MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis F11 chromosome

Total Repeats: 3530

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009565	TCATC	2	10	1003	1012	20 %	40 %	0 %	40 %	148821192
2	NC_009565	CGTTT	2	10	2193	2202	0 %	60 %	20 %	20 %	148821193
3	NC_009565	CGGTT	2	10	3342	3351	0 %	40 %	40 %	20 %	148821193
4	NC_009565	GTCGG	2	10	4690	4699	0 %	20 %	60 %	20 %	148821195
5	NC_009565	GCAGC	2	10	7474	7483	20 %	0 %	40 %	40 %	148821197
6	NC_009565	CGGTG	2	10	9382	9391	0 %	20 %	60 %	20 %	148821197
7	NC_009565	CAGAC	2	10	9900	9909	40 %	0 %	20 %	40 %	148821197
8	NC_009565	CGCAA	2	10	10424	10433	40 %	0 %	20 %	40 %	148821198
9	NC_009565	CGGCG	2	10	10550	10559	0 %	0 %	60 %	40 %	148821198
10	NC_009565	ACCCG	2	10	11380	11389	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_009565	CGACC	2	10	13773	13782	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_009565	GGCGT	2	10	14255	14264	0 %	20 %	60 %	20 %	148821203
13	NC_009565	GGGCC	2	10	14538	14547	0 %	0 %	60 %	40 %	148821203
14	NC_009565	GCGTT	2	10	15283	15292	0 %	40 %	40 %	20 %	148821204
15	NC_009565	CCAGC	2	10	15823	15832	20 %	0 %	20 %	60 %	148821205
16	NC_009565	ACCGA	2	10	16586	16595	40 %	0 %	20 %	40 %	148821205
17	NC_009565	ATCGG	2	10	16978	16987	20 %	20 %	40 %	20 %	148821205
18	NC_009565	CGGCC	2	10	17987	17996	0 %	0 %	40 %	60 %	148821206
19	NC_009565	TTAGC	2	10	19138	19147	20 %	40 %	20 %	20 %	148821207
20	NC_009565	GGTCC	2	10	19210	19219	0 %	20 %	40 %	40 %	148821207
21	NC_009565	GTCGT	2	10	21729	21738	0 %	40 %	40 %	20 %	148821208
22	NC_009565	ATCAC	2	10	24002	24011	40 %	20 %	0 %	40 %	148821211
23	NC_009565	GCCGG	2	10	24689	24698	0 %	0 %	60 %	40 %	148821211
24	NC_009565	CGAGC	2	10	27069	27078	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_009565	GGCAA	2	10	29402	29411	40 %	0 %	40 %	20 %	148821216
26	NC_009565	CGATC	2	10	30228	30237	20 %	20 %	20 %	40 %	148821217
27	NC_009565	CGACG	2	10	32411	32420	20 %	0 %	40 %	40 %	148821220
28	NC_009565	GCGTC	2	10	32466	32475	0 %	20 %	40 %	40 %	148821220
29	NC_009565	GACAC	2	10	32563	32572	40 %	0 %	20 %	40 %	148821220
30	NC_009565	CCGCC	2	10	33909	33918	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
31	NC_009565	TCCTG	2	10	37568	37577	0 %	40 %	20 %	40 %	148821225
32	NC_009565	CTCGG	2	10	37661	37670	0 %	20 %	40 %	40 %	148821225
33	NC_009565	GGCGC	2	10	38204	38213	0 %	0 %	60 %	40 %	148821225
34	NC_009565	TGGCC	2	10	38352	38361	0 %	20 %	40 %	40 %	148821225
35	NC_009565	CGGCG	2	10	38884	38893	0 %	0 %	60 %	40 %	148821225
36	NC_009565	GTCCA	2	10	39496	39505	20 %	20 %	20 %	40 %	148821226
37	NC_009565	GCCAA	2	10	41630	41639	40 %	0 %	20 %	40 %	148821228
38	NC_009565	GCGTC	2	10	42045	42054	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_009565	GCACA	2	10	42429	42438	40 %	0 %	20 %	40 %	148821229
40	NC_009565	GGTAC	2	10	44963	44972	20 %	20 %	40 %	20 %	148821231
41	NC_009565	TCGAA	2	10	45195	45204	40 %	20 %	20 %	20 %	148821231
42	NC_009565	GCACC	2	10	46125	46134	20 %	0 %	20 %	60 %	148821231
43	NC_009565	CGGTG	2	10	47159	47168	0 %	20 %	60 %	20 %	148821232
44	NC_009565	TCATG	2	10	47305	47314	20 %	40 %	20 %	20 %	148821232
45	NC_009565	ATCGG	2	10	47452	47461	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_009565	GCAGC	2	10	48699	48708	20 %	0 %	40 %	40 %	148821234
