MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Flavobacterium psychrophilum JIP02/86 complete genome

Total Repeats: 554

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009613	AAGGA	2	10	105	114	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009613	TCTAA	2	10	399	408	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009613	ATTAT	2	10	7050	7059	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009613	TTAAA	2	10	17497	17506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009613	TTACT	2	10	19437	19446	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009613	ATATG	2	10	19568	19577	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009613	TTTTA	2	10	22599	22608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009613	CATCT	2	10	22794	22803	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009613	TAAAA	2	10	27592	27601	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009613	TTTGT	2	10	28894	28903	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009613	TCTTT	2	10	58773	58782	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009613	AATAA	2	10	58832	58841	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009613	CAAAA	2	10	63528	63537	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009613	TAATT	2	10	68492	68501	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009613	TTCAA	2	10	88539	88548	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009613	CTAAA	2	10	88663	88672	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009613	CCCGA	2	10	98505	98514	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_009613	AAATA	2	10	104843	104852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009613	AAAAT	2	10	111517	111526	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009613	CTTTT	2	10	113384	113393	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009613	ATTAT	2	10	117890	117899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009613	ATTAC	2	10	130032	130041	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009613	TAAAA	2	10	133376	133385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009613	ATTAA	2	10	134487	134496	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009613	AAACA	3	15	147081	147095	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009613	ATTTT	2	10	160403	160412	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009613	TTAAT	2	10	160803	160812	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009613	ATTTT	2	10	171795	171804	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009613	GTATT	2	10	181413	181422	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009613	AGTTT	2	10	182549	182558	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009613	TTTTG	2	10	182624	182633	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009613	AATCA	2	10	194671	194680	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009613	ATTAC	2	10	202644	202653	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009613	TTGAA	2	10	208822	208831	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009613	ATTAT	2	10	209893	209902	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009613	TGTTT	2	10	215373	215382	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009613	AAAAG	2	10	244273	244282	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009613	GGCTA	2	10	249813	249822	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009613	GTTGT	2	10	251804	251813	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009613	AAATT	2	10	258730	258739	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009613	AAACA	2	10	258767	258776	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009613	TTTAT	2	10	265907	265916	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009613	ATTGT	2	10	278621	278630	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009613	ATTTT	2	10	278669	278678	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009613	AATAA	2	10	296072	296081	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009613	TTTTA	2	10	301548	301557	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009613	GTTTT	3	15	302586	302600	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009613	GTTTT	2	10	302848	302857	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009613	GTTTT	3	15	302924	302938	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009613	TATAT	2	10	312197	312206	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009613	TAATT	2	10	312210	312219	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009613	TAAAA	2	10	319677	319686	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009613	GTTTT	2	10	319889	319898	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009613	CGTAA	2	10	320230	320239	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009613	ATTTT	2	10	321976	321985	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009613	TTGTG	2	10	323376	323385	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009613	GTTTT	2	10	338838	338847	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009613	GTTTT	2	10	353607	353616	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009613	TTTAT	2	10	360591	360600	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009613	CAAAT	2	10	375782	375791	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_009613	AGATT	2	10	375793	375802	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009613	TGAAT	2	10	389268	389277	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009613	AATAA	3	15	389709	389723	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009613	TTTTA	2	10	393218	393227	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009613	GAAAA	2	10	405473	405482	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009613	ATATT	2	10	414155	414164	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009613	TTTTA	2	10	428087	428096	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009613	ATCTT	2	10	438633	438642	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009613	ATTTT	2	10	440379	440388	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009613	GTTGT	2	10	445898	445907	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009613	TACTT	2	10	456713	456722	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_009613	TATAA	2	10	462823	462832	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009613	GCTAC	2	10	466905	466914	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_009613	GTTTT	2	10	468353	468362	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009613	TATAT	2	10	474539	474548	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009613	TTTAA	2	10	474558	474567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009613	CAAAC	2	10	475492	475501	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_009613	ATTAT	2	10	482485	482494	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009613	AATTC	2	10	504452	504461	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_009613	TGAAT	2	10	506662	506671	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009613	GGTCG	2	10	508687	508696	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009613	ATTGA	2	10	509524	509533	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009613	ATAGT	2	10	509824	509833	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009613	GGTAA	2	10	509901	509910	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009613	TGTAG	2	10	510321	510330	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009613	TCGGA	2	10	510936	510945	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009613	TAAAG	2	10	511409	511418	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009613	CTGAA	2	10	511969	511978	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_009613	AGAAA	2	10	513069	513078	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009613	AATTC	2	10	519815	519824	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_009613	TGTTT	2	10	521184	521193	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009613	ATTTT	2	10	524396	524405	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009613	TTATT	2	10	531977	531986	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009613	ATGTT	2	10	547318	547327	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009613	TTTAA	2	10	557132	557141	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009613	TAATT	2	10	566245	566254	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009613	CAAAA	2	10	568211	568220	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009613	AACTT	2	10	571260	571269	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009613	TAAAA	2	10	577314	577323	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009613	ACATA	2	10	582633	582642	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009613	GTTAT	2	10	586873	586882	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009613	TTATA	2	10	592736	592745	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009613	TTGTT	2	10	596497	596506	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009613	ATTTT	2	10	597971	597980	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009613	ACTTT	2	10	607902	607911	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009613	TCTTG	2	10	623705	623714	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009613	ATTTT	2	10	637558	637567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009613	TATTT	2	10	642069	642078	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009613	CAATG	2	10	643678	643687	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009613	GGTCG	2	10	644459	644468	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_009613	ATTGA	2	10	645288	645297	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009613	ATAGT	2	10	645588	645597	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009613	GGTAA	2	10	645665	645674	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009613	TGTAG	2	10	646085	646094	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009613	TCGGA	2	10	646700	646709	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_009613	TAAAG	2	10	647173	647182	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009613	CTGAA	2	10	647733	647742	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_009613	AGAAA	2	10	648833	648842	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009613	ATTAT	2	10	654415	654424	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009613	GAATT	2	10	660570	660579	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009613	GTAGC	2	10	668840	668849	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009613	TTTAT	2	10	669773	669782	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009613	TTTTC	2	10	669817	669826	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_009613	CAATG	2	10	671925	671934	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_009613	ATATT	2	10	675135	675144	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009613	TAAAA	2	10	676025	676034	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009613	GTTTT	2	10	688981	688990	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009613	CCCGA	2	10	689109	689118	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_009613	AAAAT	2	10	699938	699947	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009613	TTGAT	2	10	709094	709103	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009613	TTTTG	2	10	721243	721252	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009613	AATTA	2	10	727464	727473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009613	ATTCT	2	10	735249	735258	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009613	TAAAA	2	10	747919	747928	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009613	GTATT	2	10	748163	748172	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009613	TCAAA	2	10	748191	748200	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009613	ATTTT	2	10	749945	749954	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009613	TTAAT	2	10	749977	749986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009613	CTTTT	2	10	753561	753570	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_009613	TTTAA	2	10	773009	773018	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009613	TTGGT	2	10	773757	773766	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009613	AAAAT	2	10	774622	774631	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009613	TAAAA	2	10	775498	775507	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009613	TAATT	2	10	775963	775972	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009613	TCTTT	2	10	778345	778354	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_009613	AATTT	2	10	778588	778597	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009613	TATAA	2	10	778610	778619	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009613	ATTTT	2	10	778707	778716	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_009613	ACTAT	2	10	2512456	2512465	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

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