MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Flavobacterium psychrophilum JIP02/86 complete genome

Total Repeats: 33465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009613	CAA	2	6	600	605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150026517
2	NC_009613	ACT	2	6	667	672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150026517
3	NC_009613	GAT	2	6	680	685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026517
4	NC_009613	TAG	2	6	744	749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026517
5	NC_009613	ACA	2	6	930	935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150026517
6	NC_009613	GAA	2	6	936	941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026517
7	NC_009613	CAA	2	6	1103	1108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150026517
8	NC_009613	TGT	2	6	1114	1119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150026517
9	NC_009613	TGA	2	6	1381	1386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026517
10	NC_009613	AAG	2	6	1464	1469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026517
11	NC_009613	TAG	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026517
12	NC_009613	GAA	2	6	1586	1591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026517
13	NC_009613	GAA	2	6	1656	1661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026517
14	NC_009613	GAA	2	6	1694	1699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026517
15	NC_009613	GCT	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150026517
16	NC_009613	ATC	2	6	1944	1949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150026517
17	NC_009613	AGA	2	6	1954	1959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026517
18	NC_009613	ACG	2	6	2034	2039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150026517
19	NC_009613	ATT	3	9	2259	2267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026517
20	NC_009613	TCG	2	6	2287	2292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150026517
21	NC_009613	TTG	2	6	2318	2323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150026517
22	NC_009613	GAT	2	6	2576	2581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026517
23	NC_009613	TAG	2	6	2613	2618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026517
24	NC_009613	GAA	2	6	2689	2694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026517
25	NC_009613	AAT	3	9	2724	2732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026517
26	NC_009613	TAG	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026518
27	NC_009613	TTA	2	6	2816	2821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026518
28	NC_009613	AAT	2	6	2923	2928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026518
29	NC_009613	GAT	2	6	2974	2979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026518
30	NC_009613	TAG	2	6	2981	2986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026518
31	NC_009613	AAG	2	6	3089	3094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026518
32	NC_009613	ATC	2	6	3141	3146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150026518
33	NC_009613	TAT	2	6	3156	3161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026518
34	NC_009613	AGG	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150026518
35	NC_009613	AGG	2	6	3267	3272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150026518
36	NC_009613	TAG	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026518
37	NC_009613	TGG	2	6	3321	3326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150026518
38	NC_009613	ATA	2	6	3405	3410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026518
39	NC_009613	GAC	2	6	3724	3729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150026519
40	NC_009613	ATT	2	6	3735	3740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026519
41	NC_009613	TAT	3	9	3753	3761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026519
42	NC_009613	AGC	2	6	3810	3815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150026519
43	NC_009613	GAG	2	6	3820	3825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150026519
44	NC_009613	AGT	2	6	3828	3833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026519
45	NC_009613	TTA	2	6	3923	3928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026519
46	NC_009613	TAT	2	6	4031	4036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026519
47	NC_009613	AGT	2	6	4093	4098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026519
48	NC_009613	AGT	2	6	4196	4201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026519
49	NC_009613	TTC	2	6	4434	4439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150026520
50	NC_009613	CAC	2	6	4466	4471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150026520
51	NC_009613	AGG	2	6	4476	4481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150026520
52	NC_009613	AAT	2	6	4503	4508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026520
53	NC_009613	TAA	2	6	4569	4574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026520
54	NC_009613	TCT	2	6	4594	4599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150026520
55	NC_009613	ATG	2	6	4655	4660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026520
56	NC_009613	TCT	2	6	4720	4725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150026520
57	NC_009613	AAC	2	6	4730	4735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150026520
58	NC_009613	TAA	2	6	4769	4774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026520
59	NC_009613	GAA	2	6	4894	4899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026521
60	NC_009613	AGA	2	6	4929	4934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026521
61	NC_009613	CCA	2	6	4981	4986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150026521
62	NC_009613	CGA	2	6	5082	5087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150026521
63	NC_009613	AGA	2	6	5103	5108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026521
64	NC_009613	AGA	2	6	5133	5138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026521
65	NC_009613	AGA	2	6	5166	5171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026521
66	NC_009613	ATT	2	6	5186	5191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026521
67	NC_009613	TCA	2	6	5260	5265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150026521
68	NC_009613	GAA	2	6	5380	5385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026521
69	NC_009613	TCT	2	6	5419	5424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150026521
70	NC_009613	CAT	2	6	5476	5481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150026521
71	NC_009613	ACA	2	6	5632	5637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150026521
72	NC_009613	GAT	2	6	5746	5751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026521
73	NC_009613	CAA	2	6	5762	5767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150026521
74	NC_009613	GCC	2	6	5780	5785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150026521
75	NC_009613	AGA	2	6	5970	5975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026521
76	NC_009613	AAG	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026521
77	NC_009613	AGA	2	6	6060	6065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026521
78	NC_009613	TAT	2	6	6138	6143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026521
79	NC_009613	GGA	2	6	6546	6551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150026521
80	NC_009613	GAA	2	6	6565	6570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026521
81	NC_009613	TGA	2	6	6578	6583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026521
82	NC_009613	ATA	2	6	6728	6733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026521
83	NC_009613	TAT	2	6	6740	6745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026521
84	NC_009613	TAA	2	6	6870	6875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026521
85	NC_009613	ATT	2	6	6963	6968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026521