47	NC_009565	CCCGA	2	10	48782	48791	20 %	0 %	20 %	60 %	148821234
48	NC_009565	CAGCG	2	10	49907	49916	20 %	0 %	40 %	40 %	148821235
49	NC_009565	CTCCC	2	10	56344	56353	0 %	20 %	0 %	80 %	148821241
50	NC_009565	CGGCG	2	10	56793	56802	0 %	0 %	60 %	40 %	148821241
51	NC_009565	CGACC	2	10	58325	58334	20 %	0 %	20 %	60 %	148821243
52	NC_009565	CTTCG	2	10	59012	59021	0 %	40 %	20 %	40 %	148821244
53	NC_009565	CGGTG	2	10	60068	60077	0 %	20 %	60 %	20 %	148821247
54	NC_009565	TCAGG	2	10	62554	62563	20 %	20 %	40 %	20 %	148821248
55	NC_009565	TGCCG	2	10	65585	65594	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_009565	GGCGA	2	10	66517	66526	20 %	0 %	60 %	20 %	148821252
57	NC_009565	GGTGT	2	10	69093	69102	0 %	40 %	60 %	0 %	148821254
58	NC_009565	ATCGG	2	10	69731	69740	20 %	20 %	40 %	20 %	148821254
59	NC_009565	CCGCG	2	10	70268	70277	0 %	0 %	40 %	60 %	148821255
60	NC_009565	GGCAA	2	10	70619	70628	40 %	0 %	40 %	20 %	148821255
61	NC_009565	CGACC	2	10	70908	70917	20 %	0 %	20 %	60 %	148821255
62	NC_009565	CGGGT	2	10	71362	71371	0 %	20 %	60 %	20 %	148821255
63	NC_009565	GGTCG	2	10	71422	71431	0 %	20 %	60 %	20 %	148821255
64	NC_009565	TGCCT	2	10	72163	72172	0 %	40 %	20 %	40 %	148821256
65	NC_009565	GTCCA	2	10	73034	73043	20 %	20 %	20 %	40 %	148821257
66	NC_009565	TGACC	2	10	75658	75667	20 %	20 %	20 %	40 %	148821259
67	NC_009565	GCCAA	2	10	75972	75981	40 %	0 %	20 %	40 %	148821259
68	NC_009565	GTCGC	2	10	76049	76058	0 %	20 %	40 %	40 %	148821259
69	NC_009565	GCGCG	2	10	77137	77146	0 %	0 %	60 %	40 %	148821260
70	NC_009565	CACGA	2	10	79985	79994	40 %	0 %	20 %	40 %	148821262
71	NC_009565	GCACC	2	10	80425	80434	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_009565	CCACC	2	10	80618	80627	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
73	NC_009565	GAGCA	2	10	82523	82532	40 %	0 %	40 %	20 %	148821264
74	NC_009565	GCCGG	2	10	82622	82631	0 %	0 %	60 %	40 %	148821264
75	NC_009565	GCGAC	2	10	82698	82707	20 %	0 %	40 %	40 %	148821264
76	NC_009565	ATCCG	2	10	83468	83477	20 %	20 %	20 %	40 %	148821265
77	NC_009565	CACCG	2	10	84248	84257	20 %	0 %	20 %	60 %	148821266
78	NC_009565	TGGTC	2	10	86383	86392	0 %	40 %	40 %	20 %	148821268
79	NC_009565	GCTGG	2	10	87020	87029	0 %	20 %	60 %	20 %	148821269
80	NC_009565	TGGGT	2	10	90058	90067	0 %	40 %	60 %	0 %	148821274
81	NC_009565	TCGCC	2	10	90265	90274	0 %	20 %	20 %	60 %	148821274
82	NC_009565	GGGCC	2	10	91238	91247	0 %	0 %	60 %	40 %	148821275
83	NC_009565	GGCCG	2	10	92557	92566	0 %	0 %	60 %	40 %	148821276
84	NC_009565	GCGCC	2	10	93209	93218	0 %	0 %	40 %	60 %	148821276
85	NC_009565	GCTTG	2	10	95241	95250	0 %	40 %	40 %	20 %	148821278
86	NC_009565	CGTGT	2	10	95673	95682	0 %	40 %	40 %	20 %	148821279
87	NC_009565	AGATC	2	10	95752	95761	40 %	20 %	20 %	20 %	148821279
88	NC_009565	CGGCG	2	10	99333	99342	0 %	0 %	60 %	40 %	148821282
89	NC_009565	CGGCG	2	10	99460	99469	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_009565	GCGGT	2	10	100409	100418	0 %	20 %	60 %	20 %	148821283
91	NC_009565	GGTGA	2	10	100627	100636	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009565	GCGCC	2	10	103241	103250	0 %	0 %	40 %	60 %	148821285
93	NC_009565	GGTGG	2	10	103929	103938	0 %	20 %	80 %	0 %	148821286
94	NC_009565	CTGGC	2	10	105665	105674	0 %	20 %	40 %	40 %	148821288
