MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae PittGG chromosome

Total Repeats: 836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009567	ACTTCC	2	12	36	47	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009567	TAAAAA	2	12	48	59	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009567	AATGCT	2	12	3265	3276	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148826763
4	NC_009567	AAAGAA	2	12	18657	18668	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148826780
5	NC_009567	AATGAA	2	12	18756	18767	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148826780
6	NC_009567	TTAGGT	2	12	20714	20725	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148826782
7	NC_009567	ATCCAA	2	12	25163	25174	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148826787
8	NC_009567	GATTTT	2	12	30092	30103	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148826792
9	NC_009567	AAATTG	2	12	34259	34270	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148826797
10	NC_009567	AATTTT	2	12	36318	36329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826799
11	NC_009567	ATTACT	2	12	37054	37065	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148826799
12	NC_009567	CTTGTG	2	12	38876	38887	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148826802
13	NC_009567	AGGTGC	2	12	39192	39203	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148826802
14	NC_009567	GCTTAT	2	12	47181	47192	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148826808
15	NC_009567	TTTGGT	2	12	48132	48143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826808
16	NC_009567	AAACCA	2	12	49743	49754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826811
17	NC_009567	GGCAAT	2	12	50300	50311	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148826811
18	NC_009567	TCATAT	2	12	52071	52082	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148826812
19	NC_009567	TTTTCA	2	12	53411	53422	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_009567	CCAGTG	2	12	56253	56264	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148826814
21	NC_009567	TAGTTT	2	12	58108	58119	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009567	CTTTTT	2	12	60092	60103	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	148826818
23	NC_009567	CACTTC	2	12	60138	60149	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	148826818
24	NC_009567	TAGCCT	2	12	66310	66321	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009567	TGAGTT	2	12	68257	68268	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148826824
26	NC_009567	GCCAAT	2	12	68993	69004	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148826825
27	NC_009567	AGTAAA	2	12	71403	71414	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009567	CTGAAT	2	12	73799	73810	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148826827
29	NC_009567	TAAAAA	2	12	74691	74702	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009567	TGCCTT	2	12	83384	83395	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148826831
31	NC_009567	TTACGT	2	12	84606	84617	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148826832
32	NC_009567	CGGCTT	2	12	85537	85548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826832
33	NC_009567	AAGTGA	2	12	87393	87404	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148826833
34	NC_009567	CAATAT	2	12	87508	87519	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148826833
35	NC_009567	GGTGTG	2	12	87695	87706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826833
36	NC_009567	GCACAA	2	12	89019	89030	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148826834
37	NC_009567	AGCAAA	2	12	90560	90571	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148826835
38	NC_009567	TAATAC	2	12	93774	93785	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148826836
39	NC_009567	TGCGTG	2	12	95199	95210	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148826837
40	NC_009567	AGAAAG	2	12	97172	97183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826838
41	NC_009567	CTAATT	2	12	98503	98514	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148826838
42	NC_009567	AATAGA	2	12	100147	100158	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009567	GATTTA	2	12	106189	106200	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009567	AAAGCA	2	12	108460	108471	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148826844
45	NC_009567	TGAAAT	2	12	108735	108746	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148826844
46	NC_009567	CTTGAG	2	12	108946	108957	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148826844
47	NC_009567	AAATCA	2	12	112537	112548	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148826845
48	NC_009567	CAGTTT	2	12	113003	113014	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_009567	AGATAA	2	12	121765	121776	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148826859
50	NC_009567	ACTTTT	2	12	126022	126033	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_009567	GGCATA	2	12	129076	129087	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148826866
52	NC_009567	TAGAAC	2	12	132570	132581	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148826869
53	NC_009567	GCTTCT	2	12	137476	137487	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148826875
54	NC_009567	TTTCGA	2	12	138174	138185	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148826875
55	NC_009567	CATCTT	2	12	138437	138448	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148826875
56	NC_009567	CACCGC	2	12	139146	139157	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148826875
57	NC_009567	CATTTT	2	12	139757	139768	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148826875
58	NC_009567	TTCAAA	2	12	140108	140119	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148826876
59	NC_009567	AAGTTC	2	12	142190	142201	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148826881
60	NC_009567	TGAATG	2	12	142466	142477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826881
61	NC_009567	ATGAAA	2	12	143678	143689	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148826882
62	NC_009567	CTAAAT	2	12	144420	144431	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148826883
63	NC_009567	AAAACC	2	12	145980	145991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826884
