MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium beijerinckii NCIMB 8052 chromosome

Total Repeats: 4399

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009617	ATTAT	2	10	1009	1018	40 %	60 %	0 %	0 %	150014893
2	NC_009617	ATTTA	2	10	2556	2565	40 %	60 %	0 %	0 %	150014894
3	NC_009617	AATAA	2	10	3031	3040	80 %	20 %	0 %	0 %	150014895
4	NC_009617	TAGAT	2	10	3513	3522	40 %	40 %	20 %	0 %	150014896
5	NC_009617	ATTAT	2	10	3842	3851	40 %	60 %	0 %	0 %	150014896
6	NC_009617	ACAAT	2	10	4476	4485	60 %	20 %	0 %	20 %	150014897
7	NC_009617	AAAGG	2	10	5145	5154	60 %	0 %	40 %	0 %	150014898
8	NC_009617	AAGAA	2	10	6554	6563	80 %	0 %	20 %	0 %	150014898
9	NC_009617	ATGAA	2	10	6675	6684	60 %	20 %	20 %	0 %	150014899
10	NC_009617	AATTA	2	10	15326	15335	60 %	40 %	0 %	0 %	150014901
11	NC_009617	AGATG	2	10	15527	15536	40 %	20 %	40 %	0 %	150014901
12	NC_009617	ATATA	2	10	15889	15898	60 %	40 %	0 %	0 %	150014902
13	NC_009617	TATAA	2	10	18443	18452	60 %	40 %	0 %	0 %	150014904
14	NC_009617	TAATT	2	10	18517	18526	40 %	60 %	0 %	0 %	150014904
15	NC_009617	AAAAT	2	10	19004	19013	80 %	20 %	0 %	0 %	150014905
16	NC_009617	AAAAT	2	10	19622	19631	80 %	20 %	0 %	0 %	150014905
17	NC_009617	AGATA	2	10	20252	20261	60 %	20 %	20 %	0 %	150014905
18	NC_009617	TAATT	2	10	20892	20901	40 %	60 %	0 %	0 %	150014905
19	NC_009617	ATAGA	2	10	21650	21659	60 %	20 %	20 %	0 %	150014905
20	NC_009617	AAGAA	2	10	25621	25630	80 %	0 %	20 %	0 %	150014906
21	NC_009617	AAGAT	2	10	25941	25950	60 %	20 %	20 %	0 %	150014906
22	NC_009617	TTATT	2	10	26242	26251	20 %	80 %	0 %	0 %	150014907
23	NC_009617	ACTTT	2	10	26255	26264	20 %	60 %	0 %	20 %	150014907
24	NC_009617	CCTTT	2	10	26559	26568	0 %	60 %	0 %	40 %	150014907
25	NC_009617	TCTTT	2	10	26748	26757	0 %	80 %	0 %	20 %	150014907
26	NC_009617	AATTA	2	10	26833	26842	60 %	40 %	0 %	0 %	150014907
27	NC_009617	ATTTT	2	10	28473	28482	20 %	80 %	0 %	0 %	150014909
28	NC_009617	AATTT	2	10	28841	28850	40 %	60 %	0 %	0 %	150014909
29	NC_009617	AAAGT	2	10	29190	29199	60 %	20 %	20 %	0 %	150014909
30	NC_009617	TTTTA	2	10	29529	29538	20 %	80 %	0 %	0 %	150014910
31	NC_009617	ATTAT	2	10	30044	30053	40 %	60 %	0 %	0 %	150014910
32	NC_009617	AACAA	2	10	30811	30820	80 %	0 %	0 %	20 %	150014911
33	NC_009617	ATAAA	2	10	35677	35686	80 %	20 %	0 %	0 %	150014915
34	NC_009617	TAATT	2	10	39065	39074	40 %	60 %	0 %	0 %	150014919
35	NC_009617	AAAGC	2	10	40399	40408	60 %	0 %	20 %	20 %	150014920
36	NC_009617	TAATA	2	10	40935	40944	60 %	40 %	0 %	0 %	150014920
37	NC_009617	ATAGT	2	10	42196	42205	40 %	40 %	20 %	0 %	150014921
38	NC_009617	ATGTA	2	10	42299	42308	40 %	40 %	20 %	0 %	150014921
39	NC_009617	ATTCA	2	10	43923	43932	40 %	40 %	0 %	20 %	150014921
40	NC_009617	GTTAA	2	10	44888	44897	40 %	40 %	20 %	0 %	150014922
41	NC_009617	AATTG	2	10	45993	46002	40 %	40 %	20 %	0 %	150014923
42	NC_009617	GTTAA	2	10	47120	47129	40 %	40 %	20 %	0 %	150014924
43	NC_009617	GGAAA	2	10	47405	47414	60 %	0 %	40 %	0 %	150014924
44	NC_009617	AAAGT	2	10	48632	48641	60 %	20 %	20 %	0 %	150014926
45	NC_009617	TATTT	2	10	49040	49049	20 %	80 %	0 %	0 %	150014927