95	NC_009565	GCACA	2	10	106786	106795	40 %	0 %	20 %	40 %	148821288
96	NC_009565	CTGAA	2	10	109116	109125	40 %	20 %	20 %	20 %	148821291
97	NC_009565	ATCGC	2	10	109611	109620	20 %	20 %	20 %	40 %	148821291
98	NC_009565	TCTGA	2	10	110945	110954	20 %	40 %	20 %	20 %	148821293
99	NC_009565	CGGTC	2	10	111220	111229	0 %	20 %	40 %	40 %	148821293
100	NC_009565	GACCA	2	10	112358	112367	40 %	0 %	20 %	40 %	148821293
101	NC_009565	GGCTG	2	10	114922	114931	0 %	20 %	60 %	20 %	148821293
102	NC_009565	CCGCG	2	10	118842	118851	0 %	0 %	40 %	60 %	148821294
103	NC_009565	TCGTG	2	10	122795	122804	0 %	40 %	40 %	20 %	148821296
104	NC_009565	GCACG	2	10	124450	124459	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_009565	CCGGA	2	10	124576	124585	20 %	0 %	40 %	40 %	148821298
106	NC_009565	TGCGC	2	10	127049	127058	0 %	20 %	40 %	40 %	148821299
107	NC_009565	GCGAG	2	10	127560	127569	20 %	0 %	60 %	20 %	148821299
108	NC_009565	GGGGT	2	10	128569	128578	0 %	20 %	80 %	0 %	148821299
109	NC_009565	CCCAC	2	10	129131	129140	20 %	0 %	0 %	80 %	148821299
110	NC_009565	CCGGC	2	10	129641	129650	0 %	0 %	40 %	60 %	148821299
111	NC_009565	TGCGG	2	10	130051	130060	0 %	20 %	60 %	20 %	148821299
112	NC_009565	ATCAC	2	10	131530	131539	40 %	20 %	0 %	40 %	148821301
113	NC_009565	ATCGG	2	10	131578	131587	20 %	20 %	40 %	20 %	148821301
114	NC_009565	CGGGC	2	10	132669	132678	0 %	0 %	60 %	40 %	148821301
115	NC_009565	GCGAT	2	10	134474	134483	20 %	20 %	40 %	20 %	148821303
116	NC_009565	GTTCG	2	10	134695	134704	0 %	40 %	40 %	20 %	148821303
117	NC_009565	CCTGG	2	10	135087	135096	0 %	20 %	40 %	40 %	148821303
118	NC_009565	GGCCC	2	10	135193	135202	0 %	0 %	40 %	60 %	148821303
119	NC_009565	CGTTG	2	10	135705	135714	0 %	40 %	40 %	20 %	148821303
120	NC_009565	CGACC	2	10	135777	135786	20 %	0 %	20 %	60 %	148821303
121	NC_009565	GAGAT	2	10	138797	138806	40 %	20 %	40 %	0 %	148821307
122	NC_009565	CGGCG	2	10	140951	140960	0 %	0 %	60 %	40 %	148821308
123	NC_009565	TGCGG	2	10	141584	141593	0 %	20 %	60 %	20 %	148821309
124	NC_009565	CGCTG	2	10	142291	142300	0 %	20 %	40 %	40 %	148821310
125	NC_009565	GTTGC	2	10	142837	142846	0 %	40 %	40 %	20 %	148821310
126	NC_009565	CCGAT	2	10	143585	143594	20 %	20 %	20 %	40 %	148821310
127	NC_009565	ATCGC	2	10	144276	144285	20 %	20 %	20 %	40 %	148821311
128	NC_009565	AACCG	2	10	145015	145024	40 %	0 %	20 %	40 %	148821311
129	NC_009565	CCGCC	2	10	145602	145611	0 %	0 %	20 %	80 %	148821311
130	NC_009565	CCGCC	2	10	146245	146254	0 %	0 %	20 %	80 %	148821312
131	NC_009565	GGGTC	2	10	147999	148008	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_009565	ATCGG	2	10	149729	149738	20 %	20 %	40 %	20 %	148821316
133	NC_009565	ATTGG	2	10	152564	152573	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009565	AGCGA	2	10	154467	154476	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_009565	AGCGA	2	10	154520	154529	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_009565	TCGTC	2	10	154867	154876	0 %	40 %	20 %	40 %	148821319
137	NC_009565	CACGC	2	10	155331	155340	20 %	0 %	20 %	60 %	148821319
138	NC_009565	ATTCT	2	10	156175	156184	20 %	60 %	0 %	20 %	148821320
139	NC_009565	AGGCG	2	10	156703	156712	20 %	0 %	60 %	20 %	148821320
140	NC_009565	TGACC	2	10	159707	159716	20 %	20 %	20 %	40 %	148821323
