MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus influenzae PittGG chromosome

Total Repeats: 654

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009567	AATGCT	2	12	3265	3276	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148826763
2	NC_009567	AAAGAA	2	12	18657	18668	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148826780
3	NC_009567	AATGAA	2	12	18756	18767	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148826780
4	NC_009567	TTAGGT	2	12	20714	20725	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148826782
5	NC_009567	ATCCAA	2	12	25163	25174	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148826787
6	NC_009567	GATTTT	2	12	30092	30103	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148826792
7	NC_009567	AAATTG	2	12	34259	34270	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148826797
8	NC_009567	AATTTT	2	12	36318	36329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826799
9	NC_009567	ATTACT	2	12	37054	37065	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148826799
10	NC_009567	CTTGTG	2	12	38876	38887	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148826802
11	NC_009567	AGGTGC	2	12	39192	39203	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148826802
12	NC_009567	GCTTAT	2	12	47181	47192	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148826808
13	NC_009567	TTTGGT	2	12	48132	48143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826808
14	NC_009567	AAACCA	2	12	49743	49754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826811
15	NC_009567	GGCAAT	2	12	50300	50311	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148826811
16	NC_009567	TCATAT	2	12	52071	52082	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148826812
17	NC_009567	CCAGTG	2	12	56253	56264	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148826814
18	NC_009567	CTTTTT	2	12	60092	60103	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	148826818
19	NC_009567	CACTTC	2	12	60138	60149	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	148826818
20	NC_009567	TGAGTT	2	12	68257	68268	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148826824
21	NC_009567	GCCAAT	2	12	68993	69004	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148826825
22	NC_009567	CTGAAT	2	12	73799	73810	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148826827
23	NC_009567	TGCCTT	2	12	83384	83395	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148826831
24	NC_009567	TTACGT	2	12	84606	84617	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148826832
25	NC_009567	CGGCTT	2	12	85537	85548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826832
26	NC_009567	AAGTGA	2	12	87393	87404	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148826833
27	NC_009567	CAATAT	2	12	87508	87519	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148826833
28	NC_009567	GGTGTG	2	12	87695	87706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826833
29	NC_009567	GCACAA	2	12	89019	89030	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148826834
30	NC_009567	AGCAAA	2	12	90560	90571	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148826835
31	NC_009567	TAATAC	2	12	93774	93785	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148826836
32	NC_009567	TGCGTG	2	12	95199	95210	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148826837
33	NC_009567	AGAAAG	2	12	97172	97183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826838
34	NC_009567	CTAATT	2	12	98503	98514	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148826838
35	NC_009567	AAAGCA	2	12	108460	108471	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148826844
36	NC_009567	TGAAAT	2	12	108735	108746	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148826844
37	NC_009567	CTTGAG	2	12	108946	108957	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148826844
38	NC_009567	AAATCA	2	12	112537	112548	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148826845
39	NC_009567	AGATAA	2	12	121765	121776	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148826859
40	NC_009567	GGCATA	2	12	129076	129087	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148826866
41	NC_009567	TAGAAC	2	12	132570	132581	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148826869
42	NC_009567	GCTTCT	2	12	137476	137487	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148826875
43	NC_009567	TTTCGA	2	12	138174	138185	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148826875
44	NC_009567	CATCTT	2	12	138437	138448	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148826875
45	NC_009567	CACCGC	2	12	139146	139157	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148826875
46	NC_009567	CATTTT	2	12	139757	139768	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148826875
47	NC_009567	TTCAAA	2	12	140108	140119	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148826876
48	NC_009567	AAGTTC	2	12	142190	142201	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148826881
49	NC_009567	TGAATG	2	12	142466	142477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826881
50	NC_009567	ATGAAA	2	12	143678	143689	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148826882
51	NC_009567	CTAAAT	2	12	144420	144431	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148826883
52	NC_009567	AAAACC	2	12	145980	145991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826884
53	NC_009567	TCACGC	2	12	152368	152379	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148826888
54	NC_009567	CCACGA	2	12	154549	154560	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148826893
55	NC_009567	GAGCTA	2	12	155156	155167	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148826894
56	NC_009567	GTTTGC	2	12	157277	157288	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148826897
57	NC_009567	GATAAA	2	12	166791	166802	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148826915
58	NC_009567	ACAAGA	2	12	168755	168766	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148826918
59	NC_009567	CACTTT	2	12	170788	170799	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148826922
60	NC_009567	TATCAA	2	12	173833	173844	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148826927
61	NC_009567	CTTCGC	2	12	175229	175240	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148826929
62	NC_009567	ATGATC	2	12	180411	180422	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148826934
63	NC_009567	AAAATT	2	12	182901	182912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826939
64	NC_009567	TCAATA	2	12	183544	183555	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148826939
