MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium beijerinckii NCIMB 8052 chromosome

Total Repeats: 76395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009617	TCT	2	6	391	396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150014893
2	NC_009617	TAT	2	6	516	521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014893
3	NC_009617	AGA	2	6	543	548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014893
4	NC_009617	TCA	2	6	559	564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150014893
5	NC_009617	ATG	2	6	593	598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014893
6	NC_009617	GTC	2	6	603	608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150014893
7	NC_009617	TGC	2	6	672	677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150014893
8	NC_009617	TAA	2	6	848	853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014893
9	NC_009617	GAT	2	6	865	870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014893
10	NC_009617	GAA	2	6	877	882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014893
11	NC_009617	GAT	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014893
12	NC_009617	AAG	2	6	959	964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014893
13	NC_009617	ATG	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014893
14	NC_009617	AGA	2	6	1053	1058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014893
15	NC_009617	CTA	2	6	1196	1201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150014893
16	NC_009617	TAA	2	6	1238	1243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014893
17	NC_009617	AAT	2	6	1245	1250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014893
18	NC_009617	CTC	2	6	1257	1262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150014893
19	NC_009617	ATA	2	6	1315	1320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014893
20	NC_009617	GAA	2	6	1501	1506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014893
21	NC_009617	GGA	2	6	1510	1515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150014893
22	NC_009617	TGA	2	6	1572	1577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014893
23	NC_009617	CAA	2	6	1964	1969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150014894
24	NC_009617	CAA	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150014894
25	NC_009617	TAT	2	6	2070	2075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014894
26	NC_009617	GAA	2	6	2077	2082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014894
27	NC_009617	ATA	2	6	2119	2124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
28	NC_009617	TAA	2	6	2174	2179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
29	NC_009617	CTT	2	6	2312	2317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150014894
30	NC_009617	TTC	2	6	2348	2353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150014894
31	NC_009617	ATT	2	6	2361	2366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014894
32	NC_009617	AGA	2	6	2505	2510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014894
33	NC_009617	TAA	2	6	2541	2546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
34	NC_009617	ATA	2	6	2578	2583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
35	NC_009617	ATT	2	6	2622	2627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014894
36	NC_009617	TAA	2	6	2726	2731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
37	NC_009617	TAA	2	6	2759	2764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
38	NC_009617	GGA	2	6	2877	2882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150014894
39	NC_009617	GTT	2	6	2890	2895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150014894
40	NC_009617	GAA	2	6	2932	2937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014894
41	NC_009617	ATA	2	6	2939	2944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
42	NC_009617	AGG	2	6	2990	2995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150014894
43	NC_009617	GTA	2	6	3196	3201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014895
44	NC_009617	ATA	2	6	3226	3231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014895
45	NC_009617	TAT	2	6	3412	3417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014896
46	NC_009617	TAA	2	6	3461	3466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014896
47	NC_009617	GTA	2	6	3622	3627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014896
48	NC_009617	AGA	2	6	3639	3644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014896
49	NC_009617	AAG	2	6	3659	3664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014896
50	NC_009617	AAG	3	9	3675	3683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014896
51	NC_009617	ATA	2	6	3743	3748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014896
52	NC_009617	TTA	2	6	3772	3777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014896
53	NC_009617	AGA	2	6	3927	3932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014896
54	NC_009617	ATT	2	6	3989	3994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014896
55	NC_009617	ATA	2	6	4010	4015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014896
56	NC_009617	GAT	2	6	4063	4068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014896
57	NC_009617	ATA	2	6	4085	4090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014896
58	NC_009617	ACA	2	6	4119	4124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150014896
59	NC_009617	TAT	2	6	4196	4201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014896
60	NC_009617	GAT	2	6	4207	4212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014896
61	NC_009617	TAA	2	6	4280	4285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014896
62	NC_009617	ATT	2	6	4313	4318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014896
63	NC_009617	GAT	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014896
64	NC_009617	GTA	2	6	4410	4415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014897
65	NC_009617	ATT	2	6	4431	4436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014897
66	NC_009617	AGA	3	9	4499	4507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014897
