MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED01

Total Repeats: 444

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009620	T	6	6	4445	4450	0 %	100 %	0 %	0 %	150375728
2	NC_009620	T	6	6	4466	4471	0 %	100 %	0 %	0 %	150375728
3	NC_009620	G	6	6	8659	8664	0 %	0 %	100 %	0 %	150375732
4	NC_009620	C	6	6	11695	11700	0 %	0 %	0 %	100 %	150375735
5	NC_009620	A	6	6	22861	22866	100 %	0 %	0 %	0 %	150375746
6	NC_009620	A	6	6	29782	29787	100 %	0 %	0 %	0 %	150375753
7	NC_009620	C	6	6	30904	30909	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_009620	T	6	6	31157	31162	0 %	100 %	0 %	0 %	150375754
9	NC_009620	T	6	6	34275	34280	0 %	100 %	0 %	0 %	150375756
10	NC_009620	T	6	6	36047	36052	0 %	100 %	0 %	0 %	150375758
11	NC_009620	T	6	6	37077	37082	0 %	100 %	0 %	0 %	150375759
12	NC_009620	A	6	6	57662	57667	100 %	0 %	0 %	0 %	150375774
13	NC_009620	C	6	6	60415	60420	0 %	0 %	0 %	100 %	150375776
14	NC_009620	G	6	6	64900	64905	0 %	0 %	100 %	0 %	150375781
15	NC_009620	T	6	6	65345	65350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009620	A	6	6	69513	69518	100 %	0 %	0 %	0 %	150375785
17	NC_009620	T	8	8	74947	74954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009620	G	7	7	79137	79143	0 %	0 %	100 %	0 %	150375792
19	NC_009620	G	7	7	87526	87532	0 %	0 %	100 %	0 %	150375800
20	NC_009620	C	6	6	94346	94351	0 %	0 %	0 %	100 %	150375806
21	NC_009620	A	6	6	98992	98997	100 %	0 %	0 %	0 %	150375811
22	NC_009620	A	6	6	107197	107202	100 %	0 %	0 %	0 %	150375817
23	NC_009620	A	6	6	107318	107323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009620	T	7	7	113389	113395	0 %	100 %	0 %	0 %	150375823
25	NC_009620	T	6	6	115880	115885	0 %	100 %	0 %	0 %	150375826
26	NC_009620	T	6	6	117207	117212	0 %	100 %	0 %	0 %	150375828
27	NC_009620	A	6	6	119779	119784	100 %	0 %	0 %	0 %	150375830
28	NC_009620	G	7	7	120560	120566	0 %	0 %	100 %	0 %	150375831
29	NC_009620	T	6	6	128546	128551	0 %	100 %	0 %	0 %	150375838
30	NC_009620	A	6	6	131694	131699	100 %	0 %	0 %	0 %	150375840
31	NC_009620	T	6	6	132380	132385	0 %	100 %	0 %	0 %	150375841
32	NC_009620	T	6	6	134009	134014	0 %	100 %	0 %	0 %	150375842
33	NC_009620	C	6	6	143716	143721	0 %	0 %	0 %	100 %	150375852
34	NC_009620	A	6	6	143866	143871	100 %	0 %	0 %	0 %	150375853
35	NC_009620	C	6	6	144644	144649	0 %	0 %	0 %	100 %	150375853
36	NC_009620	A	6	6	148639	148644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009620	C	7	7	148952	148958	0 %	0 %	0 %	100 %	150375857
38	NC_009620	C	6	6	152126	152131	0 %	0 %	0 %	100 %	150375860
39	NC_009620	A	6	6	152992	152997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009620	C	6	6	158318	158323	0 %	0 %	0 %	100 %	150375866
41	NC_009620	C	6	6	159095	159100	0 %	0 %	0 %	100 %	150375866
42	NC_009620	G	6	6	161766	161771	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009620	A	6	6	163896	163901	100 %	0 %	0 %	0 %	150375870
44	NC_009620	A	6	6	165125	165130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009620	A	6	6	167126	167131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009620	A	6	6	169895	169900	100 %	0 %	0 %	0 %	150375876
