150377174
3	NC_009621	C	6	6	6010	6015	0 %	0 %	0 %	100 %	150377176
4	NC_009621	G	6	6	6888	6893	0 %	0 %	100 %	0 %	150377177
5	NC_009621	G	6	6	9010	9015	0 %	0 %	100 %	0 %	150377179
6	NC_009621	T	6	6	17554	17559	0 %	100 %	0 %	0 %	150377187
7	NC_009621	A	6	6	20893	20898	100 %	0 %	0 %	0 %	150377190
8	NC_009621	T	6	6	22446	22451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009621	G	6	6	25259	25264	0 %	0 %	100 %	0 %	150377194
10	NC_009621	A	7	7	30765	30771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009621	T	6	6	34162	34167	0 %	100 %	0 %	0 %	150377201
12	NC_009621	G	6	6	42191	42196	0 %	0 %	100 %	0 %	150377209
13	NC_009621	C	6	6	43949	43954	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_009621	A	6	6	43986	43991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009621	T	7	7	44004	44010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009621	C	6	6	44774	44779	0 %	0 %	0 %	100 %	150377211
17	NC_009621	C	6	6	45785	45790	0 %	0 %	0 %	100 %	150377212
18	NC_009621	C	6	6	55363	55368	0 %	0 %	0 %	100 %	150377223
19	NC_009621	T	6	6	58799	58804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009621	A	8	8	58877	58884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009621	A	6	6	60002	60007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009621	T	6	6	60064	60069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009621	G	6	6	62729	62734	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009621	A	6	6	63507	63512	100 %	0 %	0 %	0 %	150377228
25	NC_009621	T	6	6	63658	63663	0 %	100 %	0 %	0 %	150377228
26	NC_009621	C	6	6	67890	67895	0 %	0 %	0 %	100 %	150377230
27	NC_009621	G	6	6	68103	68108	0 %	0 %	100 %	0 %	150377230
28	NC_009621	C	7	7	68285	68291	0 %	0 %	0 %	100 %	150377230
29	NC_009621	G	6	6	69255	69260	0 %	0 %	100 %	0 %	150377232
30	NC_009621	G	7	7	72002	72008	0 %	0 %	100 %	0 %	150377233
31	NC_009621	T	6	6	73947	73952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009621	A	6	6	73983	73988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009621	A	6	6	83308	83313	100 %	0 %	0 %	0 %	150377244
34	NC_009621	T	6	6	83722	83727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009621	C	6	6	84350	84355	0 %	0 %	0 %	100 %	150377246
36	NC_009621	C	6	6	89160	89165	0 %	0 %	0 %	100 %	150377251
37	NC_009621	G	6	6	91833	91838	0 %	0 %	100 %	0 %	150377253
38	NC_009621	T	6	6	92568	92573	0 %	100 %	0 %	0 %	150377253
39	NC_009621	G	6	6	92818	92823	0 %	0 %	100 %	0 %	150377253
40	NC_009621	C	6	6	96903	96908	0 %	0 %	0 %	100 %	150377259
41	NC_009621	A	7	7	97977	97983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009621	T	6	6	98430	98435	0 %	100 %	0 %	0 %	150377261
43	NC_009621	C	6	6	98908	98913	0 %	0 %	0 %	100 %	150377261
44	NC_009621	A	6	6	102531	102536	100 %	0 %	0 %	0 %	150377264
45	NC_009621	A	7	7	103196	103202	100 %	0 %	0 %	0 %	150377266
46	NC_009621	T	6	6	104757	104762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009621	T	7	7	105892	105898	0 %	100 %	0 %	0 %	150377268
48	NC_009621	C	6	6	107346	107351	0 %	0 %	0 %	100 %	150377268
49	NC_009621	C	6	6	108327	108332	0 %	0 %	0 %	100 %	150377269
50	NC_009621	A	6	6	109337	109342	100 %	0 %	0 %	0 %	150377269
51	NC_009621	A	6	6	110129	110134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009621	C	6	6	113005	113010	0 %	0 %	0 %	100 %	150377273
53	NC_009621	T	6	6	115452	115457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009621	A	6	6	123044	123049	100 %	0 %	0 %	0 %	150377284
55	NC_009621	T	6	6	127655	127660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009621	C	8	8	127773	127780	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_009621	C	7	7	128128	128134	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58	NC_009621	C	6	6	131732	131737	0 %	0 %	0 %	100 %	150377290
59	NC_009621	G	6	6	133696	133701	0 %	0 %	100 %	0 %	150377293
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62	NC_009621	A	6	6	143243	143248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009621	C	6	6	151204	151209	0 %	0 %	0 %	100 %	150377310
64	NC_009621	T	6	6	153351	153356	0 %	100 %	0 %	0 %	150377311
65	NC_009621	G	6	6	154050	154055	0 %	0 %	100 %	0 %	150377311
66	NC_009621	C	6	6	156157	156162	0 %	0 %	0 %	100 %	150377312
67	NC_009621	A	7	7	157769	157775	100 %	0 %	0 %	0 %	150377313
