MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus influenzae PittEE chromosome

Total Repeats: 1115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009566	CAAAA	2	10	2492	2501	80 %	0 %	0 %	20 %	148825134
2	NC_009566	ATTTG	2	10	3336	3345	20 %	60 %	20 %	0 %	148825134
3	NC_009566	AAACA	2	10	3511	3520	80 %	0 %	0 %	20 %	148825134
4	NC_009566	TACAT	2	10	3720	3729	40 %	40 %	0 %	20 %	148825134
5	NC_009566	TCAGT	2	10	4393	4402	20 %	40 %	20 %	20 %	148825134
6	NC_009566	AACCA	2	10	9861	9870	60 %	0 %	0 %	40 %	148825136
7	NC_009566	CTTTT	2	10	10726	10735	0 %	80 %	0 %	20 %	148825137
8	NC_009566	TCTGG	2	10	14867	14876	0 %	40 %	40 %	20 %	148825141
9	NC_009566	TTGAT	2	10	15203	15212	20 %	60 %	20 %	0 %	148825141
10	NC_009566	TCGTA	2	10	15732	15741	20 %	40 %	20 %	20 %	148825141
11	NC_009566	CACAC	2	10	17719	17728	40 %	0 %	0 %	60 %	148825142
12	NC_009566	AGTTA	2	10	18894	18903	40 %	40 %	20 %	0 %	148825145
13	NC_009566	TTTGA	2	10	19184	19193	20 %	60 %	20 %	0 %	148825146
14	NC_009566	GCAAA	2	10	19490	19499	60 %	0 %	20 %	20 %	148825146
15	NC_009566	TTGAT	2	10	20202	20211	20 %	60 %	20 %	0 %	148825147
16	NC_009566	TGAAA	2	10	20788	20797	60 %	20 %	20 %	0 %	148825148
17	NC_009566	CCATT	2	10	24170	24179	20 %	40 %	0 %	40 %	148825153
18	NC_009566	GCATT	2	10	26213	26222	20 %	40 %	20 %	20 %	148825153
19	NC_009566	ATTTT	2	10	27239	27248	20 %	80 %	0 %	0 %	148825154
20	NC_009566	TTGCA	2	10	27280	27289	20 %	40 %	20 %	20 %	148825154
21	NC_009566	CTTAT	2	10	29085	29094	20 %	60 %	0 %	20 %	148825155
22	NC_009566	AATCC	2	10	30417	30426	40 %	20 %	0 %	40 %	148825156
23	NC_009566	TCATT	2	10	35939	35948	20 %	60 %	0 %	20 %	148825164
24	NC_009566	TTGAA	2	10	36225	36234	40 %	40 %	20 %	0 %	148825165
25	NC_009566	TATCG	2	10	37538	37547	20 %	40 %	20 %	20 %	148825166
26	NC_009566	AAAGC	2	10	39147	39156	60 %	0 %	20 %	20 %	148825167
27	NC_009566	ACTGG	2	10	42092	42101	20 %	20 %	40 %	20 %	148825170
28	NC_009566	GCATC	2	10	45377	45386	20 %	20 %	20 %	40 %	148825174
29	NC_009566	GATAT	2	10	46331	46340	40 %	40 %	20 %	0 %	148825175
30	NC_009566	TTTCA	2	10	50259	50268	20 %	60 %	0 %	20 %	148825183
31	NC_009566	ATTAC	2	10	51313	51322	40 %	40 %	0 %	20 %	148825183
32	NC_009566	TTAAA	2	10	51989	51998	60 %	40 %	0 %	0 %	148825185
33	NC_009566	GTGAA	2	10	52506	52515	40 %	20 %	40 %	0 %	148825186
34	NC_009566	AAAGC	2	10	55121	55130	60 %	0 %	20 %	20 %	148825189
35	NC_009566	TGGTA	2	10	57665	57674	20 %	40 %	40 %	0 %	148825192
36	NC_009566	AAGAT	2	10	61146	61155	60 %	20 %	20 %	0 %	148825193
37	NC_009566	AATGA	2	10	61584	61593	60 %	20 %	20 %	0 %	148825194
38	NC_009566	CAGTA	2	10	62456	62465	40 %	20 %	20 %	20 %	148825194
39	NC_009566	GTTTG	2	10	62617	62626	0 %	60 %	40 %	0 %	148825194
40	NC_009566	GCGTT	2	10	63133	63142	0 %	40 %	40 %	20 %	148825195
41	NC_009566	GATTA	2	10	64066	64075	40 %	40 %	20 %	0 %	148825196
42	NC_009566	TTTTG	2	10	65038	65047	0 %	80 %	20 %	0 %	148825197
43	NC_009566	TTGGC	2	10	66264	66273	0 %	40 %	40 %	20 %	148825198
44	NC_009566	GGTTG	2	10	67291	67300	0 %	40 %	60 %	0 %	148825200
