MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae PittGG chromosome

Total Repeats: 1484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009567	GGGGA	2	10	397	406	20 %	0 %	80 %	0 %	148826758
2	NC_009567	TCGGC	2	10	5245	5254	0 %	20 %	40 %	40 %	148826764
3	NC_009567	CTAAA	2	10	6396	6405	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009567	GATTT	2	10	7135	7144	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009567	TTTTC	2	10	10572	10581	0 %	80 %	0 %	20 %	148826769
6	NC_009567	GTTAT	2	10	12242	12251	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009567	CACTT	2	10	13523	13532	20 %	40 %	0 %	40 %	148826774
8	NC_009567	ATAAC	2	10	13764	13773	60 %	20 %	0 %	20 %	148826774
9	NC_009567	AATTG	2	10	13876	13885	40 %	40 %	20 %	0 %	148826774
10	NC_009567	GGAAT	2	10	15757	15766	40 %	20 %	40 %	0 %	148826776
11	NC_009567	TTTTC	2	10	17215	17224	0 %	80 %	0 %	20 %	148826779
12	NC_009567	GGCGT	2	10	17381	17390	0 %	20 %	60 %	20 %	148826779
13	NC_009567	AATTT	2	10	17459	17468	40 %	60 %	0 %	0 %	148826779
14	NC_009567	AATTT	2	10	17567	17576	40 %	60 %	0 %	0 %	148826779
15	NC_009567	AATTT	2	10	17783	17792	40 %	60 %	0 %	0 %	148826779
16	NC_009567	AATTT	2	10	17999	18008	40 %	60 %	0 %	0 %	148826779
17	NC_009567	TTCAA	2	10	18254	18263	40 %	40 %	0 %	20 %	148826779
18	NC_009567	TCTTT	2	10	19324	19333	0 %	80 %	0 %	20 %	148826781
19	NC_009567	AGCAG	2	10	19436	19445	40 %	0 %	40 %	20 %	148826781
20	NC_009567	GCAGA	2	10	20330	20339	40 %	0 %	40 %	20 %	148826782
21	NC_009567	AAAGA	2	10	20382	20391	80 %	0 %	20 %	0 %	148826782
22	NC_009567	ATTTT	2	10	21145	21154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009567	TGAAA	2	10	21386	21395	60 %	20 %	20 %	0 %	148826783
24	NC_009567	AAAAT	2	10	24446	24455	80 %	20 %	0 %	0 %	148826787
25	NC_009567	TAATT	2	10	24966	24975	40 %	60 %	0 %	0 %	148826787
26	NC_009567	TAATT	2	10	26189	26198	40 %	60 %	0 %	0 %	148826788
27	NC_009567	TGAAA	2	10	28607	28616	60 %	20 %	20 %	0 %	148826790
28	NC_009567	TTATT	2	10	29629	29638	20 %	80 %	0 %	0 %	148826791
29	NC_009567	GCCAA	2	10	29734	29743	40 %	0 %	20 %	40 %	148826791
30	NC_009567	GGATT	2	10	33269	33278	20 %	40 %	40 %	0 %	148826796
31	NC_009567	TTGAA	2	10	33454	33463	40 %	40 %	20 %	0 %	148826796
32	NC_009567	CATTT	2	10	35414	35423	20 %	60 %	0 %	20 %	148826798
33	NC_009567	ATGAA	2	10	37613	37622	60 %	20 %	20 %	0 %	148826800
34	NC_009567	ATTAT	2	10	40597	40606	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009567	CACTT	2	10	42202	42211	20 %	40 %	0 %	40 %	148826804
36	NC_009567	ATAAC	2	10	42443	42452	60 %	20 %	0 %	20 %	148826804
37	NC_009567	AATTG	2	10	42555	42564	40 %	40 %	20 %	0 %	148826804
38	NC_009567	GGAAT	2	10	44436	44445	40 %	20 %	40 %	0 %	148826806
39	NC_009567	CAAGC	2	10	45592	45601	40 %	0 %	20 %	40 %	148826807
40	NC_009567	GCCAC	2	10	45756	45765	20 %	0 %	20 %	60 %	148826807
41	NC_009567	TGTCA	2	10	48116	48125	20 %	40 %	20 %	20 %	148826808
42	NC_009567	TGTGT	2	10	50824	50833	0 %	60 %	40 %	0 %	148826812
43	NC_009567	TTAAA	2	10	51837	51846	60 %	40 %	0 %	0 %	148826812
44	NC_009567	AGAGT	2	10	53535	53544	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009567	ATAGG	2	10	55936	55945	40 %	20 %	40 %	0 %	148826813
46	NC_009567	TTAGT	2	10	57675	57684	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009567	GAATT	2	10	59805	59814	40 %	40 %	20 %	0 %	148826818