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142	NC_009565	GCACC	2	10	160123	160132	20 %	0 %	20 %	60 %	148821324
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144	NC_009565	CGCGG	2	10	161380	161389	0 %	0 %	60 %	40 %	148821325
145	NC_009565	CGGTT	2	10	161707	161716	0 %	40 %	40 %	20 %	148821325
146	NC_009565	GTCGC	2	10	161869	161878	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
147	NC_009565	GCCGG	2	10	162168	162177	0 %	0 %	60 %	40 %	148821326
148	NC_009565	GCGCG	2	10	162290	162299	0 %	0 %	60 %	40 %	148821326
149	NC_009565	CTGGG	2	10	164504	164513	0 %	20 %	60 %	20 %	148821328
150	NC_009565	GCCGG	2	10	165097	165106	0 %	0 %	60 %	40 %	148821329
151	NC_009565	GTTGG	2	10	167066	167075	0 %	40 %	60 %	0 %	148821331
152	NC_009565	GCGTG	2	10	168232	168241	0 %	20 %	60 %	20 %	148821334
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154	NC_009565	CCGCC	2	10	170156	170165	0 %	0 %	20 %	80 %	148821335
155	NC_009565	GCATG	2	10	171519	171528	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
156	NC_009565	CTACC	2	10	172122	172131	20 %	20 %	0 %	60 %	148821337
157	NC_009565	GCGCC	2	10	174281	174290	0 %	0 %	40 %	60 %	148821339
158	NC_009565	ACCAA	2	10	174988	174997	60 %	0 %	0 %	40 %	148821339
159	NC_009565	CCCGA	2	10	174998	175007	20 %	0 %	20 %	60 %	148821339
160	NC_009565	TGGTC	2	10	175655	175664	0 %	40 %	40 %	20 %	148821340
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162	NC_009565	GGGCT	2	10	176594	176603	0 %	20 %	60 %	20 %	148821341
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164	NC_009565	GGACA	2	10	178618	178627	40 %	0 %	40 %	20 %	148821343
165	NC_009565	GCCGA	2	10	179441	179450	20 %	0 %	40 %	40 %	148821343
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170	NC_009565	CGGCT	2	10	191048	191057	0 %	20 %	40 %	40 %	148821353
171	NC_009565	GGCTG	2	10	191279	191288	0 %	20 %	60 %	20 %	148821353
172	NC_009565	ACGGT	2	10	191425	191434	20 %	20 %	40 %	20 %	148821353
173	NC_009565	CACCC	2	10	191547	191556	20 %	0 %	0 %	80 %	148821353
174	NC_009565	GGAAG	2	10	195289	195298	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
175	NC_009565	GGCCG	2	10	196695	196704	0 %	0 %	60 %	40 %	148821358
176	NC_009565	CGGCG	2	10	197449	197458	0 %	0 %	60 %	40 %	148821359
177	NC_009565	GCCGC	2	10	204750	204759	0 %	0 %	40 %	60 %	148821365
178	NC_009565	GACCT	2	10	205368	205377	20 %	20 %	20 %	40 %	148821365
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180	NC_009565	TTGCG	2	10	207429	207438	0 %	40 %	40 %	20 %	148821367
181	NC_009565	CCACG	2	10	209014	209023	20 %	0 %	20 %	60 %	148821369
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183	NC_009565	ACCGC	2	10	212688	212697	20 %	0 %	20 %	60 %	148821373
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185	NC_009565	GCCGA	2	10	215244	215253	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
186	NC_009565	CCTCG	2	10	215680	215689	0 %	20 %	20 %	60 %	148821376
187	NC_009565	TCGGT	3	15	216180	216194	0 %	40 %	40 %	20 %	148821377
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191	NC_009565	CAGCG	2	10	220732	220741	20 %	0 %	40 %	40 %	148821381
192	NC_009565	GAATC	2	10	220784	220793	40 %	20 %	20 %	20 %	148821381
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194	NC_009565	GCGTC	2	10	222240	222249	0 %	20 %	40 %	40 %	148821382
