MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus influenzae PittGG chromosome

Total Repeats: 19231

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009567	ATT	2	6	421	426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826758
2	NC_009567	CAG	2	6	490	495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148826758
3	NC_009567	GTT	2	6	508	513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826758
4	NC_009567	GTT	2	6	541	546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826758
5	NC_009567	TGG	3	9	841	849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826759
6	NC_009567	GGT	2	6	857	862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826759
7	NC_009567	GTA	2	6	870	875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826759
8	NC_009567	GGT	2	6	884	889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826759
9	NC_009567	GCA	2	6	905	910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148826759
10	NC_009567	GAA	2	6	953	958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826759
11	NC_009567	GTT	3	9	1019	1027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826759
12	NC_009567	CAG	2	6	1039	1044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148826759
13	NC_009567	TTG	2	6	1071	1076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826759
14	NC_009567	GGC	2	6	1079	1084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148826759
15	NC_009567	TGA	2	6	1596	1601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826760
16	NC_009567	AAC	2	6	1655	1660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826760
17	NC_009567	CTA	2	6	1666	1671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826760
18	NC_009567	TCT	2	6	1693	1698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826760
19	NC_009567	TTA	2	6	1714	1719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826760
20	NC_009567	GTT	2	6	1767	1772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826760
21	NC_009567	AAT	2	6	1887	1892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826760
22	NC_009567	ATC	2	6	1977	1982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826760
23	NC_009567	AAC	2	6	2015	2020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826760
24	NC_009567	TCT	2	6	2104	2109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826760
25	NC_009567	CAT	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826760
26	NC_009567	TAA	2	6	2180	2185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826760
27	NC_009567	TAC	2	6	2479	2484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826761
28	NC_009567	AAT	2	6	2503	2508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826761
29	NC_009567	ACC	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826761
30	NC_009567	CAC	2	6	2630	2635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826762
31	NC_009567	AAT	2	6	2911	2916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826763
32	NC_009567	TTG	2	6	2951	2956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826763
33	NC_009567	GAA	2	6	2999	3004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826763
34	NC_009567	GTT	2	6	3017	3022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826763
35	NC_009567	TTA	2	6	3163	3168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826763
36	NC_009567	CAT	2	6	3203	3208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826763
37	NC_009567	CTT	3	9	3245	3253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826763
38	NC_009567	AAG	2	6	3289	3294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826763
39	NC_009567	TGA	2	6	3313	3318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826763
40	NC_009567	GTG	2	6	3373	3378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826763
41	NC_009567	TGA	2	6	3382	3387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826763
42	NC_009567	TGT	2	6	3406	3411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826763
43	NC_009567	TTG	2	6	3513	3518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826763
44	NC_009567	AGT	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826763
45	NC_009567	TAA	2	6	3684	3689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826763
46	NC_009567	TGC	2	6	3840	3845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826763
47	NC_009567	GCT	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826763
48	NC_009567	CCA	2	6	4096	4101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826763
49	NC_009567	ATA	2	6	4162	4167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826763
50	NC_009567	CAA	2	6	4232	4237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826763
51	NC_009567	GCA	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148826763
52	NC_009567	CTT	2	6	4325	4330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826763
53	NC_009567	GTT	2	6	4381	4386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826763
54	NC_009567	GTT	2	6	4395	4400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826763
55	NC_009567	AAT	2	6	4442	4447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826763
56	NC_009567	TGG	2	6	4487	4492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826763
57	NC_009567	CAA	2	6	4847	4852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826764
58	NC_009567	CCG	2	6	4972	4977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148826764
59	NC_009567	ATG	2	6	5001	5006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826764
60	NC_009567	TCA	2	6	5036	5041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826764
61	NC_009567	ATA	2	6	5095	5100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826764
62	NC_009567	GCC	2	6	5148	5153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148826764
63	NC_009567	AAT	2	6	5318	5323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826764
64	NC_009567	TCA	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826764
65	NC_009567	CAC	2	6	5439	5444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826764
66	NC_009567	ATT	2	6	5454	5459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826764