47	NC_009620	C	7	7	183268	183274	0 %	0 %	0 %	100 %	150375888
48	NC_009620	G	7	7	184871	184877	0 %	0 %	100 %	0 %	150375889
49	NC_009620	A	7	7	194248	194254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009620	T	6	6	195757	195762	0 %	100 %	0 %	0 %	150375902
51	NC_009620	A	6	6	196494	196499	100 %	0 %	0 %	0 %	150375902
52	NC_009620	C	6	6	197722	197727	0 %	0 %	0 %	100 %	150375903
53	NC_009620	C	6	6	211485	211490	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_009620	A	7	7	223056	223062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009620	C	6	6	227361	227366	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_009620	G	7	7	231125	231131	0 %	0 %	100 %	0 %	150375934
57	NC_009620	C	6	6	235149	235154	0 %	0 %	0 %	100 %	150375937
58	NC_009620	T	7	7	235767	235773	0 %	100 %	0 %	0 %	150375937
59	NC_009620	C	6	6	236224	236229	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_009620	T	6	6	239135	239140	0 %	100 %	0 %	0 %	150375940
61	NC_009620	A	6	6	239961	239966	100 %	0 %	0 %	0 %	150375941
62	NC_009620	G	6	6	242437	242442	0 %	0 %	100 %	0 %	150375942
63	NC_009620	T	6	6	247062	247067	0 %	100 %	0 %	0 %	150375946
64	NC_009620	T	6	6	248327	248332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009620	C	6	6	253493	253498	0 %	0 %	0 %	100 %	150375953
66	NC_009620	C	6	6	253822	253827	0 %	0 %	0 %	100 %	150375953
67	NC_009620	C	6	6	253857	253862	0 %	0 %	0 %	100 %	150375953
68	NC_009620	C	6	6	254338	254343	0 %	0 %	0 %	100 %	150375953
69	NC_009620	G	6	6	254395	254400	0 %	0 %	100 %	0 %	150375953
70	NC_009620	T	6	6	254508	254513	0 %	100 %	0 %	0 %	150375953
71	NC_009620	A	6	6	266246	266251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009620	C	6	6	267384	267389	0 %	0 %	0 %	100 %	150375962
73	NC_009620	C	6	6	273166	273171	0 %	0 %	0 %	100 %	150375968
74	NC_009620	C	6	6	274142	274147	0 %	0 %	0 %	100 %	150375969
75	NC_009620	C	6	6	274543	274548	0 %	0 %	0 %	100 %	150375969
76	NC_009620	G	6	6	276553	276558	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009620	G	6	6	277819	277824	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009620	T	7	7	284071	284077	0 %	100 %	0 %	0 %	150375976
79	NC_009620	T	7	7	285338	285344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009620	A	6	6	288720	288725	100 %	0 %	0 %	0 %	150375982
81	NC_009620	T	6	6	292493	292498	0 %	100 %	0 %	0 %	150375985
82	NC_009620	A	6	6	293536	293541	100 %	0 %	0 %	0 %	150375987
83	NC_009620	C	6	6	294012	294017	0 %	0 %	0 %	100 %	150375987
84	NC_009620	T	7	7	294240	294246	0 %	100 %	0 %	0 %	150375988
85	NC_009620	A	7	7	299055	299061	100 %	0 %	0 %	0 %	150375991
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87	NC_009620	T	6	6	310441	310446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009620	C	6	6	311746	311751	0 %	0 %	0 %	100 %	150376003
89	NC_009620	G	6	6	313996	314001	0 %	0 %	100 %	0 %	150376005
90	NC_009620	C	6	6	319089	319094	0 %	0 %	0 %	100 %	150376011
91	NC_009620	C	6	6	321308	321313	0 %	0 %	0 %	100 %	150376012
92	NC_009620	C	6	6	321691	321696	0 %	0 %	0 %	100 %	150376013
93	NC_009620	T	6	6	335526	335531	0 %	100 %	0 %	0 %	150376028