195	NC_009565	CCGTG	2	10	222393	222402	0 %	20 %	40 %	40 %	148821382
196	NC_009565	GGTGC	2	10	222517	222526	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
197	NC_009565	GCCGC	2	10	222853	222862	0 %	0 %	40 %	60 %	148821383
198	NC_009565	CGGCG	2	10	223150	223159	0 %	0 %	60 %	40 %	148821383
199	NC_009565	CTGGC	2	10	223373	223382	0 %	20 %	40 %	40 %	148821383
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201	NC_009565	CGCAG	2	10	225195	225204	20 %	0 %	40 %	40 %	148821386
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204	NC_009565	GGCCG	2	10	231878	231887	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
205	NC_009565	CTGCG	2	10	234853	234862	0 %	20 %	40 %	40 %	148821391
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237	NC_009565	GCAGT	2	10	276321	276330	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
238	NC_009565	GATCC	2	10	278763	278772	20 %	20 %	20 %	40 %	148821425
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243	NC_009565	GCCGA	2	10	284291	284300	20 %	0 %	40 %	40 %	148821429
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246	NC_009565	GCGGT	2	10	292679	292688	0 %	20 %	60 %	20 %	148821437
247	NC_009565	ACGCC	2	10	294543	294552	20 %	0 %	20 %	60 %	148821438
248	NC_009565	CGGCC	2	10	302460	302469	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
249	NC_009565	TGCGC	2	10	302507	302516	0 %	20 %	40 %	40 %	148821445
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251	NC_009565	TCGAC	2	10	305665	305674	20 %	20 %	20 %	40 %	148821446
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253	NC_009565	TGCGG	2	10	309356	309365	0 %	20 %	60 %	20 %	148821450
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259	NC_009565	AGCGG	2	10	314615	314624	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
260	NC_009565	CGCAG	2	10	314937	314946	20 %	0 %	40 %	40 %	148821457
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263	NC_009565	TCGGC	2	10	316778	316787	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
264	NC_009565	CCTGG	2	10	317326	317335	0 %	20 %	40 %	40 %	148821460
265	NC_009565	GGCCG	2	10	320431	320440	0 %	0 %	60 %	40 %	148821461
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267	NC_009565	GTTGG	2	10	322526	322535	0 %	40 %	60 %	0 %	148821462
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302	NC_009565	TCGCA	2	10	389140	389149	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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380	NC_009565	CCCGG	2	10	482937	482946	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
381	NC_009565	GCACC	2	10	483307	483316	20 %	0 %	20 %	60 %	148821597
382	NC_009565	CAGTG	2	10	483940	483949	20 %	20 %	40 %	20 %	148821598
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385	NC_009565	GGACT	2	10	487454	487463	20 %	20 %	40 %	20 %	148821600
386	NC_009565	TGATT	2	10	489119	489128	20 %	60 %	20 %	0 %	148821601
387	NC_009565	CACCC	2	10	492132	492141	20 %	0 %	0 %	80 %	148821601
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392	NC_009565	TGCGC	2	10	495618	495627	0 %	20 %	40 %	40 %	148821604
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394	NC_009565	CGCAA	2	10	495941	495950	40 %	0 %	20 %	40 %	148821604
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