46	NC_009617	TAGAA	2	10	49913	49922	60 %	20 %	20 %	0 %	150014928
47	NC_009617	TAATA	2	10	50468	50477	60 %	40 %	0 %	0 %	150014928
48	NC_009617	TGAAT	2	10	50585	50594	40 %	40 %	20 %	0 %	150014928
49	NC_009617	AATTG	2	10	51455	51464	40 %	40 %	20 %	0 %	150014928
50	NC_009617	GAATA	2	10	52352	52361	60 %	20 %	20 %	0 %	150014928
51	NC_009617	TTATA	2	10	53519	53528	40 %	60 %	0 %	0 %	150014929
52	NC_009617	TTTAC	2	10	53689	53698	20 %	60 %	0 %	20 %	150014929
53	NC_009617	TAGTT	2	10	53907	53916	20 %	60 %	20 %	0 %	150014930
54	NC_009617	ATTTT	2	10	58896	58905	20 %	80 %	0 %	0 %	150014935
55	NC_009617	TCAGT	2	10	58963	58972	20 %	40 %	20 %	20 %	150014935
56	NC_009617	GATAA	2	10	58981	58990	60 %	20 %	20 %	0 %	150014935
57	NC_009617	TTAGA	2	10	65518	65527	40 %	40 %	20 %	0 %	150014940
58	NC_009617	TAAGA	2	10	66453	66462	60 %	20 %	20 %	0 %	150014941
59	NC_009617	TATTT	2	10	67206	67215	20 %	80 %	0 %	0 %	150014942
60	NC_009617	CTTTT	2	10	67280	67289	0 %	80 %	0 %	20 %	150014942
61	NC_009617	GAAAA	2	10	69137	69146	80 %	0 %	20 %	0 %	150014945
62	NC_009617	AAGTA	2	10	70615	70624	60 %	20 %	20 %	0 %	150014946
63	NC_009617	GAAAT	2	10	70663	70672	60 %	20 %	20 %	0 %	150014946
64	NC_009617	ATATT	2	10	72602	72611	40 %	60 %	0 %	0 %	150014947
65	NC_009617	AGGAA	2	10	74856	74865	60 %	0 %	40 %	0 %	150014948
66	NC_009617	AAGTA	2	10	76843	76852	60 %	20 %	20 %	0 %	150014949
67	NC_009617	AGAAA	2	10	77304	77313	80 %	0 %	20 %	0 %	150014950
68	NC_009617	AAGAG	2	10	78500	78509	60 %	0 %	40 %	0 %	150014951
69	NC_009617	AGAAA	2	10	79964	79973	80 %	0 %	20 %	0 %	150014952
70	NC_009617	GAATG	2	10	81092	81101	40 %	20 %	40 %	0 %	150014953
71	NC_009617	GAAGT	2	10	82711	82720	40 %	20 %	40 %	0 %	150014955
72	NC_009617	TAATC	2	10	85952	85961	40 %	40 %	0 %	20 %	150014959
73	NC_009617	ATTAG	2	10	86042	86051	40 %	40 %	20 %	0 %	150014959
74	NC_009617	AGATA	2	10	87307	87316	60 %	20 %	20 %	0 %	150014960
75	NC_009617	AGAAA	2	10	88024	88033	80 %	0 %	20 %	0 %	150014960
76	NC_009617	CTTAT	2	10	88416	88425	20 %	60 %	0 %	20 %	150014960
77	NC_009617	GAAGA	2	10	91869	91878	60 %	0 %	40 %	0 %	150014962
78	NC_009617	TACCT	2	10	92643	92652	20 %	40 %	0 %	40 %	150014962
79	NC_009617	TTTAT	2	10	94180	94189	20 %	80 %	0 %	0 %	150014964
80	NC_009617	ACAAT	2	10	97904	97913	60 %	20 %	0 %	20 %	150014967
81	NC_009617	AAAGC	2	10	99784	99793	60 %	0 %	20 %	20 %	150014968
82	NC_009617	AATGA	2	10	102839	102848	60 %	20 %	20 %	0 %	150014970
83	NC_009617	AAATA	2	10	103236	103245	80 %	20 %	0 %	0 %	150014971
84	NC_009617	ATATA	2	10	103478	103487	60 %	40 %	0 %	0 %	150014971
85	NC_009617	ACTTA	2	10	105872	105881	40 %	40 %	0 %	20 %	150014973
86	NC_009617	TAAAT	2	10	108169	108178	60 %	40 %	0 %	0 %	150014975
87	NC_009617	AGACA	2	10	109253	109262	60 %	0 %	20 %	20 %	150014976
88	NC_009617	AAAAG	2	10	112499	112508	80 %	0 %	20 %	0 %	150014978
89	NC_009617	ATTTA	2	10	117729	117738	40 %	60 %	0 %	0 %	150014982
90	NC_009617	GAATA	2	10	117810	117819	60 %	20 %	20 %	0 %	150014982
91	NC_009617	ATGAA	2	10	118893	118902	60 %	20 %	20 %	0 %	150014982