64	NC_009567	TTTTAT	2	12	146427	146438	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009567	TCGCTG	2	12	146941	146952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009567	TCACGC	2	12	152368	152379	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148826888
67	NC_009567	CCACGA	2	12	154549	154560	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148826893
68	NC_009567	GAGCTA	2	12	155156	155167	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148826894
69	NC_009567	GTTTGC	2	12	157277	157288	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148826897
70	NC_009567	GATAAA	2	12	166791	166802	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148826915
71	NC_009567	ACAAGA	2	12	168755	168766	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148826918
72	NC_009567	CACTTT	2	12	170788	170799	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148826922
73	NC_009567	TATCAA	2	12	173833	173844	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148826927
74	NC_009567	AATTTA	2	12	175189	175200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009567	CTTCGC	2	12	175229	175240	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148826929
76	NC_009567	TAAAAT	2	12	176339	176350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009567	ATGATC	2	12	180411	180422	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148826934
78	NC_009567	AAAATT	2	12	182901	182912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826939
79	NC_009567	TCAATA	2	12	183544	183555	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148826939
80	NC_009567	GAATTA	2	12	184918	184929	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148826941
81	NC_009567	CGCCAT	2	12	187402	187413	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148826943
82	NC_009567	TTAATC	2	12	189412	189423	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_009567	AAATTG	2	12	189750	189761	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009567	ATATCC	2	12	196385	196396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826956
85	NC_009567	ATCTTC	2	12	199024	199035	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148826959
86	NC_009567	GCCAAA	2	12	204515	204526	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148826965
87	NC_009567	TGCATA	2	12	204663	204674	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148826965
88	NC_009567	TTTCGC	2	12	205505	205516	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148826966
89	NC_009567	TGTATT	2	12	208472	208483	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148826969
90	NC_009567	ACTTCA	2	12	212255	212266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826973
91	NC_009567	AGGCAA	2	12	213273	213284	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	148826974
92	NC_009567	GCCACT	2	12	216683	216694	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148826976
93	NC_009567	CATAAT	2	12	217349	217360	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_009567	ACGTTT	2	12	221468	221479	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148826978
95	NC_009567	TTTTTG	2	12	226329	226340	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009567	TTTATC	2	12	228864	228875	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148826983
97	NC_009567	AATTAT	2	12	228899	228910	50 %	50 %	0 %	0 %	148826983
98	NC_009567	AATTTC	2	12	229464	229475	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148826984
99	NC_009567	TCTTCA	2	12	235182	235193	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148826993
100	NC_009567	CTAAAT	2	12	236014	236025	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148826993
101	NC_009567	AAAAAT	2	12	238625	238636	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009567	TAATTC	2	12	241792	241803	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148826999
103	NC_009567	CGTAAT	2	12	242233	242244	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148826999
104	NC_009567	AATTTG	2	12	255061	255072	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148827013
105	NC_009567	GTAGAA	2	12	259901	259912	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148827016
106	NC_009567	TAGTTA	2	12	260453	260464	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148827017
107	NC_009567	AGGCAC	2	12	264294	264305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009567	ACCACA	2	12	264393	264404	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009567	ACCACA	2	12	264578	264589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009567	TTTACC	2	12	266854	266865	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148827020
111	NC_009567	GCCACG	2	12	266974	266985	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148827020
112	NC_009567	CGCTTC	2	12	267382	267393	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148827020
113	NC_009567	ATCTTC	2	12	267870	267881	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148827021
114	NC_009567	ATCGCA	2	12	268978	268989	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148827021
115	NC_009567	TAGTAA	2	12	269634	269645	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009567	ATCAAT	2	12	271587	271598	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148827025
117	NC_009567	TTTTTC	2	12	278256	278267	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_009567	TTTTGC	2	12	279148	279159	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_009567	CTTCAT	2	12	280027	280038	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148827031
120	NC_009567	TCGTGC	2	12	284781	284792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009567	TCTTTG	2	12	289207	289218	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_009567	TTGCCA	2	12	289554	289565	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009567	ATAAGC	2	12	293480	293491	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148827037
124	NC_009567	TTTGTT	2	12	294136	294147	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	148827037
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234	NC_009567	GCATCA	2	12	573252	573263	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148827254
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236	NC_009567	ATTTCA	2	12	580226	580237	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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