MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 10334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009525	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	148659758
2	NC_009525	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	148659758
3	NC_009525	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	148659758
4	NC_009525	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	148659758
5	NC_009525	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	148659758
6	NC_009525	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	148659759
7	NC_009525	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	148659759
8	NC_009525	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	148659759
9	NC_009525	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	148659759
10	NC_009525	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	148659759
11	NC_009525	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	148659759
12	NC_009525	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	148659760
13	NC_009525	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	148659760
14	NC_009525	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	148659760
15	NC_009525	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	148659760
16	NC_009525	ATCG	2	8	4012	4019	25 %	25 %	25 %	25 %	148659760
17	NC_009525	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	148659762
18	NC_009525	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	148659762
19	NC_009525	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	148659762
20	NC_009525	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	148659762
21	NC_009525	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	148659762
22	NC_009525	GACA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	25 %	25 %	148659763
23	NC_009525	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	148659763
24	NC_009525	CGAG	2	8	8456	8463	25 %	0 %	50 %	25 %	148659763
25	NC_009525	CCAC	2	8	8986	8993	25 %	0 %	0 %	75 %	148659763
26	NC_009525	CGGC	2	8	9298	9305	0 %	0 %	50 %	50 %	148659763
27	NC_009525	CGAC	2	8	9355	9362	25 %	0 %	25 %	50 %	148659763
28	NC_009525	GGTT	2	8	9583	9590	0 %	50 %	50 %	0 %	148659763
29	NC_009525	CCCG	2	8	10132	10139	0 %	0 %	25 %	75 %	148659764
30	NC_009525	GAGC	2	8	12092	12099	25 %	0 %	50 %	25 %	148659765
31	NC_009525	CTCA	2	8	12303	12310	25 %	25 %	0 %	50 %	148659765
32	NC_009525	AACC	2	8	13338	13345	50 %	0 %	0 %	50 %	148659767
33	NC_009525	CCCG	2	8	13447	13454	0 %	0 %	25 %	75 %	148659767
34	NC_009525	CCGA	2	8	13900	13907	25 %	0 %	25 %	50 %	148659768
35	NC_009525	TGCC	2	8	13916	13923	0 %	25 %	25 %	50 %	148659768
36	NC_009525	CGCT	2	8	13933	13940	0 %	25 %	25 %	50 %	148659768
37	NC_009525	CCGC	2	8	14875	14882	0 %	0 %	25 %	75 %	148659769
38	NC_009525	ACCC	2	8	15456	15463	25 %	0 %	0 %	75 %	148659771
39	NC_009525	TGAT	2	8	15493	15500	25 %	50 %	25 %	0 %	148659771
40	NC_009525	TGCT	2	8	15540	15547	0 %	50 %	25 %	25 %	148659771
41	NC_009525	GCCC	2	8	16027	16034	0 %	0 %	25 %	75 %	148659771
42	NC_009525	GGGC	2	8	16808	16815	0 %	0 %	75 %	25 %	148659772
