MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis F11 chromosome

Total Repeats: 78035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009565	CGT	2	6	97	102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821192
2	NC_009565	CAC	2	6	128	133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821192
3	NC_009565	GTC	2	6	147	152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821192
4	NC_009565	GAC	2	6	180	185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821192
5	NC_009565	CAG	2	6	191	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821192
6	NC_009565	TCG	2	6	268	273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821192
7	NC_009565	AGC	2	6	300	305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821192
8	NC_009565	GCC	2	6	361	366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821192
9	NC_009565	CCG	2	6	405	410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821192
10	NC_009565	CGA	2	6	425	430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821192
11	NC_009565	GCC	2	6	440	445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821192
12	NC_009565	ACG	2	6	490	495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821192
13	NC_009565	TGA	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148821192
14	NC_009565	CGC	3	9	662	670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821192
15	NC_009565	GTT	2	6	782	787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821192
16	NC_009565	CGA	2	6	911	916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821192
17	NC_009565	TTC	2	6	957	962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148821192
18	NC_009565	CAA	2	6	989	994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148821192
19	NC_009565	AGC	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821192
20	NC_009565	ACC	2	6	1094	1099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821192
21	NC_009565	CGA	2	6	1163	1168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821192
22	NC_009565	CAG	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821192
23	NC_009565	GCG	2	6	1338	1343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821192
24	NC_009565	CCG	2	6	1360	1365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821192
25	NC_009565	CAC	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821192
26	NC_009565	GTT	2	6	2287	2292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821193
27	NC_009565	CCG	2	6	2343	2348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821193
28	NC_009565	TTG	2	6	2405	2410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821193
29	NC_009565	CGA	2	6	2508	2513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821193
30	NC_009565	TTG	2	6	2564	2569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821193
31	NC_009565	ATT	2	6	2578	2583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148821193
32	NC_009565	CGC	2	6	2611	2616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821193
33	NC_009565	GAC	2	6	2624	2629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821193
34	NC_009565	GGT	2	6	2677	2682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821193
35	NC_009565	CGT	2	6	2736	2741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821193
36	NC_009565	GCC	2	6	2792	2797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821193
37	NC_009565	CGG	2	6	2809	2814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821193
38	NC_009565	GCA	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821193
39	NC_009565	CTT	2	6	2909	2914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148821193
40	NC_009565	CCA	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821193
41	NC_009565	GAT	2	6	3089	3094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148821193
42	NC_009565	TTG	3	9	3117	3125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821193
43	NC_009565	CGG	2	6	3306	3311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821193
44	NC_009565	TTG	2	6	3463	3468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821194
45	NC_009565	CGA	2	6	3517	3522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821194
46	NC_009565	GTG	2	6	3600	3605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821194
47	NC_009565	ACG	2	6	3607	3612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821194
48	NC_009565	CAA	2	6	3656	3661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148821194
49	NC_009565	ATC	2	6	3677	3682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821194
50	NC_009565	TGT	2	6	3724	3729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821194
51	NC_009565	CGG	2	6	3774	3779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821194
52	NC_009565	GAT	2	6	3789	3794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148821194
53	NC_009565	TGG	2	6	3970	3975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821194
54	NC_009565	GAA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148821194
55	NC_009565	AGC	2	6	4130	4135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821194
56	NC_009565	GGC	2	6	4145	4150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821194
57	NC_009565	GGC	2	6	4154	4159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821194
58	NC_009565	GAC	2	6	4212	4217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821194
59	NC_009565	GGC	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821194
60	NC_009565	TGG	2	6	4328	4333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821194
61	NC_009565	GTT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821194
62	NC_009565	CGA	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821194
63	NC_009565	CGG	2	6	4402	4407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821194
64	NC_009565	CCG	2	6	4414	4419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821194
65	NC_009565	CCG	2	6	4459	4464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821194
66	NC_009565	GGT	2	6	4523	4528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821194
67	NC_009565	TGC	3	9	4633	4641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821195
68	NC_009565	CGA	2	6	4712	4717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821195
69	NC_009565	GGT	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821195
70	NC_009565	CCA	2	6	4855	4860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821195
71	NC_009565	ACG	2	6	4893	4898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821195
72	NC_009565	CGC	2	6	4978	4983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821195
73	NC_009565	CGG	2	6	5028	5033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821195
74	NC_009565	AGA	2	6	5242	5247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148821196
75	NC_009565	GTG	2	6	5275	5280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821196
