MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae PittEE chromosome

Total Repeats: 805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009566	TTAGTG	2	12	914	925	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009566	AGTGGT	2	12	1957	1968	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148825134
3	NC_009566	AGGATA	2	12	2891	2902	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148825134
4	NC_009566	TTTGAT	2	12	8161	8172	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148825135
5	NC_009566	AAAAAC	2	12	13177	13188	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	148825138
6	NC_009566	ACAAGA	2	12	14817	14828	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148825141
7	NC_009566	AGTTGA	2	12	16497	16508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825141
8	NC_009566	CAGAAC	2	12	17424	17435	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148825142
9	NC_009566	ATTGAT	2	12	19478	19489	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148825146
10	NC_009566	TGCTTT	2	12	20341	20352	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148825147
11	NC_009566	TTGATA	2	12	20856	20867	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148825148
12	NC_009566	TTTCTG	2	12	23079	23090	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148825151
13	NC_009566	CGTGGA	2	12	24911	24922	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148825153
14	NC_009566	TGAAGC	2	12	25161	25172	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148825153
15	NC_009566	ATTTTG	2	12	28552	28563	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148825154
16	NC_009566	TACAAT	2	12	30392	30403	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148825156
17	NC_009566	GCCACC	2	12	30778	30789	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148825157
18	NC_009566	TTTCTT	2	12	33248	33259	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	148825162
19	NC_009566	TATTGA	2	12	34562	34573	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148825163
20	NC_009566	TTATTT	2	12	35970	35981	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148825164
21	NC_009566	CAAATC	2	12	41831	41842	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148825170
22	NC_009566	GTTGAT	2	12	44491	44502	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148825173
23	NC_009566	GATGTT	2	12	45826	45837	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148825175
24	NC_009566	AAAATA	2	12	52234	52245	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009566	CAATTA	2	12	58590	58601	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148825192
26	NC_009566	AAGTAA	2	12	59138	59149	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009566	CCTCAA	2	12	64437	64448	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148825196
28	NC_009566	CAAATT	2	12	65087	65098	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148825197
29	NC_009566	AAATGC	2	12	67320	67331	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148825200
30	NC_009566	AATTTT	2	12	67743	67754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009566	GATTTA	2	12	67797	67808	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148825201
32	NC_009566	TTCCAG	2	12	68524	68535	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148825201
33	NC_009566	GATACC	2	12	69911	69922	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148825202
34	NC_009566	CCCAAG	2	12	71570	71581	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009566	GCAAAA	2	12	76253	76264	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148825206
36	NC_009566	TCTGGT	2	12	76981	76992	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148825207
37	NC_009566	CAAACT	2	12	80077	80088	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148825209
38	NC_009566	AAACAA	2	12	81621	81632	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	148825209
39	NC_009566	TTCGCT	2	12	88985	88996	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148825213
40	NC_009566	CTAAAC	2	12	99177	99188	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148825223
41	NC_009566	AAACTT	2	12	100108	100119	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148825225
42	NC_009566	TCAATT	2	12	101834	101845	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148825226
43	NC_009566	CTGCAG	2	12	103158	103169	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148825228
44	NC_009566	AACAAA	2	12	106613	106624	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	148825233
45	NC_009566	AAAACA	2	12	111742	111753	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	148825240
46	NC_009566	GAACCA	2	12	112637	112648	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148825241
47	NC_009566	GCACGT	2	12	114057	114068	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148825242
48	NC_009566	CTCTTC	2	12	123653	123664	0 %	50 %	0 %	50 %	148825252
49	NC_009566	CGCAAA	2	12	125698	125709	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148825254
50	NC_009566	TGAAAT	2	12	125882	125893	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148825254
51	NC_009566	GTGAAT	2	12	129851	129862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825258
52	NC_009566	TGGATT	2	12	137047	137058	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148825264
53	NC_009566	AAAATG	2	12	140444	140455	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148825268
54	NC_009566	AGATAA	2	12	141538	141549	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148825271
55	NC_009566	ATTTTA	2	12	145515	145526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825274
56	NC_009566	TGTTTT	2	12	146480	146491	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009566	TTTTAC	2	12	147783	147794	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148825276
58	NC_009566	TCAATG	2	12	149918	149929	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148825278
59	NC_009566	ATTTTG	2	12	153921	153932	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148825281
60	NC_009566	TTATTT	2	12	154382	154393	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148825281
61	NC_009566	AATAAG	2	12	163415	163426	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009566	ATGCAG	2	12	165546	165557	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148825293
63	NC_009566	CTTGCA	2	12	166254	166265	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148825294
64	NC_009566	TATTGA	2	12	169992	170003	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148825298
65	NC_009566	AATACC	2	12	173162	173173	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148825301
66	NC_009566	TAAAAA	2	12	176199	176210	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009566	TATTTT	2	12	176241	176252	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009566	ACGTAA	2	12	178056	178067	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148825306
69	NC_009566	GGCAAT	2	12	180044	180055	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148825307
70	NC_009566	CACGAA	2	12	182012	182023	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148825310
71	NC_009566	ATTGGC	2	12	184778	184789	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148825312
72	NC_009566	GTGGGC	2	12	186942	186953	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148825314
73	NC_009566	TTTAAG	2	12	189747	189758	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148825318
74	NC_009566	CAATAA	2	12	196767	196778	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148825325
