MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 14620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009523	TATG	2	8	1758	1765	25 %	50 %	25 %	0 %	148654189
2	NC_009523	CGCT	2	8	2363	2370	0 %	25 %	25 %	50 %	148654190
3	NC_009523	TTCC	2	8	2997	3004	0 %	50 %	0 %	50 %	148654190
4	NC_009523	CCGA	2	8	4141	4148	25 %	0 %	25 %	50 %	148654192
5	NC_009523	CAAT	2	8	4604	4611	50 %	25 %	0 %	25 %	148654192
6	NC_009523	GAAG	2	8	5149	5156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009523	TCGT	2	8	5165	5172	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009523	CATC	2	8	5338	5345	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009523	CGAC	2	8	5872	5879	25 %	0 %	25 %	50 %	148654193
10	NC_009523	GATG	2	8	6949	6956	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009523	GAGC	2	8	7139	7146	25 %	0 %	50 %	25 %	148654194
12	NC_009523	TCGC	2	8	8045	8052	0 %	25 %	25 %	50 %	148654195
13	NC_009523	CGAT	2	8	8114	8121	25 %	25 %	25 %	25 %	148654195
14	NC_009523	CCGT	2	8	9917	9924	0 %	25 %	25 %	50 %	148654197
15	NC_009523	CAGT	2	8	10257	10264	25 %	25 %	25 %	25 %	148654197
16	NC_009523	AGGG	2	8	11190	11197	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009523	GCAA	2	8	11533	11540	50 %	0 %	25 %	25 %	148654198
18	NC_009523	TCAT	2	8	12115	12122	25 %	50 %	0 %	25 %	148654198
19	NC_009523	GGAA	2	8	12403	12410	50 %	0 %	50 %	0 %	148654198
20	NC_009523	TTCA	2	8	12518	12525	25 %	50 %	0 %	25 %	148654198
21	NC_009523	TCGT	2	8	13074	13081	0 %	50 %	25 %	25 %	148654198
22	NC_009523	GTGA	2	8	13636	13643	25 %	25 %	50 %	0 %	148654199
23	NC_009523	TGGC	2	8	13858	13865	0 %	25 %	50 %	25 %	148654199
24	NC_009523	GTGG	2	8	13971	13978	0 %	25 %	75 %	0 %	148654199
25	NC_009523	ACCG	2	8	14919	14926	25 %	0 %	25 %	50 %	148654200
26	NC_009523	TGCA	2	8	15139	15146	25 %	25 %	25 %	25 %	148654200
27	NC_009523	CAGG	2	8	15186	15193	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009523	TTCG	2	8	15977	15984	0 %	50 %	25 %	25 %	148654202
29	NC_009523	CGTT	2	8	16607	16614	0 %	50 %	25 %	25 %	148654202
30	NC_009523	ACCA	2	8	16847	16854	50 %	0 %	0 %	50 %	148654202
31	NC_009523	GTAC	2	8	17334	17341	25 %	25 %	25 %	25 %	148654202
32	NC_009523	AAAT	2	8	17524	17531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009523	CTGT	2	8	18794	18801	0 %	50 %	25 %	25 %	148654203
34	NC_009523	CGAT	2	8	19243	19250	25 %	25 %	25 %	25 %	148654204
35	NC_009523	ACGC	2	8	19882	19889	25 %	0 %	25 %	50 %	148654205
36	NC_009523	CGCA	2	8	19936	19943	25 %	0 %	25 %	50 %	148654205
37	NC_009523	GCTC	2	8	20505	20512	0 %	25 %	25 %	50 %	148654206
38	NC_009523	GCTC	2	8	20572	20579	0 %	25 %	25 %	50 %	148654206
39	NC_009523	ACGA	2	8	21510	21517	50 %	0 %	25 %	25 %	148654207
40	NC_009523	TGTC	2	8	22077	22084	0 %	50 %	25 %	25 %	148654209
41	NC_009523	GGTC	2	8	22978	22985	0 %	25 %	50 %	25 %	148654211
42	NC_009523	CACG	2	8	23046	23053	25 %	0 %	25 %	50 %	148654211
43	NC_009523	CCTG	2	8	23171	23178	0 %	25 %	25 %	50 %	148654211
44	NC_009523	GTTC	2	8	23937	23944	0 %	50 %	25 %	25 %	148654211
45	NC_009523	CGCC	2	8	24137	24144	0 %	0 %	25 %	75 %	148654212
46	NC_009523	TCCA	2	8	24165	24172	25 %	25 %	0 %	50 %	148654212
