MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae PittGG chromosome

Total Repeats: 2039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009567	AT	4	8	1194	1201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009567	AT	3	6	1475	1480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009567	AC	3	6	1492	1497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009567	CT	3	6	1734	1739	0 %	50 %	0 %	50 %	148826760
5	NC_009567	AT	3	6	1835	1840	50 %	50 %	0 %	0 %	148826760
6	NC_009567	TA	3	6	2205	2210	50 %	50 %	0 %	0 %	148826760
7	NC_009567	TC	3	6	2835	2840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009567	GC	3	6	3674	3679	0 %	0 %	50 %	50 %	148826763
9	NC_009567	TG	3	6	4001	4006	0 %	50 %	50 %	0 %	148826763
10	NC_009567	GC	3	6	4343	4348	0 %	0 %	50 %	50 %	148826763
11	NC_009567	GA	3	6	4521	4526	50 %	0 %	50 %	0 %	148826763
12	NC_009567	AC	3	6	4838	4843	50 %	0 %	0 %	50 %	148826764
13	NC_009567	CG	3	6	4901	4906	0 %	0 %	50 %	50 %	148826764
14	NC_009567	GC	3	6	6127	6132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009567	GC	3	6	6196	6201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009567	GA	3	6	8618	8623	50 %	0 %	50 %	0 %	148826765
17	NC_009567	CA	3	6	8960	8965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009567	AG	3	6	9074	9079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009567	TA	3	6	9112	9117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009567	CA	3	6	9122	9127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009567	CA	3	6	9224	9229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009567	TC	3	6	9574	9579	0 %	50 %	0 %	50 %	148826767
23	NC_009567	GC	3	6	10017	10022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009567	CA	3	6	11663	11668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009567	AT	3	6	13004	13009	50 %	50 %	0 %	0 %	148826773
26	NC_009567	AT	3	6	13310	13315	50 %	50 %	0 %	0 %	148826773
27	NC_009567	AT	3	6	13426	13431	50 %	50 %	0 %	0 %	148826774
28	NC_009567	TA	3	6	13472	13477	50 %	50 %	0 %	0 %	148826774
29	NC_009567	TG	3	6	13711	13716	0 %	50 %	50 %	0 %	148826774
30	NC_009567	TG	3	6	13995	14000	0 %	50 %	50 %	0 %	148826774
31	NC_009567	TG	3	6	14004	14009	0 %	50 %	50 %	0 %	148826774
32	NC_009567	AG	4	8	14404	14411	50 %	0 %	50 %	0 %	148826775
33	NC_009567	AG	3	6	14628	14633	50 %	0 %	50 %	0 %	148826775
34	NC_009567	AT	3	6	16227	16232	50 %	50 %	0 %	0 %	148826777
35	NC_009567	CT	3	6	16490	16495	0 %	50 %	0 %	50 %	148826778
36	NC_009567	CG	3	6	16950	16955	0 %	0 %	50 %	50 %	148826778
37	NC_009567	CT	3	6	17076	17081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009567	AG	3	6	17086	17091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009567	TA	3	6	17276	17281	50 %	50 %	0 %	0 %	148826779
40	NC_009567	AT	3	6	19007	19012	50 %	50 %	0 %	0 %	148826780
41	NC_009567	AT	3	6	19039	19044	50 %	50 %	0 %	0 %	148826780
42	NC_009567	GA	3	6	19228	19233	50 %	0 %	50 %	0 %	148826780
43	NC_009567	TA	3	6	19480	19485	50 %	50 %	0 %	0 %	148826781
44	NC_009567	GT	3	6	21679	21684	0 %	50 %	50 %	0 %	148826783
45	NC_009567	TA	3	6	25335	25340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009567	GT	3	6	27963	27968	0 %	50 %	50 %	0 %	148826790
47	NC_009567	AT	3	6	28879	28884	50 %	50 %	0 %	0 %	148826791
48	NC_009567	AG	3	6	30157	30162	50 %	0 %	50 %	0 %	148826792
49	NC_009567	CG	3	6	31332	31337	0 %	0 %	50 %	50 %	148826793
50	NC_009567	CA	3	6	31831	31836	50 %	0 %	0 %	50 %	148826794
51	NC_009567	TC	3	6	33064	33069	0 %	50 %	0 %	50 %	148826796
52	NC_009567	TA	3	6	33529	33534	50 %	50 %	0 %	0 %	148826796
53	NC_009567	AG	3	6	34106	34111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009567	AG	3	6	34234	34239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009567	GT	3	6	34541	34546	0 %	50 %	50 %	0 %	148826797
56	NC_009567	AG	3	6	37386	37391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009567	CA	3	6	38860	38865	50 %	0 %	0 %	50 %	148826802
58	NC_009567	AT	3	6	41683	41688	50 %	50 %	0 %	0 %	148826803
59	NC_009567	AT	3	6	41989	41994	50 %	50 %	0 %	0 %	148826803
60	NC_009567	AT	3	6	42105	42110	50 %	50 %	0 %	0 %	148826804
61	NC_009567	TA	3	6	42151	42156	50 %	50 %	0 %	0 %	148826804
62	NC_009567	TG	3	6	42390	42395	0 %	50 %	50 %	0 %	148826804
63	NC_009567	TG	3	6	42674	42679	0 %	50 %	50 %	0 %	148826804
64	NC_009567	TG	3	6	42683	42688	0 %	50 %	50 %	0 %	148826804
65	NC_009567	AG	4	8	43083	43090	50 %	0 %	50 %	0 %	148826805
66	NC_009567	AG	3	6	43307	43312	50 %	0 %	50 %	0 %	148826805
67	NC_009567	TG	3	6	46654	46659	0 %	50 %	50 %	0 %	148826807
68	NC_009567	AT	3	6	49162	49167	50 %	50 %	0 %	0 %	148826810
69	NC_009567	GA	3	6	51951	51956	50 %	0 %	50 %	0 %	148826812
70	NC_009567	TG	3	6	52515	52520	0 %	50 %	50 %	0 %	148826812
