MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 18222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009523	AT	3	6	344	349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009523	CG	3	6	541	546	0 %	0 %	50 %	50 %	148654189
3	NC_009523	AC	3	6	1208	1213	50 %	0 %	0 %	50 %	148654189
4	NC_009523	GC	3	6	1362	1367	0 %	0 %	50 %	50 %	148654189
5	NC_009523	CG	3	6	1800	1805	0 %	0 %	50 %	50 %	148654189
6	NC_009523	CG	3	6	2744	2749	0 %	0 %	50 %	50 %	148654190
7	NC_009523	CG	3	6	3086	3091	0 %	0 %	50 %	50 %	148654190
8	NC_009523	CG	3	6	3720	3725	0 %	0 %	50 %	50 %	148654191
9	NC_009523	GC	3	6	4011	4016	0 %	0 %	50 %	50 %	148654192
10	NC_009523	GC	3	6	4365	4370	0 %	0 %	50 %	50 %	148654192
11	NC_009523	GC	3	6	4412	4417	0 %	0 %	50 %	50 %	148654192
12	NC_009523	GC	4	8	4777	4784	0 %	0 %	50 %	50 %	148654192
13	NC_009523	TC	3	6	4930	4935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009523	GC	3	6	5191	5196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009523	CG	3	6	5509	5514	0 %	0 %	50 %	50 %	148654193
16	NC_009523	CG	3	6	5782	5787	0 %	0 %	50 %	50 %	148654193
17	NC_009523	GC	3	6	6068	6073	0 %	0 %	50 %	50 %	148654193
18	NC_009523	GC	3	6	6353	6358	0 %	0 %	50 %	50 %	148654193
19	NC_009523	GC	3	6	7123	7128	0 %	0 %	50 %	50 %	148654194
20	NC_009523	GC	3	6	7201	7206	0 %	0 %	50 %	50 %	148654194
21	NC_009523	GC	3	6	7389	7394	0 %	0 %	50 %	50 %	148654194
22	NC_009523	CG	3	6	7580	7585	0 %	0 %	50 %	50 %	148654194
23	NC_009523	GC	3	6	7874	7879	0 %	0 %	50 %	50 %	148654195
24	NC_009523	GC	3	6	8185	8190	0 %	0 %	50 %	50 %	148654195
25	NC_009523	GC	5	10	8629	8638	0 %	0 %	50 %	50 %	148654196
26	NC_009523	GA	3	6	8822	8827	50 %	0 %	50 %	0 %	148654196
27	NC_009523	GC	3	6	8914	8919	0 %	0 %	50 %	50 %	148654196
28	NC_009523	CG	3	6	9267	9272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009523	GC	4	8	9596	9603	0 %	0 %	50 %	50 %	148654197
30	NC_009523	CG	3	6	9831	9836	0 %	0 %	50 %	50 %	148654197
31	NC_009523	GC	3	6	10005	10010	0 %	0 %	50 %	50 %	148654197
32	NC_009523	GC	3	6	10214	10219	0 %	0 %	50 %	50 %	148654197
33	NC_009523	TA	3	6	11319	11324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009523	TC	3	6	11408	11413	0 %	50 %	0 %	50 %	148654198
35	NC_009523	AC	3	6	12161	12166	50 %	0 %	0 %	50 %	148654198
36	NC_009523	TA	3	6	12626	12631	50 %	50 %	0 %	0 %	148654198
37	NC_009523	CA	3	6	13233	13238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009523	GC	3	6	13243	13248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009523	GC	3	6	13849	13854	0 %	0 %	50 %	50 %	148654199
40	NC_009523	GC	3	6	13909	13914	0 %	0 %	50 %	50 %	148654199
41	NC_009523	AG	3	6	14177	14182	50 %	0 %	50 %	0 %	148654200
42	NC_009523	GC	3	6	14303	14308	0 %	0 %	50 %	50 %	148654200
43	NC_009523	GC	3	6	14632	14637	0 %	0 %	50 %	50 %	148654200
44	NC_009523	GC	3	6	15004	15009	0 %	0 %	50 %	50 %	148654200
45	NC_009523	TG	3	6	15260	15265	0 %	50 %	50 %	0 %	148654201
46	NC_009523	CG	3	6	15522	15527	0 %	0 %	50 %	50 %	148654201
47	NC_009523	TC	3	6	16288	16293	0 %	50 %	0 %	50 %	148654202
48	NC_009523	GC	3	6	16400	16405	0 %	0 %	50 %	50 %	148654202