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95	NC_009620	A	6	6	345725	345730	100 %	0 %	0 %	0 %	150376037
96	NC_009620	A	6	6	348609	348614	100 %	0 %	0 %	0 %	150376039
97	NC_009620	G	6	6	353123	353128	0 %	0 %	100 %	0 %	150376043
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99	NC_009620	T	7	7	356531	356537	0 %	100 %	0 %	0 %	150376048
100	NC_009620	A	6	6	357230	357235	100 %	0 %	0 %	0 %	150376050
101	NC_009620	C	6	6	365130	365135	0 %	0 %	0 %	100 %	150376059
102	NC_009620	G	6	6	379059	379064	0 %	0 %	100 %	0 %	150376073
103	NC_009620	A	6	6	381938	381943	100 %	0 %	0 %	0 %	150376076
104	NC_009620	C	6	6	386194	386199	0 %	0 %	0 %	100 %	150376082
105	NC_009620	C	6	6	387364	387369	0 %	0 %	0 %	100 %	150376083
106	NC_009620	C	6	6	395658	395663	0 %	0 %	0 %	100 %	150376092
107	NC_009620	T	6	6	397328	397333	0 %	100 %	0 %	0 %	150376094
108	NC_009620	C	6	6	397669	397674	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_009620	A	6	6	399786	399791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009620	T	6	6	400346	400351	0 %	100 %	0 %	0 %	150376098
111	NC_009620	A	7	7	400849	400855	100 %	0 %	0 %	0 %	150376098
112	NC_009620	G	6	6	405327	405332	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009620	C	6	6	406985	406990	0 %	0 %	0 %	100 %	150376105
114	NC_009620	C	6	6	407711	407716	0 %	0 %	0 %	100 %	150376105
115	NC_009620	A	7	7	419671	419677	100 %	0 %	0 %	0 %	150376114
116	NC_009620	G	6	6	428808	428813	0 %	0 %	100 %	0 %	150376123
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118	NC_009620	T	6	6	432444	432449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009620	A	6	6	432481	432486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009620	T	7	7	436135	436141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009620	C	6	6	448632	448637	0 %	0 %	0 %	100 %	150376140
122	NC_009620	G	6	6	448918	448923	0 %	0 %	100 %	0 %	150376140
123	NC_009620	G	6	6	452012	452017	0 %	0 %	100 %	0 %	150376143
124	NC_009620	C	6	6	454921	454926	0 %	0 %	0 %	100 %	150376146
125	NC_009620	G	6	6	457914	457919	0 %	0 %	100 %	0 %	150376148
126	NC_009620	C	6	6	460095	460100	0 %	0 %	0 %	100 %	150376150
127	NC_009620	C	6	6	464754	464759	0 %	0 %	0 %	100 %	150376154
128	NC_009620	C	6	6	470459	470464	0 %	0 %	0 %	100 %	150376159
129	NC_009620	G	6	6	476129	476134	0 %	0 %	100 %	0 %	150376164
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131	NC_009620	G	6	6	481500	481505	0 %	0 %	100 %	0 %	150376167
132	NC_009620	A	6	6	482556	482561	100 %	0 %	0 %	0 %	150376169
133	NC_009620	C	6	6	484774	484779	0 %	0 %	0 %	100 %	150376171
134	NC_009620	A	6	6	486689	486694	100 %	0 %	0 %	0 %	150376172
135	NC_009620	C	6	6	498003	498008	0 %	0 %	0 %	100 %	150376181
136	NC_009620	C	6	6	501756	501761	0 %	0 %	0 %	100 %	150376184
137	NC_009620	T	6	6	503001	503006	0 %	100 %	0 %	0 %	150376185
138	NC_009620	A	7	7	503258	503264	100 %	0 %	0 %	0 %	150376186
139	NC_009620	G	6	6	506029	506034	0 %	0 %	100 %	0 %	150376188
140	NC_009620	G	6	6	512296	512301	0 %	0 %	100 %	0 %	150376194
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.