MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 plasmid pSJH101

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009619	ATTA	2	8	47	54	50 %	50 %	0 %	0 %	150375693
2	NC_009619	AGTA	2	8	856	863	50 %	25 %	25 %	0 %	150375695
3	NC_009619	TTCA	2	8	979	986	25 %	50 %	0 %	25 %	150375695
4	NC_009619	ACTA	2	8	1123	1130	50 %	25 %	0 %	25 %	150375695
5	NC_009619	ATAA	2	8	1631	1638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009619	AATT	2	8	1854	1861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009619	GAAA	2	8	1950	1957	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009619	AATA	2	8	1958	1965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009619	GAAA	2	8	1974	1981	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009619	AAAT	2	8	2125	2132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009619	CTTT	2	8	2403	2410	0 %	75 %	0 %	25 %	150375696
12	NC_009619	TCAT	2	8	2587	2594	25 %	50 %	0 %	25 %	150375696
13	NC_009619	AAAT	2	8	2635	2642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009619	CTTA	2	8	2660	2667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009619	AAGA	2	8	2863	2870	75 %	0 %	25 %	0 %	150375697
16	NC_009619	TTAT	2	8	3564	3571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009619	AAAT	2	8	3866	3873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009619	CAAA	2	8	3888	3895	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009619	TACA	2	8	4185	4192	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009619	TTAG	2	8	4876	4883	25 %	50 %	25 %	0 %	150375698
21	NC_009619	TCAT	2	8	4996	5003	25 %	50 %	0 %	25 %	150375698
22	NC_009619	CTTC	2	8	5141	5148	0 %	50 %	0 %	50 %	150375698
23	NC_009619	TTTA	2	8	5241	5248	25 %	75 %	0 %	0 %	150375698
24	NC_009619	TTAG	2	8	5452	5459	25 %	50 %	25 %	0 %	150375698
25	NC_009619	TCTT	2	8	5508	5515	0 %	75 %	0 %	25 %	150375698
26	NC_009619	TTTA	2	8	5604	5611	25 %	75 %	0 %	0 %	150375699
27	NC_009619	ATTT	2	8	5619	5626	25 %	75 %	0 %	0 %	150375699
28	NC_009619	TAAA	2	8	5779	5786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009619	GATG	2	8	5876	5883	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009619	ACAA	2	8	6174	6181	75 %	0 %	0 %	25 %	150375700
31	NC_009619	AAGA	2	8	6333	6340	75 %	0 %	25 %	0 %	150375700
32	NC_009619	GTTT	2	8	6705	6712	0 %	75 %	25 %	0 %	150375700
33	NC_009619	CAAA	2	8	6806	6813	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009619	ACAT	2	8	7376	7383	50 %	25 %	0 %	25 %	150375701
35	NC_009619	AAGA	2	8	7610	7617	75 %	0 %	25 %	0 %	150375701
36	NC_009619	TTTA	2	8	8233	8240	25 %	75 %	0 %	0 %	150375702
37	NC_009619	ATAA	2	8	8455	8462	75 %	25 %	0 %	0 %	150375702
38	NC_009619	GAAA	2	8	8841	8848	75 %	0 %	25 %	0 %	150375703
39	NC_009619	GATT	2	8	9897	9904	25 %	50 %	25 %	0 %	150375703
40	NC_009619	AATC	2	8	10311	10318	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009619	ACAT	2	8	10734	10741	50 %	25 %	0 %	25 %	150375704
42	NC_009619	AAGA	2	8	10968	10975	75 %	0 %	25 %	0 %	150375704
43	NC_009619	CTTT	2	8	11277	11284	0 %	75 %	0 %	25 %	150375705
44	NC_009619	ATTT	2	8	11515	11522	25 %	75 %	0 %	0 %	150375705
45	NC_009619	TATT	2	8	11560	11567	25 %	75 %	0 %	0 %	150375705
46	NC_009619	AGTA	2	8	11954	11961	50 %	25 %	25 %	0 %	150375705
47	NC_009619	TTTA	2	8	12206	12213	25 %	75 %	0 %	0 %	150375705
48	NC_009619	TCGC	2	8	13128	13135	0 %	25 %	25 %	50 %	150375706
49	NC_009619	ATGT	2	8	13644	13651	25 %	50 %	25 %	0 %	150375706
50	NC_009619	TTGA	2	8	14283	14290	25 %	50 %	25 %	0 %	150375707
51	NC_009619	AATG	2	8	14599	14606	50 %	25 %	25 %	0 %	150375707