48	NC_009567	AGAGT	2	10	62092	62101	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009567	CTATG	2	10	62659	62668	20 %	40 %	20 %	20 %	148826820
50	NC_009567	AGTTG	2	10	63288	63297	20 %	40 %	40 %	0 %	148826820
51	NC_009567	AAATT	2	10	65646	65655	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009567	TAAAA	2	10	67367	67376	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009567	AATAA	2	10	67608	67617	80 %	20 %	0 %	0 %	148826824
54	NC_009567	AAAGC	2	10	68463	68472	60 %	0 %	20 %	20 %	148826825
55	NC_009567	AAGCA	2	10	69015	69024	60 %	0 %	20 %	20 %	148826825
56	NC_009567	CTTTG	2	10	70699	70708	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009567	AACAG	2	10	71415	71424	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_009567	TGTAA	2	10	71454	71463	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009567	TTGGC	2	10	72177	72186	0 %	40 %	40 %	20 %	148826826
60	NC_009567	TTTAA	2	10	73637	73646	40 %	60 %	0 %	0 %	148826826
61	NC_009567	TCAGC	2	10	79704	79713	20 %	20 %	20 %	40 %	148826829
62	NC_009567	AACGA	2	10	80028	80037	60 %	0 %	20 %	20 %	148826829
63	NC_009567	CGCAC	2	10	82322	82331	20 %	0 %	20 %	60 %	148826831
64	NC_009567	CGATG	2	10	83432	83441	20 %	20 %	40 %	20 %	148826831
65	NC_009567	TAAAT	2	10	88556	88565	60 %	40 %	0 %	0 %	148826834
66	NC_009567	TGGAT	2	10	89783	89792	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009567	TTGCT	2	10	90358	90367	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009567	TTCTA	2	10	91605	91614	20 %	60 %	0 %	20 %	148826835
69	NC_009567	TGAAT	2	10	92231	92240	40 %	40 %	20 %	0 %	148826835
70	NC_009567	TTAAT	2	10	92446	92455	40 %	60 %	0 %	0 %	148826835
71	NC_009567	TGCGG	2	10	92682	92691	0 %	20 %	60 %	20 %	148826835
72	NC_009567	ATTTT	2	10	93235	93244	20 %	80 %	0 %	0 %	148826836
73	NC_009567	TGGCG	2	10	94694	94703	0 %	20 %	60 %	20 %	148826837
74	NC_009567	GGTAT	2	10	94862	94871	20 %	40 %	40 %	0 %	148826837
75	NC_009567	TTTAA	2	10	96056	96065	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009567	TGTTC	2	10	96603	96612	0 %	60 %	20 %	20 %	148826838
77	NC_009567	CATTG	2	10	97469	97478	20 %	40 %	20 %	20 %	148826838
78	NC_009567	AAGGC	2	10	97510	97519	40 %	0 %	40 %	20 %	148826838
79	NC_009567	TTGAG	2	10	97740	97749	20 %	40 %	40 %	0 %	148826838
80	NC_009567	TAAGT	2	10	97967	97976	40 %	40 %	20 %	0 %	148826838
81	NC_009567	GTTTT	2	10	98183	98192	0 %	80 %	20 %	0 %	148826838
82	NC_009567	CAATC	2	10	99366	99375	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_009567	ATAGT	2	10	101437	101446	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009567	AATGT	2	10	102440	102449	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009567	TAAAT	2	10	105084	105093	60 %	40 %	0 %	0 %	148826843
86	NC_009567	GAAAT	2	10	106613	106622	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009567	AAGCC	2	10	108711	108720	40 %	0 %	20 %	40 %	148826844
88	NC_009567	GCAGG	2	10	110497	110506	20 %	0 %	60 %	20 %	148826844
89	NC_009567	CCATG	2	10	111414	111423	20 %	20 %	20 %	40 %	148826844
90	NC_009567	TCTTA	2	10	112303	112312	20 %	60 %	0 %	20 %	148826845
91	NC_009567	TGGTT	2	10	113439	113448	0 %	60 %	40 %	0 %	148826846
92	NC_009567	CCCAA	2	10	114118	114127	40 %	0 %	0 %	60 %	148826847