67	NC_009617	AGA	2	6	4529	4534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014897
68	NC_009617	ATA	2	6	4567	4572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014897
69	NC_009617	ATC	2	6	4598	4603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150014897
70	NC_009617	ATG	2	6	4723	4728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014898
71	NC_009617	TCA	2	6	4814	4819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150014898
72	NC_009617	ATA	2	6	4840	4845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014898
73	NC_009617	TGA	2	6	4850	4855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014898
74	NC_009617	TAA	2	6	4874	4879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014898
75	NC_009617	GGT	2	6	5007	5012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150014898
76	NC_009617	GGA	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150014898
77	NC_009617	GAA	2	6	5088	5093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014898
78	NC_009617	GCA	2	6	5129	5134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150014898
79	NC_009617	TGA	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014898
80	NC_009617	TAG	2	6	5317	5322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014898
81	NC_009617	AGA	2	6	5339	5344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014898
82	NC_009617	ATA	2	6	5446	5451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014898
83	NC_009617	CAA	2	6	5513	5518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150014898
84	NC_009617	TGA	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014898
85	NC_009617	TTG	2	6	5758	5763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150014898
86	NC_009617	TTG	2	6	5815	5820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150014898
87	NC_009617	GAA	2	6	6004	6009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014898
88	NC_009617	ATA	2	6	6166	6171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014898
89	NC_009617	GAT	2	6	6264	6269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014898
90	NC_009617	ACC	2	6	6290	6295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150014898
91	NC_009617	TAT	2	6	6327	6332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014898
92	NC_009617	TTA	2	6	6477	6482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014898
93	NC_009617	AGA	2	6	6494	6499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014898
94	NC_009617	ACA	2	6	6569	6574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150014898
95	NC_009617	TGT	2	6	6587	6592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150014898
96	NC_009617	AGA	2	6	6767	6772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014899
97	NC_009617	ATC	2	6	6861	6866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150014899
98	NC_009617	ATG	2	6	6888	6893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014899
99	NC_009617	GCT	2	6	6983	6988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150014899
100	NC_009617	TAA	2	6	7045	7050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014899
101	NC_009617	AGT	2	6	7099	7104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014899
102	NC_009617	TCA	2	6	7142	7147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150014899
103	NC_009617	CCA	2	6	7178	7183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150014899
104	NC_009617	AAT	2	6	7198	7203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014899
105	NC_009617	TAT	2	6	7213	7218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014899
106	NC_009617	ATA	2	6	7349	7354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014899
107	NC_009617	AGA	3	9	7375	7383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014899
108	NC_009617	AAT	2	6	7399	7404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014899
109	NC_009617	GTA	2	6	7568	7573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014899
110	NC_009617	TAT	2	6	7581	7586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014899
111	NC_009617	ATT	2	6	7619	7624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014899
112	NC_009617	TAA	2	6	7639	7644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014899
113	NC_009617	AAG	2	6	7701	7706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014899
114	NC_009617	AAG	2	6	7714	7719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014899
115	NC_009617	TAA	2	6	7803	7808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014899
116	NC_009617	TAA	2	6	7812	7817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014899
117	NC_009617	TAC	2	6	7828	7833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150014899
118	NC_009617	AAG	2	6	7912	7917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014899
119	NC_009617	GAA	2	6	8006	8011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014899
120	NC_009617	TTA	2	6	8025	8030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014899
121	NC_009617	AAG	3	9	8127	8135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014899
122	NC_009617	TGT	2	6	8137	8142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150014899
123	NC_009617	TCA	2	6	8195	8200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150014899
124	NC_009617	AGA	2	6	8204	8209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014899
125	NC_009617	GAT	2	6	8246	8251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014899
126	NC_009617	TTG	2	6	8253	8258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150014899
127	NC_009617	TGA	2	6	8265	8270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014899
128	NC_009617	ATG	2	6	8346	8351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014899
129	NC_009617	AGA	2	6	8490	8495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014899
130	NC_009617	TGA	2	6	8560	8565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014899
131	NC_009617	GAA	2	6	8667	8672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014899
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