MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 92336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009523	CTT	2	6	239	244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009523	CAA	2	6	396	401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009523	ACA	2	6	439	444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654189
4	NC_009523	ACA	2	6	482	487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654189
5	NC_009523	TCA	2	6	557	562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654189
6	NC_009523	AAG	2	6	563	568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654189
7	NC_009523	GGT	2	6	615	620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654189
8	NC_009523	CGT	2	6	642	647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654189
9	NC_009523	CAC	2	6	683	688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654189
10	NC_009523	CGC	2	6	791	796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654189
11	NC_009523	GTT	2	6	945	950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654189
12	NC_009523	CGG	2	6	957	962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654189
13	NC_009523	CCT	2	6	984	989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654189
14	NC_009523	CGC	2	6	1087	1092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654189
15	NC_009523	CAG	2	6	1093	1098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654189
16	NC_009523	GGA	2	6	1101	1106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654189
17	NC_009523	CGA	2	6	1146	1151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654189
18	NC_009523	TCG	2	6	1316	1321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654189
19	NC_009523	GCA	2	6	1525	1530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654189
20	NC_009523	CGC	2	6	1596	1601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654189
21	NC_009523	TCT	2	6	1683	1688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654189
22	NC_009523	CGG	2	6	1734	1739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654189
23	NC_009523	GAA	2	6	1783	1788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654189
24	NC_009523	CGA	2	6	1823	1828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654189
25	NC_009523	CTG	2	6	1840	1845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654189
26	NC_009523	GCA	2	6	1898	1903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009523	CTG	2	6	1919	1924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009523	CTG	2	6	2091	2096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654190
29	NC_009523	GCG	2	6	2144	2149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654190
30	NC_009523	TGT	2	6	2293	2298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654190
31	NC_009523	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654190
32	NC_009523	GCG	2	6	2342	2347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654190
33	NC_009523	ACA	2	6	2388	2393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654190
34	NC_009523	TTC	2	6	2480	2485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654190
35	NC_009523	CAA	3	9	2536	2544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654190
36	NC_009523	CTG	2	6	2636	2641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654190
37	NC_009523	ATT	2	6	2763	2768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148654190
38	NC_009523	GCC	2	6	2799	2804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654190
39	NC_009523	GGT	2	6	2809	2814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654190
40	NC_009523	CTG	2	6	2828	2833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654190
41	NC_009523	GCC	2	6	2878	2883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654190
42	NC_009523	CGT	2	6	2897	2902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654190
43	NC_009523	TGG	2	6	2981	2986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654190
44	NC_009523	GCC	2	6	3041	3046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654190
45	NC_009523	GAT	2	6	3166	3171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654190
46	NC_009523	CGG	2	6	3272	3277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654191
47	NC_009523	GTG	2	6	3300	3305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654191
48	NC_009523	CTG	2	6	3420	3425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654191
49	NC_009523	CGA	2	6	3434	3439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654191
50	NC_009523	CGG	2	6	3482	3487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654191
51	NC_009523	AGG	2	6	3512	3517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654191
52	NC_009523	GCA	3	9	3563	3571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654191
53	NC_009523	CGG	2	6	3592	3597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654191
54	NC_009523	CAG	2	6	3662	3667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654191
55	NC_009523	GCT	2	6	3750	3755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654191
56	NC_009523	CGC	2	6	3824	3829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654191
57	NC_009523	CGT	2	6	3881	3886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654191
58	NC_009523	TCG	2	6	3895	3900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654191
59	NC_009523	ATC	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654191
60	NC_009523	CTG	2	6	3960	3965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009523	AAG	2	6	3993	3998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009523	CAG	2	6	4032	4037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654192
63	NC_009523	CAG	2	6	4083	4088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654192
64	NC_009523	CGA	2	6	4187	4192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654192
65	NC_009523	CAT	2	6	4227	4232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654192
66	NC_009523	AAC	2	6	4240	4245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654192
67	NC_009523	GCA	2	6	4297	4302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654192
68	NC_009523	CAC	2	6	4314	4319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654192
69	NC_009523	GCG	2	6	4355	4360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654192
70	NC_009523	GGC	2	6	4361	4366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654192
71	NC_009523	CGG	2	6	4512	4517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654192
72	NC_009523	GTT	2	6	4559	4564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654192
73	NC_009523	ACG	2	6	4708	4713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654192
74	NC_009523	GCG	2	6	4764	4769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654192
75	NC_009523	GCT	2	6	4810	4815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654192
76	NC_009523	CTG	2	6	4833	4838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654192
77	NC_009523	TCT	2	6	4944	4949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009523	ATG	2	6	5073	5078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009523	GCG	2	6	5293	5298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009523	ACG	2	6	5455	5460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654193
81	NC_009523	GGT	2	6	5495	5500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654193
82	NC_009523	GCA	2	6	5602	5607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654193
83	NC_009523	CGA	2	6	5611	5616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654193
84	NC_009523	TCG	2	6	5637	5642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654193
85	NC_009523	TTG	2	6	5706	5711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654193
86	NC_009523	CAC	2	6	5750	5755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654193
87	NC_009523	CAT	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654193
88	NC_009523	AAT	2	6	5816	5821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148654193
89	NC_009523	CCG	2	6	5937	5942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654193
90	NC_009523	ACC	2	6	5952	5957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654193
91	NC_009523	CAC	2	6	5984	5989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654193
92	NC_009523	GCG	2	6	6044	6049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654193
93	NC_009523	GCC	2	6	6105	6110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654193
94	NC_009523	TCC	2	6	6117	6122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654193
95	NC_009523	CGA	2	6	6169	6174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654193
96	NC_009523	GCC	2	6	6228	6233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654193
97	NC_009523	CGG	2	6	6775	6780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654193
98	NC_009523	CGG	2	6	6790	6795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654193