92	NC_009617	ATTAT	2	10	120510	120519	40 %	60 %	0 %	0 %	150014986
93	NC_009617	AAATT	2	10	121021	121030	60 %	40 %	0 %	0 %	150014987
94	NC_009617	TTAAA	2	10	124578	124587	60 %	40 %	0 %	0 %	150014989
95	NC_009617	AAAGG	2	10	124906	124915	60 %	0 %	40 %	0 %	150014989
96	NC_009617	AGATT	2	10	125109	125118	40 %	40 %	20 %	0 %	150014989
97	NC_009617	GATGG	2	10	125387	125396	20 %	20 %	60 %	0 %	150014989
98	NC_009617	AGCAA	2	10	125423	125432	60 %	0 %	20 %	20 %	150014989
99	NC_009617	AAATA	2	10	126786	126795	80 %	20 %	0 %	0 %	150014990
100	NC_009617	ATACT	2	10	127629	127638	40 %	40 %	0 %	20 %	150014991
101	NC_009617	AAAGC	2	10	128649	128658	60 %	0 %	20 %	20 %	150014992
102	NC_009617	AGATG	2	10	129631	129640	40 %	20 %	40 %	0 %	150014992
103	NC_009617	GGTTT	2	10	133048	133057	0 %	60 %	40 %	0 %	150014995
104	NC_009617	ATTAT	2	10	133083	133092	40 %	60 %	0 %	0 %	150014995
105	NC_009617	AGAAA	2	10	134477	134486	80 %	0 %	20 %	0 %	150014996
106	NC_009617	GATTG	2	10	135229	135238	20 %	40 %	40 %	0 %	150014997
107	NC_009617	GAAAT	2	10	138524	138533	60 %	20 %	20 %	0 %	150014998
108	NC_009617	AGTTC	2	10	140181	140190	20 %	40 %	20 %	20 %	150014999
109	NC_009617	TATTT	2	10	148395	148404	20 %	80 %	0 %	0 %	150015001
110	NC_009617	TTTGG	2	10	149047	149056	0 %	60 %	40 %	0 %	150015001
111	NC_009617	TAATA	2	10	149175	149184	60 %	40 %	0 %	0 %	150015001
112	NC_009617	ATATA	2	10	149761	149770	60 %	40 %	0 %	0 %	150015002
113	NC_009617	TGTAA	2	10	150284	150293	40 %	40 %	20 %	0 %	150015002
114	NC_009617	AATTT	2	10	151431	151440	40 %	60 %	0 %	0 %	150015003
115	NC_009617	TAGAT	2	10	153231	153240	40 %	40 %	20 %	0 %	150015005
116	NC_009617	GATAT	2	10	153278	153287	40 %	40 %	20 %	0 %	150015005
117	NC_009617	TAAAT	2	10	155054	155063	60 %	40 %	0 %	0 %	150015008
118	NC_009617	TAGAA	2	10	155183	155192	60 %	20 %	20 %	0 %	150015008
119	NC_009617	TTGAT	2	10	160323	160332	20 %	60 %	20 %	0 %	150015015
120	NC_009617	ATAGA	2	10	161268	161277	60 %	20 %	20 %	0 %	150015015
121	NC_009617	AAAGA	2	10	161748	161757	80 %	0 %	20 %	0 %	150015016
122	NC_009617	AGTAT	2	10	164594	164603	40 %	40 %	20 %	0 %	150015018
123	NC_009617	TAATT	2	10	166597	166606	40 %	60 %	0 %	0 %	150015020
124	NC_009617	TCAAG	2	10	167336	167345	40 %	20 %	20 %	20 %	150015020
125	NC_009617	AAAGA	2	10	168037	168046	80 %	0 %	20 %	0 %	150015021
126	NC_009617	ATAGT	2	10	168182	168191	40 %	40 %	20 %	0 %	150015021
127	NC_009617	GAAAT	2	10	168938	168947	60 %	20 %	20 %	0 %	150015022
128	NC_009617	GCAAT	2	10	169496	169505	40 %	20 %	20 %	20 %	150015022
129	NC_009617	GAAAA	2	10	169868	169877	80 %	0 %	20 %	0 %	150015022
130	NC_009617	ACCAT	2	10	169983	169992	40 %	20 %	0 %	40 %	150015022
131	NC_009617	TATAA	2	10	170245	170254	60 %	40 %	0 %	0 %	150015022
132	NC_009617	TTTGA	2	10	171426	171435	20 %	60 %	20 %	0 %	150015023
133	NC_009617	AAAAT	2	10	172505	172514	80 %	20 %	0 %	0 %	150015025
134	NC_009617	AAAAG	2	10	172866	172875	80 %	0 %	20 %	0 %	150015025
135	NC_009617	ATGGA	2	10	175605	175614	40 %	20 %	40 %	0 %	150015028
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