67	NC_009567	TAA	2	6	5505	5510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826764
68	NC_009567	CAA	2	6	5603	5608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826764
69	NC_009567	AAT	2	6	5649	5654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826764
70	NC_009567	ATT	2	6	5680	5685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826764
71	NC_009567	ATT	2	6	5743	5748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826764
72	NC_009567	ATT	2	6	7301	7306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826765
73	NC_009567	CAA	2	6	7307	7312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826765
74	NC_009567	ACC	2	6	7350	7355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826765
75	NC_009567	TGC	2	6	7416	7421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826765
76	NC_009567	TTC	2	6	7446	7451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826765
77	NC_009567	TAA	2	6	7557	7562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826765
78	NC_009567	TGC	2	6	7620	7625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826765
79	NC_009567	TGC	2	6	7740	7745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826765
80	NC_009567	CTG	3	9	7769	7777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826765
81	NC_009567	CAT	2	6	7878	7883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826765
82	NC_009567	ACG	2	6	7923	7928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148826765
83	NC_009567	CAC	2	6	7985	7990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826765
84	NC_009567	ATA	2	6	8020	8025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826765
85	NC_009567	TCA	2	6	8038	8043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826765
86	NC_009567	TTG	2	6	8100	8105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826765
87	NC_009567	TAA	2	6	8189	8194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826765
88	NC_009567	TTA	2	6	8248	8253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826765
89	NC_009567	TAT	2	6	8261	8266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826765
90	NC_009567	ACC	2	6	8277	8282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148826765
91	NC_009567	ATA	2	6	8321	8326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826765
92	NC_009567	CAT	2	6	8345	8350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826765
93	NC_009567	TAA	2	6	8352	8357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826765
94	NC_009567	TCA	2	6	8602	8607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826765
95	NC_009567	TTC	2	6	8717	8722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826765
96	NC_009567	TCT	2	6	8727	8732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826765
97	NC_009567	ATT	2	6	8737	8742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826765
98	NC_009567	AAG	2	6	9431	9436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826766
99	NC_009567	TCG	2	6	9702	9707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826767
100	NC_009567	ATG	2	6	9752	9757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826767
101	NC_009567	AAT	2	6	9864	9869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826767
102	NC_009567	CCG	2	6	10097	10102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148826768
103	NC_009567	TTA	2	6	10184	10189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826768
104	NC_009567	CTT	2	6	10284	10289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826769
105	NC_009567	CAA	2	6	10313	10318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826769
106	NC_009567	GCG	2	6	10466	10471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148826769
107	NC_009567	GGT	2	6	10492	10497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826769
108	NC_009567	TGA	2	6	10566	10571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826769
109	NC_009567	CAA	2	6	10716	10721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826770
110	NC_009567	TGG	2	6	10980	10985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826771
111	NC_009567	TTG	2	6	11198	11203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826771
112	NC_009567	CTG	2	6	11259	11264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826771
113	NC_009567	GCA	2	6	11312	11317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148826771
114	NC_009567	TGA	2	6	11380	11385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826771
115	NC_009567	TGA	2	6	11434	11439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826771
116	NC_009567	ATC	2	6	11459	11464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826771
117	NC_009567	GAA	2	6	11929	11934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826772
118	NC_009567	TGG	2	6	11961	11966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148826772
119	NC_009567	AAC	2	6	12005	12010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148826772
120	NC_009567	TCA	2	6	12052	12057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826772
121	NC_009567	AGA	3	9	12124	12132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148826772
122	NC_009567	GAT	2	6	12149	12154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826772
123	NC_009567	ACT	2	6	12162	12167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826772
124	NC_009567	CTT	2	6	12575	12580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826773
125	NC_009567	ATG	2	6	12585	12590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148826773
126	NC_009567	TCT	3	9	12601	12609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148826773
127	NC_009567	ATA	2	6	12633	12638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826773
128	NC_009567	GTC	2	6	12680	12685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826773
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130	NC_009567	ATA	2	6	12761	12766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148826773
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259	NC_009567	TTA	2	6	22059	22064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148826783
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