MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae PittEE chromosome

Total Repeats: 5139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009566	TTTC	2	8	330	337	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009566	TAGT	2	8	702	709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009566	TATT	2	8	750	757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009566	AATC	2	8	1367	1374	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009566	AACC	9	36	1523	1558	50 %	0 %	0 %	50 %	148825134
6	NC_009566	TCAA	2	8	1948	1955	50 %	25 %	0 %	25 %	148825134
7	NC_009566	AATC	2	8	2071	2078	50 %	25 %	0 %	25 %	148825134
8	NC_009566	AAAT	2	8	2861	2868	75 %	25 %	0 %	0 %	148825134
9	NC_009566	AAAC	2	8	3164	3171	75 %	0 %	0 %	25 %	148825134
10	NC_009566	CTTA	2	8	3260	3267	25 %	50 %	0 %	25 %	148825134
11	NC_009566	TTAG	2	8	3823	3830	25 %	50 %	25 %	0 %	148825134
12	NC_009566	AATT	2	8	3903	3910	50 %	50 %	0 %	0 %	148825134
13	NC_009566	ATGG	2	8	3943	3950	25 %	25 %	50 %	0 %	148825134
14	NC_009566	AATG	2	8	4008	4015	50 %	25 %	25 %	0 %	148825134
15	NC_009566	AACA	2	8	4334	4341	75 %	0 %	0 %	25 %	148825134
16	NC_009566	TGTA	2	8	4527	4534	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009566	TGTT	2	8	5156	5163	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009566	TGAT	2	8	5187	5194	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009566	TTGG	2	8	5232	5239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009566	ATTT	2	8	5644	5651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009566	ATTA	2	8	5772	5779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009566	TTAC	2	8	5851	5858	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009566	AAAG	2	8	6245	6252	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009566	TTTC	2	8	6564	6571	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009566	TTGT	2	8	6789	6796	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009566	TTTA	2	8	6916	6923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009566	CAAA	2	8	7104	7111	75 %	0 %	0 %	25 %	148825135
28	NC_009566	ATGC	2	8	7372	7379	25 %	25 %	25 %	25 %	148825135
29	NC_009566	TTTC	2	8	7612	7619	0 %	75 %	0 %	25 %	148825135
30	NC_009566	AAAT	2	8	8018	8025	75 %	25 %	0 %	0 %	148825135
31	NC_009566	TTAC	2	8	8182	8189	25 %	50 %	0 %	25 %	148825135
32	NC_009566	TTAA	2	8	8232	8239	50 %	50 %	0 %	0 %	148825135
33	NC_009566	CTTT	2	8	8258	8265	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009566	TCTA	2	8	9083	9090	25 %	50 %	0 %	25 %	148825136
35	NC_009566	TCAC	2	8	9126	9133	25 %	25 %	0 %	50 %	148825136
36	NC_009566	TGGC	2	8	9548	9555	0 %	25 %	50 %	25 %	148825136
37	NC_009566	TAAA	2	8	9629	9636	75 %	25 %	0 %	0 %	148825136
38	NC_009566	TGAT	2	8	9830	9837	25 %	50 %	25 %	0 %	148825136
39	NC_009566	GATA	2	8	10440	10447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009566	CTTT	2	8	10471	10478	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009566	GATA	2	8	10479	10486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009566	ATAA	2	8	10557	10564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009566	ATAA	2	8	10658	10665	75 %	25 %	0 %	0 %	148825137
44	NC_009566	TCAA	2	8	11057	11064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009566	ATAA	2	8	11153	11160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009566	AATA	2	8	11482	11489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009566	GATA	2	8	11492	11499	50 %	25 %	25 %	0 %	148825138
