MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Flavobacterium psychrophilum JIP02/86 complete genome

Total Repeats: 259

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009613	TAAATT	2	12	317	328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009613	TTATAA	2	12	64316	64327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009613	TTTATA	2	12	112381	112392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009613	TTAATT	2	12	115821	115832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009613	TAAATT	2	12	118308	118319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009613	ATCTTA	2	12	129919	129930	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_009613	TTTAAA	2	12	129980	129991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009613	TTTTAA	2	12	134272	134283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009613	AAAAAC	2	12	151683	151694	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009613	AAAACA	2	12	158839	158850	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009613	TTTTTA	2	12	183870	183881	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009613	TTTGAA	2	12	191993	192004	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009613	TTAAAA	2	12	196072	196083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009613	TTTTTA	2	12	197547	197558	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009613	AATATA	2	12	201166	201177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009613	TAAAAT	2	12	267997	268008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009613	TGTTTT	2	12	296204	296215	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009613	CTAAAA	2	12	307234	307245	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_009613	TAGATT	2	12	308804	308815	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009613	GTTTTT	2	12	309996	310007	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009613	AGCCCT	2	12	315391	315402	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009613	TGCACA	2	12	319549	319560	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009613	GTAAAT	2	12	323242	323253	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009613	AATAAA	2	12	326322	326333	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009613	AATTAA	2	12	353929	353940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009613	TCTTGT	2	12	354303	354314	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009613	TTTCAT	2	12	355103	355114	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009613	ATTTGC	2	12	355374	355385	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009613	TGTTGC	2	12	355434	355445	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_009613	TTGAAT	2	12	356228	356239	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009613	TTTATT	2	12	360661	360672	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009613	TAAAAA	2	12	391720	391731	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009613	TAGTTG	2	12	394277	394288	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009613	AAATAA	2	12	408992	409003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009613	TGTTTA	2	12	440364	440375	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009613	TAAAAT	2	12	476658	476669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009613	ATTTTT	2	12	481482	481493	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009613	CAAAAC	2	12	509145	509156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009613	AAGAAA	2	12	509371	509382	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009613	TAGAAT	2	12	512108	512119	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009613	CGTTGA	2	12	512563	512574	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_009613	AGTACC	2	12	513425	513436	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009613	AAAAAT	2	12	519928	519939	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009613	TAAATA	2	12	522390	522401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009613	ATAAAA	2	12	557095	557106	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009613	AAGTTT	2	12	585487	585498	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009613	AAAATT	2	12	637122	637133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009613	CAAAAC	2	12	644909	644920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009613	AAGAAA	2	12	645135	645146	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009613	TAGAAT	2	12	647872	647883	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009613	CGTTGA	2	12	648327	648338	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_009613	AGTACC	2	12	649189	649200	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009613	GTATTG	2	12	650893	650904	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009613	ATAATT	2	12	683673	683684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009613	ATTTTT	2	12	709055	709066	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009613	AATTAA	2	12	709307	709318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009613	AATAAA	2	12	713962	713973	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009613	TGAATT	2	12	747872	747883	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009613	ATTTTT	2	12	748440	748451	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009613	ACGTGA	2	12	750099	750110	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_009613	TTTTAA	2	12	750197	750208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009613	TTTTAA	2	12	751318	751329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009613	TTTTTA	2	12	763399	763410	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009613	TAATTA	2	12	765641	765652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009613	ATAAAA	2	12	767126	767137	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009613	TAAAAT	2	12	801111	801122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009613	CAAAAA	2	12	802368	802379	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_009613	AAATTT	2	12	804458	804469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009613	TTTAAA	2	12	804477	804488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009613	TTAAAC	2	12	810980	810991	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_009613	ATAAAA	2	12	820842	820853	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009613	AATTTT	2	12	821132	821143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009613	TTTTTC	2	12	835513	835524	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009613	TAAAAA	2	12	839787	839798	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009613	TAAAAA	2	12	853425	853436	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009613	TGTAAA	2	12	866293	866304	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009613	TAAATT	2	12	898115	898126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009613	GGTTTT	2	12	914075	914086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009613	AGATTT	2	12	920289	920300	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009613	AAAAGT	2	12	925458	925469	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009613	AATTTT	2	12	931167	931178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009613	ATTTTT	2	12	941704	941715	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009613	CAAAAA	2	12	977795	977806	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_009613	GTAAAA	2	12	981431	981442	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009613	TGTTTT	2	12	1022252	1022263	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009613	AAATTC	2	12	1066864	1066875	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_009613	TTTTAA	2	12	1072448	1072459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009613	AAACAA	2	12	1102537	1102548	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_009613	AAATTA	2	12	1103393	1103404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009613	CAAAAC	2	12	1113170	1113181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009613	AAGAAA	2	12	1113396	1113407	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009613	TAGAAT	2	12	1116133	1116144	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009613	CGTTGA	2	12	1116588	1116599	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_009613	AGTACC	2	12	1117450	1117461	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009613	ATTGAA	2	12	1143476	1143487	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009613	TCTGGG	2	12	1172377	1172388	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_009613	GTCTTC	2	12	1172463	1172474	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009613	TGGTAC	2	12	1174588	1174599	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_009613	AATTAA	2	12	1175137	1175148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009613	TTTGTC	2	12	1184880	1184891	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_009613	AAATTT	2	12	1202797	1202808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009613	TAAAAA	2	12	1213651	1213662	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009613	TTTTAT	2	12	1218667	1218678	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009613	TAAAAA	2	12	1224272	1224283	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009613	TTTATT	2	12	1225821	1225832	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009613	TATAAA	2	12	1233491	1233502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009613	TAAAAC	2	12	1244022	1244033	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_009613	TAAGAT	2	12	1246686	1246697	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009613	TAAAAA	2	12	1285980	1285991	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009613	AGTATT	2	12	1296090	1296101	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009613	ATATTA	2	12	1297126	1297137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009613	TATATT	2	12	1303949	1303960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009613	CAATAC	2	12	1311718	1311729	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009613	GGTACT	2	12	1313422	1313433	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_009613	TCAACG	2	12	1314284	1314295	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009613	ATTCTA	2	12	1314739	1314750	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_009613	GGTTTT	2	12	1317701	1317712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009613	AAATTC	2	12	1324092	1324103	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_009613	TTTGTG	2	12	1327610	1327621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009613	ATTTTA	2	12	1359401	1359412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009613	TTTTAT	2	12	1406904	1406915	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009613	ATGTAA	2	12	1413769	1413780	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009613	ATTTTT	2	12	1418897	1418908	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009613	TAAAAT	2	12	1420150	1420161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009613	CTTTTT	2	12	1423954	1423965	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_009613	ATTTTA	2	12	1471645	1471656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009613	TGGAGA	2	12	1471724	1471735	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009613	AAAAAT	2	12	1483083	1483094	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009613	ACATAA	2	12	1483170	1483181	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_009613	AAAAAG	2	12	1483595	1483606	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_009613	TTAAAA	2	12	2768058	2768069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_009613	TTTTAA	2	12	2810458	2810469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_009613	TTTTAA	2	12	2812198	2812209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_009613	TTTTAA	2	12	2813188	2813199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_009613	TTTCTT	2	12	2819035	2819046	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
259	NC_009613	CATTAC	2	12	2819448	2819459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.