86	NC_009613	AAT	2	6	7303	7308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026522
87	NC_009613	TAA	2	6	7368	7373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026522
88	NC_009613	TAA	3	9	7431	7439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026522
89	NC_009613	GAA	2	6	7453	7458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026522
90	NC_009613	AGA	2	6	7488	7493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026522
91	NC_009613	GAA	2	6	7543	7548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026522
92	NC_009613	AGA	2	6	7563	7568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026522
93	NC_009613	AAT	2	6	7610	7615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026522
94	NC_009613	TAT	2	6	7692	7697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026523
95	NC_009613	CTA	2	6	7729	7734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150026523
96	NC_009613	GTA	2	6	7776	7781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026523
97	NC_009613	TTA	2	6	7824	7829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026523
98	NC_009613	TAT	2	6	8043	8048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026524
99	NC_009613	TGC	2	6	8358	8363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150026525
100	NC_009613	GGC	2	6	8397	8402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150026525
101	NC_009613	GAG	2	6	8405	8410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150026525
102	NC_009613	TGT	2	6	8473	8478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150026525
103	NC_009613	CTT	2	6	8501	8506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150026525
104	NC_009613	CTA	2	6	8546	8551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150026525
105	NC_009613	ACG	2	6	8568	8573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150026525
106	NC_009613	CAA	2	6	8633	8638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150026525
107	NC_009613	GCT	2	6	8671	8676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150026525
108	NC_009613	CAT	2	6	8843	8848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150026525
109	NC_009613	TAC	2	6	8877	8882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150026525
110	NC_009613	TAA	2	6	8987	8992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026525
111	NC_009613	TTG	2	6	9033	9038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150026525
112	NC_009613	AAC	2	6	9138	9143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150026525
113	NC_009613	GAT	2	6	9172	9177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026525
114	NC_009613	TGA	2	6	9206	9211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026525
115	NC_009613	CAT	2	6	9473	9478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150026526
116	NC_009613	CTA	2	6	9484	9489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150026526
117	NC_009613	ATG	2	6	9574	9579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026526
118	NC_009613	TCT	2	6	9636	9641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150026526
119	NC_009613	TCA	2	6	9663	9668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150026526
120	NC_009613	AAT	2	6	9691	9696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026526
121	NC_009613	ACT	2	6	9750	9755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150026526
122	NC_009613	AAT	2	6	9810	9815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026526
123	NC_009613	TCT	2	6	9831	9836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150026526
124	NC_009613	TGG	2	6	9852	9857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150026526
125	NC_009613	TTC	2	6	9935	9940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150026526
126	NC_009613	TTG	2	6	9956	9961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150026526
127	NC_009613	CGT	2	6	9967	9972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150026526
128	NC_009613	TAA	2	6	10190	10195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026526
129	NC_009613	TTC	2	6	10223	10228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150026526
130	NC_009613	ATC	2	6	10262	10267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150026526
131	NC_009613	CAC	2	6	10354	10359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150026526
132	NC_009613	AAT	2	6	10361	10366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026526
133	NC_009613	CTG	2	6	10519	10524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150026526
134	NC_009613	ATA	2	6	10574	10579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026526
135	NC_009613	TCA	2	6	10680	10685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150026526
136	NC_009613	TCT	2	6	10761	10766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150026526
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142	NC_009613	ATT	2	6	11642	11647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150024115
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147	NC_009613	TTC	2	6	11872	11877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150024115
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252	NC_009613	GGA	2	6	20604	20609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150024120
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254	NC_009613	AAT	2	6	20751	20756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150024120
255	NC_009613	ACC	2	6	20859	20864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150024120
256	NC_009613	CTA	2	6	20896	20901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150024120
257	NC_009613	GGC	2	6	20904	20909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150024120
258	NC_009613	GCA	2	6	20931	20936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150024120
259	NC_009613	CTA	4	12	20962	20973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150024120
260	NC_009613	CAA	2	6	20977	20982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150024120
261	NC_009613	ACT	2	6	21057	21062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150024120
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263	NC_009613	CTA	2	6	21154	21159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150024120
264	NC_009613	GGT	2	6	21219	21224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150024120
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267	NC_009613	TGT	2	6	21440	21445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150024120
268	NC_009613	CTA	2	6	21451	21456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150024120
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272	NC_009613	TGG	2	6	21725	21730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150024120
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276	NC_009613	TTG	2	6	22198	22203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150024120
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280	NC_009613	TTA	2	6	22383	22388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150024120
281	NC_009613	ATA	2	6	22476	22481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150024120
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288	NC_009613	TCA	2	6	23194	23199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150024121
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290	NC_009613	TGG	2	6	23306	23311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150024121
291	NC_009613	TTA	2	6	23337	23342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150024121
292	NC_009613	CCT	2	6	23349	23354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150024121
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296	NC_009613	AAT	2	6	23928	23933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150024121
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305	NC_009613	GAA	2	6	24756	24761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150024121
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