48	NC_009566	CCAT	2	8	12330	12337	25 %	25 %	0 %	50 %	148825138
49	NC_009566	ATTT	2	8	12381	12388	25 %	75 %	0 %	0 %	148825138
50	NC_009566	TGAT	2	8	12868	12875	25 %	50 %	25 %	0 %	148825138
51	NC_009566	TCAA	2	8	12895	12902	50 %	25 %	0 %	25 %	148825138
52	NC_009566	TAAC	2	8	13739	13746	50 %	25 %	0 %	25 %	148825139
53	NC_009566	TAAG	2	8	13956	13963	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009566	AATC	2	8	14220	14227	50 %	25 %	0 %	25 %	148825140
55	NC_009566	ACGT	2	8	14304	14311	25 %	25 %	25 %	25 %	148825140
56	NC_009566	TAAA	2	8	14635	14642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009566	TGGA	2	8	14809	14816	25 %	25 %	50 %	0 %	148825141
58	NC_009566	TACC	2	8	15508	15515	25 %	25 %	0 %	50 %	148825141
59	NC_009566	GAAT	2	8	16584	16591	50 %	25 %	25 %	0 %	148825141
60	NC_009566	ATGG	2	8	17117	17124	25 %	25 %	50 %	0 %	148825142
61	NC_009566	ACTC	2	8	19035	19042	25 %	25 %	0 %	50 %	148825145
62	NC_009566	GATA	2	8	20623	20630	50 %	25 %	25 %	0 %	148825147
63	NC_009566	AATG	2	8	20667	20674	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009566	TCTA	2	8	20705	20712	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009566	AAAT	2	8	20896	20903	75 %	25 %	0 %	0 %	148825148
66	NC_009566	AATT	2	8	21863	21870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009566	CCAA	2	8	21992	21999	50 %	0 %	0 %	50 %	148825150
68	NC_009566	GAAA	2	8	22142	22149	75 %	0 %	25 %	0 %	148825150
69	NC_009566	TGAA	2	8	22645	22652	50 %	25 %	25 %	0 %	148825150
70	NC_009566	GCGG	2	8	23063	23070	0 %	0 %	75 %	25 %	148825151
71	NC_009566	CCAC	2	8	23701	23708	25 %	0 %	0 %	75 %	148825152
72	NC_009566	AGCC	2	8	23940	23947	25 %	0 %	25 %	50 %	148825152
73	NC_009566	AGCC	2	8	24014	24021	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009566	ATTT	2	8	24253	24260	25 %	75 %	0 %	0 %	148825153
75	NC_009566	GACA	2	8	24528	24535	50 %	0 %	25 %	25 %	148825153
76	NC_009566	CAGC	2	8	24877	24884	25 %	0 %	25 %	50 %	148825153
77	NC_009566	AATT	2	8	25214	25221	50 %	50 %	0 %	0 %	148825153
78	NC_009566	TTGC	2	8	25585	25592	0 %	50 %	25 %	25 %	148825153
79	NC_009566	TTTA	2	8	26484	26491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009566	GTAT	2	8	26593	26600	25 %	50 %	25 %	0 %	148825154
81	NC_009566	CTTT	2	8	27099	27106	0 %	75 %	0 %	25 %	148825154
82	NC_009566	ATGA	2	8	27576	27583	50 %	25 %	25 %	0 %	148825154
83	NC_009566	AATG	2	8	28241	28248	50 %	25 %	25 %	0 %	148825154
84	NC_009566	TTCT	2	8	29106	29113	0 %	75 %	0 %	25 %	148825155
85	NC_009566	GGCG	2	8	29647	29654	0 %	0 %	75 %	25 %	148825155
86	NC_009566	AAAC	2	8	29990	29997	75 %	0 %	0 %	25 %	148825156
87	NC_009566	ATTT	2	8	30207	30214	25 %	75 %	0 %	0 %	148825156
88	NC_009566	TTCC	2	8	30660	30667	0 %	50 %	0 %	50 %	148825157
89	NC_009566	CCTA	2	8	30846	30853	25 %	25 %	0 %	50 %	148825157
90	NC_009566	GGAA	2	8	31931	31938	50 %	0 %	50 %	0 %	148825160
91	NC_009566	AACA	2	8	32126	32133	75 %	0 %	0 %	25 %	148825160
92	NC_009566	AAAT	2	8	32389	32396	75 %	25 %	0 %	0 %	148825160
93	NC_009566	CTTT	2	8	32489	32496	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009566	TAAA	2	8	32534	32541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009566	TACT	2	8	33305	33312	25 %	50 %	0 %	25 %	148825162
