MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus influenzae PittEE chromosome

Total Repeats: 19602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009566	AAC	2	6	1577	1582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825134
2	NC_009566	TGT	2	6	1731	1736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825134
3	NC_009566	GTG	2	6	1775	1780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825134
4	NC_009566	TCT	2	6	1837	1842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825134
5	NC_009566	AAT	2	6	1882	1887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825134
6	NC_009566	AAG	2	6	1919	1924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825134
7	NC_009566	ACA	2	6	2134	2139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825134
8	NC_009566	AGA	2	6	2140	2145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825134
9	NC_009566	ATT	2	6	2250	2255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825134
10	NC_009566	ATC	2	6	2282	2287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825134
11	NC_009566	GCA	2	6	2299	2304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825134
12	NC_009566	AAG	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825134
13	NC_009566	ATA	3	9	2900	2908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825134
14	NC_009566	CTT	2	6	2942	2947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825134
15	NC_009566	ATA	2	6	3077	3082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825134
16	NC_009566	ATG	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825134
17	NC_009566	TGG	2	6	3136	3141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825134
18	NC_009566	TGT	2	6	3312	3317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825134
19	NC_009566	ATT	2	6	3326	3331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825134
20	NC_009566	TGA	2	6	3411	3416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825134
21	NC_009566	ATA	2	6	3455	3460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825134
22	NC_009566	ATG	2	6	3461	3466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825134
23	NC_009566	TTA	2	6	3470	3475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825134
24	NC_009566	TTC	2	6	3575	3580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825134
25	NC_009566	ATG	2	6	3731	3736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825134
26	NC_009566	GTA	2	6	3886	3891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825134
27	NC_009566	ACC	2	6	4055	4060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148825134
28	NC_009566	ACC	2	6	4090	4095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148825134
29	NC_009566	AGA	2	6	4116	4121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825134
30	NC_009566	CGT	2	6	6997	7002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825135
31	NC_009566	GTA	2	6	7150	7155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825135
32	NC_009566	ATT	2	6	7239	7244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825135
33	NC_009566	AAG	2	6	7340	7345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825135
34	NC_009566	CAG	2	6	7481	7486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825135
35	NC_009566	AAG	2	6	7487	7492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825135
36	NC_009566	GCA	2	6	7504	7509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825135
37	NC_009566	TGA	2	6	7533	7538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825135
38	NC_009566	ATT	2	6	7544	7549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825135
39	NC_009566	CTT	2	6	7553	7558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825135
40	NC_009566	TGC	2	6	7668	7673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825135
41	NC_009566	TTA	2	6	7696	7701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825135
42	NC_009566	CTG	2	6	7817	7822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825135
43	NC_009566	GAA	2	6	7993	7998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825135
44	NC_009566	AAC	2	6	8009	8014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825135
45	NC_009566	CAG	2	6	8138	8143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825135
46	NC_009566	TCA	2	6	8145	8150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825135
47	NC_009566	ATT	2	6	8223	8228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825135
48	NC_009566	ATG	2	6	8329	8334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825136
49	NC_009566	CAA	2	6	8441	8446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825136
50	NC_009566	TAT	2	6	8479	8484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825136
51	NC_009566	GTA	2	6	8782	8787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825136
52	NC_009566	AGA	2	6	8799	8804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825136
53	NC_009566	TGG	2	6	8843	8848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825136
54	NC_009566	ATA	2	6	8849	8854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825136
55	NC_009566	GAA	2	6	8994	8999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825136
56	NC_009566	TGA	2	6	9045	9050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825136
57	NC_009566	AAG	2	6	9059	9064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825136
58	NC_009566	ATA	2	6	9236	9241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825136
59	NC_009566	GTG	2	6	9247	9252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825136
60	NC_009566	ATG	2	6	9323	9328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825136
61	NC_009566	GAT	2	6	9472	9477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825136
62	NC_009566	GCA	2	6	9541	9546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825136
63	NC_009566	GGT	2	6	9592	9597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825136
64	NC_009566	GCA	2	6	9658	9663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825136
65	NC_009566	GTT	2	6	9694	9699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825136
