MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Flavobacterium psychrophilum JIP02/86 complete genome

Total Repeats: 2901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009613	AAGGA	2	10	105	114	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009613	TCTAA	2	10	399	408	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009613	AACAC	2	10	1200	1209	60 %	0 %	0 %	40 %	150026517
4	NC_009613	ACAAT	2	10	1725	1734	60 %	20 %	0 %	20 %	150026517
5	NC_009613	TAATT	2	10	2775	2784	40 %	60 %	0 %	0 %	150026518
6	NC_009613	AAAAT	2	10	2870	2879	80 %	20 %	0 %	0 %	150026518
7	NC_009613	ATTTA	2	10	4482	4491	40 %	60 %	0 %	0 %	150026520
8	NC_009613	ACCAA	2	10	5646	5655	60 %	0 %	0 %	40 %	150026521
9	NC_009613	ATTAT	2	10	7050	7059	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009613	AAGAT	2	10	7903	7912	60 %	20 %	20 %	0 %	150026523
11	NC_009613	TATTC	2	10	9905	9914	20 %	60 %	0 %	20 %	150026526
12	NC_009613	AACAA	2	10	12160	12169	80 %	0 %	0 %	20 %	150024115
13	NC_009613	TTTTC	2	10	12873	12882	0 %	80 %	0 %	20 %	150024115
14	NC_009613	TGGCG	2	10	12905	12914	0 %	20 %	60 %	20 %	150024115
15	NC_009613	ACCAA	2	10	13423	13432	60 %	0 %	0 %	40 %	150024115
16	NC_009613	AAACC	2	10	15287	15296	60 %	0 %	0 %	40 %	150024116
17	NC_009613	CAATT	2	10	15728	15737	40 %	40 %	0 %	20 %	150024117
18	NC_009613	AAGAT	2	10	16337	16346	60 %	20 %	20 %	0 %	150024117
19	NC_009613	AAAGT	2	10	16492	16501	60 %	20 %	20 %	0 %	150024117
20	NC_009613	TTAAA	2	10	17497	17506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009613	ATCTC	2	10	17954	17963	20 %	40 %	0 %	40 %	150024118
22	NC_009613	ATCAA	2	10	18021	18030	60 %	20 %	0 %	20 %	150024118
23	NC_009613	GAAAA	2	10	19049	19058	80 %	0 %	20 %	0 %	150024119
24	NC_009613	TTACT	2	10	19437	19446	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009613	ATATG	2	10	19568	19577	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009613	TTTTA	2	10	22599	22608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009613	CATCT	2	10	22794	22803	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009613	TGATG	2	10	24167	24176	20 %	40 %	40 %	0 %	150024121
29	NC_009613	AATAA	2	10	27176	27185	80 %	20 %	0 %	0 %	150024124
30	NC_009613	TAAAA	2	10	27592	27601	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009613	GTTTT	2	10	28526	28535	0 %	80 %	20 %	0 %	150024125
32	NC_009613	TTTGT	2	10	28894	28903	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009613	TATAT	2	10	29620	29629	40 %	60 %	0 %	0 %	150024126
34	NC_009613	AATGT	2	10	30333	30342	40 %	40 %	20 %	0 %	150024127
35	NC_009613	TAAAA	2	10	32234	32243	80 %	20 %	0 %	0 %	150024128
36	NC_009613	TAAAT	2	10	35928	35937	60 %	40 %	0 %	0 %	150024129
37	NC_009613	ATATT	2	10	36195	36204	40 %	60 %	0 %	0 %	150024129
38	NC_009613	TAATT	2	10	39555	39564	40 %	60 %	0 %	0 %	150024130
39	NC_009613	AGTAC	2	10	40981	40990	40 %	20 %	20 %	20 %	150024130
40	NC_009613	AATCT	2	10	41720	41729	40 %	40 %	0 %	20 %	150024130
41	NC_009613	CTTTA	2	10	42099	42108	20 %	60 %	0 %	20 %	150024130
42	NC_009613	TGTAA	2	10	42376	42385	40 %	40 %	20 %	0 %	150024130
43	NC_009613	TTAAC	2	10	43157	43166	40 %	40 %	0 %	20 %	150024130
44	NC_009613	ATATT	2	10	45315	45324	40 %	60 %	0 %	0 %	150024130
45	NC_009613	TCTAT	2	10	45506	45515	20 %	60 %	0 %	20 %	150024130