43	NC_009525	CTGA	2	8	17263	17270	25 %	25 %	25 %	25 %	148659773
44	NC_009525	TGGC	2	8	17406	17413	0 %	25 %	50 %	25 %	148659773
45	NC_009525	GCTT	2	8	17465	17472	0 %	50 %	25 %	25 %	148659773
46	NC_009525	CAGT	2	8	17493	17500	25 %	25 %	25 %	25 %	148659773
47	NC_009525	CGGT	2	8	17864	17871	0 %	25 %	50 %	25 %	148659773
48	NC_009525	GCCG	2	8	17923	17930	0 %	0 %	50 %	50 %	148659773
49	NC_009525	CGGG	2	8	19158	19165	0 %	0 %	75 %	25 %	148659774
50	NC_009525	CTGG	2	8	19266	19273	0 %	25 %	50 %	25 %	148659774
51	NC_009525	GTGC	2	8	19766	19773	0 %	25 %	50 %	25 %	148659774
52	NC_009525	GCCG	2	8	19784	19791	0 %	0 %	50 %	50 %	148659774
53	NC_009525	CCGC	2	8	20149	20156	0 %	0 %	25 %	75 %	148659775
54	NC_009525	GCCG	2	8	21613	21620	0 %	0 %	50 %	50 %	148659776
55	NC_009525	CCAG	2	8	22101	22108	25 %	0 %	25 %	50 %	148659776
56	NC_009525	CACC	2	8	22284	22291	25 %	0 %	0 %	75 %	148659776
57	NC_009525	CGGG	2	8	23240	23247	0 %	0 %	75 %	25 %	148659777
58	NC_009525	GCCG	2	8	23331	23338	0 %	0 %	50 %	50 %	148659777
59	NC_009525	GCTG	2	8	23711	23718	0 %	25 %	50 %	25 %	148659777
60	NC_009525	CGGC	2	8	23731	23738	0 %	0 %	50 %	50 %	148659777
61	NC_009525	GCCG	2	8	24402	24409	0 %	0 %	50 %	50 %	148659777
62	NC_009525	CCCA	2	8	24414	24421	25 %	0 %	0 %	75 %	148659777
63	NC_009525	GCTG	2	8	25553	25560	0 %	25 %	50 %	25 %	148659779
64	NC_009525	CGGC	2	8	25601	25608	0 %	0 %	50 %	50 %	148659779
65	NC_009525	GCCG	2	8	25701	25708	0 %	0 %	50 %	50 %	148659779
66	NC_009525	CGGG	2	8	25776	25783	0 %	0 %	75 %	25 %	148659779
67	NC_009525	GCTC	2	8	27863	27870	0 %	25 %	25 %	50 %	148659780
68	NC_009525	CCAA	2	8	28080	28087	50 %	0 %	0 %	50 %	148659780
69	NC_009525	CAGC	2	8	28146	28153	25 %	0 %	25 %	50 %	148659780
70	NC_009525	CGGC	2	8	28966	28973	0 %	0 %	50 %	50 %	148659783
71	NC_009525	CCGG	2	8	29452	29459	0 %	0 %	50 %	50 %	148659783
72	NC_009525	GCTC	2	8	30008	30015	0 %	25 %	25 %	50 %	148659784
73	NC_009525	TGCG	2	8	30147	30154	0 %	25 %	50 %	25 %	148659784
74	NC_009525	CCGG	2	8	30412	30419	0 %	0 %	50 %	50 %	148659784
75	NC_009525	CGTC	2	8	30743	30750	0 %	25 %	25 %	50 %	148659785
76	NC_009525	CACG	2	8	31103	31110	25 %	0 %	25 %	50 %	148659786
77	NC_009525	ACCG	2	8	31184	31191	25 %	0 %	25 %	50 %	148659786
78	NC_009525	CCGG	2	8	31503	31510	0 %	0 %	50 %	50 %	148659786
79	NC_009525	GTCG	2	8	31679	31686	0 %	25 %	50 %	25 %	148659786
80	NC_009525	CCCG	2	8	32301	32308	0 %	0 %	25 %	75 %	148659786
81	NC_009525	CGAG	2	8	32813	32820	25 %	0 %	50 %	25 %	148659787
82	NC_009525	CGAC	2	8	33110	33117	25 %	0 %	25 %	50 %	148659788
83	NC_009525	GCCG	2	8	33837	33844	0 %	0 %	50 %	50 %	148659789
84	NC_009525	CCGA	2	8	34826	34833	25 %	0 %	25 %	50 %	148659790
85	NC_009525	GGCC	2	8	35961	35968	0 %	0 %	50 %	50 %	148659792
86	NC_009525	ATCG	2	8	36454	36461	25 %	25 %	25 %	25 %	148659792
87	NC_009525	GATC	2	8	36792	36799	25 %	25 %	25 %	25 %	148659792
88	NC_009525	CCAC	2	8	37613	37620	25 %	0 %	0 %	75 %	148659792
89	NC_009525	ACCG	2	8	38007	38014	25 %	0 %	25 %	50 %	148659793
90	NC_009525	CTGG	2	8	38351	38358	0 %	25 %	50 %	25 %	148659794
91	NC_009525	TGCC	2	8	38386	38393	0 %	25 %	25 %	50 %	148659794