96	NC_009566	TAAC	2	8	34171	34178	50 %	25 %	0 %	25 %	148825163
97	NC_009566	ATTA	2	8	35012	35019	50 %	50 %	0 %	0 %	148825163
98	NC_009566	AAAT	2	8	35183	35190	75 %	25 %	0 %	0 %	148825163
99	NC_009566	CATT	2	8	35491	35498	25 %	50 %	0 %	25 %	148825163
100	NC_009566	ATTT	2	8	35662	35669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009566	CTTA	2	8	35714	35721	25 %	50 %	0 %	25 %	148825164
102	NC_009566	ACTT	2	8	36147	36154	25 %	50 %	0 %	25 %	148825165
103	NC_009566	TTGA	2	8	36386	36393	25 %	50 %	25 %	0 %	148825165
104	NC_009566	GGTT	2	8	36688	36695	0 %	50 %	50 %	0 %	148825165
105	NC_009566	TGAA	2	8	36798	36805	50 %	25 %	25 %	0 %	148825165
106	NC_009566	ATTG	2	8	36933	36940	25 %	50 %	25 %	0 %	148825165
107	NC_009566	TGGT	2	8	37603	37610	0 %	50 %	50 %	0 %	148825166
108	NC_009566	TGGA	2	8	39574	39581	25 %	25 %	50 %	0 %	148825168
109	NC_009566	TAAA	2	8	40204	40211	75 %	25 %	0 %	0 %	148825169
110	NC_009566	GCAA	2	8	40439	40446	50 %	0 %	25 %	25 %	148825169
111	NC_009566	CATC	2	8	40587	40594	25 %	25 %	0 %	50 %	148825169
112	NC_009566	TAAA	2	8	40665	40672	75 %	25 %	0 %	0 %	148825169
113	NC_009566	TTGG	2	8	41732	41739	0 %	50 %	50 %	0 %	148825170
114	NC_009566	AATA	2	8	42318	42325	75 %	25 %	0 %	0 %	148825171
115	NC_009566	TAAA	2	8	43745	43752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009566	TTTA	2	8	43835	43842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009566	ATCA	23	92	43964	44055	50 %	25 %	0 %	25 %	148825173
118	NC_009566	TACT	2	8	44090	44097	25 %	50 %	0 %	25 %	148825173
119	NC_009566	AATG	2	8	44230	44237	50 %	25 %	25 %	0 %	148825173
120	NC_009566	AAAC	2	8	44314	44321	75 %	0 %	0 %	25 %	148825173
121	NC_009566	ATGG	2	8	45419	45426	25 %	25 %	50 %	0 %	148825174
122	NC_009566	TATT	2	8	46551	46558	25 %	75 %	0 %	0 %	148825175
123	NC_009566	GAAA	2	8	46569	46576	75 %	0 %	25 %	0 %	148825175
124	NC_009566	AAAG	2	8	46602	46609	75 %	0 %	25 %	0 %	148825175
125	NC_009566	AAAT	2	8	46849	46856	75 %	25 %	0 %	0 %	148825176
126	NC_009566	AAAT	2	8	47269	47276	75 %	25 %	0 %	0 %	148825176
127	NC_009566	GTTT	2	8	47283	47290	0 %	75 %	25 %	0 %	148825176
128	NC_009566	TACT	2	8	47634	47641	25 %	50 %	0 %	25 %	148825176
129	NC_009566	CGGT	2	8	48796	48803	0 %	25 %	50 %	25 %	148825180
130	NC_009566	CGCT	2	8	49097	49104	0 %	25 %	25 %	50 %	148825181
131	NC_009566	CCTT	2	8	50911	50918	0 %	50 %	0 %	50 %	148825183
132	NC_009566	GCGT	2	8	52754	52761	0 %	25 %	50 %	25 %	148825187
133	NC_009566	ACGC	2	8	53116	53123	25 %	0 %	25 %	50 %	148825187
134	NC_009566	TGAT	2	8	53306	53313	25 %	50 %	25 %	0 %	148825187
135	NC_009566	TCAT	2	8	53423	53430	25 %	50 %	0 %	25 %	148825187
136	NC_009566	CAAC	2	8	53513	53520	50 %	0 %	0 %	50 %	148825187
137	NC_009566	TGGA	2	8	54251	54258	25 %	25 %	50 %	0 %	148825187
138	NC_009566	ATAA	2	8	54381	54388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009566	ATGG	2	8	55537	55544	25 %	25 %	50 %	0 %	148825189
140	NC_009566	GCTC	2	8	55571	55578	0 %	25 %	25 %	50 %	148825189
141	NC_009566	TGGC	2	8	55868	55875	0 %	25 %	50 %	25 %	148825190
142	NC_009566	ACTC	2	8	55911	55918	25 %	25 %	0 %	50 %	148825190
143	NC_009566	TATT	2	8	56135	56142	25 %	75 %	0 %	0 %	148825190
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145	NC_009566	CTTT	2	8	56767	56774	0 %	75 %	0 %	25 %	148825191
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