MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED01

Total Repeats: 312

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009620	T	6	6	4445	4450	0 %	100 %	0 %	0 %	150375728
2	NC_009620	T	6	6	4466	4471	0 %	100 %	0 %	0 %	150375728
3	NC_009620	G	6	6	8659	8664	0 %	0 %	100 %	0 %	150375732
4	NC_009620	C	6	6	11695	11700	0 %	0 %	0 %	100 %	150375735
5	NC_009620	A	6	6	22861	22866	100 %	0 %	0 %	0 %	150375746
6	NC_009620	A	6	6	29782	29787	100 %	0 %	0 %	0 %	150375753
7	NC_009620	T	6	6	31157	31162	0 %	100 %	0 %	0 %	150375754
8	NC_009620	T	6	6	34275	34280	0 %	100 %	0 %	0 %	150375756
9	NC_009620	T	6	6	36047	36052	0 %	100 %	0 %	0 %	150375758
10	NC_009620	T	6	6	37077	37082	0 %	100 %	0 %	0 %	150375759
11	NC_009620	A	6	6	57662	57667	100 %	0 %	0 %	0 %	150375774
12	NC_009620	C	6	6	60415	60420	0 %	0 %	0 %	100 %	150375776
13	NC_009620	G	6	6	64900	64905	0 %	0 %	100 %	0 %	150375781
14	NC_009620	A	6	6	69513	69518	100 %	0 %	0 %	0 %	150375785
15	NC_009620	G	7	7	79137	79143	0 %	0 %	100 %	0 %	150375792
16	NC_009620	G	7	7	87526	87532	0 %	0 %	100 %	0 %	150375800
17	NC_009620	C	6	6	94346	94351	0 %	0 %	0 %	100 %	150375806
18	NC_009620	A	6	6	98992	98997	100 %	0 %	0 %	0 %	150375811
19	NC_009620	A	6	6	107197	107202	100 %	0 %	0 %	0 %	150375817
20	NC_009620	T	7	7	113389	113395	0 %	100 %	0 %	0 %	150375823
21	NC_009620	T	6	6	115880	115885	0 %	100 %	0 %	0 %	150375826
22	NC_009620	T	6	6	117207	117212	0 %	100 %	0 %	0 %	150375828
23	NC_009620	A	6	6	119779	119784	100 %	0 %	0 %	0 %	150375830
24	NC_009620	G	7	7	120560	120566	0 %	0 %	100 %	0 %	150375831
25	NC_009620	T	6	6	128546	128551	0 %	100 %	0 %	0 %	150375838
26	NC_009620	A	6	6	131694	131699	100 %	0 %	0 %	0 %	150375840
27	NC_009620	T	6	6	132380	132385	0 %	100 %	0 %	0 %	150375841
28	NC_009620	T	6	6	134009	134014	0 %	100 %	0 %	0 %	150375842
29	NC_009620	C	6	6	143716	143721	0 %	0 %	0 %	100 %	150375852
30	NC_009620	A	6	6	143866	143871	100 %	0 %	0 %	0 %	150375853
31	NC_009620	C	6	6	144644	144649	0 %	0 %	0 %	100 %	150375853
32	NC_009620	C	7	7	148952	148958	0 %	0 %	0 %	100 %	150375857
33	NC_009620	C	6	6	152126	152131	0 %	0 %	0 %	100 %	150375860
34	NC_009620	C	6	6	158318	158323	0 %	0 %	0 %	100 %	150375866
35	NC_009620	C	6	6	159095	159100	0 %	0 %	0 %	100 %	150375866
36	NC_009620	A	6	6	163896	163901	100 %	0 %	0 %	0 %	150375870
37	NC_009620	A	6	6	169895	169900	100 %	0 %	0 %	0 %	150375876
38	NC_009620	C	7	7	183268	183274	0 %	0 %	0 %	100 %	150375888
39	NC_009620	G	7	7	184871	184877	0 %	0 %	100 %	0 %	150375889
40	NC_009620	T	6	6	195757	195762	0 %	100 %	0 %	0 %	150375902
41	NC_009620	A	6	6	196494	196499	100 %	0 %	0 %	0 %	150375902
42	NC_009620	C	6	6	197722	197727	0 %	0 %	0 %	100 %	150375903
43	NC_009620	G	7	7	231125	231131	0 %	0 %	100 %	0 %	150375934
44	NC_009620	C	6	6	235149	235154	0 %	0 %	0 %	100 %	150375937
45	NC_009620	T	7	7	235767	235773	0 %	100 %	0 %	0 %	150375937
46	NC_009620	T	6	6	239135	239140	0 %	100 %	0 %	0 %	150375940
47	NC_009620	A	6	6	239961	239966	100 %	0 %	0 %	0 %	150375941
48	NC_009620	G	6	6	242437	242442	0 %	0 %	100 %	0 %	150375942
49	NC_009620	T	6	6	247062	247067	0 %	100 %	0 %	0 %	150375946
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51	NC_009620	C	6	6	253822	253827	0 %	0 %	0 %	100 %	150375953
52	NC_009620	C	6	6	253857	253862	0 %	0 %	0 %	100 %	150375953
53	NC_009620	C	6	6	254338	254343	0 %	0 %	0 %	100 %	150375953
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63	NC_009620	A	6	6	293536	293541	100 %	0 %	0 %	0 %	150375987
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66	NC_009620	A	7	7	299055	299061	100 %	0 %	0 %	0 %	150375991
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106	NC_009620	C	6	6	484774	484779	0 %	0 %	0 %	100 %	150376171
107	NC_009620	A	6	6	486689	486694	100 %	0 %	0 %	0 %	150376172
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121	NC_009620	T	6	6	533773	533778	0 %	100 %	0 %	0 %	150376215
122	NC_009620	C	6	6	535610	535615	0 %	0 %	0 %	100 %	150376218
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.