MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacteroides vulgatus ATCC 8482 chromosome

Total Repeats: 215

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009614	CAGAAA	2	12	52137	52148	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009614	TCTTTT	2	12	69673	69684	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009614	ACTGCC	2	12	116919	116930	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009614	GGCAGT	2	12	116974	116985	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_009614	GAATCA	2	12	194078	194089	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_009614	ACTTAA	2	12	262483	262494	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_009614	ATCTTT	2	12	317784	317795	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009614	TCGCTT	2	12	345610	345621	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009614	TATCAA	2	12	348303	348314	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009614	TTGTAT	2	12	381683	381694	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009614	GTAAAA	2	12	388787	388798	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009614	AAATTT	2	12	430904	430915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009614	TATAAA	2	12	435103	435114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009614	CTTTTT	2	12	484466	484477	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009614	TTTATC	2	12	496197	496208	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_009614	TTTACG	2	12	512630	512641	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_009614	CAAAAG	2	12	533431	533442	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009614	TCAATT	2	12	538789	538800	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_009614	TTATAA	2	12	558299	558310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009614	AAAACG	2	12	575532	575543	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009614	TGTGGA	2	12	577658	577669	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009614	AAAGAA	2	12	622150	622161	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009614	ATTTGT	2	12	641874	641885	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009614	CCTGCC	2	12	644111	644122	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_009614	TCGCTT	2	12	646723	646734	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009614	TATCAA	2	12	649402	649413	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009614	AAAGAT	2	12	660457	660468	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009614	ATTTAA	2	12	687823	687834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009614	GAAATA	2	12	687919	687930	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009614	ACTTTT	2	12	706512	706523	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009614	TTATGC	2	12	753716	753727	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009614	TTAAAT	2	12	768053	768064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009614	TTAAAA	2	12	791979	791990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009614	ATAAAA	2	12	815678	815689	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009614	TATCAA	2	12	839841	839852	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_009614	AAAAAG	2	12	899587	899598	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009614	TACAAT	2	12	906086	906097	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_009614	GCAGAG	2	12	913690	913701	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_009614	GGCCCT	2	12	943972	943983	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009614	TTGTAA	2	12	944318	944329	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009614	GATGCC	2	12	985266	985277	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009614	AAAAAG	2	12	988221	988232	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009614	ATTCGT	2	12	1001443	1001454	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_009614	AACAAA	2	12	1080250	1080261	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_009614	CATACA	2	12	1080593	1080604	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009614	TAAAAA	2	12	1094993	1095004	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009614	TTTTTA	2	12	1151239	1151250	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009614	TGCTTC	2	12	1160359	1160370	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009614	AGATGC	2	12	1222814	1222825	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_009614	AATGAA	2	12	1238488	1238499	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009614	TCCTAT	2	12	1262500	1262511	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009614	TTGTTT	2	12	1278188	1278199	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009614	ATATTT	2	12	1291394	1291405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009614	GAAAAT	2	12	1292299	1292310	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009614	GTTTAA	2	12	1296957	1296968	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009614	ATATTT	2	12	1300069	1300080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009614	GAAAAT	2	12	1300974	1300985	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009614	GTTTAA	2	12	1305632	1305643	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009614	CTAATC	2	12	1334617	1334628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009614	CATCAG	2	12	1343811	1343822	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009614	TTAAAG	2	12	1382750	1382761	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009614	TTCATT	2	12	1383726	1383737	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_009614	AAGGAA	2	12	1390762	1390773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009614	TTTTAT	2	12	1421654	1421665	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009614	ATGATA	2	12	1438400	1438411	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009614	AAATAA	2	12	1495075	1495086	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009614	TAAAAA	2	12	1531354	1531365	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009614	TTATTT	2	12	1640125	1640136	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009614	GTTTTT	2	12	1643289	1643300	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009614	TCCTTT	2	12	1671992	1672003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009614	TAGTCA	2	12	1725142	1725153	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_009614	ATTTTA	2	12	1725378	1725389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009614	CTTTTT	2	12	1745888	1745899	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009614	TAAAAA	2	12	1754399	1754410	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009614	GTTATT	2	12	1817164	1817175	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009614	GTTATT	2	12	1822448	1822459	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009614	TTTAAA	2	12	1844860	1844871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009614	TTATAT	2	12	1849539	1849550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009614	TGTTCA	2	12	1863705	1863716	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_009614	GTTCCT	2	12	1888626	1888637	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009614	TTTCTT	2	12	1939130	1939141	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_009614	AGAAAT	2	12	1994531	1994542	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009614	TTCTTT	2	12	2011364	2011375	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_009614	GGCATC	2	12	2014325	2014336	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009614	GTCAAG	2	12	2071127	2071138	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_009614	ATATCA	2	12	2075728	2075739	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_009614	ATATTG	2	12	2095376	2095387	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009614	AAGCGA	2	12	2098058	2098069	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_009614	GTGGGT	2	12	2100565	2100576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009614	ACTTGA	2	12	2100686	2100697	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_009614	CCATTG	2	12	2127061	2127072	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009614	ATAAAA	2	12	2173167	2173178	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009614	ATATTG	2	12	2183468	2183479	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009614	AAGCGA	2	12	2186150	2186161	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_009614	GTGGGT	2	12	2188657	2188668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009614	GGCAGG	2	12	2188716	2188727	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_009614	CCTGTT	2	12	2197360	2197371	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009614	CCATCT	2	12	2212238	2212249	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009614	AGTATG	2	12	2231643	2231654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009614	AATTAA	2	12	2235359	2235370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009614	TATTGT	2	12	2297753	2297764	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009614	TATCGT	2	12	2315912	2315923	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_009614	AAATTT	2	12	2449707	2449718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009614	GAAAAA	2	12	2474102	2474113	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009614	TTAATT	2	12	2486155	2486166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009614	GTTTTT	2	12	2499131	2499142	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009614	TCAAAA	2	12	2499312	2499323	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_009614	CAAAGA	2	12	2499432	2499443	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_009614	GATTAT	2	12	2517072	2517083	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009614	ATATTG	2	12	2587655	2587666	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009614	AAGCGA	2	12	2590338	2590349	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_009614	GGCAGG	2	12	2592949	2592960	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_009614	TTTATT	2	12	2599646	2599657	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009614	TTAAAA	2	12	2623023	2623034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009614	TCCACA	2	12	2655702	2655713	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009614	AAAGTA	2	12	2675441	2675452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009614	TTATTG	2	12	2675499	2675510	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009614	CCGTAT	2	12	2691068	2691079	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009614	ATTAAA	2	12	2738865	2738876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009614	TGACAA	2	12	2791774	2791785	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_009614	ATGGAC	2	12	2813924	2813935	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_009614	TTTTAA	2	12	2814053	2814064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009614	AAAGTT	2	12	2908089	2908100	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009614	TTTTTC	2	12	2908131	2908142	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_009614	TCTTTT	2	12	2976405	2976416	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_009614	ATAAAA	2	12	2985902	2985913	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.