MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus influenzae PittEE chromosome

Total Repeats: 650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009566	AGTGGT	2	12	1957	1968	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148825134
2	NC_009566	AGGATA	2	12	2891	2902	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148825134
3	NC_009566	TTTGAT	2	12	8161	8172	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148825135
4	NC_009566	AAAAAC	2	12	13177	13188	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	148825138
5	NC_009566	ACAAGA	2	12	14817	14828	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148825141
6	NC_009566	AGTTGA	2	12	16497	16508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825141
7	NC_009566	CAGAAC	2	12	17424	17435	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148825142
8	NC_009566	ATTGAT	2	12	19478	19489	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148825146
9	NC_009566	TGCTTT	2	12	20341	20352	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148825147
10	NC_009566	TTGATA	2	12	20856	20867	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148825148
11	NC_009566	TTTCTG	2	12	23079	23090	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148825151
12	NC_009566	CGTGGA	2	12	24911	24922	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148825153
13	NC_009566	TGAAGC	2	12	25161	25172	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148825153
14	NC_009566	ATTTTG	2	12	28552	28563	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148825154
15	NC_009566	TACAAT	2	12	30392	30403	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148825156
16	NC_009566	GCCACC	2	12	30778	30789	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148825157
17	NC_009566	TTTCTT	2	12	33248	33259	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	148825162
18	NC_009566	TATTGA	2	12	34562	34573	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148825163
19	NC_009566	TTATTT	2	12	35970	35981	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148825164
20	NC_009566	CAAATC	2	12	41831	41842	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148825170
21	NC_009566	GTTGAT	2	12	44491	44502	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148825173
22	NC_009566	GATGTT	2	12	45826	45837	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148825175
23	NC_009566	CAATTA	2	12	58590	58601	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148825192
24	NC_009566	CCTCAA	2	12	64437	64448	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148825196
25	NC_009566	CAAATT	2	12	65087	65098	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148825197
26	NC_009566	AAATGC	2	12	67320	67331	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148825200
27	NC_009566	GATTTA	2	12	67797	67808	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148825201
28	NC_009566	TTCCAG	2	12	68524	68535	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148825201
29	NC_009566	GATACC	2	12	69911	69922	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148825202
30	NC_009566	GCAAAA	2	12	76253	76264	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148825206
31	NC_009566	TCTGGT	2	12	76981	76992	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148825207
32	NC_009566	CAAACT	2	12	80077	80088	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148825209
33	NC_009566	AAACAA	2	12	81621	81632	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	148825209
34	NC_009566	TTCGCT	2	12	88985	88996	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148825213
35	NC_009566	CTAAAC	2	12	99177	99188	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148825223
36	NC_009566	AAACTT	2	12	100108	100119	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148825225
37	NC_009566	TCAATT	2	12	101834	101845	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148825226
38	NC_009566	CTGCAG	2	12	103158	103169	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148825228
39	NC_009566	AACAAA	2	12	106613	106624	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	148825233
40	NC_009566	AAAACA	2	12	111742	111753	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	148825240
41	NC_009566	GAACCA	2	12	112637	112648	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148825241
42	NC_009566	GCACGT	2	12	114057	114068	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148825242
43	NC_009566	CTCTTC	2	12	123653	123664	0 %	50 %	0 %	50 %	148825252
44	NC_009566	CGCAAA	2	12	125698	125709	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148825254
45	NC_009566	TGAAAT	2	12	125882	125893	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148825254
46	NC_009566	GTGAAT	2	12	129851	129862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825258
47	NC_009566	TGGATT	2	12	137047	137058	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148825264
48	NC_009566	AAAATG	2	12	140444	140455	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148825268
49	NC_009566	AGATAA	2	12	141538	141549	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148825271
50	NC_009566	ATTTTA	2	12	145515	145526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825274
51	NC_009566	TTTTAC	2	12	147783	147794	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148825276
52	NC_009566	TCAATG	2	12	149918	149929	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148825278
53	NC_009566	ATTTTG	2	12	153921	153932	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148825281
54	NC_009566	TTATTT	2	12	154382	154393	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148825281
55	NC_009566	ATGCAG	2	12	165546	165557	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148825293
56	NC_009566	CTTGCA	2	12	166254	166265	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148825294
57	NC_009566	TATTGA	2	12	169992	170003	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148825298
58	NC_009566	AATACC	2	12	173162	173173	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148825301
59	NC_009566	ACGTAA	2	12	178056	178067	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148825306
60	NC_009566	GGCAAT	2	12	180044	180055	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148825307
61	NC_009566	CACGAA	2	12	182012	182023	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148825310
62	NC_009566	ATTGGC	2	12	184778	184789	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148825312
63	NC_009566	GTGGGC	2	12	186942	186953	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148825314
64	NC_009566	TTTAAG	2	12	189747	189758	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148825318
65	NC_009566	CAATAA	2	12	196767	196778	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148825325
66	NC_009566	TGGCAC	2	12	201819	201830	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148825328
67	NC_009566	TAAACC	2	12	204141	204152	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148825330
68	NC_009566	CAATAA	2	12	205144	205155	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148825331
69	NC_009566	TGATTT	2	12	207064	207075	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148825333
70	NC_009566	TTTTAG	2	12	207818	207829	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148825334