92	NC_009525	GCAT	2	8	38746	38753	25 %	25 %	25 %	25 %	148659795
93	NC_009525	GCTG	2	8	39260	39267	0 %	25 %	50 %	25 %	148659795
94	NC_009525	AACG	2	8	40015	40022	50 %	0 %	25 %	25 %	148659795
95	NC_009525	CCGA	2	8	40076	40083	25 %	0 %	25 %	50 %	148659795
96	NC_009525	CCAC	2	8	40232	40239	25 %	0 %	0 %	75 %	148659795
97	NC_009525	CAGC	2	8	40459	40466	25 %	0 %	25 %	50 %	148659796
98	NC_009525	CCGG	2	8	40955	40962	0 %	0 %	50 %	50 %	148659796
99	NC_009525	GGCC	2	8	41486	41493	0 %	0 %	50 %	50 %	148659797
100	NC_009525	CGAT	2	8	41936	41943	25 %	25 %	25 %	25 %	148659797
101	NC_009525	GCCG	2	8	42236	42243	0 %	0 %	50 %	50 %	148659797
102	NC_009525	CACC	2	8	42261	42268	25 %	0 %	0 %	75 %	148659797
103	NC_009525	ACCG	2	8	42484	42491	25 %	0 %	25 %	50 %	148659797
104	NC_009525	GCGT	2	8	42510	42517	0 %	25 %	50 %	25 %	148659797
105	NC_009525	CCAC	2	8	43239	43246	25 %	0 %	0 %	75 %	148659798
106	NC_009525	CGAT	2	8	43248	43255	25 %	25 %	25 %	25 %	148659798
107	NC_009525	GGCC	2	8	43944	43951	0 %	0 %	50 %	50 %	148659800
108	NC_009525	CCCG	2	8	44535	44542	0 %	0 %	25 %	75 %	148659800
109	NC_009525	CGGG	2	8	44564	44571	0 %	0 %	75 %	25 %	148659800
110	NC_009525	CGAC	2	8	45203	45210	25 %	0 %	25 %	50 %	148659801
111	NC_009525	GAGC	2	8	45583	45590	25 %	0 %	50 %	25 %	148659801
112	NC_009525	GGGC	2	8	46742	46749	0 %	0 %	75 %	25 %	148659801
113	NC_009525	CGGC	2	8	46837	46844	0 %	0 %	50 %	50 %	148659801
114	NC_009525	GCCG	2	8	47800	47807	0 %	0 %	50 %	50 %	148659801
115	NC_009525	TTGC	2	8	47964	47971	0 %	50 %	25 %	25 %	148659802
116	NC_009525	CCGC	2	8	48112	48119	0 %	0 %	25 %	75 %	148659802
117	NC_009525	CCGC	2	8	48145	48152	0 %	0 %	25 %	75 %	148659802
118	NC_009525	GGTC	2	8	48253	48260	0 %	25 %	50 %	25 %	148659802
119	NC_009525	CGGG	2	8	48804	48811	0 %	0 %	75 %	25 %	148659803
120	NC_009525	GCAG	2	8	48877	48884	25 %	0 %	50 %	25 %	148659803
121	NC_009525	GTGC	2	8	49777	49784	0 %	25 %	50 %	25 %	148659804
122	NC_009525	GCCG	2	8	50061	50068	0 %	0 %	50 %	50 %	148659804
123	NC_009525	CAGC	2	8	51246	51253	25 %	0 %	25 %	50 %	148659805
124	NC_009525	CGGG	2	8	51435	51442	0 %	0 %	75 %	25 %	148659806
125	NC_009525	GCCG	2	8	51535	51542	0 %	0 %	50 %	50 %	148659806
126	NC_009525	GGTG	2	8	51858	51865	0 %	25 %	75 %	0 %	148659806
127	NC_009525	CTCA	2	8	52474	52481	25 %	25 %	0 %	50 %	148659806
128	NC_009525	CGCT	2	8	52613	52620	0 %	25 %	25 %	50 %	148659807
129	NC_009525	GGTA	2	8	53479	53486	25 %	25 %	50 %	0 %	148659808
130	NC_009525	ACCA	2	8	55099	55106	50 %	0 %	0 %	50 %	148659810
131	NC_009525	GTGC	2	8	55984	55991	0 %	25 %	50 %	25 %	148659810
132	NC_009525	ACCG	2	8	56862	56869	25 %	0 %	25 %	50 %	148659810
133	NC_009525	CCCG	2	8	57024	57031	0 %	0 %	25 %	75 %	148659810
134	NC_009525	GGCC	2	8	57698	57705	0 %	0 %	50 %	50 %	148659811
135	NC_009525	CGCT	2	8	58425	58432	0 %	25 %	25 %	50 %	148659811
136	NC_009525	GCGG	2	8	60182	60189	0 %	0 %	75 %	25 %	148659814
137	NC_009525	GTTC	2	8	60401	60408	0 %	50 %	25 %	25 %	148659814
138	NC_009525	AGCG	2	8	60606	60613	25 %	0 %	50 %	25 %	148659815
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