76	NC_009565	GCG	2	6	5292	5297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821196
77	NC_009565	GAG	2	6	5323	5328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148821196
78	NC_009565	AAG	2	6	5356	5361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148821196
79	NC_009565	GGT	2	6	5484	5489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821196
80	NC_009565	CGA	2	6	5502	5507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821196
81	NC_009565	TGC	2	6	5543	5548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821196
82	NC_009565	CGA	2	6	5574	5579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821196
83	NC_009565	GTG	2	6	5632	5637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821196
84	NC_009565	CGG	2	6	5655	5660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821196
85	NC_009565	TGG	2	6	5691	5696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821196
86	NC_009565	GGT	2	6	5718	5723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821196
87	NC_009565	AAG	2	6	5833	5838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148821196
88	NC_009565	CAA	2	6	5940	5945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148821196
89	NC_009565	CGA	2	6	5967	5972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821196
90	NC_009565	GTC	2	6	5992	5997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821196
91	NC_009565	TGG	2	6	6110	6115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821196
92	NC_009565	AGC	2	6	6157	6162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821196
93	NC_009565	GGC	2	6	6277	6282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821196
94	NC_009565	GGT	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821196
95	NC_009565	GCG	2	6	6621	6626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821196
96	NC_009565	ATC	2	6	6793	6798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821196
97	NC_009565	ATC	2	6	6853	6858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821196
98	NC_009565	ACG	2	6	6881	6886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821196
99	NC_009565	TGT	2	6	6968	6973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821196
100	NC_009565	GTT	3	9	6978	6986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821196
101	NC_009565	CCG	2	6	7036	7041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821196
102	NC_009565	CTG	2	6	7108	7113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821196
103	NC_009565	GAA	2	6	7134	7139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148821196
104	NC_009565	CAA	2	6	7143	7148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148821196
105	NC_009565	ACC	2	6	7210	7215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821196
106	NC_009565	GAC	2	6	7255	7260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821196
107	NC_009565	GCC	4	12	7261	7272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821196
108	NC_009565	GTT	2	6	7278	7283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821196
109	NC_009565	GCC	2	6	7420	7425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821197
110	NC_009565	GAC	2	6	7427	7432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821197
111	NC_009565	CAG	2	6	7463	7468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821197
112	NC_009565	TCG	2	6	7509	7514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821197
113	NC_009565	ACC	2	6	7653	7658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821197
114	NC_009565	TGG	2	6	7728	7733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821197
115	NC_009565	CGG	2	6	7773	7778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821197
116	NC_009565	CGA	2	6	7837	7842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821197
117	NC_009565	ACG	2	6	7869	7874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821197
118	NC_009565	CTG	2	6	7919	7924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821197
119	NC_009565	GGC	2	6	7937	7942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821197
120	NC_009565	CGC	2	6	7971	7976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821197
121	NC_009565	ACG	2	6	8025	8030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821197
122	NC_009565	CGA	2	6	8032	8037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821197
123	NC_009565	CCG	2	6	8091	8096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821197
124	NC_009565	TCG	2	6	8103	8108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821197
125	NC_009565	GTT	2	6	8168	8173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821197
126	NC_009565	AGA	2	6	8179	8184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148821197
127	NC_009565	TCA	2	6	8250	8255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821197
128	NC_009565	GGT	2	6	8377	8382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821197
129	NC_009565	TCG	2	6	8445	8450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821197
130	NC_009565	ACC	2	6	8502	8507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821197
131	NC_009565	GCG	2	6	8524	8529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821197
132	NC_009565	CAC	2	6	8530	8535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821197
133	NC_009565	GCT	2	6	8671	8676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821197
134	NC_009565	CGA	2	6	8683	8688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821197
135	NC_009565	GCG	2	6	8722	8727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821197
136	NC_009565	CAT	2	6	8752	8757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821197
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138	NC_009565	CGA	2	6	8842	8847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821197
139	NC_009565	CGA	2	6	8875	8880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821197
140	NC_009565	ATC	2	6	8894	8899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821197
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152	NC_009565	CTG	3	9	9413	9421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821197
153	NC_009565	CGA	2	6	9523	9528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821197
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163	NC_009565	CGA	2	6	9871	9876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821197
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249	NC_009565	CCG	2	6	16770	16775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821205
250	NC_009565	ACG	2	6	16820	16825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821205
251	NC_009565	CGG	2	6	16836	16841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821205
252	NC_009565	CTG	2	6	17046	17051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821205
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