65	NC_009567	GAATTA	2	12	184918	184929	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148826941
66	NC_009567	CGCCAT	2	12	187402	187413	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148826943
67	NC_009567	ATATCC	2	12	196385	196396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826956
68	NC_009567	ATCTTC	2	12	199024	199035	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148826959
69	NC_009567	GCCAAA	2	12	204515	204526	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148826965
70	NC_009567	TGCATA	2	12	204663	204674	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148826965
71	NC_009567	TTTCGC	2	12	205505	205516	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148826966
72	NC_009567	TGTATT	2	12	208472	208483	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148826969
73	NC_009567	ACTTCA	2	12	212255	212266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826973
74	NC_009567	AGGCAA	2	12	213273	213284	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	148826974
75	NC_009567	GCCACT	2	12	216683	216694	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148826976
76	NC_009567	ACGTTT	2	12	221468	221479	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148826978
77	NC_009567	TTTATC	2	12	228864	228875	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148826983
78	NC_009567	AATTAT	2	12	228899	228910	50 %	50 %	0 %	0 %	148826983
79	NC_009567	AATTTC	2	12	229464	229475	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148826984
80	NC_009567	TCTTCA	2	12	235182	235193	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148826993
81	NC_009567	CTAAAT	2	12	236014	236025	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148826993
82	NC_009567	TAATTC	2	12	241792	241803	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148826999
83	NC_009567	CGTAAT	2	12	242233	242244	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148826999
84	NC_009567	AATTTG	2	12	255061	255072	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148827013
85	NC_009567	GTAGAA	2	12	259901	259912	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148827016
86	NC_009567	TAGTTA	2	12	260453	260464	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148827017
87	NC_009567	TTTACC	2	12	266854	266865	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148827020
88	NC_009567	GCCACG	2	12	266974	266985	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148827020
89	NC_009567	CGCTTC	2	12	267382	267393	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148827020
90	NC_009567	ATCTTC	2	12	267870	267881	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148827021
91	NC_009567	ATCGCA	2	12	268978	268989	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148827021
92	NC_009567	ATCAAT	2	12	271587	271598	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148827025
93	NC_009567	CTTCAT	2	12	280027	280038	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148827031
94	NC_009567	ATAAGC	2	12	293480	293491	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148827037
95	NC_009567	TTTGTT	2	12	294136	294147	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	148827037
96	NC_009567	TTTTCA	2	12	294957	294968	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148827037
97	NC_009567	ATTTTG	2	12	296102	296113	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148827037
98	NC_009567	ATAAAT	2	12	296223	296234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148827037
99	NC_009567	TTCCTC	2	12	297834	297845	0 %	50 %	0 %	50 %	148827039
100	NC_009567	CCAAGC	2	12	310013	310024	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148827046
101	NC_009567	ATCTCT	2	12	310621	310632	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148827047
102	NC_009567	CAGAAT	2	12	313181	313192	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148827050
103	NC_009567	TAAAAA	2	12	313280	313291	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148827050
104	NC_009567	CCACCG	2	12	316827	316838	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148827053
105	NC_009567	AATGGT	2	12	322684	322695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148827057
106	NC_009567	CAAATT	2	12	324612	324623	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148827058
107	NC_009567	TCAGCT	2	12	325170	325181	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148827058
108	NC_009567	AAAAAC	2	12	325717	325728	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	148827058
109	NC_009567	TGAAGT	2	12	326977	326988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148827059
110	NC_009567	AATTGA	2	12	328783	328794	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148827061
111	NC_009567	GGCATT	2	12	329566	329577	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148827061
112	NC_009567	AATTCT	2	12	337662	337673	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148827070
113	NC_009567	AATGAA	2	12	340196	340207	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148827072
114	NC_009567	ATGCAA	2	12	347228	347239	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148827078
115	NC_009567	TATCAA	2	12	348793	348804	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148827078
116	NC_009567	ATTCAA	2	12	349242	349253	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148827080
117	NC_009567	ATTATG	2	12	355161	355172	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148827082
118	NC_009567	TTTCAA	2	12	355376	355387	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148827082
119	NC_009567	GAAGCT	2	12	355691	355702	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148827083
120	NC_009567	TATCTA	2	12	361324	361335	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148827088
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122	NC_009567	TCAATT	2	12	367304	367315	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148827094
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228	NC_009567	TTGTTC	2	12	674207	674218	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148827339
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456	NC_009567	AGAAGT	2	12	1337178	1337189	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148827937
457	NC_009567	TTTTCT	2	12	1340540	1340551	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	148827938
458	NC_009567	TCCTGA	2	12	1345913	1345924	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148827942
459	NC_009567	GCAATG	2	12	1347174	1347185	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148827942
460	NC_009567	TTAAAT	2	12	1348702	1348713	50 %	50 %	0 %	0 %	148827942
461	NC_009567	ATAACC	2	12	1351347	1351358	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148827946
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