75	NC_009566	TTATTT	2	12	198461	198472	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009566	TGGCAC	2	12	201819	201830	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148825328
77	NC_009566	TAAACC	2	12	204141	204152	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148825330
78	NC_009566	CAATAA	2	12	205144	205155	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148825331
79	NC_009566	TGATTT	2	12	207064	207075	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148825333
80	NC_009566	TTTTAG	2	12	207818	207829	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148825334
81	NC_009566	AGGCTA	2	12	208661	208672	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148825335
82	NC_009566	GCAAAA	2	12	208882	208893	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148825335
83	NC_009566	TTGTGG	2	12	214920	214931	0 %	50 %	50 %	0 %	148825341
84	NC_009566	CTAATG	2	12	219480	219491	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148825348
85	NC_009566	CATAAA	2	12	225660	225671	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_009566	AGCTTG	2	12	225758	225769	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148825355
87	NC_009566	GCACTT	2	12	226547	226558	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148825356
88	NC_009566	CAGTGT	2	12	227684	227695	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148825357
89	NC_009566	CTTACT	2	12	229799	229810	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148825359
90	NC_009566	CTAAGC	2	12	230075	230086	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148825360
91	NC_009566	TTTTTG	2	12	236550	236561	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	148825366
92	NC_009566	ACCAAA	2	12	239420	239431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825370
93	NC_009566	TCCTCT	2	12	240780	240791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009566	CGTGAC	2	12	241401	241412	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148825372
95	NC_009566	GCGTTG	2	12	244683	244694	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148825375
96	NC_009566	TAAATT	2	12	248882	248893	50 %	50 %	0 %	0 %	148825378
97	NC_009566	CTTGAT	2	12	249763	249774	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148825380
98	NC_009566	AAAAAG	2	12	260476	260487	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009566	ACTCGT	2	12	263072	263083	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148825390
100	NC_009566	AAAATT	2	12	269188	269199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825397
101	NC_009566	CGTGAT	2	12	269764	269775	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148825398
102	NC_009566	GAAGTG	2	12	269920	269931	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148825398
103	NC_009566	GGTGGC	2	12	274347	274358	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148825403
104	NC_009566	ATTTTT	2	12	274755	274766	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009566	TTAATC	2	12	277271	277282	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148825406
106	NC_009566	AGTGCA	2	12	278000	278011	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148825407
107	NC_009566	GCATCA	2	12	280598	280609	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148825411
108	NC_009566	TTCAAT	2	12	285554	285565	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148825417
109	NC_009566	CACGAA	2	12	288353	288364	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148825419
110	NC_009566	TGATTG	2	12	289915	289926	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148825421
111	NC_009566	ACAACC	2	12	290789	290800	50 %	0 %	0 %	50 %	148825423
112	NC_009566	AAACCA	2	12	294731	294742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825426
113	NC_009566	ACCTTA	2	12	295905	295916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009566	ACGGTA	2	12	299443	299454	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148825433
115	NC_009566	ATTAAC	2	12	299894	299905	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148825433
116	NC_009566	TCAAGT	2	12	301556	301567	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148825434
117	NC_009566	CAGCAA	2	12	306169	306180	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148825438
118	NC_009566	CTTTCT	2	12	308644	308655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825440
119	NC_009566	AAGCTA	2	12	314226	314237	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148825445
120	NC_009566	ACGTAA	2	12	314714	314725	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_009566	AAATTA	2	12	317180	317191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825447
122	NC_009566	TTGGCA	2	12	320077	320088	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148825450
123	NC_009566	AATTTG	2	12	325996	326007	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148825457
124	NC_009566	ACCCGT	2	12	327275	327286	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148825457
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142	NC_009566	AAATTA	2	12	347937	347948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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235	NC_009566	ATTAGA	2	12	541113	541124	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
236	NC_009566	TGATGC	2	12	544402	544413	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
237	NC_009566	ATCCAA	2	12	549241	549252	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148825618
238	NC_009566	GAAGTA	2	12	549428	549439	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148825618
239	NC_009566	CGCAAT	2	12	549760	549771	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148825618
240	NC_009566	CTTTGC	2	12	555828	555839	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148825621
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353	NC_009566	GAAAAA	2	12	847016	847027	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148825857
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355	NC_009566	TGCGAT	2	12	856270	856281	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148825866
356	NC_009566	GAAGAT	2	12	857378	857389	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148825866
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384	NC_009566	CTTGAG	2	12	926285	926296	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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452	NC_009566	TCATAA	2	12	1096708	1096719	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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455	NC_009566	GGAAGT	2	12	1098255	1098266	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
456	NC_009566	GATGAA	2	12	1099230	1099241	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148826102
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465	NC_009566	CAAAAT	2	12	1111735	1111746	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148826111
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467	NC_009566	TTTCTG	2	12	1114563	1114574	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148826113
468	NC_009566	AACTCT	2	12	1121594	1121605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826117
469	NC_009566	TGCTAA	2	12	1122188	1122199	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148826117
470	NC_009566	GCTCTG	2	12	1122505	1122516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148826117
471	NC_009566	TTTATA	2	12	1127756	1127767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_009566	TTCACA	2	12	1131603	1131614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148826126
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