46	NC_009613	TTATA	2	10	46170	46179	40 %	60 %	0 %	0 %	150024130
47	NC_009613	CTAAT	2	10	46334	46343	40 %	40 %	0 %	20 %	150024130
48	NC_009613	AAATA	2	10	49421	49430	80 %	20 %	0 %	0 %	150024133
49	NC_009613	AGAAA	2	10	50464	50473	80 %	0 %	20 %	0 %	150024133
50	NC_009613	TAAAA	2	10	51036	51045	80 %	20 %	0 %	0 %	150024133
51	NC_009613	ATTCT	2	10	52201	52210	20 %	60 %	0 %	20 %	150024135
52	NC_009613	CAAAC	2	10	55837	55846	60 %	0 %	0 %	40 %	150024137
53	NC_009613	CCAAC	2	10	55851	55860	40 %	0 %	0 %	60 %	150024137
54	NC_009613	CCAAA	2	10	55861	55870	60 %	0 %	0 %	40 %	150024137
55	NC_009613	GAATC	2	10	56381	56390	40 %	20 %	20 %	20 %	150024138
56	NC_009613	AATCT	2	10	56575	56584	40 %	40 %	0 %	20 %	150024139
57	NC_009613	CAAAA	3	15	57433	57447	80 %	0 %	0 %	20 %	150024139
58	NC_009613	TCTTT	2	10	58773	58782	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009613	AATAA	2	10	58832	58841	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009613	GAATT	2	10	60509	60518	40 %	40 %	20 %	0 %	150024141
61	NC_009613	AGAAT	2	10	61486	61495	60 %	20 %	20 %	0 %	150024141
62	NC_009613	CACAA	2	10	62125	62134	60 %	0 %	0 %	40 %	150024141
63	NC_009613	AAAAG	2	10	62832	62841	80 %	0 %	20 %	0 %	150024142
64	NC_009613	CAAAA	2	10	63528	63537	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009613	AGCAA	2	10	65065	65074	60 %	0 %	20 %	20 %	150024145
66	NC_009613	TTTCT	2	10	65289	65298	0 %	80 %	0 %	20 %	150024145
67	NC_009613	ACATC	2	10	65546	65555	40 %	20 %	0 %	40 %	150024145
68	NC_009613	GTTTT	2	10	65998	66007	0 %	80 %	20 %	0 %	150024145
69	NC_009613	AAAAT	2	10	66157	66166	80 %	20 %	0 %	0 %	150024145
70	NC_009613	TTTTC	2	10	66807	66816	0 %	80 %	0 %	20 %	150024146
71	NC_009613	TCATC	2	10	66993	67002	20 %	40 %	0 %	40 %	150024146
72	NC_009613	TAATT	2	10	68492	68501	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009613	ATAAA	2	10	69914	69923	80 %	20 %	0 %	0 %	150024150
74	NC_009613	AAATT	2	10	70790	70799	60 %	40 %	0 %	0 %	150024151
75	NC_009613	TTATA	2	10	71620	71629	40 %	60 %	0 %	0 %	150024152
76	NC_009613	ATTTT	3	15	72783	72797	20 %	80 %	0 %	0 %	150024154
77	NC_009613	GCGTG	2	10	73683	73692	0 %	20 %	60 %	20 %	150024155
78	NC_009613	GCAAT	2	10	74380	74389	40 %	20 %	20 %	20 %	150024155
79	NC_009613	ATTGT	2	10	77453	77462	20 %	60 %	20 %	0 %	150024158
80	NC_009613	ATTTC	2	10	77812	77821	20 %	60 %	0 %	20 %	150024159
81	NC_009613	CATTC	2	10	82445	82454	20 %	40 %	0 %	40 %	150024164
82	NC_009613	ATGAC	2	10	82804	82813	40 %	20 %	20 %	20 %	150024164
83	NC_009613	TTGTT	2	10	83057	83066	0 %	80 %	20 %	0 %	150024164
84	NC_009613	ATTTT	2	10	84090	84099	20 %	80 %	0 %	0 %	150024165
85	NC_009613	AATCA	2	10	86778	86787	60 %	20 %	0 %	20 %	150024169
86	NC_009613	CAAAC	2	10	87590	87599	60 %	0 %	0 %	40 %	150024169
87	NC_009613	TTCAA	2	10	88539	88548	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009613	CTAAA	2	10	88663	88672	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_009613	TTAGT	2	10	89063	89072	20 %	60 %	20 %	0 %	150024171
90	NC_009613	CCAAA	2	10	90029	90038	60 %	0 %	0 %	40 %	150024172
91	NC_009613	TCTAT	2	10	90570	90579	20 %	60 %	0 %	20 %	150024172
92	NC_009613	CTATT	2	10	91100	91109	20 %	60 %	0 %	20 %	511542233
