MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 chromosome

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009515	TAAAAT	2	12	3336	3347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009515	TTAAAG	2	12	5946	5957	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009515	TTTAAT	2	12	6067	6078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009515	TTATTT	2	12	15257	15268	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009515	TAAAAT	2	12	29763	29774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009515	ATTATA	2	12	102983	102994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009515	AAATTA	2	12	144154	144165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009515	AAAATA	2	12	144788	144799	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009515	CATTTC	2	12	154893	154904	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009515	TAAAAA	2	12	196664	196675	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009515	TAAAAA	2	12	200377	200388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009515	TAAAAA	2	12	204926	204937	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009515	AATAAA	2	12	209848	209859	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009515	TATTTT	2	12	214433	214444	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009515	AAATAT	2	12	235686	235697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009515	TAAAAA	2	12	235743	235754	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009515	ATTAAA	2	12	240033	240044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009515	AGTTAT	2	12	270543	270554	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009515	ATTTAA	2	12	296240	296251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009515	TTATTT	2	12	318879	318890	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009515	AATTAT	2	12	318931	318942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009515	ATTCAA	2	12	322151	322162	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_009515	ATTAAA	2	12	323497	323508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009515	AAAAAT	2	12	329898	329909	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009515	ATAAAA	2	12	335333	335344	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009515	TAACAT	2	12	339094	339105	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009515	GAAAAA	2	12	343441	343452	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009515	AATGAT	2	12	353299	353310	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009515	TAAAAA	2	12	357463	357474	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009515	ATTTAA	2	12	364158	364169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009515	ATTTAA	2	12	366966	366977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009515	TAATTG	2	12	378949	378960	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009515	AATAAA	2	12	408824	408835	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009515	ATAAAA	2	12	430203	430214	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009515	AAATAA	2	12	437829	437840	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009515	AATATA	2	12	437853	437864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009515	ACTGTG	2	12	502779	502790	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_009515	TTAAAT	2	12	515785	515796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009515	AAATAA	2	12	516053	516064	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009515	ATATTA	2	12	524102	524113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009515	CTTTTT	2	12	527178	527189	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_009515	CATAAT	2	12	552876	552887	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_009515	TTTAAT	2	12	573946	573957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009515	ATTTTT	2	12	577441	577452	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009515	ATTTAT	2	12	596482	596493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009515	TTTTAA	2	12	598990	599001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009515	ATATCT	2	12	605175	605186	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009515	ATTAAA	2	12	606927	606938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009515	AAAATA	2	12	607304	607315	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009515	TTTAAT	2	12	609217	609228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009515	ATAAGT	2	12	614030	614041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009515	AAAAAT	2	12	628671	628682	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009515	AAAATA	2	12	641954	641965	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009515	TTTGAA	2	12	669402	669413	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009515	TGTACC	2	12	688202	688213	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009515	ATTAAA	2	12	701242	701253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009515	TAAAAA	2	12	705881	705892	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009515	TAATAT	2	12	743230	743241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009515	CCATCA	2	12	753424	753435	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009515	CATATA	2	12	753564	753575	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_009515	TCAAAA	2	12	753755	753766	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_009515	TAAAAA	2	12	784041	784052	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009515	ATTATA	2	12	798590	798601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009515	AAAAAT	2	12	801444	801455	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009515	TAAACT	2	12	821150	821161	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009515	ATTAAA	2	12	827324	827335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009515	AAAAAT	2	12	859199	859210	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009515	ATAAAA	2	12	869333	869344	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009515	TATATT	2	12	880478	880489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009515	TAAAAA	2	12	880707	880718	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009515	AAATTA	2	12	880729	880740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009515	TTATAA	2	12	880782	880793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009515	AATTTA	2	12	884278	884289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009515	AACAAA	2	12	891120	891131	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_009515	TTAAAA	2	12	892552	892563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009515	ATTAAT	2	12	950001	950012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009515	TTATAA	2	12	969645	969656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009515	TGAAAA	2	12	1031948	1031959	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009515	TTTTAA	2	12	1043437	1043448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009515	GGGGCC	2	12	1050753	1050764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009515	TATTAA	2	12	1051418	1051429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009515	AAAAAT	2	12	1059764	1059775	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009515	ATAAAA	2	12	1114448	1114459	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009515	ATTTTA	2	12	1117804	1117815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009515	ATTTAA	2	12	1119094	1119105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009515	TAATGA	2	12	1119380	1119391	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009515	AGAAAA	2	12	1141512	1141523	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009515	AATAAA	2	12	1142935	1142946	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009515	TTAAAA	2	12	1146735	1146746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009515	ATTAAA	2	12	1186845	1186856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009515	AAAATA	2	12	1187065	1187076	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009515	TTATTT	2	12	1202845	1202856	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009515	CATTAC	2	12	1223825	1223836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009515	AAAATT	2	12	1226941	1226952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009515	ATTTTT	2	12	1258994	1259005	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009515	TAAAAA	2	12	1261945	1261956	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009515	TTAAAA	2	12	1269896	1269907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009515	AATAAA	2	12	1270116	1270127	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009515	TTAATT	2	12	1294248	1294259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009515	GTTTTA	2	12	1294269	1294280	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009515	TATTTT	2	12	1309336	1309347	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009515	TTATAT	3	18	1319191	1319208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009515	TCTTTT	2	12	1323646	1323657	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_009515	ATTTTT	2	12	1363795	1363806	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009515	ATTAAT	2	12	1391447	1391458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009515	TTCCTT	2	12	1441106	1441117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009515	ATTTTT	2	12	1445283	1445294	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009515	TTTAAT	2	12	1445442	1445453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009515	ATATTA	2	12	1467515	1467526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009515	TGTTTT	2	12	1489395	1489406	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009515	ATTGTT	2	12	1507184	1507195	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009515	TTGGTA	2	12	1512469	1512480	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009515	ATAACT	2	12	1519504	1519515	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_009515	TTAAAT	2	12	1522919	1522930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009515	ATAATT	2	12	1534325	1534336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009515	TATATT	2	12	1534754	1534765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009515	ATAAAA	2	12	1548689	1548700	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009515	GAATTT	2	12	1557422	1557433	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009515	CTTTTT	2	12	1610484	1610495	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_009515	TTAATT	2	12	1611203	1611214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009515	TTAATT	2	12	1621666	1621677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009515	ATAGCA	2	12	1645167	1645178	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_009515	ATTAAA	2	12	1660021	1660032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009515	ATTTTT	2	12	1673795	1673806	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009515	TTTAAT	2	12	1690591	1690602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009515	AGTGTA	2	12	1703197	1703208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009515	CATTAT	2	12	1704992	1705003	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_009515	TATTTT	2	12	1711504	1711515	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009515	ATTTTT	2	12	1776754	1776765	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009515	ATTTAA	2	12	1782948	1782959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009515	ATTTTA	2	12	1783703	1783714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009515	AAAAAC	2	12	1818792	1818803	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_009515	GAATTT	2	12	1820961	1820972	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009515	AAAGAA	2	12	1839367	1839378	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.