MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis F11 chromosome

Total Repeats: 1040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009565	CCGA	2	8	1826	1833	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009565	GCAC	2	8	11709	11716	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009565	GCCC	2	8	12554	12561	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_009565	ATTC	2	8	13792	13799	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009565	TCAA	2	8	25615	25622	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009565	GAGC	2	8	25643	25650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009565	GGCC	2	8	25657	25664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009565	ACCA	2	8	31225	31232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009565	GCTA	2	8	33956	33963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009565	CTAC	2	8	47320	47327	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009565	CTGG	2	8	52817	52824	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009565	CGGT	2	8	79312	79319	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009565	CGGT	2	8	79497	79504	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009565	CTGG	2	8	87333	87340	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009565	CGCA	2	8	89634	89641	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009565	CGCT	2	8	97764	97771	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009565	CCTG	2	8	97811	97818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009565	GCGA	2	8	97855	97862	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009565	ACCG	2	8	99578	99585	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009565	ATCC	2	8	125714	125721	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009565	GCGA	2	8	130802	130809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009565	CGGG	2	8	130845	130852	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009565	GCTC	2	8	131357	131364	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009565	CGGG	2	8	134069	134076	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009565	TTCT	2	8	139985	139992	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009565	ACGC	2	8	140057	140064	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009565	GGGC	2	8	140149	140156	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009565	AGCA	2	8	141229	141236	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009565	GCCG	2	8	144035	144042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009565	GCGT	2	8	148579	148586	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009565	GCCG	2	8	152552	152559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009565	CCGG	2	8	155918	155925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009565	GCGT	3	12	155946	155957	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009565	GGCT	2	8	158092	158099	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009565	CGCA	2	8	158118	158125	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009565	TCGT	2	8	161809	161816	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009565	CCGG	2	8	161817	161824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009565	CCCG	2	8	162029	162036	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_009565	ACTT	2	8	171506	171513	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009565	TTGA	2	8	187038	187045	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009565	CTGG	2	8	197023	197030	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009565	CTGT	2	8	212575	212582	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009565	GGCC	2	8	218663	218670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009565	CGGT	2	8	218999	219006	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009565	GATG	2	8	219746	219753	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009565	AACT	2	8	230941	230948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009565	GGAA	2	8	231116	231123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009565	ACGT	2	8	231868	231875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009565	ACAT	2	8	231935	231942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009565	GTGC	2	8	241648	241655	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009565	GAAC	2	8	249334	249341	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009565	CGCA	2	8	253943	253950	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009565	GACG	2	8	256352	256359	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009565	GCGG	2	8	273233	273240	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009565	CGGC	2	8	274599	274606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009565	TAGA	2	8	288708	288715	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009565	ACTT	2	8	292413	292420	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009565	TCGT	2	8	294039	294046	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009565	AACT	2	8	296089	296096	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009565	AACC	2	8	296097	296104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009565	ATGC	2	8	297087	297094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009565	GACG	2	8	302405	302412	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009565	GGTA	2	8	336615	336622	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009565	GCCG	2	8	336702	336709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009565	TGGC	2	8	336714	336721	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009565	GCCG	2	8	339652	339659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009565	TGGC	2	8	339664	339671	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009565	CTGT	2	8	367658	367665	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009565	AATC	2	8	378838	378845	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009565	GGCC	2	8	389198	389205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009565	AAGG	2	8	390214	390221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009565	TGAC	2	8	399183	399190	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009565	GTCA	2	8	399194	399201	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009565	ATCG	2	8	420164	420171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009565	GCCA	2	8	420255	420262	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009565	GTCC	2	8	420281	420288	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009565	ACGG	2	8	420367	420374	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009565	GAGC	2	8	427149	427156	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009565	GAGC	2	8	427200	427207	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009565	GAGC	2	8	427251	427258	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009565	GAGC	2	8	427302	427309	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009565	CACG	2	8	457558	457565	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009565	TGCG	2	8	458670	458677	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009565	GCTC	2	8	459050	459057	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009565	GGAT	2	8	471343	471350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009565	CGAG	2	8	471486	471493	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009565	CAAC	2	8	483435	483442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009565	AGAA	2	8	493942	493949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009565	GCGG	2	8	506318	506325	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009565	ACCG	2	8	508198	508205	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009565	CGGG	2	8	508235	508242	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009565	GAGG	2	8	510191	510198	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009565	GCGT	2	8	510277	510284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009565	ACGG	2	8	513527	513534	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009565	GATG	2	8	518501	518508	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009565	CTGA	2	8	519125	519132	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009565	GCAA	2	8	521761	521768	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009565	GCTG	2	8	524634	524641	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009565	CCGT	2	8	531679	531686	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009565	CGGC	2	8	536990	536997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009565	CGGC	2	8	541733	541740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009565	GACG	2	8	541743	541750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_009565	AATC	2	8	548426	548433	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009565	GTCT	2	8	549048	549055	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009565	CCGG	2	8	563984	563991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009565	AGCA	2	8	568128	568135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009565	CGAC	2	8	568798	568805	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009565	CGCC	2	8	580688	580695	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_009565	GCAT	2	8	580771	580778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009565	GTTT	2	8	589481	589488	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009565	GCCG	2	8	594495	594502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009565	GCTA	2	8	599797	599804	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009565	GCGT	2	8	607683	607690	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009565	CCGA	2	8	607708	607715	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009565	CCGA	2	8	611710	611717	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009565	GTCC	2	8	614265	614272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009565	GCCC	2	8	628765	628772	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
118	NC_009565	AGCC	2	8	633246	633253	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009565	CCGG	2	8	638770	638777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009565	TGCC	2	8	643207	643214	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009565	ATCG	2	8	643893	643900	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009565	CGCC	2	8	644152	644159	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
123	NC_009565	GCCG	2	8	654749	654756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_009565	TGGC	2	8	658039	658046	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009565	CCAG	2	8	660749	660756	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009565	CGGT	2	8	661493	661500	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009565	GTGC	2	8	664193	664200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009565	AAGG	2	8	664216	664223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009565	CGGC	2	8	666700	666707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009565	TTGC	2	8	668794	668801	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009565	GTCG	2	8	668865	668872	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009565	CGGC	2	8	671694	671701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009565	GTGG	2	8	671711	671718	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009565	GCCG	2	8	675200	675207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009565	CGGC	2	8	680328	680335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009565	CCGG	2	8	682334	682341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009565	TTCA	2	8	687620	687627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009565	CGGA	2	8	698850	698857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009565	TCCG	2	8	700222	700229	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009565	CGGG	2	8	700314	700321	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_009565	CCCA	2	8	707449	707456	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
142	NC_009565	ACCG	2	8	707546	707553	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_009565	CCGC	2	8	710161	710168	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_009565	GGTC	2	8	717198	717205	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009565	CGGC	2	8	731555	731562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009565	CATG	2	8	731569	731576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009565	CACC	2	8	731801	731808	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
148	NC_009565	GCTG	2	8	733466	733473	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009565	GACT	2	8	735133	735140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_009565	AGGT	2	8	735141	735148	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_009565	CGGC	2	8	758226	758233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
156	NC_009565	TCGA	2	8	758274	758281	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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159	NC_009565	GCCG	2	8	763469	763476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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168	NC_009565	GGCG	2	8	798393	798400	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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191	NC_009565	CCGG	2	8	892796	892803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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497	NC_009565	CGGC	2	8	2211908	2211915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
498	NC_009565	GGCC	2	8	2213073	2213080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
499	NC_009565	GGAG	2	8	2224832	2224839	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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