71	NC_009566	AGGCTA	2	12	208661	208672	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148825335
72	NC_009566	GCAAAA	2	12	208882	208893	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148825335
73	NC_009566	TTGTGG	2	12	214920	214931	0 %	50 %	50 %	0 %	148825341
74	NC_009566	CTAATG	2	12	219480	219491	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148825348
75	NC_009566	AGCTTG	2	12	225758	225769	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148825355
76	NC_009566	GCACTT	2	12	226547	226558	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148825356
77	NC_009566	CAGTGT	2	12	227684	227695	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148825357
78	NC_009566	CTTACT	2	12	229799	229810	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148825359
79	NC_009566	CTAAGC	2	12	230075	230086	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148825360
80	NC_009566	TTTTTG	2	12	236550	236561	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	148825366
81	NC_009566	ACCAAA	2	12	239420	239431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825370
82	NC_009566	CGTGAC	2	12	241401	241412	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148825372
83	NC_009566	GCGTTG	2	12	244683	244694	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148825375
84	NC_009566	TAAATT	2	12	248882	248893	50 %	50 %	0 %	0 %	148825378
85	NC_009566	CTTGAT	2	12	249763	249774	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148825380
86	NC_009566	ACTCGT	2	12	263072	263083	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148825390
87	NC_009566	AAAATT	2	12	269188	269199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825397
88	NC_009566	CGTGAT	2	12	269764	269775	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148825398
89	NC_009566	GAAGTG	2	12	269920	269931	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148825398
90	NC_009566	GGTGGC	2	12	274347	274358	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148825403
91	NC_009566	TTAATC	2	12	277271	277282	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148825406
92	NC_009566	AGTGCA	2	12	278000	278011	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148825407
93	NC_009566	GCATCA	2	12	280598	280609	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148825411
94	NC_009566	TTCAAT	2	12	285554	285565	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148825417
95	NC_009566	CACGAA	2	12	288353	288364	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148825419
96	NC_009566	TGATTG	2	12	289915	289926	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148825421
97	NC_009566	ACAACC	2	12	290789	290800	50 %	0 %	0 %	50 %	148825423
98	NC_009566	AAACCA	2	12	294731	294742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825426
99	NC_009566	ACGGTA	2	12	299443	299454	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148825433
100	NC_009566	ATTAAC	2	12	299894	299905	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148825433
101	NC_009566	TCAAGT	2	12	301556	301567	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148825434
102	NC_009566	CAGCAA	2	12	306169	306180	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148825438
103	NC_009566	CTTTCT	2	12	308644	308655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825440
104	NC_009566	AAGCTA	2	12	314226	314237	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148825445
105	NC_009566	AAATTA	2	12	317180	317191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825447
106	NC_009566	TTGGCA	2	12	320077	320088	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148825450
107	NC_009566	AATTTG	2	12	325996	326007	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148825457
108	NC_009566	ACCCGT	2	12	327275	327286	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148825457
109	NC_009566	TTATCT	2	12	327288	327299	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148825457
110	NC_009566	ATTGCC	3	18	327968	327985	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148825457
111	NC_009566	TTAATC	2	12	329456	329467	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148825458
112	NC_009566	ACTTGT	4	24	330664	330687	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148825459
113	NC_009566	ATCGTT	2	12	334026	334037	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148825460
114	NC_009566	ACAAAC	2	12	334222	334233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825460
115	NC_009566	GATATA	2	12	335581	335592	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148825462
116	NC_009566	CAAGAT	2	12	335791	335802	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148825462
117	NC_009566	AATATC	2	12	337469	337480	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148825465
118	NC_009566	TTTTAT	2	12	337790	337801	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148825466
119	NC_009566	CTGATC	2	12	339072	339083	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148825467
120	NC_009566	TGGAAT	2	12	340392	340403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825470
121	NC_009566	AGAGCC	4	24	340520	340543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825470
122	NC_009566	GAAAAG	2	12	340614	340625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825470
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148	NC_009566	TTTTTG	2	12	448965	448976	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	148825540
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229	NC_009566	CAAATT	2	12	693901	693912	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148825735
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231	NC_009566	ATATTT	2	12	715854	715865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825754
232	NC_009566	GTTTTG	2	12	716854	716865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825755
233	NC_009566	ACTATC	2	12	716959	716970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825755
234	NC_009566	GCATTA	2	12	717228	717239	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148825755
235	NC_009566	ATTTAG	2	12	717385	717396	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148825755
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238	NC_009566	AAGCCT	2	12	731650	731661	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148825768
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333	NC_009566	ATCATA	2	12	1014631	1014642	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148826022
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340	NC_009566	ATGAAA	2	12	1048911	1048922	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148826055
341	NC_009566	ATTGCC	2	12	1052024	1052035	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148826056
342	NC_009566	TGGTTT	2	12	1052581	1052592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148826056
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344	NC_009566	CACAAC	2	12	1054651	1054662	50 %	0 %	0 %	50 %	148826059
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457	NC_009566	TTCCCG	2	12	1338392	1338403	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148826321
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