93	NC_009613	TTGTA	2	10	91815	91824	20 %	60 %	20 %	0 %	150024174
94	NC_009613	GTTTC	2	10	95775	95784	0 %	60 %	20 %	20 %	150024177
95	NC_009613	TATGA	2	10	95797	95806	40 %	40 %	20 %	0 %	150024177
96	NC_009613	ATTTT	2	10	96086	96095	20 %	80 %	0 %	0 %	150024177
97	NC_009613	ATTTT	2	10	97622	97631	20 %	80 %	0 %	0 %	150024178
98	NC_009613	CCCGA	2	10	98505	98514	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
99	NC_009613	GGTTT	2	10	99756	99765	0 %	60 %	40 %	0 %	150024181
100	NC_009613	AGTTT	2	10	100052	100061	20 %	60 %	20 %	0 %	150024181
101	NC_009613	TTTTG	2	10	101650	101659	0 %	80 %	20 %	0 %	150024183
102	NC_009613	CTTTA	2	10	102216	102225	20 %	60 %	0 %	20 %	150024183
103	NC_009613	TTTTG	2	10	103267	103276	0 %	80 %	20 %	0 %	150024185
104	NC_009613	GAATA	2	10	103708	103717	60 %	20 %	20 %	0 %	150024185
105	NC_009613	AACAA	2	10	104676	104685	80 %	0 %	0 %	20 %	150024185
106	NC_009613	AAATA	2	10	104843	104852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009613	TGTGC	2	10	105177	105186	0 %	40 %	40 %	20 %	150024186
108	NC_009613	AGGTA	2	10	105890	105899	40 %	20 %	40 %	0 %	150024186
109	NC_009613	GTTTT	2	10	107032	107041	0 %	80 %	20 %	0 %	150024187
110	NC_009613	ATCGA	2	10	107855	107864	40 %	20 %	20 %	20 %	150024188
111	NC_009613	AAAAT	2	10	111517	111526	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009613	AAATA	2	10	112144	112153	80 %	20 %	0 %	0 %	150024191
113	NC_009613	TTTGG	2	10	113241	113250	0 %	60 %	40 %	0 %	150024192
114	NC_009613	CTTTT	2	10	113384	113393	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009613	AATTG	2	10	115006	115015	40 %	40 %	20 %	0 %	150024194
116	NC_009613	AAATA	2	10	117622	117631	80 %	20 %	0 %	0 %	150024195
117	NC_009613	ATTTC	2	10	117727	117736	20 %	60 %	0 %	20 %	150024195
118	NC_009613	ATTAT	2	10	117890	117899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009613	GTTTT	2	10	120623	120632	0 %	80 %	20 %	0 %	150024199
120	NC_009613	TTTTG	2	10	121295	121304	0 %	80 %	20 %	0 %	150024199
121	NC_009613	CACGC	2	10	124106	124115	20 %	0 %	20 %	60 %	150024200
122	NC_009613	TGCCA	2	10	125579	125588	20 %	20 %	20 %	40 %	150024200
123	NC_009613	TGGTT	2	10	126298	126307	0 %	60 %	40 %	0 %	150024201
124	NC_009613	TTTTG	2	10	126542	126551	0 %	80 %	20 %	0 %	150024201
125	NC_009613	GAAAA	2	10	126642	126651	80 %	0 %	20 %	0 %	150024201
126	NC_009613	ATTAG	2	10	126935	126944	40 %	40 %	20 %	0 %	150024202
127	NC_009613	CAAAA	2	10	128627	128636	80 %	0 %	0 %	20 %	150024203
128	NC_009613	TGCAA	2	10	128952	128961	40 %	20 %	20 %	20 %	150024203
129	NC_009613	ATTAC	2	10	130032	130041	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009613	GTAAC	2	10	131577	131586	40 %	20 %	20 %	20 %	150024206
131	NC_009613	CAAAG	2	10	131966	131975	60 %	0 %	20 %	20 %	150024206
132	NC_009613	TACAC	2	10	132141	132150	40 %	20 %	0 %	40 %	150024206
133	NC_009613	AAAGA	2	10	132669	132678	80 %	0 %	20 %	0 %	150024206
134	NC_009613	TAAAA	2	10	133376	133385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009613	ATTAA	2	10	134487	134496	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009613	TGTTT	2	10	136317	136326	0 %	80 %	20 %	0 %	150024210
137	NC_009613	TTTGG	2	10	138140	138149	0 %	60 %	40 %	0 %	150024211
138	NC_009613	TCAAT	2	10	138512	138521	40 %	40 %	0 %	20 %	150024211
