MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 chromosome

Total Repeats: 985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009515	GCTGAA	2	12	2817	2828	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148642062
2	NC_009515	GTACCT	2	12	4640	4651	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148642064
3	NC_009515	TTTTCC	2	12	4689	4700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642064
4	NC_009515	TTTCCA	2	12	7500	7511	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148642069
5	NC_009515	AACTTC	2	12	7627	7638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642069
6	NC_009515	ATACGG	2	12	8062	8073	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148642070
7	NC_009515	ATAATT	2	12	11085	11096	50 %	50 %	0 %	0 %	148642074
8	NC_009515	TATTAA	2	12	13175	13186	50 %	50 %	0 %	0 %	148642079
9	NC_009515	TTTTCA	2	12	15467	15478	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148642083
10	NC_009515	AATTAT	2	12	16455	16466	50 %	50 %	0 %	0 %	148642084
11	NC_009515	AGCTAT	2	12	19916	19927	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148642087
12	NC_009515	CTGAAA	2	12	22926	22937	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148642089
13	NC_009515	ATTAAC	2	12	23998	24009	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148642091
14	NC_009515	TAGGAT	2	12	25255	25266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642093
15	NC_009515	AGGTGA	2	12	30500	30511	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148642100
16	NC_009515	TTTGTT	2	12	34225	34236	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	148642105
17	NC_009515	CAGCTG	2	12	37271	37282	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148642109
18	NC_009515	TCAAAA	2	12	37903	37914	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148642110
19	NC_009515	ATCAGA	2	12	39673	39684	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148642111
20	NC_009515	TGCCAT	2	12	40038	40049	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148642111
21	NC_009515	ATTGTA	2	12	45589	45600	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148642112
22	NC_009515	TGTTAT	2	12	47073	47084	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148642112
23	NC_009515	CCTTCA	2	12	48602	48613	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	148642112
24	NC_009515	AATAGA	2	12	48637	48648	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148642112
25	NC_009515	ACTTTA	2	12	51129	51140	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148642115
26	NC_009515	TATCTA	2	12	52876	52887	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148642116
27	NC_009515	TTGTAT	2	12	53409	53420	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148642117
28	NC_009515	AACATA	2	12	54511	54522	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148642118
29	NC_009515	AAAATG	2	12	54934	54945	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148642118
30	NC_009515	AATTTC	2	12	55054	55065	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148642118
31	NC_009515	TTATCT	2	12	56339	56350	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148642118
32	NC_009515	ATGCAG	2	12	59977	59988	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148642120
33	NC_009515	TAATAT	2	12	61062	61073	50 %	50 %	0 %	0 %	148642121
34	NC_009515	CATACT	2	12	64635	64646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642126
35	NC_009515	ACTAAT	2	12	65784	65795	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148642127
36	NC_009515	TTTAGC	2	12	65967	65978	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148642127
37	NC_009515	ATTTAG	2	12	67405	67416	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148642129
38	NC_009515	TTTCTA	2	12	67737	67748	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148642130
39	NC_009515	TTTCAT	2	12	68238	68249	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148642130
40	NC_009515	CTTTAT	2	12	71760	71771	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148642132
41	NC_009515	CTTCAA	2	12	74735	74746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642134
42	NC_009515	TTGATG	2	12	75369	75380	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148642135
43	NC_009515	GACGAA	2	12	78994	79005	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	148642140
44	NC_009515	GTGTTT	2	12	80995	81006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642142
45	NC_009515	TCTTCA	2	12	83561	83572	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148642144
46	NC_009515	ATTCAA	2	12	86393	86404	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148642147
47	NC_009515	GAAAAA	2	12	87232	87243	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148642147
48	NC_009515	TGAAAA	2	12	91012	91023	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148642152
49	NC_009515	GTTGGA	2	12	93422	93433	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148642155
50	NC_009515	TTTCCG	2	12	95943	95954	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148642158
51	NC_009515	TTCATT	2	12	96492	96503	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148642159
52	NC_009515	TAATGT	2	12	98101	98112	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148642162
53	NC_009515	TTGGAT	2	12	99160	99171	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148642164
54	NC_009515	CAATAT	2	12	101223	101234	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148642166
55	NC_009515	ATTCCA	2	12	105308	105319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642172
56	NC_009515	CATCTT	2	12	107118	107129	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148642172
57	NC_009515	TAAAAA	2	12	111227	111238	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148642174
58	NC_009515	AGCTGT	2	12	111362	111373	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148642175
59	NC_009515	GGAGCT	2	12	111513	111524	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148642175
60	NC_009515	TTTCCA	2	12	112951	112962	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148642177
61	NC_009515	GCCTTA	2	12	115948	115959	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148642180
62	NC_009515	ACATTA	2	12	116278	116289	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148642180
63	NC_009515	TTTATT	2	12	116958	116969	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148642180
64	NC_009515	CAAAAA	2	12	120829	120840	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	148642182
65	NC_009515	ATTTAC	2	12	124308	124319	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148642186
66	NC_009515	AAATAA	2	12	124989	125000	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148642187
67	NC_009515	TAATCA	2	12	128320	128331	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148642193
68	NC_009515	TTTCAT	2	12	128727	128738	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148642194
69	NC_009515	GCTTCA	2	12	130266	130277	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148642195
