MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae PittEE chromosome

Total Repeats: 23986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009566	GGC	2	6	32	37	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009566	GAA	3	9	53	61	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009566	ATG	2	6	111	116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009566	TGC	2	6	145	150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009566	GTT	2	6	191	196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009566	GAA	2	6	353	358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009566	GAA	2	6	376	381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009566	TAT	2	6	457	462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009566	TGG	2	6	488	493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009566	ATC	2	6	530	535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009566	TAG	2	6	603	608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009566	TCT	2	6	779	784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009566	GTA	2	6	1019	1024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009566	CAA	2	6	1128	1133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009566	ATG	2	6	1183	1188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009566	CCA	2	6	1216	1221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_009566	TGG	2	6	1243	1248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009566	CAA	2	6	1278	1283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009566	ATA	2	6	1329	1334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009566	TTG	2	6	1379	1384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009566	ATT	4	12	1419	1430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009566	AAC	2	6	1577	1582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825134
23	NC_009566	TGT	2	6	1731	1736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825134
24	NC_009566	GTG	2	6	1775	1780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825134
25	NC_009566	TCT	2	6	1837	1842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825134
26	NC_009566	AAT	2	6	1882	1887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825134
27	NC_009566	AAG	2	6	1919	1924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825134
28	NC_009566	ACA	2	6	2134	2139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825134
29	NC_009566	AGA	2	6	2140	2145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825134
30	NC_009566	ATT	2	6	2250	2255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825134
31	NC_009566	ATC	2	6	2282	2287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825134
32	NC_009566	GCA	2	6	2299	2304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825134
33	NC_009566	AAG	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825134
34	NC_009566	ATA	3	9	2900	2908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825134
35	NC_009566	CTT	2	6	2942	2947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825134
36	NC_009566	ATA	2	6	3077	3082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825134
37	NC_009566	ATG	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825134
38	NC_009566	TGG	2	6	3136	3141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825134
39	NC_009566	TGT	2	6	3312	3317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825134
40	NC_009566	ATT	2	6	3326	3331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825134
41	NC_009566	TGA	2	6	3411	3416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825134
42	NC_009566	ATA	2	6	3455	3460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825134
43	NC_009566	ATG	2	6	3461	3466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825134
44	NC_009566	TTA	2	6	3470	3475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825134
45	NC_009566	TTC	2	6	3575	3580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825134
46	NC_009566	ATG	2	6	3731	3736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825134
47	NC_009566	GTA	2	6	3886	3891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825134
48	NC_009566	ACC	2	6	4055	4060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148825134
49	NC_009566	ACC	2	6	4090	4095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148825134
50	NC_009566	AGA	2	6	4116	4121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825134
51	NC_009566	TGT	2	6	4416	4421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009566	ATT	2	6	4622	4627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009566	CGA	2	6	4646	4651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009566	AAT	2	6	4770	4775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009566	ATA	2	6	4832	4837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009566	GTA	2	6	4970	4975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009566	TGA	2	6	5019	5024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009566	TCA	2	6	5083	5088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009566	ATT	2	6	5108	5113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009566	GGC	2	6	5138	5143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009566	TAT	2	6	5269	5274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009566	TCC	2	6	5302	5307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_009566	TCA	2	6	5335	5340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009566	GAA	2	6	5396	5401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009566	TTA	2	6	5572	5577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009566	ATT	2	6	5601	5606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009566	ATT	2	6	5632	5637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009566	TAA	2	6	5699	5704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009566	TTC	2	6	5881	5886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009566	TCA	2	6	5906	5911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009566	TCA	2	6	5918	5923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009566	CTG	3	9	5939	5947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009566	TGC	3	9	5952	5960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009566	CTG	2	6	6014	6019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009566	ATG	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009566	TTC	2	6	6066	6071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009566	GTT	2	6	6169	6174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009566	AAC	2	6	6212	6217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009566	GTT	2	6	6263	6268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009566	TGG	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009566	CAT	2	6	6336	6341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009566	ACA	2	6	6343	6348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009566	GAA	2	6	6452	6457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009566	TAT	2	6	6499	6504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009566	TGC	2	6	6556	6561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009566	CAA	2	6	6606	6611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009566	GCA	2	6	6653	6658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009566	GCA	2	6	6731	6736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009566	ATT	2	6	6877	6882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009566	TGT	2	6	6885	6890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009566	GAA	2	6	6954	6959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009566	CGT	2	6	6997	7002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825135