93	NC_009567	GTTTT	2	10	115794	115803	0 %	80 %	20 %	0 %	148826848
94	NC_009567	GAAAA	2	10	116619	116628	80 %	0 %	20 %	0 %	148826850
95	NC_009567	TCAAT	2	10	117421	117430	40 %	40 %	0 %	20 %	148826852
96	NC_009567	AATTT	2	10	117690	117699	40 %	60 %	0 %	0 %	148826852
97	NC_009567	ATTTT	2	10	119314	119323	20 %	80 %	0 %	0 %	148826857
98	NC_009567	GAAAA	2	10	121632	121641	80 %	0 %	20 %	0 %	148826859
99	NC_009567	GCAAT	2	10	122045	122054	40 %	20 %	20 %	20 %	148826859
100	NC_009567	TAAAT	2	10	124319	124328	60 %	40 %	0 %	0 %	148826861
101	NC_009567	TTGCA	2	10	124555	124564	20 %	40 %	20 %	20 %	148826861
102	NC_009567	ATCCA	2	10	125800	125809	40 %	20 %	0 %	40 %	148826862
103	NC_009567	AGTGA	2	10	125991	126000	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009567	TCTTT	2	10	126455	126464	0 %	80 %	0 %	20 %	148826863
105	NC_009567	AAGCA	2	10	126874	126883	60 %	0 %	20 %	20 %	148826864
106	NC_009567	TACTA	2	10	128047	128056	40 %	40 %	0 %	20 %	148826865
107	NC_009567	AAATG	2	10	128353	128362	60 %	20 %	20 %	0 %	148826865
108	NC_009567	AAGCA	2	10	128548	128557	60 %	0 %	20 %	20 %	148826865
109	NC_009567	AATAA	2	10	128888	128897	80 %	20 %	0 %	0 %	148826866
110	NC_009567	ATTTA	2	10	130064	130073	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009567	TAAAT	2	10	131163	131172	60 %	40 %	0 %	0 %	148826868
112	NC_009567	CTCAA	2	10	132372	132381	40 %	20 %	0 %	40 %	148826869
113	NC_009567	ATTTT	2	10	133106	133115	20 %	80 %	0 %	0 %	148826870
114	NC_009567	AAAGG	2	10	135009	135018	60 %	0 %	40 %	0 %	148826872
115	NC_009567	AAAGA	2	10	135325	135334	80 %	0 %	20 %	0 %	148826873
116	NC_009567	AATTT	2	10	135449	135458	40 %	60 %	0 %	0 %	148826873
117	NC_009567	TGCAA	2	10	139737	139746	40 %	20 %	20 %	20 %	148826875
118	NC_009567	GTTAC	2	10	139989	139998	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_009567	ATTCA	2	10	142134	142143	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_009567	GTAAA	2	10	143123	143132	60 %	20 %	20 %	0 %	148826881
121	NC_009567	TCCAT	2	10	144560	144569	20 %	40 %	0 %	40 %	148826883
122	NC_009567	TCAAT	2	10	145029	145038	40 %	40 %	0 %	20 %	148826883
123	NC_009567	ATCGT	2	10	145082	145091	20 %	40 %	20 %	20 %	148826883
124	NC_009567	TATTG	2	10	145595	145604	20 %	60 %	20 %	0 %	148826884
125	NC_009567	AAGGT	2	10	146292	146301	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009567	TCATT	2	10	147818	147827	20 %	60 %	0 %	20 %	148826885
127	NC_009567	AAGCC	2	10	149005	149014	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_009567	TAAGC	2	10	151532	151541	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009567	AATCA	2	10	152073	152082	60 %	20 %	0 %	20 %	148826888
130	NC_009567	ATCTG	2	10	152743	152752	20 %	40 %	20 %	20 %	148826888
131	NC_009567	ATTCT	2	10	158268	158277	20 %	60 %	0 %	20 %	148826898
132	NC_009567	CATTT	2	10	158969	158978	20 %	60 %	0 %	20 %	148826900
133	NC_009567	CCGCA	2	10	160261	160270	20 %	0 %	20 %	60 %	148826903
134	NC_009567	CCGTT	2	10	163469	163478	0 %	40 %	20 %	40 %	148826910
135	NC_009567	TTTTA	2	10	164118	164127	20 %	80 %	0 %	0 %	148826911
136	NC_009567	ATATT	2	10	164199	164208	40 %	60 %	0 %	0 %	148826911
137	NC_009567	AAAGG	2	10	164323	164332	60 %	0 %	40 %	0 %	148826911
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