MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium beijerinckii NCIMB 8052 chromosome

Total Repeats: 4936

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009617	TTTA	2	8	76	83	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009617	TTAA	2	8	9385	9392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009617	GAAA	2	8	9523	9530	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009617	GTGA	2	8	10016	10023	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009617	AATA	2	8	11315	11322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009617	AGAA	2	8	11566	11573	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009617	GCGA	2	8	11595	11602	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009617	GCTA	2	8	12832	12839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009617	CTGA	2	8	14223	14230	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009617	TTGT	2	8	14354	14361	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009617	TATG	2	8	14734	14741	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009617	GCGT	2	8	17614	17621	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009617	TAAT	2	8	17814	17821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009617	AATA	2	8	17875	17882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009617	AATA	2	8	17967	17974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009617	ATAA	2	8	17982	17989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009617	GCGT	2	8	18069	18076	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009617	TTAA	2	8	18260	18267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009617	TAAA	2	8	18278	18285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009617	TAAT	2	8	18298	18305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009617	ATTA	2	8	18325	18332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009617	ATTA	2	8	22376	22383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009617	TTTA	2	8	27493	27500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009617	ATTT	2	8	28235	28242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009617	GTTA	2	8	29432	29439	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009617	ACGG	2	8	29460	29467	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009617	ACAT	2	8	30609	30616	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009617	AATT	2	8	34170	34177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009617	TAAT	2	8	34243	34250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009617	TAAA	2	8	35843	35850	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009617	AATA	2	8	35982	35989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009617	ATTA	2	8	38828	38835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009617	AGGA	2	8	38963	38970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009617	ATAA	2	8	40033	40040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009617	TATC	2	8	40117	40124	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009617	TGAA	2	8	40224	40231	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009617	TCAT	2	8	45143	45150	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009617	ATAA	2	8	46366	46373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009617	ATAA	2	8	46598	46605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009617	AGTA	2	8	48238	48245	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009617	GTAG	2	8	49348	49355	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009617	TTAA	2	8	49441	49448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009617	TAAT	2	8	52738	52745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009617	TATG	2	8	52763	52770	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009617	ACAT	2	8	56720	56727	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009617	ATTT	2	8	56729	56736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009617	AACT	2	8	57046	57053	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009617	TTAA	2	8	57096	57103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009617	TAAA	2	8	57175	57182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009617	GTTG	2	8	60445	60452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009617	GTAT	2	8	60557	60564	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009617	ATTT	2	8	64030	64037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009617	TTAG	2	8	65135	65142	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009617	TGTA	2	8	65272	65279	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009617	TTAG	2	8	68710	68717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009617	TAAA	2	8	72031	72038	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009617	ATTA	2	8	72044	72051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009617	AATA	2	8	72542	72549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009617	TAAA	2	8	74570	74577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009617	ATTT	2	8	74692	74699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009617	AAAG	2	8	77152	77159	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009617	AATA	2	8	78716	78723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009617	ATTT	2	8	81497	81504	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009617	TATT	2	8	84187	84194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009617	ATAA	2	8	84517	84524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009617	TTAT	2	8	84539	84546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009617	AAAT	2	8	85430	85437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009617	TGTA	2	8	85602	85609	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009617	AGTA	2	8	85848	85855	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009617	TAAA	2	8	85878	85885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009617	AAAT	2	8	89857	89864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009617	TAAT	2	8	93226	93233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009617	TGAA	2	8	93950	93957	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009617	TAAT	2	8	94711	94718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009617	ATTA	2	8	94920	94927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009617	AAAT	2	8	95945	95952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009617	AACT	2	8	97231	97238	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009617	TTAA	2	8	98594	98601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009617	TAAA	2	8	98607	98614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009617	AAAT	2	8	98779	98786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009617	TAAA	2	8	98789	98796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009617	CTAA	2	8	98898	98905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009617	TAAT	2	8	100460	100467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009617	TATT	2	8	100752	100759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009617	TAAT	2	8	102903	102910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009617	GTAA	2	8	104740	104747	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009617	TAAA	2	8	107192	107199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009617	TAAA	2	8	107269	107276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009617	TTAA	2	8	107328	107335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009617	AATT	2	8	113846	113853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009617	TAAT	2	8	115188	115195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009617	TAAA	2	8	118946	118953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009617	AAAG	2	8	119038	119045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009617	ATAA	2	8	119839	119846	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009617	AAAT	2	8	119868	119875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009617	AAAT	2	8	121612	121619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009617	TAGA	2	8	123043	123050	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009617	GATT	2	8	123138	123145	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009617	ATTA	2	8	123301	123308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009617	TAAA	2	8	126037	126044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009617	TTTA	2	8	134082	134089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009617	CTAA	2	8	134143	134150	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_009617	ATTT	2	8	134303	134310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009617	ATAA	2	8	134354	134361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009617	TATT	2	8	136423	136430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009617	AAGA	2	8	136599	136606	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009617	TAAA	2	8	136639	136646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009617	GCAT	2	8	137130	137137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009617	TACT	2	8	137236	137243	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009617	AATG	2	8	137761	137768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009617	TAAA	2	8	139306	139313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009617	TAAT	2	8	141979	141986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009617	TATT	2	8	142131	142138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009617	GTGA	2	8	142846	142853	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009617	AGAA	2	8	144584	144591	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009617	GCGA	2	8	144613	144620	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009617	GCTA	2	8	145850	145857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009617	CTGA	2	8	147241	147248	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009617	TTTC	2	8	147329	147336	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009617	ATTT	2	8	147623	147630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009617	AATT	2	8	147721	147728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009617	TAAA	2	8	147892	147899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009617	AAAT	2	8	147977	147984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009617	CATG	2	8	148017	148024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009617	CGAA	2	8	148216	148223	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009617	CTTA	2	8	152137	152144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009617	AAAT	2	8	152154	152161	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009617	AAGT	2	8	157008	157015	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009617	TAAA	2	8	157030	157037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009617	TAAT	2	8	163018	163025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009617	TATT	2	8	163181	163188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009617	ATTG	2	8	163332	163339	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009617	TAAT	2	8	163403	163410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009617	AAAT	2	8	164895	164902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009617	TATT	2	8	164943	164950	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009617	ATTT	2	8	166199	166206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009617	TAAT	2	8	166307	166314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009617	TTAA	2	8	168245	168252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009617	ATTA	2	8	168488	168495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009617	AAAG	2	8	171716	171723	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009617	TTAA	2	8	176935	176942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009617	ATAA	2	8	187119	187126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009617	ATTT	2	8	191784	191791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009617	AAAT	2	8	191800	191807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009617	GAGT	2	8	199846	199853	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009617	AAAT	2	8	204906	204913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009617	TAAT	2	8	204965	204972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009617	AAAT	2	8	204976	204983	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009617	GTTT	2	8	211485	211492	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009617	CTTA	2	8	211548	211555	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_009617	AGGG	2	8	211586	211593	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009617	ATAA	2	8	212537	212544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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