71	NC_009567	AT	3	6	53095	53100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009567	AT	3	6	55174	55179	50 %	50 %	0 %	0 %	148826813
73	NC_009567	AG	3	6	56131	56136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009567	CG	3	6	56289	56294	0 %	0 %	50 %	50 %	148826814
75	NC_009567	GC	3	6	57153	57158	0 %	0 %	50 %	50 %	148826814
76	NC_009567	TC	3	6	57739	57744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009567	GT	3	6	58049	58054	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009567	TA	3	6	58355	58360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009567	AT	3	6	59852	59857	50 %	50 %	0 %	0 %	148826818
80	NC_009567	TG	3	6	59996	60001	0 %	50 %	50 %	0 %	148826818
81	NC_009567	AG	3	6	60433	60438	50 %	0 %	50 %	0 %	148826818
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84	NC_009567	CA	3	6	62408	62413	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009567	TA	3	6	63937	63942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_009567	CA	3	6	67545	67550	50 %	0 %	0 %	50 %	148826824
89	NC_009567	AG	3	6	68601	68606	50 %	0 %	50 %	0 %	148826825
90	NC_009567	AT	3	6	69406	69411	50 %	50 %	0 %	0 %	148826825
91	NC_009567	TG	3	6	69505	69510	0 %	50 %	50 %	0 %	148826825
92	NC_009567	TA	3	6	71599	71604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009567	CT	3	6	71660	71665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009567	GA	3	6	71997	72002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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100	NC_009567	AT	3	6	81054	81059	50 %	50 %	0 %	0 %	148826830
101	NC_009567	GC	3	6	81407	81412	0 %	0 %	50 %	50 %	148826830
102	NC_009567	TG	3	6	81661	81666	0 %	50 %	50 %	0 %	148826830
103	NC_009567	TG	3	6	82498	82503	0 %	50 %	50 %	0 %	148826831
104	NC_009567	AT	3	6	82877	82882	50 %	50 %	0 %	0 %	148826831
105	NC_009567	TG	3	6	83622	83627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009567	CA	3	6	83701	83706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009567	CA	3	6	85057	85062	50 %	0 %	0 %	50 %	148826832
108	NC_009567	GA	3	6	86175	86180	50 %	0 %	50 %	0 %	148826832
109	NC_009567	AG	3	6	86495	86500	50 %	0 %	50 %	0 %	148826833
110	NC_009567	TG	3	6	87776	87781	0 %	50 %	50 %	0 %	148826833
111	NC_009567	CA	3	6	87821	87826	50 %	0 %	0 %	50 %	148826833
112	NC_009567	CA	3	6	87979	87984	50 %	0 %	0 %	50 %	148826833
113	NC_009567	AT	3	6	93349	93354	50 %	50 %	0 %	0 %	148826836
114	NC_009567	AT	3	6	94609	94614	50 %	50 %	0 %	0 %	148826837
115	NC_009567	CA	3	6	95229	95234	50 %	0 %	0 %	50 %	148826837
116	NC_009567	CG	3	6	97147	97152	0 %	0 %	50 %	50 %	148826838
117	NC_009567	GA	3	6	97865	97870	50 %	0 %	50 %	0 %	148826838
118	NC_009567	AT	3	6	101300	101305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009567	CA	3	6	102426	102431	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009567	AC	3	6	103056	103061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009567	GT	3	6	103673	103678	0 %	50 %	50 %	0 %	148826842
122	NC_009567	TG	3	6	104074	104079	0 %	50 %	50 %	0 %	148826842
123	NC_009567	AT	3	6	104858	104863	50 %	50 %	0 %	0 %	148826843
124	NC_009567	AT	3	6	105242	105247	50 %	50 %	0 %	0 %	148826843
125	NC_009567	AG	3	6	105249	105254	50 %	0 %	50 %	0 %	148826843
126	NC_009567	AT	3	6	105925	105930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009567	AG	3	6	106452	106457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009567	AG	3	6	107490	107495	50 %	0 %	50 %	0 %	148826844
129	NC_009567	GC	4	8	110733	110740	0 %	0 %	50 %	50 %	148826844
130	NC_009567	GT	3	6	110919	110924	0 %	50 %	50 %	0 %	148826844
131	NC_009567	AG	3	6	112580	112585	50 %	0 %	50 %	0 %	148826845
132	NC_009567	TA	3	6	113643	113648	50 %	50 %	0 %	0 %	148826846
133	NC_009567	AG	3	6	113842	113847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009567	TA	3	6	114688	114693	50 %	50 %	0 %	0 %	148826847
135	NC_009567	TG	3	6	115521	115526	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009567	AT	4	8	116166	116173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009567	AT	4	8	116206	116213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009567	TA	3	6	116408	116413	50 %	50 %	0 %	0 %	148826850
139	NC_009567	AG	3	6	116780	116785	50 %	0 %	50 %	0 %	148826850
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141	NC_009567	CT	3	6	117437	117442	0 %	50 %	0 %	50 %	148826852
142	NC_009567	TA	3	6	117711	117716	50 %	50 %	0 %	0 %	148826852
143	NC_009567	GA	3	6	118387	118392	50 %	0 %	50 %	0 %	148826853
144	NC_009567	GA	3	6	119764	119769	50 %	0 %	50 %	0 %	148826857
145	NC_009567	CT	3	6	123407	123412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009567	CT	3	6	123685	123690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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