MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 2239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009523	GAAG	2	8	5149	5156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009523	TCGT	2	8	5165	5172	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009523	CATC	2	8	5338	5345	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009523	GATG	2	8	6949	6956	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009523	AGGG	2	8	11190	11197	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009523	CAGG	2	8	15186	15193	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009523	AAAT	2	8	17524	17531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009523	GACT	2	8	28916	28923	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009523	CATT	2	8	47317	47324	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009523	CATC	2	8	48901	48908	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009523	CATG	2	8	50152	50159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009523	ATGT	2	8	50298	50305	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009523	TCCC	2	8	52219	52226	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_009523	GGAA	2	8	59523	59530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009523	TCTG	2	8	62313	62320	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009523	GGCA	2	8	62485	62492	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009523	GTCG	2	8	66750	66757	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009523	TTTC	2	8	77956	77963	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009523	CGGA	2	8	83067	83074	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009523	GCAT	2	8	85505	85512	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009523	GACG	2	8	85938	85945	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009523	GCGA	2	8	86116	86123	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009523	GGCG	2	8	86360	86367	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009523	CAGG	2	8	91862	91869	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009523	ACCG	2	8	92643	92650	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009523	GCAG	2	8	92725	92732	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009523	CCTT	2	8	102727	102734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009523	CCGC	2	8	102736	102743	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_009523	CAGA	2	8	102915	102922	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009523	CGCT	2	8	104192	104199	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009523	TCAA	2	8	108137	108144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009523	GTCA	2	8	108191	108198	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009523	CCAG	2	8	121787	121794	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009523	CGAC	2	8	121820	121827	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009523	AAGC	2	8	121828	121835	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009523	TGCG	2	8	121891	121898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009523	AAAG	2	8	123178	123185	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009523	CAAC	2	8	133256	133263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009523	GCGT	2	8	136629	136636	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009523	GAAA	2	8	144271	144278	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009523	CTGT	2	8	144364	144371	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009523	ATGC	2	8	149263	149270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009523	GTCG	2	8	149480	149487	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009523	CCCT	2	8	149668	149675	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_009523	AATA	2	8	149863	149870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009523	GCGG	2	8	151397	151404	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009523	CGAC	2	8	151571	151578	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009523	ACGG	2	8	151687	151694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009523	GCCT	2	8	157804	157811	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009523	CCCG	2	8	164698	164705	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_009523	CCCG	2	8	164751	164758	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_009523	GGGC	2	8	164864	164871	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009523	CCCG	2	8	164909	164916	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_009523	AGGG	2	8	165270	165277	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009523	ATCC	2	8	165842	165849	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009523	GTCG	2	8	166104	166111	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009523	GCTT	2	8	167013	167020	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009523	ACTG	2	8	167535	167542	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009523	CGAC	2	8	168025	168032	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009523	CCCG	2	8	168121	168128	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_009523	TGGA	2	8	168492	168499	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009523	GGTT	2	8	168507	168514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009523	AGGC	2	8	183102	183109	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009523	ATGC	2	8	183152	183159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009523	CTGT	2	8	183703	183710	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009523	GCAG	2	8	185646	185653	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009523	TAGC	2	8	185929	185936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009523	GCAG	2	8	186178	186185	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009523	ATTT	2	8	186786	186793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009523	GCAG	2	8	187001	187008	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009523	ATTT	2	8	187165	187172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009523	CTCG	2	8	193166	193173	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009523	GACA	2	8	193457	193464	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009523	CAAA	2	8	193472	193479	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009523	CTCC	2	8	197279	197286	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_009523	GTCC	2	8	200315	200322	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009523	ACCT	2	8	201512	201519	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009523	CGGT	2	8	201714	201721	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009523	TCAT	2	8	201963	201970	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009523	CTTA	2	8	205142	205149	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009523	CCCT	2	8	205332	205339	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_009523	ATTC	2	8	206811	206818	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009523	CCTG	2	8	214450	214457	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009523	GCAA	2	8	217613	217620	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009523	CGGG	2	8	218448	218455	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009523	TTCG	2	8	232438	232445	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009523	CCCG	2	8	232837	232844	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_009523	CATC	2	8	238688	238695	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009523	TTGT	2	8	238804	238811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009523	AGCG	2	8	239118	239125	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009523	CCCG	2	8	246921	246928	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_009523	TCCG	2	8	247151	247158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009523	GCTT	2	8	247694	247701	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009523	GCAG	2	8	250443	250450	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009523	GCGG	2	8	250455	250462	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009523	GACA	2	8	250544	250551	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009523	CAGA	2	8	250702	250709	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009523	AGGC	2	8	250822	250829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009523	CGTG	2	8	254741	254748	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009523	CGTG	2	8	255001	255008	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009523	CAGG	2	8	255462	255469	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009523	GCCC	2	8	256048	256055	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_009523	AAAT	2	8	262302	262309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009523	TGAT	2	8	262831	262838	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009523	GTTT	2	8	264309	264316	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009523	GGAA	2	8	266079	266086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009523	AAAT	2	8	268472	268479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009523	GCCT	2	8	268968	268975	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009523	GCAT	2	8	276026	276033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009523	AGCA	2	8	277710	277717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009523	CATA	2	8	277962	277969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009523	CAGG	2	8	282981	282988	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009523	TCGG	2	8	283001	283008	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009523	CAGG	2	8	283164	283171	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009523	GAAA	2	8	283208	283215	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009523	TCAT	2	8	287540	287547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009523	TTCT	2	8	289566	289573	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009523	TTGA	2	8	292574	292581	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009523	TAAA	2	8	293561	293568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009523	TTTC	2	8	300643	300650	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009523	AGGG	2	8	304107	304114	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009523	AAAT	2	8	304271	304278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009523	AGGG	2	8	304484	304491	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009523	CCCT	2	8	305919	305926	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
125	NC_009523	GGGT	2	8	306465	306472	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009523	GGCA	2	8	306602	306609	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009523	ATCC	2	8	317340	317347	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009523	ATGA	2	8	317481	317488	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009523	TCGA	2	8	319896	319903	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009523	ATGT	2	8	323260	323267	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009523	CGCC	2	8	323428	323435	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_009523	ACCG	2	8	325451	325458	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009523	CCCT	2	8	326718	326725	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_009523	CCTG	2	8	329506	329513	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009523	TCGT	2	8	329547	329554	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009523	CCAA	2	8	329880	329887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009523	GGGA	2	8	330121	330128	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009523	TTTC	2	8	330383	330390	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009523	AAAT	2	8	335757	335764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009523	AAAT	2	8	336068	336075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009523	AAAT	2	8	336116	336123	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009523	ACTG	2	8	336345	336352	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009523	GCTG	2	8	343495	343502	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009523	GCTG	2	8	343556	343563	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009523	CAGC	2	8	349436	349443	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009523	CGGT	2	8	349545	349552	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009523	GATC	2	8	349565	349572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009523	GCGT	2	8	350155	350162	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009523	CAAC	2	8	350239	350246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_009523	GCGT	2	8	351312	351319	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_009523	AACG	2	8	351348	351355	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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