52	NC_009619	TAAA	2	8	15750	15757	75 %	25 %	0 %	0 %	150375708
53	NC_009619	AACA	2	8	16028	16035	75 %	0 %	0 %	25 %	150375708
54	NC_009619	AATT	2	8	16379	16386	50 %	50 %	0 %	0 %	150375709
55	NC_009619	TCAA	2	8	16529	16536	50 %	25 %	0 %	25 %	150375709
56	NC_009619	AGCA	2	8	16544	16551	50 %	0 %	25 %	25 %	150375709
57	NC_009619	TTAT	2	8	16597	16604	25 %	75 %	0 %	0 %	150375709
58	NC_009619	GTTT	2	8	16793	16800	0 %	75 %	25 %	0 %	150375709
59	NC_009619	ATAA	2	8	16908	16915	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009619	TCAA	2	8	17139	17146	50 %	25 %	0 %	25 %	150375710
61	NC_009619	TGAT	2	8	17829	17836	25 %	50 %	25 %	0 %	150375711
62	NC_009619	ATGT	2	8	17867	17874	25 %	50 %	25 %	0 %	150375711
63	NC_009619	TCAT	2	8	18546	18553	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009619	TCTA	2	8	18573	18580	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009619	ACAT	2	8	18985	18992	50 %	25 %	0 %	25 %	150375713
66	NC_009619	AAGA	2	8	19219	19226	75 %	0 %	25 %	0 %	150375713
67	NC_009619	CATT	2	8	19856	19863	25 %	50 %	0 %	25 %	150375714
68	NC_009619	CTTT	2	8	20564	20571	0 %	75 %	0 %	25 %	150375715
69	NC_009619	AATA	2	8	21039	21046	75 %	25 %	0 %	0 %	150375715
70	NC_009619	AAAG	2	8	21198	21205	75 %	0 %	25 %	0 %	150375715
71	NC_009619	ATTT	2	8	21723	21730	25 %	75 %	0 %	0 %	150375716
72	NC_009619	TATT	2	8	21991	21998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009619	AATA	2	8	22442	22449	75 %	25 %	0 %	0 %	150375717
74	NC_009619	GTTT	2	8	22662	22669	0 %	75 %	25 %	0 %	150375717
75	NC_009619	CTAG	2	8	22728	22735	25 %	25 %	25 %	25 %	150375717
76	NC_009619	TTAA	2	8	22999	23006	50 %	50 %	0 %	0 %	150375718
77	NC_009619	AATG	2	8	23246	23253	50 %	25 %	25 %	0 %	150375718
78	NC_009619	TGAA	2	8	23259	23266	50 %	25 %	25 %	0 %	150375718
79	NC_009619	ATTT	2	8	23583	23590	25 %	75 %	0 %	0 %	150375718
80	NC_009619	TTAG	2	8	24334	24341	25 %	50 %	25 %	0 %	150375718
81	NC_009619	TCGT	2	8	24679	24686	0 %	50 %	25 %	25 %	150375719
82	NC_009619	TTCA	2	8	24691	24698	25 %	50 %	0 %	25 %	150375719
83	NC_009619	TCTA	2	8	24733	24740	25 %	50 %	0 %	25 %	150375719
84	NC_009619	ATAC	2	8	25032	25039	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009619	AAAT	2	8	25369	25376	75 %	25 %	0 %	0 %	150375720
86	NC_009619	TCCA	2	8	25889	25896	25 %	25 %	0 %	50 %	150375721
87	NC_009619	TAAA	2	8	26134	26141	75 %	25 %	0 %	0 %	150375721
88	NC_009619	CTTT	2	8	26177	26184	0 %	75 %	0 %	25 %	150375721
89	NC_009619	TCTT	2	8	26207	26214	0 %	75 %	0 %	25 %	150375721
90	NC_009619	AATT	2	8	26389	26396	50 %	50 %	0 %	0 %	150375721
91	NC_009619	ATTA	2	8	26428	26435	50 %	50 %	0 %	0 %	150375721
92	NC_009619	AATG	2	8	26468	26475	50 %	25 %	25 %	0 %	150375721
93	NC_009619	TCTT	2	8	26610	26617	0 %	75 %	0 %	25 %	150375721
94	NC_009619	ACTT	2	8	27098	27105	25 %	50 %	0 %	25 %	150375722
95	NC_009619	AGCA	2	8	27183	27190	50 %	0 %	25 %	25 %	150375722
96	NC_009619	TAAA	2	8	27668	27675	75 %	25 %	0 %	0 %	150375723
97	NC_009619	TAAA	2	8	27965	27972	75 %	25 %	0 %	0 %	150375723
98	NC_009619	TTAA	2	8	28054	28061	50 %	50 %	0 %	0 %	150375723
99	NC_009619	ATTT	2	8	28387	28394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009619	ATAA	2	8	28442	28449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009619	TTTA	2	8	28807	28814	25 %	75 %	0 %	0 %	150375724
102	NC_009619	CTTT	2	8	28893	28900	0 %	75 %	0 %	25 %	150375724
103	NC_009619	GTTA	2	8	29377	29384	25 %	50 %	25 %	0 %	150375725
104	NC_009619	GAAT	2	8	29765	29772	50 %	25 %	25 %	0 %	150375725
105	NC_009619	AATG	2	8	30190	30197	50 %	25 %	25 %	0 %	150375725

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.