70	NC_009515	TCTTCA	2	12	132274	132285	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148642197
71	NC_009515	AATGAA	2	12	134945	134956	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148642199
72	NC_009515	CAAATT	2	12	138134	138145	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148642204
73	NC_009515	ATCAGT	2	12	139617	139628	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148642206
74	NC_009515	TCTGTG	2	12	140454	140465	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148642207
75	NC_009515	CTGATA	2	12	140902	140913	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148642207
76	NC_009515	AGGATT	2	12	144510	144521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642210
77	NC_009515	AAAAAC	2	12	144579	144590	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	148642210
78	NC_009515	TCAACA	2	12	147866	147877	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148642214
79	NC_009515	TTAAAG	2	12	148269	148280	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148642214
80	NC_009515	TTTGTT	2	12	149555	149566	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	148642217
81	NC_009515	AGCATA	2	12	151940	151951	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148642220
82	NC_009515	TCAGAA	2	12	152037	152048	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148642220
83	NC_009515	CAGAGT	2	12	152126	152137	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148642220
84	NC_009515	CCTAAA	2	12	152205	152216	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148642220
85	NC_009515	TTATCA	2	12	157956	157967	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148642226
86	NC_009515	AGATCC	2	12	162300	162311	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148642229
87	NC_009515	GACCTG	2	12	163648	163659	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148642230
88	NC_009515	TTTTCT	2	12	166884	166895	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	148642233
89	NC_009515	CAACAG	2	12	167768	167779	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148642233
90	NC_009515	AGTAAC	2	12	167979	167990	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148642233
91	NC_009515	AGTAAC	2	12	168303	168314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148642233
92	NC_009515	AGTAAC	2	12	168627	168638	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148642233
93	NC_009515	AGTAAC	2	12	169275	169286	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148642233
94	NC_009515	TCAACA	2	12	169645	169656	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148642233
95	NC_009515	AACATC	2	12	170970	170981	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148642233
96	NC_009515	GTTTTG	2	12	171706	171717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642233
97	NC_009515	AGTAAC	2	12	171858	171869	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148642233
98	NC_009515	TACATT	2	12	176262	176273	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148642234
99	NC_009515	GGAACC	2	12	176554	176565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642234
100	NC_009515	ATCACT	2	12	176781	176792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642234
101	NC_009515	TTTACC	2	12	178776	178787	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148642236
102	NC_009515	AAACTT	2	12	186423	186434	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148642250
103	NC_009515	AGATGA	2	12	187402	187413	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148642251
104	NC_009515	ATGATT	2	12	189680	189691	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148642255
105	NC_009515	ATTTTT	2	12	190104	190115	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148642257
106	NC_009515	TTGTGG	2	12	192486	192497	0 %	50 %	50 %	0 %	148642260
107	NC_009515	CTTCAA	2	12	193250	193261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642261
108	NC_009515	AAGAGG	2	12	194279	194290	50 %	0 %	50 %	0 %	148642262
109	NC_009515	ATTTTC	2	12	199466	199477	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148642272
110	NC_009515	ACATTA	2	12	202987	202998	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148642276
111	NC_009515	TCACAG	2	12	205922	205933	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148642279
112	NC_009515	TCCATT	2	12	207325	207336	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148642279
113	NC_009515	CCAAAT	2	12	217549	217560	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148642288
114	NC_009515	ATTTGA	2	12	219525	219536	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148642290
115	NC_009515	CCAATA	2	12	220970	220981	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148642292
116	NC_009515	ATATGG	2	12	224340	224351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642296
117	NC_009515	AAAATA	2	12	233380	233391	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148642308
118	NC_009515	TTGAAT	2	12	233831	233842	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148642309
119	NC_009515	GAACCT	2	12	234613	234624	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148642310
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341	NC_009515	GTTCCA	2	12	707654	707665	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148642794
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346	NC_009515	AGTCCA	2	12	710960	710971	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148642799
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463	NC_009515	GTCCCT	2	12	931922	931933	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148643029
464	NC_009515	GAATCA	2	12	932453	932464	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148643030
465	NC_009515	CCAATT	2	12	935269	935280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148643033
466	NC_009515	AGTTCC	2	12	936797	936808	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148643034
467	NC_009515	TATTTG	2	12	938362	938373	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148643037
468	NC_009515	TTTTAT	2	12	939254	939265	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148643038
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470	NC_009515	CCAAAT	2	12	945784	945795	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148643046
471	NC_009515	CAGCAT	2	12	947767	947778	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148643048
472	NC_009515	CGTCTT	2	12	949207	949218	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148643048
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477	NC_009515	TAATAT	2	12	960375	960386	50 %	50 %	0 %	0 %	148643056
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481	NC_009515	CATATA	2	12	976062	976073	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148643073
482	NC_009515	TGCTCT	2	12	978323	978334	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148643075
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490	NC_009515	TAAATG	2	12	992306	992317	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148643090
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