139	NC_009613	GTTTG	2	10	139902	139911	0 %	60 %	40 %	0 %	150024212
140	NC_009613	TTTCG	2	10	141912	141921	0 %	60 %	20 %	20 %	150024215
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142	NC_009613	GAATC	2	10	142964	142973	40 %	20 %	20 %	20 %	150024216
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147	NC_009613	TAAAA	2	10	150260	150269	80 %	20 %	0 %	0 %	150024223
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152	NC_009613	TATTT	2	10	159133	159142	20 %	80 %	0 %	0 %	150024230
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154	NC_009613	ATACA	2	10	160089	160098	60 %	20 %	0 %	20 %	150024231
155	NC_009613	ATTTT	2	10	160403	160412	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_009613	TTAAT	2	10	160803	160812	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_009613	TTTGT	2	10	164490	164499	0 %	80 %	20 %	0 %	150024236
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161	NC_009613	ATTTT	2	10	171795	171804	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_009613	TCTAT	2	10	172115	172124	20 %	60 %	0 %	20 %	150024243
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172	NC_009613	GTTTG	2	10	182840	182849	0 %	60 %	40 %	0 %	150024254
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197	NC_009613	TGTTT	2	10	215373	215382	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
198	NC_009613	TGTAA	2	10	224155	224164	40 %	40 %	20 %	0 %	150024283
199	NC_009613	TAAAA	2	10	225145	225154	80 %	20 %	0 %	0 %	150024283
200	NC_009613	TAAAA	2	10	229343	229352	80 %	20 %	0 %	0 %	150024286
201	NC_009613	GTAGC	2	10	229772	229781	20 %	20 %	40 %	20 %	150024287
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231	NC_009613	AAACA	2	10	258767	258776	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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252	NC_009613	ATTGT	2	10	278621	278630	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
253	NC_009613	ATTTT	2	10	278669	278678	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_009613	TATTT	2	10	279684	279693	20 %	80 %	0 %	0 %	150024334
255	NC_009613	CAAAA	2	10	281073	281082	80 %	0 %	0 %	20 %	150024335
256	NC_009613	ATTAC	2	10	281398	281407	40 %	40 %	0 %	20 %	150024335
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258	NC_009613	ACAAA	2	10	285249	285258	80 %	0 %	0 %	20 %	150024339
259	NC_009613	GTCAA	2	10	285442	285451	40 %	20 %	20 %	20 %	150024339
260	NC_009613	AAGTT	2	10	287802	287811	40 %	40 %	20 %	0 %	150024341
261	NC_009613	CATTG	2	10	288088	288097	20 %	40 %	20 %	20 %	150024341
262	NC_009613	GTTTT	2	10	290060	290069	0 %	80 %	20 %	0 %	150024341
263	NC_009613	TATTC	2	10	293484	293493	20 %	60 %	0 %	20 %	150024343
264	NC_009613	ATTTA	2	10	293886	293895	40 %	60 %	0 %	0 %	150024343
265	NC_009613	GATAG	2	10	295901	295910	40 %	20 %	40 %	0 %	150024345
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267	NC_009613	AGAAA	2	10	297277	297286	80 %	0 %	20 %	0 %	150024347
268	NC_009613	AATTG	2	10	299629	299638	40 %	40 %	20 %	0 %	150024349
269	NC_009613	ACTTT	2	10	301101	301110	20 %	60 %	0 %	20 %	150024351
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444	NC_009613	ATAAA	2	10	466673	466682	80 %	20 %	0 %	0 %	150025187
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