93	NC_009566	GTA	2	6	7150	7155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825135
94	NC_009566	ATT	2	6	7239	7244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825135
95	NC_009566	AAG	2	6	7340	7345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825135
96	NC_009566	CAG	2	6	7481	7486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825135
97	NC_009566	AAG	2	6	7487	7492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825135
98	NC_009566	GCA	2	6	7504	7509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825135
99	NC_009566	TGA	2	6	7533	7538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825135
100	NC_009566	ATT	2	6	7544	7549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825135
101	NC_009566	CTT	2	6	7553	7558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825135
102	NC_009566	TGC	2	6	7668	7673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825135
103	NC_009566	TTA	2	6	7696	7701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825135
104	NC_009566	CTG	2	6	7817	7822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825135
105	NC_009566	GAA	2	6	7993	7998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825135
106	NC_009566	AAC	2	6	8009	8014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825135
107	NC_009566	CAG	2	6	8138	8143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825135
108	NC_009566	TCA	2	6	8145	8150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825135
109	NC_009566	ATT	2	6	8223	8228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825135
110	NC_009566	TAA	2	6	8313	8318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009566	ATG	2	6	8329	8334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825136
112	NC_009566	CAA	2	6	8441	8446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825136
113	NC_009566	TAT	2	6	8479	8484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825136
114	NC_009566	GTA	2	6	8782	8787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825136
115	NC_009566	AGA	2	6	8799	8804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825136
116	NC_009566	TGG	2	6	8843	8848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825136
117	NC_009566	ATA	2	6	8849	8854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825136
118	NC_009566	GAA	2	6	8994	8999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825136
119	NC_009566	TGA	2	6	9045	9050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825136
120	NC_009566	AAG	2	6	9059	9064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825136
121	NC_009566	ATA	2	6	9236	9241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825136
122	NC_009566	GTG	2	6	9247	9252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825136
123	NC_009566	ATG	2	6	9323	9328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825136
124	NC_009566	GAT	2	6	9472	9477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825136
125	NC_009566	GCA	2	6	9541	9546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825136
126	NC_009566	GGT	2	6	9592	9597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825136
127	NC_009566	GCA	2	6	9658	9663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825136
128	NC_009566	GTT	2	6	9694	9699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825136
129	NC_009566	GCG	2	6	10204	10209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148825136
130	NC_009566	ATA	2	6	10299	10304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825136
131	NC_009566	TAG	2	6	10380	10385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009566	TCA	2	6	10565	10570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825137
133	NC_009566	TAT	2	6	10576	10581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825137
134	NC_009566	TAA	2	6	10610	10615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825137
135	NC_009566	AAT	2	6	10672	10677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825137
136	NC_009566	TTC	2	6	10790	10795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825137
137	NC_009566	TCC	2	6	10847	10852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148825137
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142	NC_009566	TAA	2	6	11341	11346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009566	AAT	2	6	11348	11353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_009566	TAT	2	6	18519	18524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825144
264	NC_009566	GTT	2	6	18564	18569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825144
265	NC_009566	CAT	2	6	18573	18578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825144
266	NC_009566	TAA	2	6	18586	18591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825144
267	NC_009566	TTG	2	6	18616	18621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825144
268	NC_009566	GTT	2	6	18633	18638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825144
269	NC_009566	CAT	2	6	18663	18668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825144
270	NC_009566	TTA	2	6	18797	18802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825145
271	NC_009566	TGC	2	6	18822	18827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825145
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278	NC_009566	TAT	2	6	19315	19320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825146
279	NC_009566	CTT	2	6	19345	19350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825146
280	NC_009566	AAT	2	6	19502	19507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825146
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282	NC_009566	TCA	2	6	19546	19551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825146
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284	NC_009566	ATA	2	6	19877	19882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_009566	TGG	2	6	19984	19989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825147
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289	NC_009566	CTT	2	6	20484	20489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825147
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292	NC_009566	TGC	2	6	20617	20622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825147
293	NC_009566	AAT	2	6	20676	20681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_009566	CAA	2	6	20756	20761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825148
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298	NC_009566	ATT	2	6	20961	20966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825148
299	NC_009566	ATA	2	6	21033	21038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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379	NC_009566	ATT	2	6	26402	26407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
380	NC_009566	GTG	2	6	26649	26654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825154
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499	NC_009566	CCA	2	6	35849	35854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148825164
500	NC_009566	TTA	2	6	35983	35988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825164

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