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69	NC_009621	T	6	6	160316	160321	0 %	100 %	0 %	0 %	150377316
70	NC_009621	C	6	6	160813	160818	0 %	0 %	0 %	100 %	150377316
71	NC_009621	A	6	6	160871	160876	100 %	0 %	0 %	0 %	150377316
72	NC_009621	A	7	7	161982	161988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009621	T	6	6	167127	167132	0 %	100 %	0 %	0 %	150377322
74	NC_009621	G	6	6	168024	168029	0 %	0 %	100 %	0 %	150377323
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78	NC_009621	G	6	6	170044	170049	0 %	0 %	100 %	0 %	150377323
79	NC_009621	A	6	6	170223	170228	100 %	0 %	0 %	0 %	150377324
80	NC_009621	G	6	6	171695	171700	0 %	0 %	100 %	0 %	150377324
81	NC_009621	G	6	6	172849	172854	0 %	0 %	100 %	0 %	150377325
82	NC_009621	A	6	6	183426	183431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009621	A	8	8	183506	183513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009621	G	6	6	184372	184377	0 %	0 %	100 %	0 %	150377338
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88	NC_009621	C	6	6	209823	209828	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
89	NC_009621	C	6	6	210542	210547	0 %	0 %	0 %	100 %	150377361
90	NC_009621	G	6	6	220588	220593	0 %	0 %	100 %	0 %	150377374
91	NC_009621	G	6	6	222670	222675	0 %	0 %	100 %	0 %	150377376
92	NC_009621	G	6	6	225096	225101	0 %	0 %	100 %	0 %	150377378
93	NC_009621	A	8	8	225919	225926	100 %	0 %	0 %	0 %	150377379
94	NC_009621	A	6	6	229571	229576	100 %	0 %	0 %	0 %	150377384
95	NC_009621	C	6	6	238746	238751	0 %	0 %	0 %	100 %	150377392
96	NC_009621	A	7	7	248349	248355	100 %	0 %	0 %	0 %	150377399
97	NC_009621	T	6	6	252858	252863	0 %	100 %	0 %	0 %	150377402
98	NC_009621	A	6	6	255901	255906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100	NC_009621	G	6	6	259858	259863	0 %	0 %	100 %	0 %	150377409
101	NC_009621	A	7	7	261486	261492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009621	A	6	6	261651	261656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009621	A	6	6	262661	262666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009621	T	6	6	262906	262911	0 %	100 %	0 %	0 %	150377416
105	NC_009621	A	6	6	268334	268339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009621	A	6	6	269598	269603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009621	T	6	6	273172	273177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009621	T	6	6	278042	278047	0 %	100 %	0 %	0 %	150377431
109	NC_009621	G	6	6	279560	279565	0 %	0 %	100 %	0 %	150377432
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111	NC_009621	G	6	6	281453	281458	0 %	0 %	100 %	0 %	150377434
112	NC_009621	T	6	6	281841	281846	0 %	100 %	0 %	0 %	150377434
113	NC_009621	G	7	7	283413	283419	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009621	G	6	6	285375	285380	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009621	T	6	6	285640	285645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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120	NC_009621	G	6	6	310401	310406	0 %	0 %	100 %	0 %	150377458
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122	NC_009621	C	6	6	325150	325155	0 %	0 %	0 %	100 %	150377468
123	NC_009621	T	6	6	327139	327144	0 %	100 %	0 %	0 %	150377470
124	NC_009621	G	6	6	329568	329573	0 %	0 %	100 %	0 %	150377471
125	NC_009621	T	6	6	330066	330071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009621	G	6	6	331623	331628	0 %	0 %	100 %	0 %	150377473
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128	NC_009621	T	6	6	340312	340317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009621	A	6	6	346653	346658	100 %	0 %	0 %	0 %	150377486
130	NC_009621	A	6	6	349198	349203	100 %	0 %	0 %	0 %	150377490
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134	NC_009621	A	6	6	353504	353509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009621	T	6	6	362528	362533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009621	G	6	6	369694	369699	0 %	0 %	100 %	0 %	150377509
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138	NC_009621	T	6	6	381787	381792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009621	A	6	6	382883	382888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_009621	A	6	6	390383	390388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.