47	NC_009523	AGCC	2	8	24185	24192	25 %	0 %	25 %	50 %	148654212
48	NC_009523	CGGA	2	8	24756	24763	25 %	0 %	50 %	25 %	148654212
49	NC_009523	CGGT	2	8	24780	24787	0 %	25 %	50 %	25 %	148654212
50	NC_009523	TCGC	2	8	26346	26353	0 %	25 %	25 %	50 %	148654213
51	NC_009523	GAAA	2	8	26559	26566	75 %	0 %	25 %	0 %	148654213
52	NC_009523	CGAA	2	8	27062	27069	50 %	0 %	25 %	25 %	148654214
53	NC_009523	GTCG	2	8	27097	27104	0 %	25 %	50 %	25 %	148654214
54	NC_009523	GCAC	2	8	27351	27358	25 %	0 %	25 %	50 %	148654214
55	NC_009523	CAGC	2	8	27463	27470	25 %	0 %	25 %	50 %	148654214
56	NC_009523	CGAT	2	8	27795	27802	25 %	25 %	25 %	25 %	148654214
57	NC_009523	ATCG	2	8	28437	28444	25 %	25 %	25 %	25 %	148654215
58	NC_009523	GCAC	2	8	28624	28631	25 %	0 %	25 %	50 %	148654215
59	NC_009523	GACT	2	8	28916	28923	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009523	ACCG	2	8	29732	29739	25 %	0 %	25 %	50 %	148654216
61	NC_009523	TATG	2	8	30054	30061	25 %	50 %	25 %	0 %	148654216
62	NC_009523	TTCG	2	8	31363	31370	0 %	50 %	25 %	25 %	148654217
63	NC_009523	ATGC	2	8	31493	31500	25 %	25 %	25 %	25 %	148654218
64	NC_009523	AGAT	2	8	33162	33169	50 %	25 %	25 %	0 %	148654219
65	NC_009523	TCGC	2	8	33332	33339	0 %	25 %	25 %	50 %	148654219
66	NC_009523	AACC	3	12	34653	34664	50 %	0 %	0 %	50 %	148654221
67	NC_009523	GGTT	2	8	35114	35121	0 %	50 %	50 %	0 %	148654221
68	NC_009523	CTCC	2	8	36695	36702	0 %	25 %	0 %	75 %	148654222
69	NC_009523	GCCA	2	8	36736	36743	25 %	0 %	25 %	50 %	148654222
70	NC_009523	GATG	2	8	36833	36840	25 %	25 %	50 %	0 %	148654222
71	NC_009523	CATC	2	8	37262	37269	25 %	25 %	0 %	50 %	148654222
72	NC_009523	CATC	2	8	37283	37290	25 %	25 %	0 %	50 %	148654222
73	NC_009523	GCCT	2	8	37698	37705	0 %	25 %	25 %	50 %	148654223
74	NC_009523	GGTC	2	8	38196	38203	0 %	25 %	50 %	25 %	148654224
75	NC_009523	CCGC	2	8	38757	38764	0 %	0 %	25 %	75 %	148654224
76	NC_009523	CACG	2	8	39390	39397	25 %	0 %	25 %	50 %	148654224
77	NC_009523	CATT	2	8	39564	39571	25 %	50 %	0 %	25 %	148654224
78	NC_009523	TCTG	2	8	39708	39715	0 %	50 %	25 %	25 %	148654224
79	NC_009523	CGCC	2	8	39797	39804	0 %	0 %	25 %	75 %	148654224
80	NC_009523	CTCC	2	8	40176	40183	0 %	25 %	0 %	75 %	148654224
81	NC_009523	TGGT	2	8	41207	41214	0 %	50 %	50 %	0 %	148654225
82	NC_009523	GCAA	2	8	41414	41421	50 %	0 %	25 %	25 %	148654225
83	NC_009523	CCAC	2	8	41621	41628	25 %	0 %	0 %	75 %	148654225
84	NC_009523	GATC	2	8	42122	42129	25 %	25 %	25 %	25 %	148654226
85	NC_009523	GATC	2	8	42747	42754	25 %	25 %	25 %	25 %	148654227
86	NC_009523	CGAG	2	8	42814	42821	25 %	0 %	50 %	25 %	148654227
87	NC_009523	TGAC	2	8	42887	42894	25 %	25 %	25 %	25 %	148654227
88	NC_009523	CTGG	2	8	43751	43758	0 %	25 %	50 %	25 %	148654228
89	NC_009523	ACAG	2	8	44181	44188	50 %	0 %	25 %	25 %	148654228
90	NC_009523	GCCC	2	8	44238	44245	0 %	0 %	25 %	75 %	148654228
91	NC_009523	CGGG	2	8	44466	44473	0 %	0 %	75 %	25 %	148654228
92	NC_009523	GCCG	2	8	45430	45437	0 %	0 %	50 %	50 %	148654229
93	NC_009523	GATG	2	8	45969	45976	25 %	25 %	50 %	0 %	148654229
94	NC_009523	AGCC	2	8	46086	46093	25 %	0 %	25 %	50 %	148654229
95	NC_009523	TCAA	2	8	46113	46120	50 %	25 %	0 %	25 %	148654229