66	NC_009566	GCG	2	6	10204	10209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148825136
67	NC_009566	ATA	2	6	10299	10304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825136
68	NC_009566	TCA	2	6	10565	10570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825137
69	NC_009566	TAT	2	6	10576	10581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825137
70	NC_009566	TAA	2	6	10610	10615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825137
71	NC_009566	AAT	2	6	10672	10677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825137
72	NC_009566	TTC	2	6	10790	10795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825137
73	NC_009566	TCC	2	6	10847	10852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148825137
74	NC_009566	ATA	2	6	10980	10985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825137
75	NC_009566	ATG	2	6	11518	11523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825138
76	NC_009566	GGT	2	6	11535	11540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825138
77	NC_009566	TTA	2	6	11598	11603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825138
78	NC_009566	TGG	2	6	11651	11656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825138
79	NC_009566	AAG	2	6	11680	11685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825138
80	NC_009566	TGC	2	6	11714	11719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825138
81	NC_009566	CAG	2	6	11767	11772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825138
82	NC_009566	CAA	2	6	11862	11867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825138
83	NC_009566	ACC	2	6	12101	12106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148825138
84	NC_009566	ACA	2	6	12149	12154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825138
85	NC_009566	TGA	2	6	12158	12163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825138
86	NC_009566	TGA	2	6	12197	12202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148825138
87	NC_009566	CAA	2	6	12210	12215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825138
88	NC_009566	TAA	2	6	12266	12271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825138
89	NC_009566	ATT	2	6	12535	12540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825138
90	NC_009566	TTC	2	6	12594	12599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825138
91	NC_009566	GAA	2	6	12630	12635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825138
92	NC_009566	TGG	2	6	12736	12741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825138
93	NC_009566	TTA	2	6	12810	12815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825138
94	NC_009566	AGA	2	6	12974	12979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825138
95	NC_009566	CGT	2	6	13038	13043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825138
96	NC_009566	CTT	2	6	13069	13074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825138
97	NC_009566	CAA	2	6	13161	13166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825138
98	NC_009566	GAA	2	6	13167	13172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825138
99	NC_009566	AAC	2	6	13270	13275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825138
100	NC_009566	CTG	2	6	13324	13329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825138
101	NC_009566	ATT	2	6	13338	13343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825138
102	NC_009566	GTG	2	6	13661	13666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825139
103	NC_009566	CTT	2	6	13760	13765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825139
104	NC_009566	GGT	2	6	13771	13776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825139
105	NC_009566	GTG	2	6	13817	13822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825139
106	NC_009566	CGT	3	9	14108	14116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825140
107	NC_009566	TTC	2	6	14136	14141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825140
108	NC_009566	TTA	2	6	14178	14183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148825140
109	NC_009566	TCG	2	6	14332	14337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825140
110	NC_009566	TGG	2	6	14341	14346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825140
111	NC_009566	CGT	2	6	14384	14389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148825140
112	NC_009566	AGC	2	6	14419	14424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825140
113	NC_009566	GTG	2	6	14433	14438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825140
114	NC_009566	ATA	2	6	14487	14492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825140
115	NC_009566	GCA	2	6	14498	14503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825140
116	NC_009566	TAA	2	6	14570	14575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825140
117	NC_009566	TAA	2	6	14651	14656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148825141
118	NC_009566	ACT	4	12	14725	14736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148825141
119	NC_009566	GCA	2	6	14794	14799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148825141
120	NC_009566	CAA	2	6	14855	14860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825141
121	NC_009566	CAA	2	6	14884	14889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148825141
122	NC_009566	TGG	2	6	15003	15008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148825141
123	NC_009566	CTT	2	6	15105	15110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148825141
124	NC_009566	GTT	2	6	15115	15120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825141
125	NC_009566	AGA	2	6	15180	15185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825141
126	NC_009566	GAA	2	6	15268	15273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825141
127	NC_009566	GAA	2	6	15301	15306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825141
128	NC_009566	TTG	2	6	15320	15325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148825141
129	NC_009566	AGA	2	6	15345	15350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148825141
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