MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis F11 chromosome

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009565	ACCGCG	2	12	31190	31201	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009565	CGTCGG	2	12	66840	66851	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009565	CAACGG	2	12	76363	76374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009565	TCACCT	2	12	80529	80540	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009565	CTCGGT	2	12	149510	149521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009565	GCCGCG	2	12	181248	181259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009565	ACAGCC	2	12	218796	218807	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009565	CCCCGA	2	12	293948	293959	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_009565	AGATTC	2	12	330680	330691	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009565	GGTCGC	2	12	345202	345213	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009565	ATAGTC	2	12	546141	546152	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009565	ACCAGT	2	12	594144	594155	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009565	CGCCGT	2	12	723153	723164	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009565	CGCGGG	2	12	833691	833702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009565	CCGGCG	2	12	867027	867038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009565	ACCGGG	2	12	873748	873759	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009565	GCGGCC	2	12	910639	910650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009565	ACAGCA	2	12	912012	912023	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009565	CTGGGT	2	12	926851	926862	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_009565	TCGGGT	2	12	969394	969405	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009565	CAACGG	2	12	1033184	1033195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009565	GATCGA	2	12	1033235	1033246	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_009565	GACTGC	2	12	1037639	1037650	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009565	CGCCGG	2	12	1056503	1056514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009565	GGCGCA	2	12	1098232	1098243	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009565	CAATGC	2	12	1127418	1127429	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009565	TTGGTG	2	12	1155554	1155565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009565	TTCCGT	2	12	1166247	1166258	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009565	TAGCCA	2	12	1200019	1200030	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009565	AGTTAC	2	12	1225711	1225722	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009565	AGGACG	2	12	1286700	1286711	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009565	AGGCCA	2	12	1345059	1345070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009565	TCGACA	2	12	1372510	1372521	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009565	CCGAGT	2	12	1423589	1423600	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009565	CACGCG	2	12	1530703	1530714	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009565	ATATTC	2	12	1565731	1565742	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_009565	GCCCCT	2	12	1639241	1639252	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_009565	GCCCCT	2	12	1642831	1642842	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_009565	CGAGTG	2	12	1785498	1785509	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_009565	GGCGCC	2	12	1831723	1831734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009565	CCGCGG	2	12	1895276	1895287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009565	CGCCGA	2	12	1913050	1913061	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009565	TAGCGG	2	12	1922381	1922392	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_009565	ACCGCA	2	12	1924318	1924329	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009565	CCCGAC	2	12	2019521	2019532	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_009565	GGTGAT	2	12	2049995	2050006	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009565	GCCGTC	2	12	2061658	2061669	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009565	TTCGGC	2	12	2063904	2063915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009565	AGAGGG	2	12	2084029	2084040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009565	CCGCGT	2	12	2095870	2095881	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009565	GCTGGG	2	12	2153132	2153143	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_009565	CGCGAG	2	12	2184784	2184795	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009565	CGGTTG	2	12	2239198	2239209	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009565	GCCGCA	2	12	2242103	2242114	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009565	CACCAG	2	12	2270301	2270312	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009565	GGTTCG	2	12	2272248	2272259	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_009565	CGGCTC	2	12	2272774	2272785	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009565	GGCGTC	2	12	2282015	2282026	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009565	CCCTGA	2	12	2335985	2335996	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009565	GTAGCC	2	12	2348998	2349009	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009565	TGCACT	2	12	2354555	2354566	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009565	CTCAAC	2	12	2423141	2423152	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009565	CCGCTG	2	12	2443744	2443755	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009565	CACCGC	2	12	2452201	2452212	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_009565	GCGTCG	2	12	2504516	2504527	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009565	CACGAC	2	12	2522686	2522697	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009565	GCAACC	2	12	2642999	2643010	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009565	CACGTG	2	12	2730035	2730046	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009565	GAGGTC	2	12	2733647	2733658	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_009565	CCGGCA	2	12	2747698	2747709	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009565	CGCCAC	2	12	2805887	2805898	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_009565	TCAAAC	2	12	2807640	2807651	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009565	CTTGAC	2	12	2821413	2821424	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009565	GCACCC	2	12	2835712	2835723	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_009565	CGACGG	2	12	2883993	2884004	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009565	GCCCGA	2	12	2891088	2891099	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009565	GTATTG	2	12	2929524	2929535	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009565	CCGTTG	2	12	2939460	2939471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009565	CGGAAG	2	12	2966617	2966628	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_009565	GTTCGG	2	12	2973370	2973381	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_009565	GGTGTG	2	12	2975946	2975957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009565	CGACTC	2	12	2993603	2993614	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009565	CATATT	2	12	3027034	3027045	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_009565	CCGGCA	2	12	3091111	3091122	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009565	CGTTGC	2	12	3112125	3112136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009565	CATCGA	2	12	3133832	3133843	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009565	CATCAC	2	12	3196312	3196323	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009565	CCCCGC	2	12	3254624	3254635	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
89	NC_009565	TCGCCG	2	12	3302905	3302916	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009565	TCGCCG	2	12	3302962	3302973	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009565	CGCCAC	2	12	3318983	3318994	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009565	GGCCGG	2	12	3324682	3324693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009565	TCCGAA	2	12	3337531	3337542	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009565	CGTAGG	2	12	3392867	3392878	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_009565	CGTGAC	2	12	3404617	3404628	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009565	TGTACA	2	12	3442118	3442129	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_009565	ACCAAC	2	12	3447467	3447478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009565	CCGTTG	2	12	3469165	3469176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009565	GCTCCT	2	12	3500901	3500912	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009565	GTCGAC	2	12	3516164	3516175	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009565	TCCGCT	2	12	3560134	3560145	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009565	GCCTCC	2	12	3652022	3652033	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_009565	ATACGA	2	12	3723688	3723699	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_009565	TCAGTG	2	12	3723813	3723824	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_009565	TGCCGC	2	12	3750426	3750437	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009565	GCGCAG	2	12	3790883	3790894	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009565	TGTACA	2	12	3810230	3810241	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_009565	TCCTCT	2	12	3893792	3893803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009565	TCGGAG	2	12	3918071	3918082	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_009565	CCGCTC	2	12	3922100	3922111	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_009565	CGTTGG	2	12	3934740	3934751	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_009565	CGGCCG	2	12	3938880	3938891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009565	GGCGAG	2	12	4123788	4123799	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_009565	GCGCCG	2	12	4164077	4164088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009565	TGGCGG	2	12	4212129	4212140	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_009565	GGGTTG	2	12	4336935	4336946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.