45	NC_009566	GAAAA	2	10	68124	68133	80 %	0 %	20 %	0 %	148825201
46	NC_009566	CTTCA	2	10	72073	72082	20 %	40 %	0 %	40 %	148825203
47	NC_009566	ACGCA	2	10	73220	73229	40 %	0 %	20 %	40 %	148825203
48	NC_009566	ATGAT	2	10	76497	76506	40 %	40 %	20 %	0 %	148825206
49	NC_009566	ATTCC	2	10	80226	80235	20 %	40 %	0 %	40 %	148825209
50	NC_009566	ATCAA	2	10	81601	81610	60 %	20 %	0 %	20 %	148825209
51	NC_009566	GTGAA	2	10	82500	82509	40 %	20 %	40 %	0 %	148825210
52	NC_009566	TTGGA	2	10	87162	87171	20 %	40 %	40 %	0 %	148825211
53	NC_009566	GTTTA	2	10	89500	89509	20 %	60 %	20 %	0 %	148825213
54	NC_009566	TTCAG	2	10	91728	91737	20 %	40 %	20 %	20 %	148825216
55	NC_009566	TTTTC	2	10	97639	97648	0 %	80 %	0 %	20 %	148825222
56	NC_009566	TTTGA	2	10	97834	97843	20 %	60 %	20 %	0 %	148825222
57	NC_009566	CCAGC	2	10	98735	98744	20 %	0 %	20 %	60 %	148825223
58	NC_009566	ATCAA	2	10	103266	103275	60 %	20 %	0 %	20 %	148825228
59	NC_009566	TTTCC	2	10	104067	104076	0 %	60 %	0 %	40 %	148825229
60	NC_009566	AGTAG	2	10	107504	107513	40 %	20 %	40 %	0 %	148825234
61	NC_009566	TGAAT	2	10	107662	107671	40 %	40 %	20 %	0 %	148825234
62	NC_009566	AATGC	2	10	108449	108458	40 %	20 %	20 %	20 %	148825236
63	NC_009566	ACGTA	2	10	108518	108527	40 %	20 %	20 %	20 %	148825236
64	NC_009566	GCTTA	2	10	109895	109904	20 %	40 %	20 %	20 %	148825239
65	NC_009566	AAATT	2	10	110315	110324	60 %	40 %	0 %	0 %	148825239
66	NC_009566	GTGAA	2	10	112218	112227	40 %	20 %	40 %	0 %	148825241
67	NC_009566	TAATT	2	10	112777	112786	40 %	60 %	0 %	0 %	148825241
68	NC_009566	TGAAT	2	10	112837	112846	40 %	40 %	20 %	0 %	148825241
69	NC_009566	ATGAA	2	10	113458	113467	60 %	20 %	20 %	0 %	148825242
70	NC_009566	ATTTA	2	10	114304	114313	40 %	60 %	0 %	0 %	148825243
71	NC_009566	GCAGA	2	10	114326	114335	40 %	0 %	40 %	20 %	148825243
72	NC_009566	ATGGA	2	10	114951	114960	40 %	20 %	40 %	0 %	148825244
73	NC_009566	TAAAA	2	10	115120	115129	80 %	20 %	0 %	0 %	148825244
74	NC_009566	TGGAA	2	10	115525	115534	40 %	20 %	40 %	0 %	148825244
75	NC_009566	TAAAG	2	10	116005	116014	60 %	20 %	20 %	0 %	148825244
76	NC_009566	ATTGT	2	10	116150	116159	20 %	60 %	20 %	0 %	148825245
77	NC_009566	GATTT	2	10	119067	119076	20 %	60 %	20 %	0 %	148825248
78	NC_009566	CATTT	2	10	119272	119281	20 %	60 %	0 %	20 %	148825249
79	NC_009566	GGATA	2	10	120780	120789	40 %	20 %	40 %	0 %	148825250
80	NC_009566	TCAAT	2	10	121245	121254	40 %	40 %	0 %	20 %	148825250
81	NC_009566	CTAGA	2	10	121775	121784	40 %	20 %	20 %	20 %	148825251
82	NC_009566	TGGAC	2	10	122836	122845	20 %	20 %	40 %	20 %	148825251
83	NC_009566	GAATT	2	10	124584	124593	40 %	40 %	20 %	0 %	148825253
84	NC_009566	AATTT	2	10	127307	127316	40 %	60 %	0 %	0 %	148825255
85	NC_009566	TACAA	2	10	127686	127695	60 %	20 %	0 %	20 %	148825256
86	NC_009566	ATTTT	2	10	127900	127909	20 %	80 %	0 %	0 %	148825256
87	NC_009566	GGTTT	2	10	128453	128462	0 %	60 %	40 %	0 %	148825257
88	NC_009566	GGGGA	2	10	128742	128751	20 %	0 %	80 %	0 %	148825257
89	NC_009566	ACATC	2	10	130450	130459	40 %	20 %	0 %	40 %	148825258
90	NC_009566	TTTCA	2	10	133401	133410	20 %	60 %	0 %	20 %	148825260