49	NC_009523	CG	3	6	16584	16589	0 %	0 %	50 %	50 %	148654202
50	NC_009523	GC	3	6	16675	16680	0 %	0 %	50 %	50 %	148654202
51	NC_009523	GC	3	6	16770	16775	0 %	0 %	50 %	50 %	148654202
52	NC_009523	GC	3	6	16901	16906	0 %	0 %	50 %	50 %	148654202
53	NC_009523	CG	3	6	18044	18049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009523	GC	3	6	18245	18250	0 %	0 %	50 %	50 %	148654203
55	NC_009523	CA	3	6	18283	18288	50 %	0 %	0 %	50 %	148654203
56	NC_009523	CG	3	6	18323	18328	0 %	0 %	50 %	50 %	148654203
57	NC_009523	CA	3	6	19010	19015	50 %	0 %	0 %	50 %	148654204
58	NC_009523	GC	3	6	19047	19052	0 %	0 %	50 %	50 %	148654204
59	NC_009523	GC	3	6	19163	19168	0 %	0 %	50 %	50 %	148654204
60	NC_009523	TC	3	6	19485	19490	0 %	50 %	0 %	50 %	148654205
61	NC_009523	GA	3	6	20278	20283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009523	GC	3	6	20441	20446	0 %	0 %	50 %	50 %	148654206
63	NC_009523	TC	4	8	20820	20827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009523	TA	3	6	20993	20998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009523	TC	3	6	21092	21097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009523	GC	3	6	21130	21135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009523	GA	3	6	22112	22117	50 %	0 %	50 %	0 %	148654209
68	NC_009523	CT	3	6	22271	22276	0 %	50 %	0 %	50 %	148654210
69	NC_009523	CG	3	6	23182	23187	0 %	0 %	50 %	50 %	148654211
70	NC_009523	GC	3	6	23998	24003	0 %	0 %	50 %	50 %	148654211
71	NC_009523	GC	3	6	24798	24803	0 %	0 %	50 %	50 %	148654212
72	NC_009523	GC	4	8	25127	25134	0 %	0 %	50 %	50 %	148654213
73	NC_009523	GC	4	8	25163	25170	0 %	0 %	50 %	50 %	148654213
74	NC_009523	GC	3	6	25190	25195	0 %	0 %	50 %	50 %	148654213
75	NC_009523	GC	3	6	25844	25849	0 %	0 %	50 %	50 %	148654213
76	NC_009523	GC	4	8	26692	26699	0 %	0 %	50 %	50 %	148654213
77	NC_009523	CA	3	6	26741	26746	50 %	0 %	0 %	50 %	148654213
78	NC_009523	CG	3	6	27133	27138	0 %	0 %	50 %	50 %	148654214
79	NC_009523	CG	3	6	27238	27243	0 %	0 %	50 %	50 %	148654214
80	NC_009523	CG	3	6	28150	28155	0 %	0 %	50 %	50 %	148654214
81	NC_009523	CG	3	6	28657	28662	0 %	0 %	50 %	50 %	148654215
82	NC_009523	GC	3	6	28675	28680	0 %	0 %	50 %	50 %	148654215
83	NC_009523	GC	4	8	29389	29396	0 %	0 %	50 %	50 %	148654216
84	NC_009523	GC	3	6	30678	30683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009523	GC	3	6	30775	30780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009523	GC	3	6	30872	30877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009523	GC	3	6	32328	32333	0 %	0 %	50 %	50 %	148654219
88	NC_009523	GC	3	6	32498	32503	0 %	0 %	50 %	50 %	148654219
89	NC_009523	GC	5	10	32569	32578	0 %	0 %	50 %	50 %	148654219
90	NC_009523	GC	3	6	32635	32640	0 %	0 %	50 %	50 %	148654219
91	NC_009523	GC	3	6	32821	32826	0 %	0 %	50 %	50 %	148654219
92	NC_009523	GC	3	6	32879	32884	0 %	0 %	50 %	50 %	148654219
93	NC_009523	CG	3	6	32912	32917	0 %	0 %	50 %	50 %	148654219
94	NC_009523	CG	3	6	33014	33019	0 %	0 %	50 %	50 %	148654219
95	NC_009523	GC	3	6	33270	33275	0 %	0 %	50 %	50 %	148654219
96	NC_009523	CG	3	6	33580	33585	0 %	0 %	50 %	50 %	148654220