96	NC_009523	CGGT	2	8	46536	46543	0 %	25 %	50 %	25 %	148654229
97	NC_009523	CATT	2	8	47317	47324	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009523	GCAA	2	8	47457	47464	50 %	0 %	25 %	25 %	148654231
99	NC_009523	CGTG	2	8	48205	48212	0 %	25 %	50 %	25 %	148654231
100	NC_009523	CTTC	2	8	48373	48380	0 %	50 %	0 %	50 %	148654231
101	NC_009523	CATC	2	8	48901	48908	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009523	GGAG	2	8	49355	49362	25 %	0 %	75 %	0 %	148654232
103	NC_009523	CGAC	2	8	49417	49424	25 %	0 %	25 %	50 %	148654232
104	NC_009523	ACGC	2	8	49496	49503	25 %	0 %	25 %	50 %	148654232
105	NC_009523	GTTT	2	8	49567	49574	0 %	75 %	25 %	0 %	148654232
106	NC_009523	CATG	2	8	50152	50159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009523	ATGT	2	8	50298	50305	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009523	GACA	2	8	51034	51041	50 %	0 %	25 %	25 %	148654233
109	NC_009523	GCTC	2	8	51462	51469	0 %	25 %	25 %	50 %	148654233
110	NC_009523	TCCC	2	8	52219	52226	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_009523	CAGA	2	8	52528	52535	50 %	0 %	25 %	25 %	148654234
112	NC_009523	TGGT	2	8	52721	52728	0 %	50 %	50 %	0 %	148654234
113	NC_009523	TGAG	2	8	53219	53226	25 %	25 %	50 %	0 %	148654234
114	NC_009523	CCGA	2	8	53485	53492	25 %	0 %	25 %	50 %	148654235
115	NC_009523	GGTC	2	8	53871	53878	0 %	25 %	50 %	25 %	148654235
116	NC_009523	TTCA	2	8	55267	55274	25 %	50 %	0 %	25 %	148654235
117	NC_009523	ACGC	2	8	55276	55283	25 %	0 %	25 %	50 %	148654235
118	NC_009523	GAGC	2	8	55843	55850	25 %	0 %	50 %	25 %	148654236
119	NC_009523	CGTC	2	8	55911	55918	0 %	25 %	25 %	50 %	148654236
120	NC_009523	ACTG	2	8	55928	55935	25 %	25 %	25 %	25 %	148654236
121	NC_009523	GCCA	2	8	56496	56503	25 %	0 %	25 %	50 %	148654237
122	NC_009523	GATC	2	8	56530	56537	25 %	25 %	25 %	25 %	148654237
123	NC_009523	CAGT	2	8	56722	56729	25 %	25 %	25 %	25 %	148654237
124	NC_009523	ACGG	2	8	56942	56949	25 %	0 %	50 %	25 %	148654237
125	NC_009523	GCTG	2	8	57026	57033	0 %	25 %	50 %	25 %	148654237
126	NC_009523	CAGG	2	8	57101	57108	25 %	0 %	50 %	25 %	148654237
127	NC_009523	CCAC	2	8	57205	57212	25 %	0 %	0 %	75 %	148654237
128	NC_009523	TCAG	2	8	57759	57766	25 %	25 %	25 %	25 %	148654238
129	NC_009523	AGCG	2	8	58025	58032	25 %	0 %	50 %	25 %	148654238
130	NC_009523	GAAA	2	8	58756	58763	75 %	0 %	25 %	0 %	148654239
131	NC_009523	GGAA	2	8	59523	59530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009523	GCGA	2	8	59849	59856	25 %	0 %	50 %	25 %	148654240
133	NC_009523	GAGT	2	8	60697	60704	25 %	25 %	50 %	0 %	148654240
134	NC_009523	GCCA	2	8	60863	60870	25 %	0 %	25 %	50 %	148654240
135	NC_009523	ATCG	2	8	61415	61422	25 %	25 %	25 %	25 %	148654241
136	NC_009523	TCTG	2	8	62313	62320	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009523	GGCA	2	8	62485	62492	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009523	GGAT	2	8	63113	63120	25 %	25 %	50 %	0 %	148654243
139	NC_009523	GCCA	2	8	64060	64067	25 %	0 %	25 %	50 %	148654243
140	NC_009523	GATC	2	8	64255	64262	25 %	25 %	25 %	25 %	148654243
141	NC_009523	CAGC	2	8	65849	65856	25 %	0 %	25 %	50 %	148654244
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