99	NC_009523	TTC	2	6	6871	6876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009523	CGG	2	6	6911	6916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009523	TCG	2	6	6925	6930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_009523	CGT	2	6	6937	6942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009523	AGG	2	6	7020	7025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009523	AGG	2	6	7041	7046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654194
105	NC_009523	GGC	3	9	7109	7117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654194
106	NC_009523	GGC	2	6	7380	7385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654194
107	NC_009523	GCC	2	6	7410	7415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654194
108	NC_009523	CGG	2	6	7509	7514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654194
109	NC_009523	GGC	2	6	7551	7556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654194
110	NC_009523	CGC	2	6	7607	7612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654194
111	NC_009523	AGC	2	6	7666	7671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654194
112	NC_009523	CAT	2	6	7692	7697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654194
113	NC_009523	CAG	2	6	7725	7730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654194
114	NC_009523	CCG	2	6	7793	7798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654195
115	NC_009523	CGC	2	6	7855	7860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654195
116	NC_009523	CGG	2	6	7912	7917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654195
117	NC_009523	TCA	2	6	7919	7924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654195
118	NC_009523	TTC	2	6	8029	8034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654195
119	NC_009523	TCG	2	6	8063	8068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654195
120	NC_009523	GAA	2	6	8069	8074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654195
121	NC_009523	GAG	2	6	8077	8082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654195
122	NC_009523	TTC	2	6	8087	8092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654195
123	NC_009523	TTC	2	6	8101	8106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654195
124	NC_009523	AGA	2	6	8199	8204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654195
125	NC_009523	CGG	2	6	8215	8220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654195
126	NC_009523	CAC	2	6	8309	8314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654196
127	NC_009523	GGC	2	6	8387	8392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654196
128	NC_009523	GCA	2	6	8837	8842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654196
129	NC_009523	CGC	2	6	8939	8944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654196
130	NC_009523	CTT	2	6	8946	8951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654196
131	NC_009523	GAC	2	6	8973	8978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654196
132	NC_009523	GCA	2	6	9250	9255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009523	GCA	2	6	9261	9266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009523	TGC	2	6	9403	9408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654197
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136	NC_009523	GTC	2	6	9448	9453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654197
137	NC_009523	TGG	2	6	9472	9477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654197
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139	NC_009523	GCA	2	6	9555	9560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654197
140	NC_009523	GCA	2	6	9623	9628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654197
141	NC_009523	GCA	2	6	9638	9643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654197
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153	NC_009523	CTT	2	6	10382	10387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654197
154	NC_009523	CCA	2	6	10457	10462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654197
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161	NC_009523	CGG	2	6	10955	10960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_009523	TGA	2	6	10963	10968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_009523	ATT	2	6	11061	11066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_009523	GTC	2	6	11219	11224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_009523	CGA	2	6	11225	11230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_009523	TTA	2	6	11351	11356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_009523	TGA	2	6	11358	11363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_009523	TGA	2	6	11371	11376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_009523	CAT	2	6	11382	11387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_009523	AGG	2	6	11391	11396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
171	NC_009523	TGC	2	6	11445	11450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654198
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245	NC_009523	ACG	2	6	16158	16163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654202
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251	NC_009523	TAC	3	9	16412	16420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654202
252	NC_009523	TCG	2	6	16428	16433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654202
253	NC_009523	GTC	2	6	16469	16474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654202
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255	NC_009523	GGC	2	6	16618	16623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654202
256	NC_009523	CGG	2	6	16669	16674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654202
257	NC_009523	TGC	2	6	16690	16695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654202
258	NC_009523	TAC	2	6	16697	16702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654202
259	NC_009523	GAA	2	6	16799	16804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654202
260	NC_009523	GGC	2	6	16883	16888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654202
261	NC_009523	GCA	2	6	16910	16915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654202
262	NC_009523	CTA	2	6	16951	16956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654202
263	NC_009523	GAG	2	6	16961	16966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654202
264	NC_009523	ACG	2	6	17084	17089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654202
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266	NC_009523	ACC	2	6	17162	17167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654202
267	NC_009523	CGG	2	6	17212	17217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654202
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270	NC_009523	CGG	2	6	17307	17312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654202
271	NC_009523	CAG	2	6	17471	17476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_009523	TGA	2	6	17510	17515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
273	NC_009523	AAT	2	6	17989	17994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_009523	CAT	2	6	18006	18011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_009523	CCG	2	6	18025	18030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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280	NC_009523	ATC	2	6	18480	18485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654203
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282	NC_009523	ACG	2	6	18523	18528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654203
283	NC_009523	TCG	2	6	18709	18714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654203
284	NC_009523	CGA	2	6	18738	18743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654203
285	NC_009523	GCC	2	6	18802	18807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654203
286	NC_009523	GAC	2	6	18837	18842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654203
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288	NC_009523	CAT	2	6	19070	19075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654204
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294	NC_009523	CAG	2	6	19356	19361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654204
295	NC_009523	TCG	2	6	19435	19440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_009523	ATC	2	6	19481	19486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654205
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340	NC_009523	GAA	2	6	22523	22528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_009523	TCT	2	6	24356	24361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654212
383	NC_009523	CGC	2	6	24372	24377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654212
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