97	NC_009523	GC	3	6	33819	33824	0 %	0 %	50 %	50 %	148654220
98	NC_009523	CG	3	6	34248	34253	0 %	0 %	50 %	50 %	148654220
99	NC_009523	CG	3	6	34363	34368	0 %	0 %	50 %	50 %	148654220
100	NC_009523	GC	3	6	34647	34652	0 %	0 %	50 %	50 %	148654221
101	NC_009523	GC	3	6	34714	34719	0 %	0 %	50 %	50 %	148654221
102	NC_009523	GC	3	6	34814	34819	0 %	0 %	50 %	50 %	148654221
103	NC_009523	GC	4	8	35625	35632	0 %	0 %	50 %	50 %	148654221
104	NC_009523	CG	4	8	36534	36541	0 %	0 %	50 %	50 %	148654222
105	NC_009523	CG	3	6	37052	37057	0 %	0 %	50 %	50 %	148654222
106	NC_009523	CG	4	8	37085	37092	0 %	0 %	50 %	50 %	148654222
107	NC_009523	CG	3	6	37121	37126	0 %	0 %	50 %	50 %	148654222
108	NC_009523	GC	3	6	38663	38668	0 %	0 %	50 %	50 %	148654224
109	NC_009523	CG	3	6	39378	39383	0 %	0 %	50 %	50 %	148654224
110	NC_009523	AG	3	6	39417	39422	50 %	0 %	50 %	0 %	148654224
111	NC_009523	GC	3	6	39531	39536	0 %	0 %	50 %	50 %	148654224
112	NC_009523	GC	3	6	40168	40173	0 %	0 %	50 %	50 %	148654224
113	NC_009523	GC	3	6	41038	41043	0 %	0 %	50 %	50 %	148654225
114	NC_009523	GC	3	6	41129	41134	0 %	0 %	50 %	50 %	148654225
115	NC_009523	GT	3	6	41874	41879	0 %	50 %	50 %	0 %	148654226
116	NC_009523	GC	3	6	42202	42207	0 %	0 %	50 %	50 %	148654226
117	NC_009523	GC	3	6	44726	44731	0 %	0 %	50 %	50 %	148654228
118	NC_009523	GC	3	6	45194	45199	0 %	0 %	50 %	50 %	148654229
119	NC_009523	CG	3	6	45471	45476	0 %	0 %	50 %	50 %	148654229
120	NC_009523	GC	3	6	45777	45782	0 %	0 %	50 %	50 %	148654229
121	NC_009523	GC	3	6	45787	45792	0 %	0 %	50 %	50 %	148654229
122	NC_009523	GT	3	6	45882	45887	0 %	50 %	50 %	0 %	148654229
123	NC_009523	CG	4	8	46591	46598	0 %	0 %	50 %	50 %	148654229
124	NC_009523	TG	3	6	46861	46866	0 %	50 %	50 %	0 %	148654229
125	NC_009523	CG	3	6	47325	47330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009523	CG	3	6	47405	47410	0 %	0 %	50 %	50 %	148654231
127	NC_009523	CG	3	6	47488	47493	0 %	0 %	50 %	50 %	148654231
128	NC_009523	GC	3	6	47580	47585	0 %	0 %	50 %	50 %	148654231
129	NC_009523	GC	3	6	47852	47857	0 %	0 %	50 %	50 %	148654231
130	NC_009523	CG	4	8	48527	48534	0 %	0 %	50 %	50 %	148654231
131	NC_009523	CG	5	10	48564	48573	0 %	0 %	50 %	50 %	148654231
132	NC_009523	GC	3	6	48932	48937	0 %	0 %	50 %	50 %	148654232
133	NC_009523	CG	3	6	49226	49231	0 %	0 %	50 %	50 %	148654232
134	NC_009523	GC	3	6	49288	49293	0 %	0 %	50 %	50 %	148654232
135	NC_009523	CA	3	6	49349	49354	50 %	0 %	0 %	50 %	148654232
136	NC_009523	GC	3	6	49380	49385	0 %	0 %	50 %	50 %	148654232
137	NC_009523	TG	3	6	49557	49562	0 %	50 %	50 %	0 %	148654232
138	NC_009523	CG	4	8	49942	49949	0 %	0 %	50 %	50 %	148654232
139	NC_009523	TC	3	6	50120	50125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009523	GC	3	6	50532	50537	0 %	0 %	50 %	50 %	148654233
141	NC_009523	CG	3	6	50691	50696	0 %	0 %	50 %	50 %	148654233
142	NC_009523	CG	3	6	50804	50809	0 %	0 %	50 %	50 %	148654233
143	NC_009523	GC	3	6	50836	50841	0 %	0 %	50 %	50 %	148654233
144	NC_009523	GC	3	6	50941	50946	0 %	0 %	50 %	50 %	148654233
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