91	NC_009566	AAAGT	2	10	133516	133525	60 %	20 %	20 %	0 %	148825260
92	NC_009566	ACTTG	2	10	135955	135964	20 %	40 %	20 %	20 %	148825263
93	NC_009566	TATGG	2	10	136277	136286	20 %	40 %	40 %	0 %	148825263
94	NC_009566	TCATC	2	10	136724	136733	20 %	40 %	0 %	40 %	148825264
95	NC_009566	GCAGA	2	10	137127	137136	40 %	0 %	40 %	20 %	148825264
96	NC_009566	TGGAT	2	10	137931	137940	20 %	40 %	40 %	0 %	148825265
97	NC_009566	GATTA	2	10	138527	138536	40 %	40 %	20 %	0 %	148825266
98	NC_009566	GAAAA	2	10	138887	138896	80 %	0 %	20 %	0 %	148825266
99	NC_009566	TTATT	2	10	139970	139979	20 %	80 %	0 %	0 %	148825268
100	NC_009566	CTGTG	2	10	143490	143499	0 %	40 %	40 %	20 %	148825272
101	NC_009566	ATTAC	2	10	145995	146004	40 %	40 %	0 %	20 %	148825274
102	NC_009566	GTTTT	2	10	147180	147189	0 %	80 %	20 %	0 %	148825276
103	NC_009566	GCATT	2	10	152624	152633	20 %	40 %	20 %	20 %	148825280
104	NC_009566	CCTTT	2	10	154041	154050	0 %	60 %	0 %	40 %	148825281
105	NC_009566	TAATT	2	10	154774	154783	40 %	60 %	0 %	0 %	148825282
106	NC_009566	AGTGC	2	10	154880	154889	20 %	20 %	40 %	20 %	148825282
107	NC_009566	ATTAT	2	10	155700	155709	40 %	60 %	0 %	0 %	148825284
108	NC_009566	GCGGA	2	10	155839	155848	20 %	0 %	60 %	20 %	148825284
109	NC_009566	TGAAA	2	10	158393	158402	60 %	20 %	20 %	0 %	148825287
110	NC_009566	ATGGT	2	10	161291	161300	20 %	40 %	40 %	0 %	148825291
111	NC_009566	GCAAT	2	10	162133	162142	40 %	20 %	20 %	20 %	148825291
112	NC_009566	GAAAT	2	10	162969	162978	60 %	20 %	20 %	0 %	148825292
113	NC_009566	AAAAG	2	10	167485	167494	80 %	0 %	20 %	0 %	148825295
114	NC_009566	CGGAA	2	10	167732	167741	40 %	0 %	40 %	20 %	148825296
115	NC_009566	TCAAT	2	10	168318	168327	40 %	40 %	0 %	20 %	148825297
116	NC_009566	CAAAA	2	10	168514	168523	80 %	0 %	0 %	20 %	148825297
117	NC_009566	GTGGC	2	10	169394	169403	0 %	20 %	60 %	20 %	148825298
118	NC_009566	CCGTT	2	10	169503	169512	0 %	40 %	20 %	40 %	148825298
119	NC_009566	GTGAA	2	10	170225	170234	40 %	20 %	40 %	0 %	148825298
120	NC_009566	TACCA	2	10	172815	172824	40 %	20 %	0 %	40 %	148825301
121	NC_009566	ACAAA	2	10	179488	179497	80 %	0 %	0 %	20 %	148825307
122	NC_009566	AACAT	2	10	182260	182269	60 %	20 %	0 %	20 %	148825310
123	NC_009566	CTTTT	2	10	182773	182782	0 %	80 %	0 %	20 %	148825310
124	NC_009566	AAATT	2	10	184122	184131	60 %	40 %	0 %	0 %	148825311
125	NC_009566	TGTGG	2	10	184465	184474	0 %	40 %	60 %	0 %	148825312
126	NC_009566	ATTTA	2	10	184767	184776	40 %	60 %	0 %	0 %	148825312
127	NC_009566	TTTTA	2	10	184897	184906	20 %	80 %	0 %	0 %	148825312
128	NC_009566	AAAAG	2	10	185383	185392	80 %	0 %	20 %	0 %	148825313
129	NC_009566	CAATC	2	10	186301	186310	40 %	20 %	0 %	40 %	148825314
130	NC_009566	TCAAT	2	10	186923	186932	40 %	40 %	0 %	20 %	148825314
131	NC_009566	TTCTT	2	10	188499	188508	0 %	80 %	0 %	20 %	148825316
132	NC_009566	AGTCA	2	10	190631	190640	40 %	20 %	20 %	20 %	148825318
133	NC_009566	GAAAA	2	10	191301	191310	80 %	0 %	20 %	0 %	148825319
134	NC_009566	CCATT	2	10	191882	191891	20 %	40 %	0 %	40 %	148825320
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